PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=447-G9-K0N)

Interfaces in PDB 5o05 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.00 Å

GII.10 VIETNAM 026 NOROVIRUS PROTRUDING DOMAIN IN COMPLEX WITH NANOBODY NANO-42

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`179`	`51`	`14009`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`185`	`50`	`13783`	`1732.6`	`-14.5`	`0.598`	`25`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		C	`75`	`19`	`6201`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`76`	`26`	`14009`	`669.1`	`-3.9`	`0.570`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`70`	`20`	`13783`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`68`	`22`	`6006`	`624.1`	`-8.5`	`0.348`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		B	`70`	`20`	`14009`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`69`	`22`	`6201`	`624.1`	`-8.3`	`0.318`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`624.1`	`-8.4`	`0.333`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		A	`49`	`13`	`13783`	`◊`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`53`	`14`	`14009`	`456.3`	`-4.4`	`0.534`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		D	`38`	`12`	`6006`	`◊`	C	-x-1/2,-y-1,z-1/2	`2_444`	`35`	`15`	`6201`	`335.2`	`-0.3`	`0.796`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		B	`27`	`8`	`14009`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`34`	`9`	`6006`	`289.7`	`-2.9`	`0.282`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		D	`34`	`11`	`6006`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`26`	`9`	`6201`	`254.6`	`0.5`	`0.837`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[EDO]A:611	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`13783`	`128.4`	`3.3`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[EDO]A:613	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`13783`	`112.5`	`3.5`	`0.507`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[EDO]D:201	`4`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`6006`	`110.9`	`3.7`	`0.533`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		[EDO]A:608	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`13783`	`110.8`	`3.6`	`0.515`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[EDO]B:606	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`14009`	`108.9`	`3.5`	`0.503`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[EDO]A:607	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`13783`	`107.7`	`2.2`	`0.434`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[EDO]B:602	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`14009`	`106.3`	`2.2`	`0.424`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[EDO]A:601	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`13783`	`105.5`	`2.9`	`0.489`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		[EDO]A:602	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`13783`	`105.5`	`2.0`	`0.254`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		[EDO]B:611	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14009`	`105.4`	`3.0`	`0.510`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		[EDO]B:601	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`14009`	`105.0`	`2.0`	`0.257`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		[EDO]B:603	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`14009`	`103.2`	`3.2`	`0.474`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[EDO]B:614	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`14009`	`102.6`	`2.1`	`0.442`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[EDO]A:612	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13783`	`102.4`	`3.1`	`0.514`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		B	`4`	`1`	`14009`	`x`	B	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`16`	`6`	`14009`	`102.0`	`-1.8`	`0.067`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		A	`11`	`6`	`13783`	`x`	A	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`4`	`1`	`13783`	`84.2`	`-1.6`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`93.1`	`-1.7`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		[EDO]B:618	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`14009`	`101.7`	`2.0`	`0.254`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		[EDO]A:615	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`13783`	`100.4`	`3.0`	`0.493`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		[EDO]C:201	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`6201`	`89.2`	`2.6`	`0.509`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[EDO]B:619	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`14009`	`88.3`	`2.4`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[EDO]B:612	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`6201`	`85.4`	`1.9`	`0.256`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		[EDO]D:202	`4`	`1`	`183`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`6006`	`84.3`	`2.1`	`0.272`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[EDO]B:610	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`14009`	`82.7`	`1.9`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[EDO]B:604	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13783`	`82.4`	`2.1`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[EDO]B:609	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`14009`	`79.2`	`2.9`	`0.323`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[EDO]A:603	`4`	`1`	`181`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`13783`	`78.3`	`0.9`	`0.206`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[EDO]A:603	`4`	`1`	`181`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`14009`	`78.0`	`1.6`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[EDO]A:609	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`13783`	`76.9`	`2.7`	`0.318`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[EDO]B:616	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`14009`	`76.6`	`2.5`	`0.318`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[EDO]B:613	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`14009`	`74.7`	`2.9`	`0.585`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[EDO]A:614	`4`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13783`	`73.8`	`2.8`	`0.343`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		C	`11`	`3`	`6201`	`◊`	[EDO]B:617	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`4`	`1`	`184`	`73.5`	`2.4`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[EDO]A:606	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13783`	`72.4`	`1.9`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[EDO]B:605	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`14009`	`72.1`	`2.2`	`0.527`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		[EDO]B:607	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`14009`	`71.9`	`2.0`	`0.313`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		[EDO]B:617	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`14009`	`69.8`	`1.1`	`0.773`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		[EDO]B:615	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`14009`	`69.8`	`2.1`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		[EDO]A:616	`3`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`14009`	`68.8`	`2.1`	`0.281`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		[EDO]A:605	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13783`	`68.6`	`2.0`	`0.282`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[EDO]A:604	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`13783`	`67.5`	`2.0`	`0.546`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
47	`49`		[EDO]B:620	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`14009`	`66.2`	`1.6`	`0.799`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		[EDO]B:607	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13783`	`65.6`	`1.9`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		[EDO]A:606	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`14009`	`64.2`	`2.1`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`52`		[EDO]B:610	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`13783`	`62.2`	`0.8`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`53`		B	`6`	`2`	`14009`	`f`	[EDO]B:608	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`4`	`1`	`185`	`61.2`	`1.0`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`54`		[EDO]C:201	`4`	`1`	`184`	`f`	B	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`5`	`3`	`14009`	`57.4`	`1.1`	`0.620`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`55`		[EDO]A:616	`3`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`13783`	`56.9`	`1.5`	`0.303`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
54	`56`		[EDO]A:605	`3`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14009`	`56.8`	`1.5`	`0.308`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
55	`57`		[EDO]B:608	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`14009`	`52.5`	`1.0`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`58`		[EDO]B:605	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`13783`	`46.8`	`1.0`	`0.928`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		[EDO]B:612	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14009`	`44.4`	`1.6`	`0.972`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
58	`60`		[EDO]A:604	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`14009`	`44.3`	`1.7`	`0.934`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`61`		[EDO]D:202	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`13783`	`43.7`	`1.5`	`0.977`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
60	`62`		[EDO]A:610	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`13783`	`41.9`	`0.2`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`63`		[EDO]B:619	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`6201`	`41.2`	`0.2`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`64`		[EDO]B:613	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`13783`	`39.8`	`1.1`	`0.836`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`65`		[EDO]A:610	`2`	`1`	`185`	`◊`	A	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`4`	`1`	`13783`	`38.3`	`0.8`	`0.726`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		[EDO]B:602	`3`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`13783`	`35.4`	`0.4`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`67`		[EDO]B:620	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`13783`	`35.3`	`1.6`	`0.951`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`68`		[EDO]B:615	`2`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`13783`	`32.6`	`0.5`	`0.335`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		[EDO]B:604	`2`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14009`	`32.4`	`0.8`	`0.906`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
68	`70`		[EDO]B:620	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:606	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`182`	`31.6`	`1.3`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
69	`71`		[EDO]A:607	`3`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14009`	`31.3`	`0.5`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`72`		[EDO]B:614	`3`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:607	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`30.6`	`1.1`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
71	`73`		[EDO]B:605	`4`	`1`	`186`	`f`	[EDO]A:604	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`183`	`29.6`	`1.4`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
72	`74`		[EDO]B:613	`3`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:604	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`27.1`	`1.1`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
73	`75`		[EDO]B:609	`3`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`13783`	`26.5`	`0.5`	`0.896`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`76`		[EDO]A:609	`2`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`14009`	`26.4`	`0.6`	`0.905`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`77`		[EDO]A:614	`2`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14009`	`26.3`	`0.1`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`78`		[EDO]B:613	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:605	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`186`	`21.5`	`0.8`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`79`		[EDO]B:620	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:610	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`20.5`	`1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`80`		[EDO]B:604	`3`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:602	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`17.2`	`0.9`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`81`		[EDO]B:604	`1`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`14.9`	`0.7`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`82`		[EDO]B:614	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:602	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`12.5`	`0.5`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`83`		[EDO]B:610	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:607	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`6.0`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`84`		[EDO]B:614	`1`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`13783`	`5.5`	`-0.0`	`0.668`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`85`		A	`1`	`1`	`13783`	`x`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`13783`	`5.3`	`0.0`	`0.494`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`86`		A	`1`	`1`	`13783`	`f`	[EDO]A:616	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`1`	`1`	`184`	`4.7`	`0.1`	`0.559`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`87`		[EDO]B:620	`1`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:607	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`4.6`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
86	`88`		[EDO]B:619	`2`	`1`	`183`	`f`	[EDO]B:612	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`3.6`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
87	`89`		[EDO]A:602	`1`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14009`	`3.4`	`0.2`	`0.870`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
88	`90`		[EDO]B:601	`1`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13783`	`3.4`	`0.1`	`0.875`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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