PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=255-52-32E)

Interfaces in PDB 5qts crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.85 Å

PANDDA ANALYSIS GROUP DEPOSITION -- CRYSTAL STRUCTURE OF NUDT5 IN COMPLEX WITH 8J-537S

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`306`	`77`	`11386`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`301`	`75`	`10981`	`3004.5`	`-47.8`	`0.071`	`26`	`12`	`0`	`0.684`
	`2`		B	`311`	`79`	`11085`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`305`	`77`	`11107`	`2975.8`	`-47.2`	`0.040`	`26`	`14`	`0`	`0.684`
	*Average:*													`2990.2`	`-47.5`	`0.055`	`26`	`13`	`0`	`0.684`
2	`3`		D	`74`	`18`	`11386`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`69`	`14`	`11085`	`562.5`	`-4.4`	`0.676`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`35`	`10`	`10981`	`◊`	A	x-1,y+1,z	`1_465`	`46`	`15`	`11107`	`383.4`	`-4.8`	`0.393`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`37`	`7`	`11386`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`8`	`11107`	`292.4`	`-3.3`	`0.517`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		B	`25`	`8`	`11085`	`◊`	D	x,y-1,z+1	`1_546`	`25`	`9`	`11386`	`226.8`	`-2.2`	`0.518`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
6	`7`		[PWS]D:501	`14`	`1`	`369`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`11386`	`160.9`	`1.2`	`0.393`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
7	`8`		[PWS]A:308	`13`	`1`	`365`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`11107`	`159.6`	`1.1`	`0.401`	`4`	`0`	`0`	`0.007`
8	`9`		[PWS]C:304	`13`	`1`	`359`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`5`	`10981`	`157.8`	`0.8`	`0.412`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
	`10`		[PWS]A:304	`14`	`1`	`367`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`5`	`11085`	`149.1`	`0.8`	`0.380`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`153.4`	`0.8`	`0.396`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
9	`11`		[PWS]D:501	`14`	`1`	`369`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`5`	`10981`	`141.6`	`2.3`	`0.502`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		[PWS]C:304	`14`	`1`	`359`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`11386`	`140.4`	`2.4`	`0.498`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[PWS]A:308	`14`	`1`	`365`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`11085`	`139.2`	`2.4`	`0.478`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[PWS]A:304	`14`	`1`	`367`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11107`	`133.2`	`2.2`	`0.498`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`138.6`	`2.3`	`0.494`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		D	`9`	`2`	`11386`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`9`	`11107`	`123.7`	`-0.9`	`0.271`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		C	`12`	`8`	`10981`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`2`	`11085`	`120.8`	`-1.2`	`0.211`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`122.3`	`-1.0`	`0.241`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		B	`14`	`4`	`11085`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`3`	`11107`	`108.6`	`-1.9`	`0.404`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		D	`12`	`4`	`11386`	`◊`	A	x-1,y+1,z-1	`1_464`	`13`	`7`	`11107`	`107.3`	`-2.4`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		[EDO]D:504	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`10`	`11386`	`107.0`	`3.5`	`0.538`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		[EDO]C:305	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`11`	`10981`	`104.5`	`3.3`	`0.538`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		[EDO]C:301	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`10981`	`102.1`	`3.3`	`0.573`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`22`		[EDO]A:305	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`11`	`11107`	`101.3`	`3.2`	`0.527`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[EDO]B:304	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`9`	`11085`	`101.3`	`3.2`	`0.510`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[EDO]B:301	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`11085`	`88.3`	`2.1`	`0.302`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		[EDO]A:306	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`5`	`11107`	`87.9`	`2.1`	`0.286`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`26`		[CL]A:303	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`7`	`11085`	`55.3`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
21	`27`		B	`7`	`1`	`11085`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`3`	`11085`	`53.1`	`-0.3`	`0.603`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`28`		[MG]B:302	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`11085`	`52.0`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
	`29`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`11107`	`50.7`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
	`30`		[MG]C:303	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`10981`	`50.7`	`-7.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
	`31`		[MG]D:502	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`11386`	`48.1`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
	*Average:*													`50.4`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
23	`32`		[EDO]A:307	`2`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`11107`	`50.7`	`1.4`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		[MG]B:303	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`11085`	`48.6`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
	`34`		[MG]C:302	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`10981`	`48.3`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
	`35`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`11107`	`48.3`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
	`36`		[MG]D:503	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`5`	`11386`	`47.3`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
	*Average:*													`48.1`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
25	`37`		[EDO]A:305	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`11085`	`39.9`	`0.8`	`0.894`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	`38`		[EDO]B:304	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`11107`	`38.9`	`0.8`	`0.897`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`39.4`	`0.8`	`0.896`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
26	`39`		[EDO]A:307	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11085`	`39.7`	`0.7`	`0.771`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`40`		[EDO]D:504	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`10981`	`38.4`	`1.1`	`0.914`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`41`		A	`5`	`2`	`11107`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`11085`	`37.7`	`-0.8`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`42`		[EDO]C:305	`3`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`11386`	`37.1`	`0.8`	`0.921`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`43`		[EDO]A:307	`4`	`1`	`184`	`f`	[PWS]A:304	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`367`	`33.5`	`1.6`	`0.731`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`44`		D	`2`	`2`	`11386`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`3`	`10981`	`29.1`	`-0.5`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`45`		[CL]A:303	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`11107`	`25.2`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
33	`46`		D	`2`	`1`	`11386`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`11085`	`24.4`	`-0.6`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`47`		[MG]D:503	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]D:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.1`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
35	`48`		D	`5`	`1`	`11386`	`x`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`11386`	`23.4`	`-0.2`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`49`		[MG]C:303	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]C:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.3`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
37	`50`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`18.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
38	`51`		[MG]B:303	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`17.3`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
39	`52`		C	`2`	`2`	`10981`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`2`	`11085`	`10.1`	`-0.3`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`53`		C	`2`	`1`	`10981`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11107`	`7.1`	`-0.0`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`54`		A	`3`	`1`	`11107`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`11085`	`4.7`	`-0.1`	`0.486`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`55`		[EDO]B:304	`1`	`1`	`184`	`◊`	[PWS]A:304	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`367`	`0.5`	`0.0`	`0.598`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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