PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=424-73-OEM)

Interfaces in PDB 5j3e crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.60 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN THYN1 PROTEIN IN COMPLEX WITH 5- METHYLCYTOSINE CONTAINING DNA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`58`	`11`	`2854`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`53`	`11`	`2862`	`541.8`	`-5.7`	`0.587`	`31`	`0`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`52`	`11`	`2833`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`56`	`11`	`2841`	`535.3`	`-7.3`	`0.549`	`31`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`538.5`	`-6.5`	`0.568`	`31`	`0`	`0`	`1.000`
2	`3`		E	`41`	`5`	`2862`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`14`	`8779`	`359.2`	`-7.0`	`0.417`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		D	`43`	`5`	`2833`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`38`	`14`	`8634`	`342.5`	`-3.6`	`0.572`	`5`	`0`	`0`	`0.106`
4	`5`		B	`34`	`9`	`8634`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`13`	`8779`	`313.3`	`-5.6`	`0.164`	`2`	`0`	`0`	`0.083`
5	`6`		C	`26`	`5`	`2841`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`38`	`12`	`8634`	`262.9`	`-3.2`	`0.539`	`3`	`0`	`0`	`0.083`
6	`7`		[5CM]C:6	`19`	`1`	`477`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`31`	`2`	`2841`	`245.4`	`5.0`	`0.686`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		[5CM]F:6	`20`	`1`	`479`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`2`	`2854`	`239.5`	`4.6`	`0.651`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[5CM]D:6	`19`	`1`	`464`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`2`	`2833`	`235.4`	`4.6`	`0.672`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		[5CM]E:6	`19`	`1`	`462`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`29`	`2`	`2862`	`234.0`	`5.0`	`0.710`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`238.6`	`4.8`	`0.680`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		B	`25`	`15`	`8634`	`x`	B	-x-2,y-1/2,-z	`2_345`	`24`	`7`	`8634`	`244.4`	`-3.6`	`0.282`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		A	`31`	`14`	`8779`	`x`	A	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`24`	`7`	`8779`	`231.7`	`-1.9`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`238.1`	`-2.8`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`13`		F	`18`	`4`	`2854`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`8`	`8779`	`193.3`	`-0.3`	`0.666`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		B	`16`	`5`	`8634`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`20`	`10`	`8634`	`152.6`	`0.2`	`0.670`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
10	`15`		C	`16`	`2`	`2841`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`2`	`2841`	`138.9`	`2.8`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		E	`17`	`2`	`2862`	`x`	E	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`2`	`2862`	`138.0`	`2.7`	`0.807`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		D	`19`	`2`	`2833`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`2`	`2833`	`136.0`	`3.2`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		F	`19`	`2`	`2854`	`x`	F	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`2`	`2854`	`135.7`	`3.3`	`0.805`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`137.2`	`3.0`	`0.808`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`19`		A	`15`	`5`	`8779`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`2`	`2862`	`127.6`	`0.2`	`0.664`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`20`		[5CM]C:6	`11`	`1`	`477`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`8634`	`112.3`	`-0.3`	`0.441`	`1`	`0`	`0`	`0.014`
13	`21`		[5CM]F:6	`9`	`1`	`479`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`8779`	`95.7`	`-0.9`	`0.406`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		[UNX]A:301	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`8779`	`75.8`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
	`23`		[UNX]B:302	`1`	`1`	`129`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`8634`	`68.1`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
	`24`		[UNX]B:303	`1`	`1`	`129`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`8634`	`63.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
	*Average:*													`69.1`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
15	`25`		[UNX]B:301	`1`	`1`	`129`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`8634`	`68.1`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
16	`26`		D	`7`	`1`	`2833`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`4`	`8634`	`63.7`	`0.5`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`27`		A	`8`	`3`	`8779`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`2`	`8779`	`63.5`	`-0.2`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`28`		[5CM]F:6	`5`	`1`	`479`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2862`	`59.6`	`-0.2`	`0.437`	`3`	`0`	`0`	`0.115`
	`29`		[5CM]C:6	`4`	`1`	`477`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`2833`	`54.4`	`-0.2`	`0.449`	`3`	`0`	`0`	`0.115`
	*Average:*													`57.0`	`-0.2`	`0.443`	`3`	`0`	`0`	`0.115`
19	`30`		[5CM]E:6	`4`	`1`	`462`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2854`	`58.8`	`-0.3`	`0.425`	`3`	`0`	`0`	`0.122`
	`31`		[5CM]D:6	`4`	`1`	`464`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`2841`	`56.6`	`-0.2`	`0.447`	`3`	`0`	`0`	`0.122`
	*Average:*													`57.7`	`-0.3`	`0.436`	`3`	`0`	`0`	`0.122`
20	`32`		[UNX]B:304	`1`	`1`	`129`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`8634`	`57.6`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
21	`33`		[UNX]B:305	`1`	`1`	`129`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`8634`	`56.2`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
22	`34`		A	`4`	`1`	`8779`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`3`	`2854`	`56.0`	`0.7`	`0.683`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`35`		[UNX]A:302	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`8779`	`54.1`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
24	`36`		[UNX]A:303	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`8779`	`51.5`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
25	`37`		[UNX]A:302	`1`	`1`	`129`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`8634`	`38.2`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
26	`38`		D	`5`	`1`	`2833`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2841`	`36.3`	`-0.3`	`0.520`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		F	`5`	`1`	`2854`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2862`	`33.7`	`-0.4`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.0`	`-0.3`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`40`		[UNX]A:303	`1`	`1`	`129`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2862`	`31.4`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`41`		[UNX]B:305	`1`	`1`	`129`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`2841`	`30.3`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
29	`42`		[UNX]B:303	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]B:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`29.9`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
30	`43`		[UNX]B:303	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]B:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`29.1`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
31	`44`		E	`5`	`1`	`2862`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2854`	`23.7`	`-0.2`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		C	`5`	`1`	`2841`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2833`	`19.1`	`-0.2`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`21.4`	`-0.2`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`46`		[5CM]F:6	`1`	`1`	`479`	`◊`	[5CM]E:6	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`462`	`20.3`	`0.0`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[5CM]D:6	`1`	`1`	`464`	`◊`	[5CM]C:6	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`477`	`15.9`	`0.0`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.1`	`0.0`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`48`		[UNX]A:303	`1`	`1`	`129`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2862`	`18.6`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[UNX]A:303	`1`	`1`	`129`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2854`	`3.8`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`11.2`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`50`		[UNX]B:304	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`8779`	`13.1`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
35	`51`		[5CM]C:6	`2`	`1`	`477`	`◊`	[UNX]B:305	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`11.5`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
36	`52`		[UNX]B:304	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`10.0`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
37	`53`		C	`1`	`1`	`2841`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`2862`	`10.0`	`-0.9`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`54`		[UNX]B:302	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]B:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`6.3`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
39	`55`		[UNX]A:303	`1`	`1`	`129`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2854`	`4.0`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`56`		C	`1`	`1`	`2841`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`8634`	`3.2`	`-0.2`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`57`		B	`1`	`1`	`8634`	`◊`	D	-x-2,y-1/2,-z	`2_345`	`1`	`1`	`2833`	`1.5`	`-0.1`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`58`		D	`1`	`1`	`2833`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2854`	`1.5`	`-0.2`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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