PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=666-D3-H64)

Interfaces in PDB 5iit crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.13 Å

STRUCTURE OF SPX DOMAIN OF THE YEAST INORGANIC POLYPHOPHATE POLYMERASE VTC4 CRYSTALLIZED BY CARRIER-DRIVEN CRYSTALLIZATION IN FUSION WITH THE MACRO DOMAIN OF HUMAN HISTONE MACROH2A1.1

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`298`	`80`	`20482`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`297`	`80`	`20428`	`3152.6`	`-53.4`	`0.000`	`12`	`4`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`299`	`78`	`20390`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`293`	`79`	`20338`	`3088.2`	`-54.4`	`0.000`	`9`	`4`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`3120.4`	`-53.9`	`0.000`	`11`	`4`	`0`	`1.000`
2	`3`		C	`127`	`33`	`20482`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`130`	`34`	`20338`	`1187.8`	`-20.9`	`0.029`	`4`	`0`	`0`	`0.642`
	`4`		D	`122`	`32`	`20390`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`125`	`32`	`20428`	`1158.8`	`-20.7`	`0.029`	`4`	`0`	`0`	`0.642`
	*Average:*													`1173.3`	`-20.8`	`0.029`	`4`	`0`	`0`	`0.642`
3	`5`		D	`105`	`31`	`20390`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`108`	`33`	`20482`	`1011.4`	`-2.0`	`0.713`	`11`	`4`	`0`	`0.196`
	`6`		B	`102`	`33`	`20428`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`102`	`33`	`20338`	`947.4`	`-4.0`	`0.602`	`10`	`5`	`0`	`0.196`
	*Average:*													`979.4`	`-3.0`	`0.658`	`11`	`5`	`0`	`0.196`
4	`7`		B	`47`	`16`	`20428`	`◊`	A	-x-2,y-1/2,-z	`2_345`	`45`	`11`	`20338`	`399.0`	`-1.3`	`0.557`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	`8`		B	`44`	`9`	`20428`	`◊`	A	-x-2,y-1/2,-z-1	`2_344`	`43`	`16`	`20338`	`388.6`	`-1.2`	`0.540`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`393.8`	`-1.2`	`0.549`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
5	`9`		B	`32`	`8`	`20428`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`38`	`11`	`20482`	`315.0`	`0.5`	`0.722`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
6	`10`		[MES]D:401	`11`	`1`	`338`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`36`	`13`	`20390`	`238.0`	`6.3`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		A	`31`	`8`	`20338`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`31`	`11`	`20390`	`236.7`	`0.1`	`0.704`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
8	`12`		[MES]A:401	`12`	`1`	`334`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`13`	`20338`	`226.7`	`5.4`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		[MES]B:402	`12`	`1`	`338`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`14`	`20428`	`213.7`	`5.0`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		[MES]C:401	`12`	`1`	`335`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`35`	`13`	`20482`	`187.8`	`4.6`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		C	`22`	`7`	`20482`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`7`	`20338`	`165.8`	`-0.5`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		B	`20`	`7`	`20428`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`19`	`7`	`20390`	`150.5`	`-0.7`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`158.1`	`-0.6`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		B	`21`	`7`	`20428`	`◊`	C	-x-2,y-1/2,-z	`2_345`	`21`	`9`	`20482`	`153.8`	`0.2`	`0.685`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		D	`20`	`7`	`20390`	`◊`	A	-x-2,y-1/2,-z-1	`2_344`	`20`	`6`	`20338`	`145.9`	`-1.5`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`149.9`	`-0.6`	`0.584`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		[EDO]A:403	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`20338`	`109.8`	`2.5`	`0.438`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		[SO4]B:403	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`20428`	`97.8`	`-13.6`	`0.559`	`2`	`0`	`0`	`0.414`
15	`21`		C	`9`	`3`	`20482`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`12`	`4`	`20338`	`92.5`	`1.3`	`0.802`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`22`		[EDO]A:404	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`20338`	`89.2`	`2.0`	`0.272`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[EDO]B:401	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`20428`	`88.1`	`1.9`	`0.270`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[SO4]C:402	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`20482`	`84.4`	`-11.5`	`0.662`	`6`	`0`	`0`	`0.368`
19	`25`		[EDO]C:403	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`20482`	`83.5`	`1.9`	`0.340`	`5`	`0`	`0`	`0.009`
20	`26`		[EDO]C:404	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`20482`	`78.4`	`1.1`	`0.651`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
21	`27`		[SO4]A:402	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`20338`	`72.8`	`-7.1`	`0.954`	`1`	`0`	`0`	`0.130`
22	`28`		[SO4]D:402	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`20482`	`62.0`	`-8.5`	`0.827`	`2`	`0`	`0`	`0.245`
23	`29`		B	`12`	`3`	`20428`	`◊`	[EDO]C:404	-x-2,y-1/2,-z	`2_345`	`3`	`1`	`185`	`61.7`	`1.4`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		[SO4]D:402	`5`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`20390`	`60.1`	`-8.2`	`0.820`	`2`	`0`	`0`	`0.238`
25	`31`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`20428`	`48.5`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.211`
	`32`		[MG]C:405	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`20482`	`47.1`	`-6.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.211`
	*Average:*													`47.8`	`-7.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.211`
26	`33`		C	`7`	`3`	`20482`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`3`	`20390`	`47.9`	`1.2`	`0.853`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`34`		[EDO]A:403	`4`	`1`	`184`	`f`	[MES]A:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`334`	`43.8`	`2.1`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`35`		[SO4]B:403	`4`	`1`	`184`	`f`	[MES]B:402	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`338`	`42.2`	`-4.9`	`0.106`	`0`	`0`	`0`	`0.139`
29	`36`		B	`4`	`3`	`20428`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`3`	`20338`	`41.4`	`0.7`	`0.809`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`37`		B	`7`	`1`	`20428`	`◊`	[MES]C:401	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`335`	`40.9`	`1.0`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`38`		[MES]B:402	`3`	`1`	`338`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`20482`	`39.6`	`1.7`	`0.569`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`39`		[SO4]C:402	`4`	`1`	`185`	`f`	[MES]C:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`335`	`39.6`	`-3.6`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
33	`40`		[EDO]C:403	`4`	`1`	`185`	`f`	[MES]C:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`335`	`31.7`	`1.8`	`0.210`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`41`		B	`6`	`2`	`20428`	`◊`	[SO4]C:402	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`185`	`27.2`	`-2.2`	`0.914`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`42`		[EDO]C:403	`3`	`1`	`185`	`f`	[SO4]C:402	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`22.5`	`-2.4`	`0.996`	`1`	`0`	`0`	`0.074`
36	`43`		[SO4]B:403	`2`	`1`	`184`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`20482`	`18.7`	`-2.5`	`0.728`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`44`		[EDO]A:404	`2`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`20482`	`14.4`	`0.5`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`45`		[EDO]B:401	`2`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`20390`	`12.2`	`0.4`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`46`		[MES]A:401	`2`	`1`	`334`	`f`	D	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`20390`	`5.1`	`0.2`	`0.214`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`47`		B	`1`	`1`	`20428`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`20482`	`3.3`	`-0.0`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`48`		[EDO]A:403	`2`	`1`	`184`	`f`	D	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`20390`	`1.5`	`0.0`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`49`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`20482`	`0.4`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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