PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=571-70-4CJ)

Interfaces in PDB 5qj6 crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.65 Å

PANDDA ANALYSIS GROUP DEPOSITION OF MODELS WITH MODELLED EVENTS (E.G. BOUND LIGANDS) -- CRYSTAL STRUCTURE OF NUDT5 IN COMPLEX WITH Z1614545742

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`311`	`76`	`11119`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`306`	`79`	`10969`	`3041.2`	`-48.1`	`0.045`	`27`	`12`	`0`	`0.615`
	`2`		D	`294`	`77`	`11147`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`296`	`76`	`10879`	`2937.8`	`-49.5`	`0.090`	`21`	`7`	`0`	`0.615`
	*Average:*													`2989.5`	`-48.8`	`0.068`	`24`	`10`	`0`	`0.615`
2	`3`		D	`71`	`17`	`11147`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`69`	`18`	`11119`	`521.3`	`-3.6`	`0.749`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`35`	`10`	`10879`	`◊`	A	x-1,y+1,z	`1_465`	`46`	`15`	`10969`	`379.5`	`-4.7`	`0.421`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`33`	`7`	`11147`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`8`	`10969`	`287.9`	`-3.3`	`0.531`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		B	`22`	`8`	`11119`	`◊`	D	x,y-1,z+1	`1_546`	`23`	`7`	`11147`	`224.9`	`-3.0`	`0.435`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
6	`7`		[GQJ]D:303	`13`	`1`	`407`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`12`	`11147`	`183.7`	`-4.2`	`0.780`	`1`	`0`	`0`	`0.056`
	`8`		[GQJ]B:304	`13`	`1`	`404`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`11`	`11119`	`179.6`	`-4.8`	`0.642`	`2`	`0`	`0`	`0.056`
	*Average:*													`181.7`	`-4.5`	`0.711`	`2`	`0`	`0`	`0.056`
7	`9`		D	`9`	`2`	`11147`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`9`	`10969`	`123.4`	`-0.9`	`0.311`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		C	`13`	`9`	`10879`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`2`	`11119`	`121.5`	`-1.1`	`0.251`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`122.4`	`-1.0`	`0.281`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		D	`12`	`5`	`11147`	`◊`	A	x-1,y+1,z-1	`1_464`	`14`	`7`	`10969`	`109.1`	`-2.2`	`0.379`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		B	`13`	`3`	`11119`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`3`	`10969`	`107.5`	`-1.5`	`0.465`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`13`		[EDO]C:304	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`10`	`10879`	`105.3`	`3.4`	`0.539`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[EDO]B:305	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`11119`	`102.8`	`3.2`	`0.499`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[EDO]A:303	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`10`	`10969`	`101.7`	`3.3`	`0.529`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`103.2`	`3.3`	`0.522`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[EDO]D:304	`4`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`11`	`11147`	`104.4`	`3.3`	`0.543`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[EDO]C:301	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`10879`	`102.0`	`3.6`	`0.579`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
13	`18`		[EDO]B:301	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`11119`	`87.4`	`2.1`	`0.303`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[GQJ]B:304	`13`	`1`	`404`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`10969`	`85.8`	`-0.4`	`0.886`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
	`20`		[GQJ]D:303	`12`	`1`	`407`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`10879`	`80.3`	`-0.9`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`83.1`	`-0.6`	`0.822`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
15	`21`		[MG]B:303	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`11119`	`53.4`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	`22`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`10969`	`48.4`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	`23`		[MG]C:302	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`10879`	`47.5`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	*Average:*													`49.7`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
16	`24`		[MG]B:302	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`11119`	`53.2`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.221`
	`25`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`10969`	`51.7`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.221`
	`26`		[MG]C:303	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`10879`	`50.5`	`-7.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.221`
	`27`		[MG]D:301	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`11147`	`47.2`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.221`
	`28`		[MG]D:302	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`11147`	`45.9`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.221`
	*Average:*													`49.7`	`-7.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.221`
17	`29`		B	`7`	`1`	`11119`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`2`	`11119`	`52.0`	`-0.3`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`30`		D	`8`	`3`	`11147`	`x`	D	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`2`	`11147`	`45.6`	`-0.5`	`0.608`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`31`		[EDO]A:303	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`11119`	`41.4`	`0.8`	`0.898`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	`32`		[EDO]B:305	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10969`	`40.2`	`0.8`	`0.897`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	`33`		[EDO]C:304	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11147`	`39.5`	`0.8`	`0.917`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`40.4`	`0.8`	`0.904`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
20	`34`		[EDO]D:304	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10879`	`40.4`	`0.8`	`0.931`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`35`		A	`5`	`2`	`10969`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`11119`	`37.7`	`-0.8`	`0.124`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`36`		D	`4`	`3`	`11147`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`4`	`10879`	`28.9`	`-0.5`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`37`		[MG]D:302	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]D:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`26.8`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
24	`38`		[MG]C:303	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]C:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.2`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
25	`39`		D	`2`	`1`	`11147`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`2`	`11119`	`19.4`	`-0.5`	`0.370`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`40`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`17.5`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
27	`41`		[MG]B:303	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
28	`42`		C	`1`	`1`	`10879`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`2`	`11119`	`14.0`	`-0.4`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`43`		C	`2`	`1`	`10879`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10969`	`3.7`	`-0.0`	`0.621`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe