PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=615-75-PFJ)

Interfaces in PDB 5mkf

CRYOEM STRUCTURE OF POLYCYSTIN-2 IN COMPLEX WITH CALCIUM AND LIPIDS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`332`	`91`	`29825`	`◊`	B	`307`	`91`	`29814`	`3141.1`	`-48.6`	`0.283`	`22`	`2`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`335`	`93`	`29814`	`◊`	C	`311`	`93`	`29815`	`3113.7`	`-47.4`	`0.336`	`21`	`2`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`311`	`92`	`29825`	`◊`	D	`333`	`92`	`29829`	`3108.8`	`-47.4`	`0.338`	`21`	`2`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`333`	`92`	`29815`	`◊`	D	`310`	`92`	`29829`	`3106.1`	`-47.3`	`0.332`	`21`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`3117.4`	`-47.7`	`0.322`	`21`	`2`	`0`	`0.000`
2	`5`		B	`36`	`12`	`29814`	`◊`	[PX6]B:1006	`27`	`1`	`919`	`311.5`	`1.9`	`0.602`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`36`	`12`	`29825`	`◊`	[PX6]A:1006	`27`	`1`	`923`	`309.9`	`1.8`	`0.603`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		D	`36`	`12`	`29829`	`◊`	[PX6]D:1006	`27`	`1`	`920`	`308.8`	`1.9`	`0.605`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		C	`36`	`12`	`29815`	`◊`	[PX6]C:1006	`27`	`1`	`919`	`308.7`	`1.9`	`0.602`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`309.7`	`1.9`	`0.603`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
3	`9`		B	`35`	`11`	`29814`	`◊`	[PLM]B:1007	`15`	`1`	`534`	`217.7`	`-0.7`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		C	`34`	`11`	`29815`	`◊`	[PLM]C:1007	`15`	`1`	`532`	`214.8`	`-0.7`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		A	`32`	`11`	`29825`	`◊`	[PLM]A:1007	`14`	`1`	`528`	`214.8`	`-0.7`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		D	`36`	`11`	`29829`	`◊`	[PLM]D:1007	`15`	`1`	`534`	`214.8`	`-0.7`	`0.357`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`215.5`	`-0.7`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`13`		D	`28`	`9`	`29829`	`◊`	[PLM]D:1009	`17`	`1`	`552`	`170.8`	`-0.7`	`0.293`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		A	`28`	`9`	`29825`	`◊`	[PLM]A:1009	`17`	`1`	`550`	`170.5`	`-0.6`	`0.306`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		C	`28`	`9`	`29815`	`◊`	[PLM]C:1009	`17`	`1`	`554`	`170.4`	`-0.7`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		B	`25`	`8`	`29814`	`◊`	[PLM]B:1009	`17`	`1`	`555`	`166.0`	`-0.6`	`0.276`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`169.4`	`-0.6`	`0.292`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`17`		A	`25`	`8`	`29825`	`◊`	[PLM]D:1008	`16`	`1`	`551`	`168.3`	`-1.6`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`18`		B	`26`	`8`	`29814`	`◊`	[PLM]A:1008	`16`	`1`	`554`	`168.0`	`-1.3`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		C	`27`	`8`	`29815`	`◊`	[PLM]B:1008	`16`	`1`	`551`	`164.9`	`-1.3`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		D	`27`	`8`	`29829`	`◊`	[PLM]C:1008	`16`	`1`	`553`	`164.2`	`-1.3`	`0.258`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`165.7`	`-1.3`	`0.255`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`21`		A	`18`	`5`	`29825`	`◊`	[PX6]D:1006	`20`	`1`	`920`	`163.1`	`-1.1`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		C	`18`	`5`	`29815`	`◊`	[PX6]B:1006	`20`	`1`	`919`	`161.8`	`-1.1`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		D	`18`	`5`	`29829`	`◊`	[PX6]C:1006	`20`	`1`	`919`	`161.7`	`-1.1`	`0.279`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		B	`18`	`5`	`29814`	`◊`	[PX6]A:1006	`19`	`1`	`923`	`160.2`	`-1.1`	`0.287`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`161.7`	`-1.1`	`0.279`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`25`		A	`25`	`9`	`29825`	`◊`	[PLM]D:1007	`11`	`1`	`534`	`159.0`	`-2.1`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		C	`25`	`9`	`29815`	`◊`	[PLM]B:1007	`11`	`1`	`534`	`158.6`	`-2.1`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		D	`24`	`9`	`29829`	`◊`	[PLM]C:1007	`11`	`1`	`532`	`157.3`	`-2.1`	`0.232`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		B	`24`	`8`	`29814`	`◊`	[PLM]A:1007	`12`	`1`	`528`	`156.5`	`-2.0`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`157.8`	`-2.1`	`0.237`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`29`		C	`20`	`8`	`29815`	`◊`	[PLM]C:1008	`12`	`1`	`553`	`149.9`	`0.1`	`0.372`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		A	`19`	`8`	`29825`	`◊`	[PLM]A:1008	`12`	`1`	`554`	`148.8`	`0.1`	`0.358`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		B	`19`	`8`	`29814`	`◊`	[PLM]B:1008	`12`	`1`	`551`	`145.7`	`0.1`	`0.367`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`148.2`	`0.1`	`0.366`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`32`		D	`20`	`8`	`29829`	`◊`	[PLM]D:1008	`12`	`1`	`551`	`149.9`	`0.2`	`0.378`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`33`		D	`12`	`5`	`29829`	`c`	[NAG]D:1001	`11`	`1`	`363`	`130.4`	`2.3`	`0.286`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		C	`12`	`6`	`29815`	`c`	[NAG]C:1001	`11`	`1`	`363`	`129.9`	`2.3`	`0.286`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		B	`12`	`5`	`29814`	`c`	[NAG]B:1001	`11`	`1`	`362`	`129.3`	`2.3`	`0.308`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		A	`12`	`6`	`29825`	`c`	[NAG]A:1001	`11`	`1`	`362`	`129.1`	`2.3`	`0.285`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`129.7`	`2.3`	`0.291`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`37`		B	`13`	`7`	`29814`	`c`	[NAG]B:1002	`9`	`1`	`346`	`126.6`	`4.1`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		A	`15`	`7`	`29825`	`c`	[NAG]A:1002	`9`	`1`	`344`	`125.9`	`4.1`	`0.629`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		D	`14`	`7`	`29829`	`c`	[NAG]D:1002	`9`	`1`	`345`	`125.5`	`4.1`	`0.658`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		C	`15`	`7`	`29815`	`c`	[NAG]C:1002	`9`	`1`	`343`	`125.5`	`4.1`	`0.608`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`125.9`	`4.1`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`41`		D	`13`	`5`	`29829`	`c`	[NAG]D:1005	`11`	`1`	`364`	`114.0`	`3.0`	`0.425`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		A	`12`	`5`	`29825`	`◊`	[NAG]A:1005	`11`	`1`	`364`	`113.6`	`2.9`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		C	`12`	`5`	`29815`	`◊`	[NAG]C:1005	`11`	`1`	`365`	`113.4`	`2.9`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		B	`12`	`5`	`29814`	`◊`	[NAG]B:1005	`11`	`1`	`363`	`113.1`	`2.9`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`113.5`	`2.9`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`45`		C	`13`	`6`	`29815`	`c`	[NAG]C:1003	`9`	`1`	`360`	`107.4`	`3.6`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		D	`13`	`6`	`29829`	`c`	[NAG]D:1003	`9`	`1`	`357`	`107.4`	`3.7`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		B	`13`	`6`	`29814`	`c`	[NAG]B:1003	`9`	`1`	`358`	`107.1`	`3.7`	`0.563`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		A	`13`	`6`	`29825`	`c`	[NAG]A:1003	`9`	`1`	`357`	`105.7`	`3.7`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`106.9`	`3.7`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`49`		[PLM]A:1008	`14`	`1`	`554`	`◊`	[PLM]A:1009	`11`	`1`	`550`	`101.5`	`0.8`	`0.164`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[PLM]C:1008	`13`	`1`	`553`	`◊`	[PLM]C:1009	`11`	`1`	`554`	`101.4`	`0.8`	`0.167`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`101.4`	`0.8`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`51`		[PLM]B:1008	`14`	`1`	`551`	`◊`	[PLM]B:1009	`11`	`1`	`555`	`101.4`	`0.7`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`52`		[PLM]D:1008	`15`	`1`	`551`	`◊`	[PLM]D:1009	`10`	`1`	`552`	`95.6`	`0.7`	`0.153`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`53`		[NAG]C:1003	`7`	`1`	`360`	`c`	[NAG]C:1004	`9`	`1`	`359`	`83.4`	`2.6`	`0.121`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]D:1003	`7`	`1`	`357`	`c`	[NAG]D:1004	`9`	`1`	`358`	`83.2`	`2.6`	`0.109`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]B:1003	`6`	`1`	`358`	`c`	[NAG]B:1004	`9`	`1`	`359`	`83.0`	`2.6`	`0.131`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]A:1003	`6`	`1`	`357`	`c`	[NAG]A:1004	`9`	`1`	`360`	`82.6`	`2.6`	`0.134`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`83.1`	`2.6`	`0.124`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`57`		C	`9`	`1`	`29815`	`◊`	[PLM]D:1009	`6`	`1`	`552`	`72.9`	`0.6`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		A	`9`	`1`	`29825`	`◊`	[PLM]B:1009	`7`	`1`	`555`	`72.8`	`0.6`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		B	`9`	`1`	`29814`	`◊`	[PLM]C:1009	`6`	`1`	`554`	`72.8`	`0.6`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		D	`9`	`1`	`29829`	`◊`	[PLM]A:1009	`6`	`1`	`550`	`71.7`	`0.7`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.6`	`0.6`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`61`		[PX6]A:1006	`3`	`1`	`923`	`◊`	[PLM]A:1007	`4`	`1`	`528`	`29.4`	`-0.9`	`0.189`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[PX6]C:1006	`3`	`1`	`919`	`◊`	[PLM]C:1007	`4`	`1`	`532`	`29.3`	`-0.9`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[PX6]B:1006	`3`	`1`	`919`	`◊`	[PLM]B:1007	`4`	`1`	`534`	`28.9`	`-0.9`	`0.191`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		[PX6]D:1006	`3`	`1`	`920`	`◊`	[PLM]D:1007	`4`	`1`	`534`	`28.7`	`-0.9`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`29.1`	`-0.9`	`0.191`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`65`		D	`3`	`2`	`29829`	`◊`	[NAG]D:1004	`4`	`1`	`358`	`25.9`	`0.3`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		C	`3`	`2`	`29815`	`◊`	[NAG]C:1004	`5`	`1`	`359`	`25.7`	`0.3`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		A	`3`	`2`	`29825`	`◊`	[NAG]A:1004	`5`	`1`	`360`	`25.6`	`0.3`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		B	`3`	`2`	`29814`	`◊`	[NAG]B:1004	`4`	`1`	`359`	`25.2`	`0.3`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`25.6`	`0.3`	`0.283`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`69`		[PX6]A:1006	`4`	`1`	`923`	`◊`	[PLM]A:1008	`5`	`1`	`554`	`24.7`	`0.4`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[PX6]C:1006	`4`	`1`	`919`	`◊`	[PLM]C:1008	`5`	`1`	`553`	`23.8`	`0.4`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[PX6]B:1006	`4`	`1`	`919`	`◊`	[PLM]B:1008	`5`	`1`	`551`	`23.4`	`0.4`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`24.0`	`0.4`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`72`		[PX6]D:1006	`3`	`1`	`920`	`◊`	[PLM]D:1008	`4`	`1`	`551`	`22.3`	`0.3`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`73`		C	`1`	`1`	`29815`	`◊`	[CA]A:1012	`1`	`1`	`85`	`20.5`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`74`		A	`1`	`1`	`29825`	`◊`	[CA]A:1012	`1`	`1`	`85`	`20.4`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		B	`1`	`1`	`29814`	`◊`	[CA]A:1012	`1`	`1`	`85`	`20.3`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		D	`1`	`1`	`29829`	`◊`	[CA]A:1012	`1`	`1`	`85`	`20.3`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`20.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`77`		B	`2`	`2`	`29814`	`◊`	D	`2`	`2`	`29829`	`17.6`	`0.1`	`0.803`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`78`		A	`2`	`2`	`29825`	`◊`	C	`2`	`2`	`29815`	`16.7`	`0.1`	`0.795`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.2`	`0.1`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`79`		B	`3`	`2`	`29814`	`◊`	[CA]B:1012	`1`	`1`	`85`	`16.6`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		C	`3`	`2`	`29815`	`◊`	[CA]B:1012	`1`	`1`	`85`	`16.4`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`81`		A	`3`	`2`	`29825`	`◊`	[CA]B:1012	`1`	`1`	`85`	`16.2`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		D	`3`	`2`	`29829`	`◊`	[CA]B:1012	`1`	`1`	`85`	`16.2`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`16.4`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`83`		B	`2`	`2`	`29814`	`◊`	[CA]A:1015	`1`	`1`	`85`	`16.0`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		A	`2`	`2`	`29825`	`◊`	[CA]A:1015	`1`	`1`	`85`	`16.0`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`85`		C	`2`	`2`	`29815`	`◊`	[CA]A:1015	`1`	`1`	`85`	`15.6`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`86`		D	`2`	`2`	`29829`	`◊`	[CA]A:1015	`1`	`1`	`85`	`15.1`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`15.7`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`87`		D	`2`	`1`	`29829`	`◊`	[CA]A:1014	`1`	`1`	`85`	`14.2`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`88`		C	`2`	`1`	`29815`	`◊`	[CA]A:1014	`1`	`1`	`85`	`14.2`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`89`		B	`2`	`1`	`29814`	`◊`	[CA]A:1014	`1`	`1`	`85`	`13.8`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		A	`2`	`1`	`29825`	`◊`	[CA]A:1014	`1`	`1`	`85`	`13.7`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`13.9`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`91`		B	`2`	`1`	`29814`	`◊`	[CA]A:1013	`1`	`1`	`85`	`11.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		C	`2`	`1`	`29815`	`◊`	[CA]A:1013	`1`	`1`	`85`	`10.7`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`93`		A	`2`	`1`	`29825`	`◊`	[CA]A:1013	`1`	`1`	`85`	`10.6`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`94`		D	`2`	`1`	`29829`	`◊`	[CA]A:1013	`1`	`1`	`85`	`10.5`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`10.7`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`95`		[CA]A:1014	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]B:1012	`1`	`1`	`85`	`7.0`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`96`		[CA]A:1014	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]A:1015	`1`	`1`	`85`	`5.1`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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