PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=925-DP-25K)

Interfaces in PDB 5mh5 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.40 Å

D-2-HYDROXYACID DEHYDROGENASES (D2-HDH) FROM HALOFERAX MEDITERRANEI IN COMPLEX WITH 2-KETO-HEXANOIC ACID AND NADP+ (1.4 A RESOLUTION)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`260`	`63`	`14888`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`263`	`63`	`14762`	`2520.5`	`-24.4`	`0.027`	`49`	`16`	`0`	`0.243`
2	`2`		[NAP]B:410	`46`	`1`	`927`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`92`	`36`	`14888`	`648.6`	`-1.9`	`0.505`	`16`	`0`	`0`	`0.107`
	`3`		[NAP]A:414	`47`	`1`	`929`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`94`	`37`	`14762`	`645.1`	`-1.7`	`0.527`	`15`	`0`	`0`	`0.107`
	*Average:*													`646.8`	`-1.8`	`0.516`	`16`	`0`	`0`	`0.107`
3	`4`		B	`59`	`16`	`14888`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`59`	`16`	`14762`	`454.6`	`-3.0`	`0.387`	`4`	`2`	`0`	`0.031`
4	`5`		A	`37`	`11`	`14762`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`33`	`11`	`14888`	`286.8`	`-3.3`	`0.237`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`27`	`9`	`14762`	`x`	A	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`26`	`9`	`14762`	`218.1`	`1.3`	`0.754`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		B	`18`	`4`	`14888`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`21`	`7`	`14888`	`191.4`	`-2.6`	`0.207`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
7	`8`		[7N5]A:413	`9`	`1`	`296`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`41`	`14`	`14762`	`180.5`	`4.3`	`0.349`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[7N5]B:409	`9`	`1`	`295`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`38`	`13`	`14888`	`178.7`	`4.3`	`0.337`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`179.6`	`4.3`	`0.343`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		B	`11`	`2`	`14888`	`x`	B	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`10`	`5`	`14888`	`106.0`	`0.4`	`0.673`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
9	`11`		B	`14`	`3`	`14888`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`9`	`2`	`14762`	`90.8`	`-0.8`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		[SO4]B:411	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`14888`	`72.9`	`-9.0`	`0.962`	`3`	`0`	`0`	`0.064`
11	`13`		[SO4]A:415	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14762`	`67.9`	`-8.3`	`0.954`	`3`	`0`	`0`	`0.059`
12	`14`		[NAP]A:414	`9`	`1`	`929`	`f`	[7N5]A:413	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`296`	`67.9`	`0.8`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[NAP]B:410	`8`	`1`	`927`	`f`	[7N5]B:409	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`295`	`67.5`	`0.9`	`0.643`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`67.7`	`0.9`	`0.646`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[MG]A:410	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14762`	`52.8`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
	`17`		[MG]B:405	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14888`	`52.0`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
	*Average:*													`52.4`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
14	`18`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`14888`	`52.7`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
15	`19`		[MG]B:406	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`14888`	`50.0`	`-7.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.092`
	`20`		[MG]A:404	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`14762`	`49.6`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.092`
	*Average:*													`49.8`	`-7.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.092`
16	`21`		[MG]B:408	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`14888`	`46.3`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
	`22`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14762`	`43.8`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
	*Average:*													`45.1`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
17	`23`		B	`10`	`5`	`14888`	`f`	[MG]A:405	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`98`	`45.4`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
18	`24`		[MG]B:407	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`14888`	`43.3`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
	`25`		A	`10`	`5`	`14762`	`f`	[MG]A:407	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`98`	`39.8`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
	*Average:*													`41.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
19	`26`		A	`6`	`1`	`14762`	`◊`	[SO4]A:415	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`4`	`1`	`186`	`39.1`	`-5.0`	`0.721`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		[MG]A:409	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`14762`	`38.3`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
	`28`		B	`9`	`4`	`14888`	`f`	[MG]A:401	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`98`	`37.3`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
	*Average:*													`37.8`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
21	`29`		[MG]B:403	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14888`	`36.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
22	`30`		[MG]B:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14762`	`36.5`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
	`31`		[MG]A:416	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14888`	`30.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
	*Average:*													`33.5`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
23	`32`		[MG]A:408	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`14762`	`34.3`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
24	`33`		[MG]B:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14888`	`34.2`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`34`		[MG]A:416	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`14762`	`29.6`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	*Average:*													`31.9`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
25	`35`		[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`14762`	`33.2`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`36`		B	`7`	`5`	`14888`	`◊`	[MG]A:409	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`98`	`33.1`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`33.2`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
26	`37`		A	`2`	`1`	`14762`	`◊`	[MG]A:408	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`98`	`32.8`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`38`		[MG]A:411	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`14762`	`32.4`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
28	`39`		[NAP]A:414	`8`	`1`	`929`	`f`	[MG]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.8`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	`40`		[NAP]B:410	`6`	`1`	`927`	`f`	[MG]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.5`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`30.1`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
29	`41`		[MG]A:405	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`14762`	`30.5`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
30	`42`		[MG]A:412	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`14762`	`24.5`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
31	`43`		[MG]A:406	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14762`	`23.5`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
32	`44`		[MG]A:407	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14762`	`22.3`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`45`		[MG]A:416	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`6`	`2`	`14762`	`20.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`46`		A	`3`	`2`	`14762`	`◊`	[MG]A:412	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`98`	`19.9`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		B	`4`	`1`	`14888`	`◊`	[MG]A:412	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`98`	`15.5`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`17.7`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`48`		[MG]B:403	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`14762`	`17.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
36	`49`		[MG]A:416	`1`	`1`	`98`	`◊`	[SO4]A:415	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`3`	`1`	`186`	`16.6`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`50`		[MG]A:405	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`8.4`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
38	`51`		A	`3`	`1`	`14762`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`1`	`1`	`14888`	`7.5`	`0.2`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`52`		[SO4]A:415	`1`	`1`	`186`	`f`	[NAP]A:414	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`929`	`7.3`	`-0.8`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
40	`53`		[SO4]B:411	`1`	`1`	`186`	`f`	[NAP]B:410	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`927`	`5.1`	`-0.5`	`0.672`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
41	`54`		[MG]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14888`	`4.0`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`55`		[MG]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`14762`	`4.0`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`4.0`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
42	`56`		B	`2`	`1`	`14888`	`◊`	[SO4]A:415	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`186`	`2.5`	`-0.2`	`0.848`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`57`		[MG]A:406	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`1`	`1`	`14762`	`0.4`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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