PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=574-EA-1HI)

Interfaces in PDB 5t9p crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.00 Å

STRUCTURAL ANALYSIS REVEALS THE FLEXIBLE C-TERMINUS OF NOP15 UNDERGOES REARRANGEMENT TO RECOGNIZE A PRE-RIBOSOMAL RNA FOLDING INTERMEDIATE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`91`	`22`	`6612`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`20`	`6183`	`772.1`	`0.3`	`0.539`	`9`	`9`	`0`	`0.045`
	`2`		D	`86`	`21`	`5684`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`90`	`22`	`6638`	`769.1`	`4.2`	`0.770`	`7`	`11`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`770.6`	`2.2`	`0.654`	`8`	`10`	`0`	`0.045`
2	`3`		C	`63`	`17`	`6638`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`48`	`15`	`6612`	`494.6`	`-1.7`	`0.390`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		B	`57`	`16`	`6612`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`47`	`13`	`6638`	`484.2`	`-2.5`	`0.353`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`489.4`	`-2.1`	`0.372`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
3	`5`		B	`25`	`10`	`6612`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`5`	`6612`	`205.7`	`1.6`	`0.633`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
4	`6`		B	`14`	`4`	`6612`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`13`	`5`	`6638`	`135.4`	`1.5`	`0.714`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		A	`12`	`4`	`6183`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`5`	`6183`	`134.7`	`0.2`	`0.585`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[SO4]B:205	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`6612`	`109.1`	`-15.6`	`0.822`	`7`	`0`	`0`	`0.166`
7	`9`		[SO4]C:204	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`6638`	`108.3`	`-15.7`	`0.735`	`4`	`0`	`0`	`0.134`
8	`10`		[SO4]C:203	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`6638`	`104.3`	`-14.1`	`0.874`	`5`	`0`	`0`	`0.125`
9	`11`		[SO4]A:201	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`6183`	`101.9`	`-16.1`	`0.743`	`6`	`0`	`0`	`0.166`
10	`12`		[SO4]D:201	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`5684`	`101.7`	`-15.5`	`0.738`	`4`	`0`	`0`	`0.132`
11	`13`		[SO4]B:202	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`6612`	`98.4`	`-14.7`	`0.741`	`5`	`0`	`0`	`0.150`
12	`14`		[SO4]C:202	`5`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`6638`	`93.9`	`-14.4`	`0.714`	`6`	`0`	`0`	`0.130`
13	`15`		[SO4]B:203	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`6183`	`78.4`	`-8.9`	`0.893`	`1`	`0`	`0`	`0.083`
14	`16`		[SO4]C:201	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`5684`	`77.7`	`-9.3`	`0.774`	`1`	`0`	`0`	`0.074`
15	`17`		[SO4]B:204	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`6612`	`76.7`	`-9.2`	`0.931`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		[SO4]B:201	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z-1	`1_554`	`7`	`3`	`6638`	`73.3`	`-8.7`	`0.885`	`4`	`0`	`0`	`0.080`
17	`19`		[CL]B:208	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`6612`	`70.5`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
18	`20`		[SO4]B:203	`5`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`6612`	`68.8`	`-8.3`	`0.862`	`2`	`0`	`0`	`0.082`
19	`21`		[SO4]C:201	`5`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`6638`	`61.8`	`-7.1`	`0.844`	`2`	`0`	`0`	`0.061`
20	`22`		[CL]B:206	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`6612`	`59.3`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
21	`23`		B	`7`	`3`	`6612`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`6183`	`54.8`	`-0.0`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`24`		[CL]B:207	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`6612`	`52.9`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
23	`25`		[CL]C:206	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`6638`	`51.2`	`-6.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`26`		[CL]C:205	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`6612`	`43.6`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	*Average:*													`47.4`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
24	`27`		[CL]B:209	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`6612`	`50.0`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`28`		[CL]B:209	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`6638`	`48.9`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
26	`29`		[CL]D:202	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`6638`	`46.2`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
27	`30`		[CL]D:202	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`5684`	`44.4`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
28	`31`		B	`4`	`2`	`6612`	`◊`	[CL]C:206	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`125`	`43.9`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[CL]C:205	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6638`	`36.9`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`40.4`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		[SO4]B:201	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`6612`	`42.5`	`-4.3`	`0.887`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`34`		[CL]B:207	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`6638`	`32.7`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`35`		[SO4]A:201	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6612`	`31.0`	`-2.9`	`0.936`	`1`	`0`	`0`	`0.030`
32	`36`		B	`4`	`2`	`6612`	`◊`	[SO4]C:203	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`186`	`25.0`	`-3.0`	`0.719`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		[SO4]B:202	`3`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6183`	`24.9`	`-2.0`	`0.959`	`1`	`0`	`0`	`0.022`
34	`38`		[CL]B:206	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`6638`	`24.1`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`39`		[SO4]C:202	`4`	`1`	`183`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`5684`	`20.2`	`-1.7`	`0.949`	`1`	`0`	`0`	`0.016`
36	`40`		[SO4]B:203	`3`	`1`	`184`	`◊`	[SO4]B:202	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`17.1`	`-4.0`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
37	`41`		[CL]D:202	`1`	`1`	`125`	`f`	[SO4]C:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`17.1`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
38	`42`		[SO4]C:202	`1`	`1`	`183`	`◊`	[SO4]C:201	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`16.5`	`-3.9`	`0.891`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
39	`43`		B	`2`	`1`	`6612`	`◊`	[SO4]B:205	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`185`	`14.1`	`-1.9`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`44`		[CL]B:208	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6638`	`7.8`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`45`		[CL]D:202	`1`	`1`	`125`	`f`	[SO4]D:201	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`6.9`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
42	`46`		C	`1`	`1`	`6638`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`6638`	`4.1`	`0.1`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`47`		[SO4]D:201	`1`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6638`	`4.1`	`-0.6`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
44	`48`		[CL]B:208	`1`	`1`	`125`	`f`	[SO4]B:204	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`3.2`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`49`		[SO4]B:205	`1`	`1`	`185`	`f`	[SO4]B:204	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`2.6`	`-0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`50`		[SO4]B:201	`1`	`1`	`186`	`f`	[SO4]C:203	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`186`	`2.5`	`-0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
47	`51`		[CL]B:209	`1`	`1`	`125`	`◊`	[CL]B:208	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`2.3`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`52`		[SO4]B:201	`1`	`1`	`186`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`6638`	`1.1`	`-0.1`	`0.822`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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