PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=935-7B-M36)

Interfaces in PDB 5j35 crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.47 Å

PROTRUDING DOMAIN OF GII.4 HUMAN NOROVIRUS NSW0514 IN COMPLEX WITH 2- FUCOSYLLACTOSE (2'FL)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`168`	`53`	`13840`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`170`	`53`	`13849`	`1589.8`	`-12.8`	`0.295`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`40`	`11`	`13849`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`46`	`16`	`13849`	`402.0`	`0.0`	`0.637`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
	`3`		B	`47`	`16`	`13840`	`x`	B	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`40`	`11`	`13840`	`400.9`	`0.2`	`0.658`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`401.5`	`0.1`	`0.648`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
3	`4`		A	`46`	`15`	`13849`	`x`	A	-x+5/2,y-1/2,-z+3	`4_748`	`40`	`13`	`13849`	`400.7`	`-5.7`	`0.098`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		B	`46`	`15`	`13840`	`x`	B	-x+5/2,y-1/2,-z+2	`4_747`	`39`	`13`	`13840`	`398.4`	`-5.8`	`0.093`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`399.5`	`-5.8`	`0.096`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		A	`39`	`14`	`13849`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`34`	`11`	`13849`	`342.3`	`-1.0`	`0.473`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		B	`38`	`14`	`13840`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`34`	`11`	`13840`	`341.9`	`-1.0`	`0.474`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`342.1`	`-1.0`	`0.474`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		[EDO]B:602	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`13840`	`109.4`	`3.1`	`0.449`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`9`		[EDO]A:602	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`13849`	`109.4`	`3.1`	`0.448`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		[EDO]B:601	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`13840`	`105.3`	`3.1`	`0.458`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		[EDO]A:601	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`13849`	`104.7`	`3.1`	`0.459`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`105.0`	`3.1`	`0.458`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		[FUC]A:603	`9`	`1`	`281`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`13849`	`93.7`	`1.5`	`0.266`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[FUC]B:603	`9`	`1`	`281`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`13840`	`93.7`	`1.5`	`0.265`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`93.7`	`1.5`	`0.265`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		[GAL]B:604	`8`	`1`	`293`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`12`	`5`	`13849`	`82.5`	`2.2`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[GAL]A:604	`8`	`1`	`294`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`12`	`5`	`13840`	`82.2`	`2.2`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`82.3`	`2.2`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		[GLC]B:605	`8`	`1`	`298`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`11`	`4`	`13849`	`72.1`	`1.2`	`0.313`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		[GLC]A:605	`8`	`1`	`299`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`11`	`4`	`13840`	`72.1`	`1.2`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`72.1`	`1.2`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`18`		[FUC]B:603	`5`	`1`	`281`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13849`	`67.7`	`1.7`	`0.571`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		[FUC]A:603	`5`	`1`	`281`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13840`	`67.6`	`1.8`	`0.567`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`67.7`	`1.8`	`0.569`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`20`		[GAL]B:604	`8`	`1`	`293`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`13849`	`65.5`	`0.4`	`0.139`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[GAL]A:604	`7`	`1`	`294`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`13840`	`64.9`	`0.4`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`65.2`	`0.4`	`0.163`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		[GLC]A:605	`4`	`1`	`299`	`cf`	[GAL]A:604	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`294`	`62.1`	`1.3`	`0.140`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[GLC]B:605	`4`	`1`	`298`	`cf`	[GAL]B:604	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`293`	`61.8`	`1.3`	`0.135`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.0`	`1.3`	`0.138`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`24`		[GLC]B:605	`6`	`1`	`298`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13849`	`61.0`	`0.1`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[GLC]A:605	`5`	`1`	`299`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13840`	`60.9`	`0.1`	`0.242`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`61.0`	`0.1`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`26`		[GAL]A:604	`5`	`1`	`294`	`cf`	[FUC]A:603	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`281`	`54.5`	`2.4`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[GAL]B:604	`5`	`1`	`293`	`cf`	[FUC]B:603	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`281`	`54.1`	`2.4`	`0.282`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.3`	`2.4`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`28`		[GLC]B:605	`5`	`1`	`298`	`f`	[FUC]B:603	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`281`	`50.0`	`2.0`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[GLC]A:605	`5`	`1`	`299`	`f`	[FUC]A:603	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`281`	`49.5`	`2.0`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`49.7`	`2.0`	`0.223`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`30`		B	`4`	`4`	`13840`	`◊`	B	-x+2,y,-z+2	`2_757`	`4`	`4`	`13840`	`11.2`	`-0.3`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		A	`4`	`4`	`13849`	`◊`	A	-x+3,y,-z+3	`2_858`	`4`	`4`	`13849`	`11.0`	`-0.3`	`0.455`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`11.1`	`-0.3`	`0.456`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`32`		[GAL]A:604	`3`	`1`	`294`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13849`	`8.1`	`0.2`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[GAL]B:604	`3`	`1`	`293`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13840`	`7.9`	`0.2`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`8.0`	`0.2`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`34`		[EDO]A:602	`1`	`1`	`184`	`f`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`2`	`1`	`13849`	`2.1`	`0.1`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`35`		B	`2`	`1`	`13840`	`f`	[EDO]B:602	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`1`	`1`	`184`	`2.0`	`0.1`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`36`		[GLC]A:605	`1`	`1`	`299`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13849`	`0.6`	`0.0`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[GLC]B:605	`1`	`1`	`298`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13840`	`0.5`	`0.0`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`0.6`	`0.0`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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