PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=355-34-G54)

Interfaces in PDB 5o0o crystal.
Space symmetry group: P 41 21 2. Resolution: 2.20 Å

DEGLYCOSYLATED NOGO RECEPTOR WITH NATIVE DISULFIDE STRUCTURE 5

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		H	`99`	`23`	`14546`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`122`	`39`	`14865`	`1051.1`	`-5.7`	`0.200`	`9`	`5`	`0`	`0.000`
	`2`		F	`122`	`41`	`14513`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`89`	`22`	`14727`	`1019.1`	`-6.4`	`0.144`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
	`3`		G	`103`	`22`	`14670`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`117`	`35`	`14663`	`993.2`	`-6.6`	`0.164`	`7`	`5`	`0`	`0.000`
	`4`		D	`88`	`20`	`14767`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`110`	`34`	`14950`	`937.4`	`-5.5`	`0.130`	`7`	`7`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1000.2`	`-6.1`	`0.159`	`8`	`6`	`0`	`0.000`
2	`5`		D	`112`	`35`	`14767`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`101`	`25`	`14865`	`997.5`	`-4.8`	`0.154`	`4`	`8`	`0`	`0.000`
	`6`		E	`112`	`34`	`14727`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`100`	`24`	`14663`	`995.1`	`-2.8`	`0.212`	`8`	`7`	`0`	`0.000`
	`7`		H	`118`	`37`	`14546`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`100`	`22`	`14950`	`993.6`	`-8.3`	`0.078`	`3`	`5`	`0`	`0.000`
	`8`		G	`113`	`34`	`14670`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`95`	`22`	`14513`	`973.3`	`-4.8`	`0.245`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`989.9`	`-5.1`	`0.172`	`5`	`7`	`0`	`0.000`
3	`9`		E	`53`	`19`	`14727`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`61`	`19`	`14950`	`544.1`	`-2.5`	`0.381`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	`10`		F	`56`	`18`	`14513`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`51`	`19`	`14767`	`542.8`	`-2.4`	`0.400`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
	`11`		H	`52`	`19`	`14546`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`55`	`18`	`14663`	`541.2`	`-2.3`	`0.364`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
	`12`		G	`53`	`19`	`14670`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`18`	`14865`	`539.6`	`-2.2`	`0.395`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`541.9`	`-2.4`	`0.385`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
4	`13`		A	`44`	`12`	`14865`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+5/4	`5_546`	`38`	`11`	`14950`	`392.2`	`-4.6`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		H	`15`	`4`	`14546`	`◊`	F	-y+1/2,x+1/2,z+1/4	`3_555`	`11`	`6`	`14513`	`113.8`	`-0.8`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`253.0`	`-2.7`	`0.274`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`15`		D	`28`	`9`	`14767`	`◊`	C	-y+3/2,x+1/2,z+1/4	`3_655`	`38`	`12`	`14663`	`327.3`	`-3.0`	`0.238`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		G	`30`	`8`	`14670`	`◊`	E	x-1/2,-y+3/2,-z+3/4	`6_465`	`34`	`10`	`14727`	`303.1`	`-2.5`	`0.293`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`315.2`	`-2.8`	`0.266`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`17`		F	`25`	`9`	`14513`	`◊`	D	y,x,-z+1	`7_556`	`20`	`7`	`14767`	`202.2`	`-1.3`	`0.390`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		A	`25`	`9`	`14865`	`◊`	E	y-1,x,-z+1	`7_456`	`19`	`8`	`14727`	`200.1`	`-0.9`	`0.418`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		G	`21`	`7`	`14670`	`◊`	B	y-1,x,-z+1	`7_456`	`23`	`9`	`14950`	`193.4`	`-1.1`	`0.425`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`198.6`	`-1.1`	`0.411`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`20`		A	`20`	`6`	`14865`	`◊`	H	-x+1/2,y-1/2,-z+5/4	`5_546`	`24`	`6`	`14546`	`195.1`	`-2.4`	`0.226`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		B	`13`	`6`	`14950`	`◊`	C	-y+3/2,x+1/2,z+1/4	`3_655`	`7`	`3`	`14663`	`77.3`	`-0.5`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`136.2`	`-1.4`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`22`		D	`23`	`6`	`14767`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+5/4	`5_546`	`16`	`5`	`14950`	`179.4`	`-2.0`	`0.283`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`23`		H	`21`	`8`	`14546`	`◊`	C	y-1,x+1,-z+1	`7_466`	`22`	`8`	`14663`	`179.3`	`-0.4`	`0.506`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`24`		D	`16`	`4`	`14767`	`◊`	E	-y+3/2,x+1/2,z+1/4	`3_655`	`24`	`5`	`14727`	`157.8`	`-2.3`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		C	`13`	`4`	`14663`	`◊`	E	x-1/2,-y+3/2,-z+3/4	`6_465`	`8`	`1`	`14727`	`80.1`	`-0.0`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		H	`2`	`1`	`14546`	`◊`	G	-y+1/2,x+1/2,z+1/4	`3_555`	`2`	`1`	`14670`	`9.2`	`-0.3`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`82.4`	`-0.9`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`27`		[NAG]C:403	`11`	`1`	`358`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`14663`	`123.4`	`3.9`	`0.400`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`28`		[GOL]B:404	`6`	`1`	`222`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`14950`	`119.7`	`-0.9`	`0.399`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[GOL]A:405	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`5`	`14865`	`116.9`	`-1.0`	`0.406`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`118.3`	`-0.9`	`0.403`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`30`		[NAG]H:401	`8`	`1`	`361`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14546`	`113.8`	`3.4`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[NAG]G:401	`8`	`1`	`360`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14670`	`113.5`	`3.5`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[NAG]E:401	`8`	`1`	`360`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14727`	`113.3`	`3.5`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[NAG]D:401	`8`	`1`	`359`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14767`	`113.1`	`3.5`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`113.4`	`3.5`	`0.520`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`34`		[NAG]C:401	`7`	`1`	`362`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14663`	`113.0`	`3.4`	`0.560`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[NAG]A:401	`7`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14865`	`112.9`	`3.4`	`0.562`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		[NAG]F:401	`7`	`1`	`362`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`14513`	`112.9`	`3.4`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[NAG]B:401	`8`	`1`	`355`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14950`	`110.6`	`3.2`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`112.3`	`3.3`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`38`		[GOL]A:404	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`14865`	`111.3`	`0.1`	`0.579`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
16	`39`		[GOL]F:404	`6`	`1`	`219`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`14513`	`111.3`	`-0.5`	`0.533`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`40`		[GOL]H:404	`6`	`1`	`220`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`14546`	`110.0`	`-0.2`	`0.521`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[GOL]D:404	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`14767`	`109.0`	`-0.6`	`0.474`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`109.5`	`-0.4`	`0.497`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`42`		[NAG]C:402	`9`	`1`	`360`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`14663`	`104.8`	`3.2`	`0.442`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[NAG]E:402	`8`	`1`	`360`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`14727`	`102.1`	`2.9`	`0.481`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		[NAG]A:402	`8`	`1`	`356`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`14865`	`97.8`	`2.5`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`101.6`	`2.9`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`45`		[NAG]B:402	`9`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14950`	`104.4`	`2.7`	`0.372`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`46`		[NAG]D:402	`8`	`1`	`364`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`14767`	`101.5`	`2.7`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[NAG]G:402	`9`	`1`	`364`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`14670`	`100.2`	`3.0`	`0.429`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[NAG]F:402	`10`	`1`	`364`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`14513`	`99.7`	`2.6`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`100.5`	`2.8`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`49`		[NAG]B:403	`11`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`14950`	`101.0`	`2.6`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`50`		[GOL]A:406	`6`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`14865`	`95.9`	`0.5`	`0.625`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`51`		[NAG]H:402	`8`	`1`	`354`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`14546`	`87.2`	`2.6`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`52`		[GOL]A:406	`5`	`1`	`220`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14546`	`85.0`	`-0.8`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`53`		[NAG]H:403	`10`	`1`	`363`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`14546`	`82.7`	`2.0`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]A:403	`10`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14865`	`78.3`	`2.0`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`80.5`	`2.0`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`55`		[NAG]E:403	`11`	`1`	`361`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`14727`	`81.2`	`2.0`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`56`		[NAG]F:403	`9`	`1`	`350`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14513`	`80.7`	`2.4`	`0.284`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`57`		[NAG]G:403	`10`	`1`	`357`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`14670`	`79.7`	`2.3`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`58`		[NAG]D:403	`8`	`1`	`360`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14767`	`75.1`	`2.1`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`59`		[GOL]A:405	`6`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`14767`	`73.6`	`1.2`	`0.711`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[GOL]B:404	`5`	`1`	`222`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`14546`	`66.7`	`1.1`	`0.672`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.1`	`1.1`	`0.691`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`61`		[NAG]D:402	`4`	`1`	`364`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`14865`	`56.8`	`1.6`	`0.542`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]E:402	`4`	`1`	`360`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`14663`	`55.7`	`1.5`	`0.533`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		[NAG]G:402	`4`	`1`	`364`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14513`	`51.6`	`1.6`	`0.530`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.7`	`1.6`	`0.535`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`64`		[NAG]H:402	`4`	`1`	`354`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14950`	`53.1`	`1.3`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`65`		[GOL]A:404	`4`	`1`	`220`	`f`	[NAG]A:403	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`49.7`	`0.5`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`66`		[GOL]D:404	`4`	`1`	`221`	`f`	[NAG]D:403	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`360`	`46.8`	`1.0`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`67`		[GOL]H:404	`3`	`1`	`220`	`f`	[NAG]H:403	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`46.7`	`0.8`	`0.306`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`68`		[GOL]F:404	`4`	`1`	`219`	`f`	[NAG]F:403	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`350`	`45.9`	`0.7`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`69`		[NAG]B:401	`6`	`1`	`355`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14727`	`30.4`	`0.5`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[NAG]C:401	`5`	`1`	`362`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14546`	`27.1`	`0.7`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[NAG]A:401	`5`	`1`	`361`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`14670`	`25.9`	`0.6`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		[NAG]F:401	`5`	`1`	`362`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`14767`	`23.4`	`0.6`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`26.7`	`0.6`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`73`		[NAG]A:402	`2`	`1`	`356`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14546`	`29.1`	`1.1`	`0.615`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`74`		B	`5`	`1`	`14950`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`14865`	`27.3`	`-0.3`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		F	`1`	`1`	`14513`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14663`	`3.2`	`-0.1`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`15.2`	`-0.2`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`76`		[NAG]C:402	`2`	`1`	`360`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14670`	`27.0`	`0.5`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`77`		[NAG]F:402	`2`	`1`	`364`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14727`	`22.0`	`0.8`	`0.547`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`24.5`	`0.6`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`78`		G	`2`	`1`	`14670`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`14727`	`20.0`	`-0.1`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`79`		H	`1`	`1`	`14546`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14767`	`9.4`	`-0.3`	`0.218`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`14.7`	`-0.2`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`80`		[NAG]B:402	`2`	`1`	`362`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`14767`	`19.6`	`0.8`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`81`		A	`3`	`3`	`14865`	`◊`	F	-y+1/2,x+1/2,z+1/4	`3_555`	`3`	`1`	`14513`	`13.5`	`-0.4`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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