PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=375-3C-OIH)

Interfaces in PDB 5k77 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.17 Å

DBR1 IN COMPLEX WITH 7-MER BRANCHED RNA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`77`	`31`	`15228`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`79`	`31`	`15171`	`725.2`	`0.9`	`0.683`	`13`	`3`	`0`	`0.020`
2	`2`		E	`66`	`17`	`15213`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`70`	`20`	`15171`	`650.4`	`-4.2`	`0.283`	`15`	`5`	`0`	`0.000`
	`3`		E	`69`	`18`	`15213`	`◊`	C	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`62`	`16`	`15228`	`628.0`	`-4.7`	`0.255`	`12`	`5`	`0`	`0.000`
	`4`		D	`63`	`16`	`15204`	`◊`	C	-x+3/2,-y-1,z-1/2	`2_644`	`68`	`19`	`15228`	`604.2`	`-5.2`	`0.230`	`13`	`3`	`0`	`0.000`
	`5`		D	`66`	`19`	`15204`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`64`	`16`	`15099`	`604.1`	`-5.5`	`0.201`	`12`	`3`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`63`	`16`	`15171`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`63`	`18`	`15099`	`601.7`	`-5.0`	`0.227`	`14`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`617.7`	`-4.9`	`0.239`	`13`	`4`	`0`	`0.000`
3	`7`		E	`48`	`15`	`15213`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`49`	`14`	`15204`	`389.5`	`0.7`	`0.691`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`8`		D	`26`	`9`	`15204`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`11`	`15171`	`194.7`	`0.1`	`0.621`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`292.1`	`0.4`	`0.656`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
4	`9`		E	`40`	`15`	`15213`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`44`	`13`	`15099`	`384.2`	`-2.7`	`0.362`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	`10`		E	`40`	`14`	`15213`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`38`	`12`	`15204`	`354.0`	`-2.5`	`0.369`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`369.1`	`-2.6`	`0.366`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
5	`11`		A	`43`	`14`	`15099`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`33`	`7`	`15171`	`365.8`	`0.0`	`0.635`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
6	`12`		C	`14`	`3`	`15228`	`x`	C	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`12`	`4`	`15228`	`105.3`	`-0.7`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`13`		[SO4]C:405	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`15228`	`102.4`	`-13.8`	`0.737`	`3`	`0`	`0`	`0.056`
8	`14`		[SO4]A:404	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`15099`	`99.8`	`-11.8`	`0.871`	`4`	`0`	`0`	`0.013`
9	`15`		[SO4]E:404	`5`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15213`	`98.4`	`-12.2`	`0.862`	`3`	`0`	`0`	`0.012`
10	`16`		[SO4]C:406	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`15228`	`95.1`	`-12.2`	`0.797`	`3`	`0`	`0`	`0.050`
11	`17`		[SO4]B:404	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15171`	`93.5`	`-11.4`	`0.870`	`2`	`0`	`0`	`0.045`
12	`18`		[SO4]C:403	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`15228`	`88.4`	`-12.5`	`0.822`	`3`	`0`	`0`	`0.051`
13	`19`		[SO4]D:405	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15204`	`87.8`	`-13.2`	`0.714`	`4`	`0`	`0`	`0.011`
14	`20`		D	`13`	`6`	`15204`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`10`	`6`	`15099`	`87.5`	`-1.5`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		[SO4]E:405	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`15213`	`87.1`	`-13.4`	`0.726`	`4`	`0`	`0`	`0.014`
16	`22`		[SO4]D:407	`5`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`15204`	`86.8`	`-11.9`	`0.816`	`4`	`0`	`0`	`0.010`
17	`23`		[SO4]A:403	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`15099`	`86.3`	`-12.0`	`0.866`	`4`	`0`	`0`	`0.013`
18	`24`		[SO4]D:403	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`15204`	`83.8`	`-12.3`	`0.836`	`5`	`0`	`0`	`0.011`
19	`25`		[SO4]E:403	`5`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`15213`	`83.0`	`-11.8`	`0.839`	`3`	`0`	`0`	`0.012`
20	`26`		[SO4]B:403	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`15171`	`82.1`	`-11.6`	`0.858`	`3`	`0`	`0`	`0.048`
21	`27`		[SO4]D:404	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`15204`	`81.8`	`-10.3`	`0.850`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
22	`28`		[SO4]C:408	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`15228`	`81.6`	`-10.1`	`0.896`	`1`	`0`	`0`	`0.039`
23	`29`		[SO4]D:406	`5`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`15204`	`80.3`	`-11.9`	`0.691`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
24	`30`		[SO4]B:405	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`15171`	`78.4`	`-11.0`	`0.718`	`2`	`0`	`0`	`0.044`
25	`31`		[SO4]A:407	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15099`	`76.7`	`-8.2`	`0.854`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
26	`32`		[SO4]A:405	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15171`	`76.7`	`-9.6`	`0.682`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
27	`33`		[SO4]C:409	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`15228`	`75.4`	`-9.9`	`0.671`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
28	`34`		[SO4]B:406	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15171`	`73.6`	`-10.7`	`0.570`	`1`	`0`	`0`	`0.041`
29	`35`		[SO4]E:406	`5`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`15213`	`72.8`	`-10.0`	`0.637`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
30	`36`		D	`8`	`4`	`15204`	`f`	[SO4]C:404	-x+3/2,-y-1,z-1/2	`2_644`	`5`	`1`	`185`	`72.2`	`-10.1`	`0.588`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
31	`37`		[SO4]C:407	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15228`	`71.4`	`-9.2`	`0.838`	`2`	`0`	`0`	`0.037`
32	`38`		[SO4]A:406	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15099`	`68.3`	`-9.3`	`0.566`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
33	`39`		[SO4]B:405	`5`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15228`	`67.7`	`-9.1`	`0.630`	`2`	`0`	`0`	`0.037`
34	`40`		A	`6`	`3`	`15099`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`9`	`2`	`15171`	`66.2`	`-0.4`	`0.504`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		[SO4]B:406	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`15228`	`65.1`	`-8.5`	`0.767`	`1`	`0`	`0`	`0.033`
36	`42`		E	`7`	`4`	`15213`	`◊`	[SO4]C:409	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`4`	`1`	`186`	`58.9`	`-7.3`	`0.838`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
37	`43`		[SO4]E:406	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15171`	`58.2`	`-7.5`	`0.857`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`44`		[SO4]C:404	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`15228`	`57.0`	`-7.5`	`0.810`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
39	`45`		[SO4]A:405	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15099`	`55.8`	`-6.8`	`0.830`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		[FE2]C:402	`1`	`1`	`137`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15228`	`53.7`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`47`		[FE2]D:401	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15204`	`53.5`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`48`		[FE2]A:402	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15099`	`53.2`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`49`		[FE2]B:401	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15171`	`53.1`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`50`		[FE2]E:401	`1`	`1`	`137`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15213`	`53.1`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	*Average:*													`53.3`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
41	`51`		D	`5`	`3`	`15204`	`◊`	[SO4]A:406	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`4`	`1`	`185`	`53.0`	`-6.6`	`0.858`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
42	`52`		B	`4`	`1`	`15171`	`◊`	C	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`7`	`2`	`15228`	`52.1`	`-0.1`	`0.569`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		[SO4]D:406	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	-x+3/2,-y-1,z-1/2	`2_644`	`5`	`2`	`15228`	`42.3`	`-5.5`	`0.601`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`54`		A	`5`	`2`	`15099`	`◊`	C	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`4`	`1`	`15228`	`42.3`	`0.1`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		E	`6`	`3`	`15213`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`15099`	`37.5`	`-0.2`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		D	`3`	`1`	`15204`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`1`	`1`	`15171`	`10.5`	`-0.1`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`30.1`	`-0.1`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`57`		[ZN]C:401	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`15228`	`32.6`	`-24.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
	`58`		[ZN]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15171`	`32.5`	`-24.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
	`59`		[ZN]D:402	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15204`	`32.4`	`-24.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
	`60`		[ZN]A:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15099`	`32.2`	`-24.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
	`61`		[ZN]E:402	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`15213`	`31.9`	`-24.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
	*Average:*													`32.3`	`-24.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
46	`62`		[OH]D:408	`1`	`1`	`99`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15204`	`32.4`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`63`		[OH]A:408	`1`	`1`	`99`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15099`	`32.0`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`64`		[OH]C:410	`1`	`1`	`99`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15228`	`31.8`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`65`		[OH]B:407	`1`	`1`	`99`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15171`	`31.6`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`66`		[OH]E:407	`1`	`1`	`99`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15213`	`31.5`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`31.9`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
47	`67`		[OH]B:407	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`25.2`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
48	`68`		[OH]A:408	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`24.9`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
49	`69`		[OH]C:410	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]C:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`24.8`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
50	`70`		[OH]E:407	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]E:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`24.7`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
51	`71`		[OH]D:408	`1`	`1`	`99`	`f`	[FE2]D:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`24.6`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
52	`72`		[OH]E:407	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]E:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.5`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
53	`73`		[OH]B:407	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.2`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
54	`74`		[OH]A:408	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.2`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
55	`75`		[OH]C:410	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]C:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.1`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
56	`76`		[OH]D:408	`1`	`1`	`99`	`f`	[ZN]D:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.0`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
57	`77`		[FE2]B:401	`1`	`1`	`137`	`f`	[ZN]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.6`	`-8.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
58	`78`		[FE2]A:402	`1`	`1`	`137`	`f`	[ZN]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.4`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
59	`79`		[FE2]E:401	`1`	`1`	`137`	`f`	[ZN]E:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.3`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
60	`80`		[FE2]C:402	`1`	`1`	`137`	`f`	[ZN]C:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.3`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
61	`81`		[FE2]D:401	`1`	`1`	`137`	`f`	[ZN]D:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.0`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
62	`82`		[SO4]A:407	`2`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15171`	`9.7`	`-0.8`	`0.949`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`83`		B	`1`	`1`	`15171`	`◊`	[SO4]C:406	x-1/2,-y-3/2,-z	`4_435`	`1`	`1`	`185`	`0.8`	`-0.1`	`0.837`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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