PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=253-3C-4F5)

Interfaces in PDB 5k73 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.08 Å

AS-ISOLATED DBR1 WITH FE(II) AND ZN(II)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`82`	`31`	`14917`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`84`	`28`	`15208`	`743.1`	`1.4`	`0.779`	`12`	`6`	`0`	`0.023`
2	`2`		E	`70`	`20`	`15270`	`◊`	C	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`67`	`16`	`14917`	`638.6`	`-3.8`	`0.376`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
	`3`		D	`69`	`20`	`15196`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`66`	`16`	`15228`	`632.9`	`-3.5`	`0.359`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
	`4`		D	`60`	`16`	`15196`	`◊`	C	-x+3/2,-y-1,z-1/2	`2_644`	`67`	`18`	`14917`	`599.9`	`-5.0`	`0.229`	`12`	`3`	`0`	`0.000`
	`5`		E	`62`	`15`	`15270`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`65`	`19`	`15208`	`585.0`	`-4.7`	`0.217`	`15`	`3`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`60`	`15`	`15208`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`62`	`17`	`15228`	`569.0`	`-4.7`	`0.221`	`14`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`605.1`	`-4.4`	`0.281`	`13`	`3`	`0`	`0.000`
3	`7`		E	`43`	`16`	`15270`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`40`	`12`	`15228`	`382.3`	`-3.7`	`0.261`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`8`		E	`38`	`12`	`15270`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`39`	`12`	`15196`	`350.0`	`-4.2`	`0.204`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`366.2`	`-4.0`	`0.233`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
4	`9`		E	`36`	`10`	`15270`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`52`	`13`	`15196`	`366.1`	`0.2`	`0.656`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`10`		D	`23`	`7`	`15196`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`10`	`15208`	`206.2`	`0.9`	`0.675`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`286.1`	`0.5`	`0.665`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
5	`11`		A	`40`	`13`	`15228`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`36`	`6`	`15208`	`344.6`	`0.8`	`0.657`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
6	`12`		C	`15`	`4`	`14917`	`x`	C	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`15`	`5`	`14917`	`126.7`	`-0.8`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`13`		[SO4]D:405	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`15196`	`102.0`	`-14.8`	`0.625`	`3`	`0`	`0`	`0.013`
8	`14`		[SO4]B:404	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`15208`	`99.0`	`-15.0`	`0.559`	`2`	`0`	`0`	`0.076`
9	`15`		[SO4]A:403	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`15228`	`91.4`	`-13.6`	`0.653`	`3`	`0`	`0`	`0.016`
10	`16`		[SO4]A:405	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`15228`	`91.3`	`-14.0`	`0.704`	`5`	`0`	`0`	`0.017`
11	`17`		[SO4]C:404	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`14917`	`91.1`	`-12.8`	`0.835`	`5`	`0`	`0`	`0.072`
12	`18`		[SO4]D:404	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`15196`	`89.0`	`-13.4`	`0.729`	`5`	`0`	`0`	`0.012`
13	`19`		[SO4]B:403	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`15208`	`87.8`	`-12.5`	`0.828`	`4`	`0`	`0`	`0.068`
14	`20`		[SO4]E:403	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`15270`	`87.7`	`-12.3`	`0.833`	`4`	`0`	`0`	`0.019`
15	`21`		A	`13`	`4`	`15228`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`10`	`2`	`15208`	`85.6`	`-1.1`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`22`		[SO4]D:403	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`15196`	`85.0`	`-12.6`	`0.824`	`5`	`0`	`0`	`0.012`
17	`23`		D	`12`	`5`	`15196`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`10`	`6`	`15228`	`84.1`	`-1.5`	`0.271`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[SO4]B:405	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15208`	`78.3`	`-10.2`	`0.832`	`4`	`0`	`0`	`0.057`
19	`25`		[SO4]C:401	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`15208`	`72.4`	`-9.9`	`0.788`	`1`	`0`	`0`	`0.050`
20	`26`		[SO4]D:406	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15196`	`71.1`	`-9.4`	`0.706`	`3`	`0`	`0`	`0.009`
21	`27`		D	`8`	`4`	`15196`	`f`	[SO4]C:405	-x+3/2,-y-1,z-1/2	`2_644`	`4`	`1`	`184`	`70.3`	`-9.7`	`0.561`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
22	`28`		[SO4]C:401	`5`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14917`	`68.6`	`-9.3`	`0.731`	`2`	`0`	`0`	`0.049`
23	`29`		[SO4]B:405	`5`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14917`	`67.3`	`-8.8`	`0.799`	`2`	`0`	`0`	`0.046`
24	`30`		[SO4]A:404	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15228`	`59.3`	`-5.6`	`0.960`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
25	`31`		[SO4]C:405	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14917`	`56.4`	`-7.3`	`0.804`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`32`		[FE2]D:401	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15196`	`54.4`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
	`33`		[FE2]A:401	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15228`	`53.6`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
	`34`		[FE2]B:401	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15208`	`53.3`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
	`35`		[FE2]C:402	`1`	`1`	`137`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`14917`	`53.2`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
	`36`		[FE2]E:401	`1`	`1`	`137`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`15270`	`52.9`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
	*Average:*													`53.5`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
27	`37`		A	`5`	`2`	`15228`	`◊`	C	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`4`	`1`	`14917`	`51.9`	`0.3`	`0.592`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		E	`3`	`1`	`15270`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`15228`	`19.8`	`-0.0`	`0.575`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		E	`1`	`1`	`15270`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`1`	`1`	`15196`	`6.2`	`-0.0`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		D	`1`	`1`	`15196`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`1`	`1`	`15208`	`4.9`	`-0.0`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.7`	`0.0`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`41`		[SO4]A:404	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`15208`	`51.8`	`-6.0`	`0.774`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`42`		B	`4`	`1`	`15208`	`◊`	C	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`7`	`2`	`14917`	`51.7`	`-0.1`	`0.601`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`43`		[OH]B:406	`1`	`1`	`99`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15208`	`39.3`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`44`		[OH]D:407	`1`	`1`	`99`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15196`	`39.3`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`45`		[OH]A:406	`1`	`1`	`99`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`15228`	`39.3`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`46`		[OH]C:406	`1`	`1`	`99`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`14917`	`38.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`47`		[OH]E:404	`1`	`1`	`99`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`15270`	`38.0`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	*Average:*													`39.0`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
31	`48`		[ZN]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15208`	`32.2`	`-24.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.234`
	`49`		[ZN]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`15228`	`32.1`	`-24.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.234`
	`50`		[ZN]D:402	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`15196`	`31.9`	`-24.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.234`
	`51`		[ZN]E:402	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`15270`	`31.7`	`-24.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.234`
	`52`		[ZN]C:403	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`14917`	`31.6`	`-24.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.234`
	*Average:*													`31.9`	`-24.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.234`
32	`53`		[OH]B:406	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`22.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
33	`54`		[OH]E:404	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]E:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`22.0`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
34	`55`		[OH]A:406	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`21.8`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
35	`56`		[OH]D:407	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]D:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`21.5`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
36	`57`		[OH]C:406	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]C:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`21.4`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
37	`58`		[OH]A:406	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.3`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
38	`59`		[OH]D:407	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]D:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.2`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
39	`60`		[OH]E:404	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]E:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.2`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
40	`61`		[OH]C:406	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]C:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.1`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
41	`62`		[OH]B:406	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.0`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
42	`63`		[ZN]C:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[FE2]C:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`18.0`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
43	`64`		[ZN]E:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[FE2]E:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`17.8`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
44	`65`		[ZN]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[FE2]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`17.7`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
45	`66`		[ZN]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[FE2]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`17.6`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
46	`67`		[ZN]D:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[FE2]D:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`17.2`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

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