PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=631-3P-843)

Interfaces in PDB 5erd crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.90 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DESMOGLEIN-2 ECTODOMAIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`71`	`19`	`32707`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`70`	`19`	`32184`	`642.2`	`-8.6`	`0.169`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`52`	`20`	`32184`	`x`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`50`	`14`	`32184`	`530.9`	`-4.2`	`0.307`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`52`	`18`	`32707`	`x`	B	-x,y-1/2,-z+3/2	`3_546`	`48`	`14`	`32707`	`506.9`	`-0.2`	`0.653`	`2`	`7`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`48`	`14`	`32707`	`x`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`56`	`20`	`32707`	`500.5`	`-5.8`	`0.228`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`49`	`13`	`32184`	`x`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`38`	`11`	`32184`	`428.4`	`2.0`	`0.776`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`44`	`16`	`32184`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`39`	`13`	`32707`	`330.4`	`-3.5`	`0.312`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`27`	`8`	`32707`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`26`	`8`	`32184`	`282.0`	`0.2`	`0.564`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`33`	`13`	`32184`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`9`	`32707`	`234.6`	`-0.2`	`0.630`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
9	`9`		A	`22`	`6`	`32184`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`24`	`9`	`32707`	`191.3`	`-2.3`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		[NAG]A:609	`12`	`1`	`352`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`32184`	`154.8`	`4.8`	`0.564`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[NAG]B:909	`12`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`32707`	`139.0`	`3.7`	`0.389`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		[MAN]A:615	`10`	`1`	`292`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`32184`	`136.8`	`3.1`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		[NAG]B:906	`10`	`1`	`344`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`32707`	`133.2`	`4.9`	`0.578`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		[NAG]B:912	`13`	`1`	`354`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`32707`	`133.1`	`3.6`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		[NAG]A:602	`10`	`1`	`356`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`32184`	`131.9`	`3.0`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		[MAN]B:903	`10`	`1`	`291`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`32707`	`130.8`	`3.6`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[NAG]A:605	`10`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`32184`	`127.3`	`2.6`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		[MAN]B:902	`9`	`1`	`290`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`32707`	`114.5`	`2.2`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[NAG]B:904	`10`	`1`	`350`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`32707`	`113.2`	`1.8`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		[MAN]A:614	`9`	`1`	`291`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`32184`	`110.1`	`2.2`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`21`		[NAG]A:608	`10`	`1`	`344`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`32184`	`102.4`	`2.8`	`0.333`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`22`		[MAN]B:901	`9`	`1`	`292`	`c`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`32707`	`99.6`	`1.7`	`0.289`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`23`		[MAN]A:613	`8`	`1`	`287`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`32184`	`97.1`	`1.8`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`24`		[NAG]B:907	`9`	`1`	`356`	`cf`	[NAG]B:906	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`344`	`87.5`	`3.0`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		A	`8`	`3`	`32184`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`6`	`2`	`32707`	`86.3`	`0.2`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		A	`10`	`5`	`32184`	`cf`	[MAN]B:901	x,y,z-1	`1_554`	`7`	`1`	`292`	`82.8`	`1.0`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		[NAG]B:911	`7`	`1`	`358`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`32707`	`82.7`	`2.7`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`28`		[NAG]A:606	`8`	`1`	`366`	`cf`	[NAG]A:605	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`78.9`	`2.3`	`0.134`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		[NAG]B:907	`6`	`1`	`356`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`32707`	`78.6`	`2.1`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`30`		[EDO]A:627	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`12`	`5`	`32707`	`75.0`	`2.5`	`0.283`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`31`		[BMA]B:908	`6`	`1`	`302`	`cf`	[NAG]B:907	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`356`	`74.0`	`1.3`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`32`		[NAG]A:610	`9`	`1`	`349`	`cf`	[NAG]A:609	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`352`	`73.8`	`1.8`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`33`		[NAG]B:910	`7`	`1`	`364`	`cf`	[NAG]B:909	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`71.1`	`1.5`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`34`		[FUC]A:612	`7`	`1`	`283`	`cf`	[NAG]A:609	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`352`	`67.3`	`2.6`	`0.144`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`35`		[FUC]A:612	`7`	`1`	`283`	`f`	[NAG]A:610	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`349`	`66.0`	`3.6`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`36`		[NAG]A:603	`10`	`1`	`353`	`cf`	[NAG]A:602	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`356`	`65.3`	`1.0`	`0.072`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`37`		[NAG]B:913	`8`	`1`	`341`	`cf`	[NAG]B:912	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`354`	`62.5`	`2.1`	`0.090`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`38`		[MAN]A:613	`5`	`1`	`287`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`4`	`32707`	`62.2`	`1.4`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`39`		[BMA]A:604	`7`	`1`	`297`	`cf`	[NAG]A:603	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`353`	`61.2`	`1.9`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`40`		[BMA]A:607	`7`	`1`	`299`	`cf`	[NAG]A:606	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`366`	`60.5`	`1.8`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`41`		[NAG]B:905	`8`	`1`	`339`	`cf`	[NAG]B:904	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`350`	`60.3`	`0.8`	`0.046`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`42`		[BMA]A:611	`5`	`1`	`297`	`cf`	[NAG]A:610	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`349`	`57.8`	`1.6`	`0.179`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`43`		[NAG]A:601	`6`	`1`	`351`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`32184`	`56.7`	`1.9`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`44`		[FUC]A:612	`6`	`1`	`283`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`32184`	`54.1`	`0.8`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`45`		[NAG]B:913	`5`	`1`	`341`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`32707`	`47.7`	`0.7`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`46`		[EDO]A:627	`4`	`1`	`186`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`32184`	`45.8`	`1.0`	`0.891`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`47`		A	`5`	`1`	`32184`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`32184`	`43.5`	`1.2`	`0.798`	`0`	`4`	`0`	`0.000`
48	`48`		[CA]B:920	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`32707`	`42.9`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.128`
49	`49`		[CA]B:918	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`32707`	`42.2`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.121`
50	`50`		[CA]A:617	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`32184`	`40.3`	`-11.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
51	`51`		[CA]A:620	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`32184`	`39.8`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
52	`52`		[CA]A:626	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`32184`	`39.2`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
53	`53`		[CA]B:922	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`32707`	`38.8`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.128`
54	`54`		[NAG]B:910	`4`	`1`	`364`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`32707`	`36.0`	`0.0`	`0.139`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`55`		A	`3`	`1`	`32184`	`◊`	[NAG]B:913	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`6`	`1`	`341`	`32.6`	`1.0`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`56`		[NAG]A:603	`3`	`1`	`353`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`32184`	`29.3`	`0.8`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`57`		[NAG]A:606	`6`	`1`	`366`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`32184`	`25.1`	`0.3`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`58`		B	`9`	`2`	`32707`	`◊`	[NAG]A:609	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`352`	`19.3`	`0.7`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`59`		B	`4`	`2`	`32707`	`◊`	[NAG]A:610	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`349`	`18.4`	`0.4`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`60`		[NAG]A:610	`4`	`1`	`349`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`32184`	`18.3`	`0.6`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`61`		[MAN]A:614	`3`	`1`	`291`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`3`	`32707`	`15.1`	`-0.1`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`62`		[MAN]A:615	`3`	`1`	`292`	`f`	[MAN]A:614	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`291`	`14.9`	`0.4`	`0.231`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[MAN]B:903	`3`	`1`	`291`	`f`	[MAN]B:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`290`	`8.2`	`0.4`	`0.154`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`11.6`	`0.4`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`64`		[CA]A:626	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:622	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`13.0`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
64	`65`		[MAN]A:614	`3`	`1`	`291`	`f`	[MAN]A:613	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`287`	`13.0`	`0.4`	`0.199`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`66`		[CA]B:924	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:918	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`12.7`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
66	`67`		[CA]A:620	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:619	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.7`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
67	`68`		[CA]B:923	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:921	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.5`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
68	`69`		[MAN]B:902	`2`	`1`	`290`	`◊`	[MAN]B:901	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`292`	`10.7`	`0.2`	`0.153`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`70`		[CA]B:922	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:914	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.7`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
70	`71`		[CA]A:625	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:624	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.6`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
71	`72`		[CA]A:617	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:616	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.1`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
72	`73`		A	`2`	`1`	`32184`	`◊`	[NAG]B:912	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`354`	`9.7`	`0.4`	`0.543`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`74`		[CA]B:920	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:916	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`8.2`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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