PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=772-H6-074)

Interfaces in PDB 5g2t crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.90 Å

STRUCTURE OF BT4656 IN COMPLEX WITH ITS SUBSTRATE D-GLUCOSAMINE-2-N, 6-O-DISULFATE.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`73`	`25`	`17773`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`67`	`19`	`18070`	`666.4`	`2.5`	`0.874`	`10`	`10`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`62`	`19`	`18065`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`73`	`23`	`17838`	`660.1`	`0.7`	`0.762`	`7`	`10`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`663.2`	`1.6`	`0.818`	`9`	`10`	`0`	`0.000`
2	`3`		C	`60`	`20`	`17773`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`51`	`12`	`18070`	`467.7`	`-4.5`	`0.359`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		A	`51`	`11`	`18065`	`◊`	D	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`54`	`19`	`17838`	`439.2`	`-3.1`	`0.461`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`453.5`	`-3.8`	`0.410`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
3	`5`		D	`47`	`10`	`17838`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`51`	`15`	`18065`	`392.6`	`-2.6`	`0.497`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`45`	`9`	`17773`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z-2	`2_443`	`49`	`15`	`18070`	`383.8`	`-3.5`	`0.390`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`388.2`	`-3.0`	`0.444`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		C	`43`	`14`	`17773`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`41`	`12`	`17838`	`371.9`	`-0.6`	`0.668`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
5	`8`		D	`28`	`8`	`17838`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`13`	`18070`	`264.9`	`0.6`	`0.724`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`31`	`11`	`17773`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`27`	`10`	`18065`	`233.0`	`1.1`	`0.777`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`248.9`	`0.9`	`0.751`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
6	`10`		A	`26`	`7`	`18065`	`x`	A	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`29`	`7`	`18065`	`246.1`	`-0.6`	`0.649`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		B	`24`	`7`	`18070`	`x`	B	-x,y-1/2,-z-2	`2_543`	`30`	`8`	`18070`	`243.8`	`-0.3`	`0.610`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`244.9`	`-0.4`	`0.629`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		[UAP]C:511	`16`	`1`	`369`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`25`	`15`	`17773`	`231.4`	`1.5`	`0.679`	`9`	`0`	`0`	`0.127`
	`13`		[UAP]D:510	`16`	`1`	`373`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`24`	`14`	`17838`	`230.8`	`0.1`	`0.591`	`11`	`0`	`0`	`0.127`
	`14`		[UAP]B:512	`16`	`1`	`370`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`15`	`18070`	`218.0`	`-0.1`	`0.581`	`12`	`0`	`0`	`0.127`
	`15`		[UAP]A:512	`16`	`1`	`367`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`13`	`18065`	`216.9`	`1.1`	`0.646`	`9`	`0`	`0`	`0.127`
	*Average:*													`224.3`	`0.6`	`0.624`	`10`	`0`	`0`	`0.127`
8	`16`		[SGN]A:510	`14`	`1`	`443`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`18065`	`175.4`	`4.2`	`0.532`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		[SGN]B:511	`14`	`1`	`446`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`18070`	`170.1`	`4.1`	`0.530`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`172.8`	`4.2`	`0.531`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
9	`18`		D	`14`	`5`	`17838`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`17773`	`136.6`	`2.1`	`0.887`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
10	`19`		[EDO]C:509	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`17773`	`122.0`	`3.2`	`0.451`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		[EDO]D:506	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`17838`	`115.8`	`3.9`	`0.690`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[EDO]B:502	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`18070`	`115.3`	`3.9`	`0.693`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		[EDO]C:502	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`17773`	`115.3`	`3.9`	`0.489`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
14	`23`		[EDO]A:507	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`18065`	`113.4`	`3.9`	`0.497`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
15	`24`		C	`17`	`5`	`17773`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`14`	`6`	`18065`	`112.4`	`-0.3`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`25`		[EDO]B:503	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`11`	`18070`	`111.3`	`2.8`	`0.444`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[EDO]C:510	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`17773`	`111.0`	`3.3`	`0.464`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		C	`9`	`5`	`17773`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`18065`	`106.0`	`-0.9`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		B	`11`	`5`	`18070`	`◊`	D	-x-1,y-1/2,-z-2	`2_443`	`12`	`4`	`17838`	`93.4`	`-0.5`	`0.543`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`99.7`	`-0.7`	`0.475`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`29`		[EDO]A:505	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`5`	`18065`	`105.2`	`3.0`	`0.480`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`30`		[EDO]D:504	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`17838`	`105.0`	`3.8`	`0.619`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[EDO]B:505	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`18070`	`97.0`	`3.4`	`0.619`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`101.0`	`3.6`	`0.619`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
21	`32`		[EDO]A:506	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`18065`	`105.0`	`2.4`	`0.450`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`33`		[EDO]A:503	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`18065`	`104.2`	`3.1`	`0.490`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
23	`34`		[EDO]C:508	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`17773`	`104.2`	`3.0`	`0.522`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
24	`35`		[EDO]D:503	`4`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`17838`	`103.8`	`3.3`	`0.498`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`36`		[EDO]C:504	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`17773`	`103.6`	`3.8`	`0.617`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[EDO]A:504	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`18065`	`97.7`	`3.5`	`0.631`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`100.7`	`3.6`	`0.624`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
26	`38`		[EDO]C:505	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`17773`	`103.1`	`3.3`	`0.500`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`39`		[EDO]B:510	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`18070`	`102.8`	`3.1`	`0.495`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
28	`40`		[EDO]D:505	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`17838`	`100.6`	`3.0`	`0.523`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`41`		[EDO]D:507	`4`	`1`	`182`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`17838`	`99.7`	`2.7`	`0.306`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`42`		[EDO]B:508	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`18070`	`94.4`	`2.6`	`0.304`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
31	`43`		[EDO]B:504	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`5`	`18070`	`94.0`	`2.8`	`0.486`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
32	`44`		[EDO]B:509	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18070`	`89.1`	`3.3`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`45`		A	`20`	`7`	`18065`	`◊`	[EDO]D:508	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`4`	`1`	`185`	`88.8`	`2.6`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`46`		[EDO]A:509	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`18065`	`87.1`	`1.8`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`47`		[EDO]C:506	`4`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`17773`	`86.1`	`2.5`	`0.305`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[EDO]D:502	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17838`	`84.7`	`2.5`	`0.304`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`85.4`	`2.5`	`0.305`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
36	`49`		[EDO]B:506	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`18070`	`80.7`	`1.4`	`0.680`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`50`		[EDO]A:502	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`17838`	`80.7`	`2.3`	`0.421`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`51`		[UAP]B:512	`13`	`1`	`370`	`cf`	[SGN]B:511	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`446`	`80.4`	`2.5`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[UAP]A:512	`13`	`1`	`367`	`cf`	[SGN]A:510	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`443`	`79.1`	`2.6`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`79.7`	`2.6`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`53`		[EDO]C:503	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`18070`	`80.1`	`2.2`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[EDO]A:508	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`18065`	`68.2`	`1.6`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`74.1`	`1.9`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`55`		[CL]D:509	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`17838`	`78.2`	`-12.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.520`
	`56`		[CL]A:511	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`18065`	`76.0`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.520`
	`57`		[CL]B:513	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`18070`	`75.1`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.520`
	`58`		[CL]C:512	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`17773`	`66.0`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.520`
	*Average:*													`73.8`	`-11.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.520`
41	`59`		[EDO]C:503	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`17773`	`70.6`	`1.7`	`0.263`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[EDO]A:502	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`18065`	`69.7`	`1.6`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.2`	`1.6`	`0.265`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`61`		D	`13`	`7`	`17838`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`5`	`18070`	`70.3`	`-0.8`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`62`		C	`10`	`4`	`17773`	`◊`	[EDO]B:507	-x-1,y-1/2,-z-2	`2_443`	`3`	`1`	`183`	`68.4`	`2.1`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`63`		A	`11`	`6`	`18065`	`◊`	[EDO]D:502	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`4`	`1`	`185`	`67.0`	`1.7`	`0.384`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		[EDO]C:506	`3`	`1`	`186`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`6`	`18070`	`66.8`	`1.7`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.9`	`1.7`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`65`		[EDO]C:507	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17773`	`67.0`	`1.8`	`0.428`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`66`		[EDO]C:507	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z-2	`2_443`	`13`	`6`	`18070`	`62.4`	`1.2`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`67`		[EDO]A:508	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`10`	`5`	`17838`	`58.9`	`1.4`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`68`		[EDO]A:509	`4`	`1`	`183`	`f`	D	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`8`	`4`	`17838`	`58.5`	`1.0`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`69`		D	`9`	`3`	`17838`	`f`	[EDO]B:509	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`183`	`50.2`	`0.8`	`0.780`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
50	`70`		[EDO]B:507	`3`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`18070`	`46.5`	`0.8`	`0.735`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`71`		[EDO]C:507	`4`	`1`	`184`	`◊`	[EDO]B:507	-x-1,y-1/2,-z-2	`2_443`	`4`	`1`	`183`	`44.2`	`1.8`	`1.000`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
52	`72`		[EDO]D:503	`2`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`18065`	`39.2`	`1.2`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`73`		[EDO]C:505	`2`	`1`	`184`	`f`	B	-x-1,y-1/2,-z-2	`2_443`	`5`	`3`	`18070`	`39.0`	`1.2`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`74`		[EDO]A:508	`3`	`1`	`184`	`◊`	[EDO]D:508	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`3`	`1`	`185`	`38.7`	`1.7`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
55	`75`		[EDO]B:504	`2`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`17773`	`36.8`	`1.0`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`76`		[EDO]A:505	`2`	`1`	`185`	`f`	D	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`4`	`2`	`17838`	`35.6`	`1.1`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`77`		[EDO]D:508	`3`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`17838`	`35.0`	`0.6`	`0.788`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`78`		[EDO]B:506	`4`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:504	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`27.5`	`0.9`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`79`		[CL]C:512	`1`	`1`	`125`	`f`	[EDO]C:509	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`25.0`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
60	`80`		[EDO]B:510	`1`	`1`	`183`	`f`	[EDO]B:505	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`16.1`	`0.4`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
61	`81`		[EDO]A:504	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:503	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`15.4`	`0.4`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
62	`82`		C	`2`	`2`	`17773`	`f`	[EDO]B:510	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`183`	`11.1`	`0.4`	`0.904`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`83`		[EDO]A:503	`2`	`1`	`183`	`f`	D	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`2`	`2`	`17838`	`3.5`	`0.1`	`0.838`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`84`		[SGN]A:510	`1`	`1`	`443`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17838`	`1.2`	`0.0`	`0.323`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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