PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=341-47-J68)

Interfaces in PDB 5epa crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.24 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF NON-HEME ALPHA KETOGLUTARATE DEPENDENT CARBOCYCLASE SNOK FROM NOGALAMYCIN BIOSYNTHESIS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		E	`86`	`29`	`12005`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`86`	`30`	`11874`	`728.1`	`-4.5`	`0.480`	`13`	`6`	`0`	`0.000`
	`2`		C	`87`	`30`	`12073`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`88`	`29`	`11801`	`726.0`	`-4.5`	`0.486`	`13`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`727.1`	`-4.5`	`0.483`	`13`	`4`	`0`	`0.000`
2	`3`		D	`77`	`19`	`11801`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`74`	`19`	`12201`	`621.6`	`-5.8`	`0.319`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`75`	`18`	`12073`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`73`	`17`	`12005`	`611.2`	`-6.1`	`0.328`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	`5`		F	`70`	`16`	`12064`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`69`	`16`	`11874`	`607.6`	`-8.0`	`0.158`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`613.5`	`-6.7`	`0.268`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
3	`6`		E	`46`	`13`	`12005`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`45`	`13`	`12201`	`422.4`	`1.2`	`0.787`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
4	`7`		F	`47`	`13`	`12064`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`40`	`11`	`11874`	`415.8`	`-2.4`	`0.419`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`8`		E	`37`	`11`	`12005`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`43`	`11`	`12073`	`394.7`	`-1.7`	`0.533`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`9`		D	`40`	`11`	`11801`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`41`	`12`	`12201`	`392.5`	`-2.1`	`0.471`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`401.0`	`-2.1`	`0.474`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
5	`10`		E	`31`	`8`	`12005`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`31`	`9`	`11801`	`283.7`	`0.5`	`0.729`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
6	`11`		E	`29`	`7`	`12005`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`12201`	`224.5`	`3.0`	`0.896`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
7	`12`		F	`31`	`12`	`12064`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`32`	`12`	`12073`	`214.0`	`0.9`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`13`		B	`20`	`8`	`12201`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`11874`	`199.0`	`2.5`	`0.851`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
9	`14`		F	`21`	`11`	`12064`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`23`	`8`	`12201`	`182.8`	`-0.9`	`0.525`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		[AKG]E:301	`10`	`1`	`290`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`28`	`15`	`12005`	`168.3`	`1.0`	`0.378`	`7`	`0`	`0`	`0.011`
11	`16`		[AKG]D:302	`10`	`1`	`288`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`28`	`15`	`11801`	`167.5`	`0.9`	`0.378`	`7`	`0`	`0`	`0.011`
	`17`		[AKG]C:301	`10`	`1`	`286`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`28`	`15`	`12073`	`166.6`	`1.0`	`0.383`	`7`	`0`	`0`	`0.011`
	`18`		[AKG]F:301	`10`	`1`	`287`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`29`	`15`	`12064`	`165.5`	`1.1`	`0.379`	`7`	`0`	`0`	`0.011`
	`19`		[AKG]A:301	`10`	`1`	`285`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`15`	`11874`	`165.3`	`0.9`	`0.365`	`6`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`166.2`	`1.0`	`0.376`	`7`	`0`	`0`	`0.011`
12	`20`		[AKG]B:302	`10`	`1`	`289`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`28`	`15`	`12201`	`166.1`	`1.0`	`0.375`	`7`	`0`	`0`	`0.011`
13	`21`		C	`17`	`5`	`12073`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`18`	`7`	`11801`	`117.1`	`0.4`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		E	`13`	`5`	`12005`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`11801`	`105.3`	`2.1`	`0.827`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		C	`11`	`5`	`12073`	`x`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`9`	`4`	`12073`	`82.5`	`1.3`	`0.837`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		D	`10`	`5`	`11801`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`11874`	`81.8`	`0.8`	`0.753`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
17	`25`		[FE]E:300	`1`	`1`	`137`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`12005`	`58.7`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`26`		[FE]C:300	`1`	`1`	`137`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`12073`	`58.6`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`27`		[FE]A:300	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`11874`	`58.4`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`28`		[FE]F:300	`1`	`1`	`137`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`12064`	`58.2`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`29`		[FE]D:301	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`11801`	`58.0`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`30`		[FE]B:301	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`12201`	`57.1`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	*Average:*													`58.1`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
18	`31`		F	`5`	`2`	`12064`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`6`	`3`	`11874`	`51.3`	`-0.5`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`32`		A	`7`	`3`	`11874`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`6`	`2`	`12201`	`50.7`	`-0.5`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`33`		F	`5`	`2`	`12064`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`2`	`11801`	`45.1`	`1.1`	`0.859`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		A	`6`	`2`	`11874`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`2`	`12201`	`29.3`	`0.4`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.2`	`0.7`	`0.797`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`35`		[AKG]E:301	`4`	`1`	`290`	`cf`	[FE]E:300	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`43.9`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`36`		[AKG]B:302	`4`	`1`	`289`	`f`	[FE]B:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`43.9`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`37`		[AKG]D:302	`4`	`1`	`288`	`f`	[FE]D:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`43.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`38`		[AKG]F:301	`4`	`1`	`287`	`f`	[FE]F:300	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`43.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`39`		[AKG]C:301	`4`	`1`	`286`	`f`	[FE]C:300	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`43.2`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	`40`		[AKG]A:301	`4`	`1`	`285`	`f`	[FE]A:300	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`42.8`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
	*Average:*													`43.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
22	`41`		C	`6`	`4`	`12073`	`f`	[MG]D:304	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`98`	`37.8`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`42`		[MG]D:303	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`11801`	`36.1`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`43`		A	`7`	`4`	`11874`	`f`	[MG]B:303	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`98`	`33.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`35.7`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
23	`44`		F	`6`	`4`	`12064`	`x`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`5`	`2`	`12064`	`37.4`	`0.6`	`0.756`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`45`		F	`5`	`2`	`12064`	`◊`	[MG]D:303	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`98`	`29.4`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		E	`5`	`2`	`12005`	`◊`	[MG]B:303	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`98`	`28.8`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[MG]D:304	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11801`	`28.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[MG]B:303	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12201`	`27.1`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		C	`5`	`2`	`12073`	`◊`	[MG]D:303	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`98`	`25.5`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`27.8`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`50`		E	`2`	`1`	`12005`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`2`	`11801`	`5.6`	`0.1`	`0.691`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		F	`1`	`1`	`12064`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`12005`	`2.6`	`0.1`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.1`	`0.1`	`0.730`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`52`		F	`1`	`1`	`12064`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`11874`	`2.3`	`0.0`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`53`		A	`1`	`1`	`11874`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`11801`	`1.5`	`-0.0`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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