PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=241-48-C2I)

Interfaces in PDB 5nwl crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 3.93 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN RAD51-ATP FILAMENT.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		M	`187`	`55`	`15702`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`171`	`42`	`15439`	`1735.8`	`-17.9`	`0.088`	`17`	`7`	`0`	`0.189`
	`2`		D	`180`	`53`	`15681`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`165`	`40`	`15352`	`1665.0`	`-17.8`	`0.082`	`16`	`7`	`0`	`0.189`
	`3`		F	`187`	`52`	`15613`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`165`	`40`	`15587`	`1653.6`	`-17.7`	`0.073`	`15`	`8`	`0`	`0.189`
	`4`		K	`182`	`51`	`15724`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`163`	`38`	`15577`	`1639.5`	`-18.7`	`0.053`	`17`	`7`	`0`	`0.189`
	*Average:*													`1673.5`	`-18.0`	`0.074`	`16`	`7`	`0`	`0.189`
2	`5`		N	`172`	`50`	`15647`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`156`	`39`	`15702`	`1517.1`	`-15.9`	`0.093`	`15`	`6`	`0`	`0.306`
	`6`		G	`171`	`47`	`15704`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`155`	`35`	`15613`	`1494.1`	`-16.1`	`0.097`	`11`	`5`	`0`	`0.306`
	`7`		B	`167`	`48`	`15618`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`153`	`38`	`15673`	`1479.3`	`-15.6`	`0.113`	`13`	`5`	`0`	`0.306`
	`8`		I	`174`	`47`	`15640`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`154`	`37`	`15583`	`1467.6`	`-14.7`	`0.133`	`13`	`5`	`0`	`0.306`
	`9`		E	`165`	`47`	`15587`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`152`	`37`	`15681`	`1466.6`	`-15.0`	`0.119`	`12`	`4`	`0`	`0.306`
	`10`		C	`157`	`47`	`15352`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`151`	`37`	`15618`	`1427.5`	`-15.7`	`0.113`	`13`	`4`	`0`	`0.306`
	`11`		L	`163`	`47`	`15439`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`146`	`36`	`15724`	`1424.3`	`-15.1`	`0.108`	`13`	`6`	`0`	`0.306`
	`12`		J	`155`	`46`	`15577`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`148`	`38`	`15640`	`1351.2`	`-13.8`	`0.146`	`11`	`3`	`0`	`0.306`
	*Average:*													`1453.5`	`-15.2`	`0.115`	`13`	`5`	`0`	`0.306`
3	`13`		N	`147`	`36`	`15647`	`◊`	H	x,y-1,z	`1_545`	`160`	`46`	`15583`	`1456.5`	`-17.1`	`0.064`	`11`	`2`	`0`	`0.354`
	`14`		G	`134`	`33`	`15704`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`145`	`41`	`15673`	`1289.7`	`-16.4`	`0.062`	`11`	`3`	`0`	`0.354`
	*Average:*													`1373.1`	`-16.7`	`0.063`	`11`	`3`	`0`	`0.354`
4	`15`		K	`47`	`18`	`15724`	`◊`	I	-x+3,y-1/2,-z+3	`2_848`	`54`	`18`	`15640`	`469.1`	`0.9`	`0.690`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		K	`56`	`16`	`15724`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`47`	`19`	`15681`	`445.3`	`0.3`	`0.660`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		F	`56`	`15`	`15613`	`◊`	A	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`49`	`17`	`15673`	`434.6`	`0.2`	`0.663`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`18`		M	`45`	`17`	`15702`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`47`	`15`	`15618`	`418.9`	`0.6`	`0.667`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		F	`45`	`18`	`15613`	`◊`	M	x-1,y,z	`1_455`	`55`	`15`	`15702`	`418.3`	`0.3`	`0.671`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		D	`50`	`14`	`15681`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`44`	`17`	`15583`	`414.9`	`0.6`	`0.695`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`433.5`	`0.5`	`0.674`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`21`		[ATP]A:402	`30`	`1`	`644`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`16`	`15673`	`358.8`	`-3.8`	`0.508`	`15`	`0`	`0`	`0.336`
	`22`		[ATP]E:402	`30`	`1`	`640`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`50`	`15`	`15587`	`341.9`	`-3.1`	`0.536`	`15`	`0`	`0`	`0.336`
	`23`		[ATP]C:402	`30`	`1`	`640`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`52`	`17`	`15352`	`335.8`	`-3.4`	`0.517`	`13`	`0`	`0`	`0.336`
	`24`		[ATP]N:402	`30`	`1`	`643`	`f`	N	x,y,z	`1_555`	`49`	`15`	`15647`	`332.0`	`-3.0`	`0.538`	`14`	`0`	`0`	`0.336`
	`25`		[ATP]I:402	`30`	`1`	`643`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`49`	`16`	`15640`	`331.9`	`-3.0`	`0.542`	`14`	`0`	`0`	`0.336`
	`26`		[ATP]F:402	`30`	`1`	`644`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`49`	`16`	`15613`	`331.8`	`-3.3`	`0.512`	`17`	`0`	`0`	`0.336`
	`27`		[ATP]L:402	`29`	`1`	`640`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`49`	`17`	`15439`	`331.5`	`-4.0`	`0.490`	`16`	`0`	`0`	`0.336`
	`28`		[ATP]G:402	`30`	`1`	`645`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`50`	`16`	`15704`	`331.0`	`-3.1`	`0.536`	`16`	`0`	`0`	`0.336`
	`29`		[ATP]M:402	`30`	`1`	`642`	`f`	M	x,y,z	`1_555`	`49`	`17`	`15702`	`329.8`	`-3.5`	`0.502`	`14`	`0`	`0`	`0.336`
	`30`		[ATP]B:402	`30`	`1`	`641`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`49`	`16`	`15618`	`329.8`	`-3.8`	`0.496`	`16`	`0`	`0`	`0.336`
	`31`		[ATP]D:402	`30`	`1`	`644`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`51`	`16`	`15681`	`328.8`	`-3.4`	`0.513`	`15`	`0`	`0`	`0.336`
	*Average:*													`334.8`	`-3.4`	`0.517`	`15`	`0`	`0`	`0.336`
6	`32`		[ATP]H:402	`30`	`1`	`643`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`46`	`17`	`15583`	`353.3`	`-3.4`	`0.519`	`19`	`0`	`0`	`0.189`
7	`33`		[ATP]J:402	`30`	`1`	`642`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`46`	`16`	`15577`	`340.9`	`-3.1`	`0.523`	`14`	`0`	`0`	`0.070`
	`34`		[ATP]K:402	`30`	`1`	`640`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`49`	`17`	`15724`	`331.2`	`-3.5`	`0.500`	`16`	`0`	`0`	`0.070`
	*Average:*													`336.1`	`-3.3`	`0.511`	`15`	`0`	`0`	`0.070`
8	`35`		G	`21`	`9`	`15704`	`x`	G	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`29`	`8`	`15704`	`244.6`	`0.6`	`0.699`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		E	`24`	`6`	`15587`	`x`	N	x-1,y+1,z	`1_465`	`17`	`8`	`15647`	`226.7`	`1.6`	`0.789`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		J	`17`	`8`	`15577`	`x`	J	-x+3,y-1/2,-z+3	`2_848`	`28`	`7`	`15577`	`216.5`	`1.4`	`0.774`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		L	`27`	`7`	`15439`	`x`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`15352`	`207.6`	`1.1`	`0.746`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		L	`16`	`7`	`15439`	`x`	C	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`6`	`15352`	`191.1`	`0.6`	`0.673`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`40`		E	`14`	`7`	`15587`	`x`	N	x-1,y,z	`1_455`	`23`	`6`	`15647`	`162.6`	`1.0`	`0.745`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`208.2`	`1.1`	`0.738`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`41`		[ATP]K:402	`22`	`1`	`640`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`33`	`10`	`15577`	`213.6`	`-0.3`	`0.625`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`42`		[ATP]D:402	`22`	`1`	`644`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`15352`	`211.9`	`-0.0`	`0.644`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`43`		[ATP]N:402	`23`	`1`	`643`	`◊`	M	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`15702`	`211.9`	`0.3`	`0.668`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`44`		[ATP]L:402	`22`	`1`	`640`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`33`	`10`	`15724`	`211.5`	`0.5`	`0.682`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`45`		[ATP]M:402	`22`	`1`	`642`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`37`	`11`	`15439`	`211.4`	`-0.2`	`0.645`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`46`		[ATP]F:402	`22`	`1`	`644`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`35`	`10`	`15587`	`209.5`	`-0.2`	`0.640`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`47`		[ATP]B:402	`22`	`1`	`641`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`15673`	`209.2`	`-0.1`	`0.646`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`48`		[ATP]I:402	`22`	`1`	`643`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`15583`	`207.2`	`0.0`	`0.655`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`49`		[ATP]G:402	`22`	`1`	`645`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`15613`	`205.6`	`0.5`	`0.668`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`50`		[ATP]C:402	`22`	`1`	`640`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`33`	`10`	`15618`	`205.0`	`0.2`	`0.659`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`51`		[ATP]E:402	`22`	`1`	`640`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`32`	`10`	`15681`	`196.7`	`0.5`	`0.680`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	`52`		[ATP]J:402	`22`	`1`	`642`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`31`	`10`	`15640`	`196.2`	`0.1`	`0.668`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`207.5`	`0.1`	`0.657`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
10	`53`		K	`29`	`10`	`15724`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`11`	`15352`	`201.7`	`1.3`	`0.753`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		L	`27`	`11`	`15439`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`28`	`10`	`15618`	`196.3`	`0.4`	`0.682`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		E	`26`	`11`	`15587`	`◊`	M	x-1,y,z	`1_455`	`25`	`9`	`15702`	`191.6`	`0.7`	`0.703`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		J	`21`	`10`	`15577`	`◊`	I	-x+3,y-1/2,-z+3	`2_848`	`24`	`9`	`15640`	`156.3`	`1.4`	`0.765`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		D	`20`	`7`	`15681`	`◊`	N	x-1,y+1,z	`1_465`	`19`	`8`	`15647`	`142.0`	`0.9`	`0.707`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`177.6`	`0.9`	`0.722`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`58`		N	`29`	`10`	`15647`	`◊`	[ATP]H:402	x,y-1,z	`1_545`	`15`	`1`	`643`	`141.6`	`1.4`	`0.711`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		G	`13`	`7`	`15704`	`◊`	[ATP]A:402	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`1`	`644`	`80.8`	`1.8`	`0.758`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`111.2`	`1.6`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`60`		G	`17`	`7`	`15704`	`◊`	F	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`24`	`10`	`15613`	`137.2`	`0.6`	`0.702`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`61`		[MG]F:401	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15613`	`45.5`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`62`		[MG]G:401	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`15704`	`45.2`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`63`		[MG]B:401	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15618`	`45.1`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`64`		[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15673`	`42.6`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`65`		[MG]D:401	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`15681`	`42.5`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`66`		[MG]N:401	`1`	`1`	`98`	`f`	N	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`15647`	`42.5`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`67`		[MG]K:401	`1`	`1`	`98`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15724`	`42.4`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`68`		[MG]I:401	`1`	`1`	`98`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15640`	`42.4`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`69`		[MG]C:401	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`15352`	`42.2`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`70`		[MG]M:401	`1`	`1`	`98`	`f`	M	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`15702`	`41.2`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`71`		[MG]H:401	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`15583`	`41.2`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`72`		[MG]L:401	`1`	`1`	`98`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`15439`	`41.1`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`73`		[MG]E:401	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15587`	`40.6`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	`74`		[MG]J:401	`1`	`1`	`98`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15577`	`38.3`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
	*Average:*													`42.3`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
14	`75`		[ATP]H:402	`5`	`1`	`643`	`f`	[MG]H:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`35.6`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`76`		[ATP]J:402	`6`	`1`	`642`	`f`	[MG]J:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`35.2`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`77`		[ATP]E:402	`5`	`1`	`640`	`f`	[MG]E:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`34.5`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`78`		[ATP]A:402	`5`	`1`	`644`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`34.5`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`79`		[ATP]M:402	`5`	`1`	`642`	`f`	[MG]M:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`34.4`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`80`		[ATP]K:402	`5`	`1`	`640`	`f`	[MG]K:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`33.2`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`81`		[ATP]L:402	`5`	`1`	`640`	`f`	[MG]L:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.9`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`82`		[ATP]N:402	`4`	`1`	`643`	`f`	[MG]N:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.7`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`83`		[ATP]I:402	`3`	`1`	`643`	`f`	[MG]I:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`84`		[ATP]F:402	`4`	`1`	`644`	`f`	[MG]F:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.3`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`85`		[ATP]D:402	`6`	`1`	`644`	`f`	[MG]D:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.2`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`86`		[ATP]G:402	`4`	`1`	`645`	`f`	[MG]G:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.1`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`87`		[ATP]B:402	`5`	`1`	`641`	`f`	[MG]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.7`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`88`		[ATP]C:402	`4`	`1`	`640`	`f`	[MG]C:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	*Average:*													`33.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
15	`89`		G	`1`	`1`	`15704`	`◊`	[ATP]G:402	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`1`	`1`	`645`	`2.4`	`0.0`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		[ATP]E:402	`1`	`1`	`640`	`◊`	N	x-1,y+1,z	`1_465`	`1`	`1`	`15647`	`0.3`	`0.0`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1.3`	`0.0`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`91`		G	`1`	`1`	`15704`	`◊`	A	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`1`	`1`	`15673`	`1.8`	`0.0`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		K	`1`	`1`	`15724`	`◊`	J	-x+3,y-1/2,-z+3	`2_848`	`1`	`1`	`15577`	`1.3`	`-0.0`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`93`		E	`1`	`1`	`15587`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`15583`	`0.8`	`0.0`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1.3`	`0.0`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`94`		L	`1`	`1`	`15439`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15681`	`1.3`	`-0.0`	`0.608`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`95`		[MG]M:401	`1`	`1`	`98`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15439`	`0.4`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe