PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=776-56-63M)

Interfaces in PDB 5knc crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 3.02 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE 3 ADP-BOUND V1 COMPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`342`	`94`	`19247`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`341`	`92`	`25124`	`3124.3`	`-15.2`	`0.364`	`40`	`7`	`0`	`0.584`
	`2`		E	`259`	`73`	`19089`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`248`	`68`	`24828`	`2316.0`	`-16.9`	`0.166`	`26`	`2`	`0`	`0.584`
	*Average:*													`2720.1`	`-16.0`	`0.265`	`33`	`5`	`0`	`0.584`
2	`3`		D	`244`	`61`	`19816`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`249`	`66`	`25503`	`2256.9`	`-17.0`	`0.220`	`24`	`2`	`0`	`0.309`
3	`4`		H	`205`	`52`	`6886`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`249`	`61`	`14023`	`2231.2`	`-33.2`	`0.090`	`15`	`6`	`0`	`1.000`
4	`5`		D	`232`	`66`	`19816`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`229`	`65`	`25124`	`2155.2`	`-10.1`	`0.393`	`21`	`3`	`0`	`0.427`
	`6`		F	`188`	`56`	`19247`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`190`	`52`	`24828`	`1771.4`	`-5.5`	`0.491`	`18`	`8`	`0`	`0.427`
	`7`		E	`192`	`55`	`19089`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`190`	`53`	`25503`	`1688.4`	`-12.4`	`0.241`	`12`	`2`	`0`	`0.427`
	*Average:*													`1871.7`	`-9.3`	`0.375`	`17`	`4`	`0`	`0.427`
5	`8`		G	`84`	`29`	`14023`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`87`	`27`	`25124`	`751.4`	`-9.7`	`0.173`	`3`	`0`	`0`	`0.166`
6	`9`		G	`77`	`21`	`14023`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`72`	`21`	`19816`	`715.8`	`-5.8`	`0.418`	`5`	`0`	`0`	`0.121`
7	`10`		G	`65`	`20`	`14023`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`70`	`21`	`19247`	`586.5`	`-4.4`	`0.287`	`4`	`0`	`0`	`0.081`
8	`11`		A	`68`	`24`	`25503`	`x`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`64`	`20`	`25503`	`578.3`	`-3.8`	`0.401`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		G	`52`	`15`	`14023`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`56`	`14`	`24828`	`512.7`	`-3.6`	`0.240`	`4`	`1`	`0`	`0.018`
10	`13`		G	`41`	`11`	`14023`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`54`	`16`	`24828`	`435.8`	`-0.7`	`0.549`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
11	`14`		D	`43`	`11`	`19816`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`38`	`11`	`24828`	`389.7`	`-0.4`	`0.589`	`8`	`4`	`0`	`0.021`
12	`15`		D	`39`	`11`	`19816`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`52`	`16`	`25503`	`385.6`	`-0.6`	`0.580`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
13	`16`		G	`35`	`14`	`14023`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`40`	`16`	`25503`	`380.1`	`-0.7`	`0.329`	`2`	`2`	`0`	`0.011`
14	`17`		[ADP]B:602	`26`	`1`	`553`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`47`	`17`	`24828`	`336.7`	`-5.6`	`0.370`	`12`	`0`	`0`	`0.263`
	`18`		[ADP]A:703	`26`	`1`	`549`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`18`	`25503`	`329.1`	`-5.0`	`0.439`	`12`	`0`	`0`	`0.263`
	`19`		[ADP]C:602	`26`	`1`	`553`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`48`	`18`	`25124`	`317.2`	`-4.9`	`0.436`	`10`	`0`	`0`	`0.263`
	*Average:*													`327.7`	`-5.1`	`0.415`	`11`	`0`	`0`	`0.263`
15	`20`		C	`37`	`10`	`25124`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`39`	`11`	`19247`	`327.9`	`1.0`	`0.727`	`6`	`0`	`0`	`0.008`
16	`21`		G	`25`	`8`	`14023`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`34`	`11`	`19089`	`296.2`	`-1.2`	`0.543`	`3`	`0`	`0`	`0.015`
17	`22`		F	`37`	`9`	`19247`	`◊`	E	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`32`	`10`	`19089`	`258.1`	`2.6`	`0.866`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
18	`23`		F	`21`	`9`	`19247`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`30`	`9`	`24828`	`209.9`	`-2.7`	`0.170`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`24`		B	`18`	`6`	`24828`	`◊`	E	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`18`	`10`	`19089`	`179.9`	`-0.6`	`0.437`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
20	`25`		A	`16`	`5`	`25503`	`◊`	H	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`16`	`6`	`6886`	`163.5`	`0.4`	`0.697`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`26`		[GOL]A:707	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`25503`	`149.3`	`0.7`	`0.612`	`3`	`0`	`0`	`0.010`
22	`27`		[GOL]B:604	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`12`	`24828`	`137.8`	`-0.5`	`0.541`	`2`	`0`	`0`	`0.033`
23	`28`		D	`14`	`4`	`19816`	`◊`	H	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`10`	`5`	`6886`	`137.1`	`0.9`	`0.770`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`29`		[GOL]A:708	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`25503`	`134.5`	`-0.9`	`0.545`	`7`	`0`	`0`	`0.058`
25	`30`		[GOL]D:502	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`19816`	`126.3`	`-0.7`	`0.483`	`5`	`0`	`0`	`0.062`
26	`31`		[ADP]C:602	`16`	`1`	`553`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`19247`	`125.5`	`-2.1`	`0.657`	`4`	`0`	`0`	`0.067`
27	`32`		[GOL]B:605	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`24828`	`122.6`	`0.2`	`0.606`	`3`	`0`	`0`	`0.027`
28	`33`		C	`12`	`4`	`25124`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`14`	`5`	`24828`	`118.9`	`1.2`	`0.770`	`3`	`1`	`0`	`0.002`
29	`34`		[GOL]A:709	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`25503`	`111.1`	`-0.2`	`0.529`	`3`	`0`	`0`	`0.022`
30	`35`		[ADP]B:602	`10`	`1`	`553`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`19089`	`108.0`	`-2.4`	`0.553`	`2`	`0`	`0`	`0.055`
31	`36`		[GOL]B:606	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`24828`	`102.8`	`-1.1`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
32	`37`		[GOL]B:603	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`24828`	`102.2`	`0.9`	`0.707`	`4`	`0`	`0`	`0.021`
33	`38`		D	`14`	`5`	`19816`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`10`	`5`	`25124`	`95.6`	`0.3`	`0.661`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`39`		[GOL]D:501	`6`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`25124`	`94.9`	`-0.6`	`0.490`	`2`	`0`	`0`	`0.032`
35	`40`		[GOL]F:501	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`25124`	`94.4`	`0.0`	`0.571`	`2`	`0`	`0`	`0.018`
36	`41`		[GOL]D:501	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`19816`	`93.3`	`-0.2`	`0.569`	`5`	`0`	`0`	`0.051`
37	`42`		[GOL]A:704	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`25503`	`91.4`	`0.2`	`0.582`	`3`	`0`	`0`	`0.017`
38	`43`		[GOL]A:706	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`25503`	`90.4`	`-0.8`	`0.493`	`1`	`0`	`0`	`0.018`
39	`44`		[GOL]B:607	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`24828`	`89.2`	`-0.6`	`0.497`	`1`	`0`	`0`	`0.026`
40	`45`		C	`14`	`4`	`25124`	`◊`	E	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`7`	`3`	`19089`	`88.8`	`-2.2`	`0.092`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`46`		[SO4]A:702	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`25503`	`76.9`	`-12.2`	`0.669`	`4`	`0`	`0`	`0.205`
42	`47`		[GOL]B:606	`5`	`1`	`218`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`19247`	`74.3`	`0.4`	`0.677`	`3`	`0`	`0`	`0.023`
43	`48`		[GOL]A:705	`6`	`1`	`213`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`19089`	`73.7`	`-0.8`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
44	`49`		D	`6`	`2`	`19816`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`6`	`3`	`19247`	`62.1`	`1.8`	`0.911`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		[GOL]F:501	`3`	`1`	`219`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`19247`	`52.7`	`0.3`	`0.615`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[GOL]F:501	`4`	`1`	`219`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14023`	`49.8`	`-0.4`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
47	`52`		[GOL]D:502	`6`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`25503`	`46.3`	`-0.7`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
48	`53`		[MG]B:601	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`24828`	`45.6`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
	`54`		[MG]C:601	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`25124`	`42.8`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
	`55`		[MG]A:701	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`25503`	`37.5`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
	*Average:*													`42.0`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
49	`56`		[SO4]A:702	`5`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`19816`	`44.0`	`-3.6`	`0.926`	`2`	`0`	`0`	`0.050`
50	`57`		B	`2`	`1`	`24828`	`◊`	[GOL]B:607	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`4`	`1`	`219`	`42.3`	`0.3`	`0.685`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`58`		[GOL]A:705	`5`	`1`	`213`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`25503`	`35.3`	`0.5`	`0.777`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
52	`59`		[GOL]A:704	`4`	`1`	`217`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`19089`	`35.0`	`0.4`	`0.672`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`60`		[ADP]A:703	`4`	`1`	`549`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`19816`	`34.7`	`-1.7`	`0.466`	`1`	`0`	`0`	`0.023`
54	`61`		[ADP]A:703	`4`	`1`	`549`	`f`	[SO4]A:702	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`33.4`	`-4.6`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
55	`62`		[GOL]A:705	`3`	`1`	`213`	`◊`	[GOL]A:704	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`217`	`28.8`	`0.4`	`0.677`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
56	`63`		[ADP]C:602	`4`	`1`	`553`	`f`	[MG]C:601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`28.5`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	`64`		[ADP]B:602	`4`	`1`	`553`	`f`	[MG]B:601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`27.2`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	`65`		[ADP]A:703	`4`	`1`	`549`	`f`	[MG]A:701	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`26.8`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	*Average:*													`27.5`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
57	`66`		C	`3`	`2`	`25124`	`◊`	G	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`14023`	`18.7`	`0.1`	`0.640`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`67`		A	`2`	`1`	`25503`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`4`	`1`	`19247`	`17.7`	`-0.0`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`68`		[SO4]A:702	`4`	`1`	`185`	`f`	[MG]A:701	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`17.3`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
60	`69`		[GOL]A:706	`2`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`19816`	`16.1`	`0.0`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`70`		[MG]B:601	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`19089`	`15.7`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`71`		[MG]C:601	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`19247`	`10.9`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`13.3`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
62	`72`		[MG]A:701	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`19816`	`14.8`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
63	`73`		H	`3`	`3`	`6886`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`19247`	`11.8`	`-0.2`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
64	`74`		[GOL]A:707	`1`	`1`	`217`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`19089`	`11.1`	`-0.0`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		H	`1`	`1`	`6886`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`19089`	`10.2`	`0.1`	`0.663`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`76`		C	`1`	`1`	`25124`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`6886`	`10.1`	`-0.1`	`0.582`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`77`		A	`3`	`1`	`25503`	`◊`	G	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`1`	`1`	`14023`	`7.9`	`-0.3`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`78`		B	`2`	`1`	`24828`	`x`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`24828`	`7.6`	`0.0`	`0.589`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`79`		H	`1`	`1`	`6886`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`25124`	`7.2`	`0.2`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`80`		[GOL]A:708	`2`	`1`	`218`	`f`	[MG]A:701	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`4.6`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
71	`81`		[GOL]A:707	`2`	`1`	`217`	`f`	[GOL]A:704	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`217`	`3.0`	`-0.0`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`82`		[GOL]A:708	`1`	`1`	`218`	`f`	[SO4]A:702	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`1.6`	`-0.1`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
73	`83`		A	`1`	`1`	`25503`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`19089`	`0.9`	`0.0`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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