PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=731-D8-66C)

Interfaces in PDB 5mhk crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.28 Å

ICP4 DNA-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH 19MER DNA DUPLEX FROM ITS OWN PROMOTER

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`339`	`79`	`12317`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`341`	`85`	`11784`	`3213.6`	`-43.1`	`0.101`	`34`	`8`	`0`	`0.517`
	`2`		B	`321`	`73`	`12603`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`330`	`79`	`11177`	`3053.3`	`-40.5`	`0.083`	`29`	`8`	`0`	`0.517`
	*Average:*													`3133.5`	`-41.8`	`0.092`	`32`	`8`	`0`	`0.517`
2	`3`		H	`91`	`18`	`4188`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`85`	`19`	`4467`	`838.5`	`-11.7`	`0.631`	`46`	`0`	`0`	`0.870`
3	`4`		E	`73`	`15`	`3608`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`72`	`16`	`3716`	`703.1`	`-7.9`	`0.680`	`42`	`0`	`0`	`1.000`
4	`5`		A	`48`	`17`	`11177`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`51`	`16`	`11784`	`462.1`	`-1.4`	`0.706`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
5	`6`		G	`55`	`12`	`4467`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`14`	`11784`	`435.5`	`-2.0`	`0.789`	`4`	`0`	`0`	`0.021`
6	`7`		H	`44`	`5`	`4188`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`44`	`14`	`11784`	`376.5`	`-4.6`	`0.509`	`6`	`0`	`0`	`0.131`
	`8`		F	`44`	`5`	`3716`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`40`	`11`	`11177`	`358.7`	`-4.0`	`0.550`	`7`	`0`	`0`	`0.131`
	*Average:*													`367.6`	`-4.3`	`0.530`	`7`	`0`	`0`	`0.131`
7	`9`		D	`38`	`11`	`12317`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`40`	`9`	`11177`	`344.2`	`-3.8`	`0.422`	`4`	`0`	`0`	`0.020`
8	`10`		E	`43`	`11`	`3608`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`40`	`12`	`11177`	`323.5`	`-4.1`	`0.639`	`3`	`0`	`0`	`0.032`
9	`11`		G	`40`	`9`	`4467`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`32`	`9`	`12317`	`317.6`	`-2.8`	`0.708`	`6`	`0`	`0`	`0.086`
10	`12`		H	`34`	`5`	`4188`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`36`	`10`	`12317`	`306.8`	`-4.6`	`0.493`	`7`	`0`	`0`	`0.121`
11	`13`		F	`37`	`5`	`3716`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`8`	`12603`	`298.5`	`-2.3`	`0.632`	`8`	`0`	`0`	`0.045`
12	`14`		C	`28`	`8`	`11784`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`30`	`8`	`11177`	`278.7`	`-4.3`	`0.299`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		E	`36`	`10`	`3608`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`12603`	`265.3`	`-2.6`	`0.681`	`5`	`0`	`0`	`0.029`
14	`16`		G	`28`	`2`	`4467`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`11`	`11177`	`261.9`	`0.3`	`0.751`	`4`	`0`	`0`	`0.004`
15	`17`		B	`18`	`7`	`12603`	`x`	B	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`33`	`13`	`12603`	`186.3`	`-3.7`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		D	`22`	`8`	`12317`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`12603`	`166.9`	`-1.6`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
17	`19`		H	`21`	`3`	`4188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`11177`	`158.7`	`0.5`	`0.727`	`3`	`0`	`0`	`0.003`
18	`20`		F	`19`	`3`	`3716`	`◊`	B	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`25`	`8`	`12603`	`147.5`	`0.3`	`0.682`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		G	`20`	`3`	`4467`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`13`	`2`	`459`	`140.0`	`-0.8`	`0.795`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		H	`16`	`2`	`4188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`12603`	`116.2`	`1.5`	`0.727`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		[SO4]A:502	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`11177`	`116.0`	`-17.7`	`0.717`	`3`	`0`	`0`	`0.166`
22	`24`		[SO4]C:503	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`11784`	`114.7`	`-17.9`	`0.737`	`3`	`0`	`0`	`0.348`
23	`25`		G	`17`	`1`	`4467`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`12603`	`106.6`	`1.0`	`0.794`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		E	`13`	`1`	`3608`	`◊`	B	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`14`	`4`	`12603`	`102.3`	`-0.3`	`0.530`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		[SO4]C:502	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`11784`	`91.5`	`-12.0`	`0.886`	`6`	`0`	`0`	`0.265`
26	`28`		[SO4]D:501	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`12317`	`87.7`	`-11.8`	`0.834`	`4`	`0`	`0`	`0.213`
27	`29`		[SO4]B:501	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`12603`	`86.8`	`-11.6`	`0.869`	`5`	`0`	`0`	`0.121`
28	`30`		[SO4]A:501	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`8`	`11177`	`85.1`	`-10.8`	`0.896`	`4`	`0`	`0`	`0.110`
29	`31`		H	`13`	`2`	`4188`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`459`	`76.7`	`-1.4`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[SO4]B:502	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`12603`	`63.5`	`-8.7`	`0.743`	`1`	`0`	`0`	`0.080`
31	`33`		C	`9`	`5`	`11784`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`9`	`4`	`12603`	`62.1`	`-0.2`	`0.521`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		D	`9`	`5`	`12317`	`x`	D	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`7`	`3`	`12317`	`61.1`	`-1.4`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[CL]C:501	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`11784`	`45.4`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
34	`36`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4188`	`37.3`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.130`
35	`37`		[SO4]B:502	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11177`	`37.0`	`-3.4`	`0.982`	`2`	`0`	`0`	`0.037`
36	`38`		B	`5`	`1`	`12603`	`◊`	F	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`4`	`1`	`3716`	`29.1`	`-0.2`	`0.549`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[CL]C:501	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`12317`	`28.8`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
38	`40`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11177`	`27.7`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
39	`41`		[SO4]C:503	`3`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`4188`	`21.7`	`-3.6`	`0.542`	`0`	`0`	`0`	`0.065`
40	`42`		[SO4]A:502	`2`	`1`	`186`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3716`	`20.4`	`-3.3`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
41	`43`		[SO4]B:501	`2`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12317`	`19.8`	`-2.2`	`0.936`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
42	`44`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12603`	`17.5`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
43	`45`		A	`2`	`1`	`11177`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`1`	`1`	`12603`	`12.1`	`-0.4`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		[SO4]A:501	`1`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`12603`	`8.3`	`-0.9`	`0.780`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
45	`47`		[SO4]C:502	`1`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12317`	`0.2`	`-0.0`	`0.813`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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