PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=586-D5-B4K)

Interfaces in PDB 5txp crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.70 Å

STRUCTURE OF Q151M COMPLEX (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`297`	`75`	`21387`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`316`	`84`	`29808`	`2864.1`	`-23.4`	`0.259`	`30`	`4`	`0`	`0.713`
	`2`		D	`294`	`76`	`21488`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`318`	`85`	`29934`	`2845.0`	`-25.0`	`0.186`	`33`	`4`	`0`	`0.713`
	*Average:*													`2854.5`	`-24.2`	`0.222`	`32`	`4`	`0`	`0.713`
2	`3`		T	`149`	`18`	`5601`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`164`	`57`	`29808`	`1361.1`	`-7.4`	`0.718`	`9`	`0`	`0`	`0.403`
	`4`		E	`139`	`19`	`5589`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`152`	`52`	`29934`	`1228.8`	`-9.5`	`0.651`	`10`	`0`	`0`	`0.403`
	*Average:*													`1295.0`	`-8.4`	`0.685`	`10`	`0`	`0`	`0.403`
3	`5`		P	`97`	`19`	`4635`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`98`	`20`	`5601`	`929.8`	`-11.1`	`0.671`	`60`	`0`	`0`	`1.000`
	`6`		F	`90`	`19`	`4566`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`94`	`21`	`5589`	`910.1`	`-11.1`	`0.675`	`58`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`919.9`	`-11.1`	`0.673`	`59`	`0`	`0`	`1.000`
4	`7`		P	`98`	`15`	`4635`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`110`	`32`	`29808`	`901.8`	`-11.0`	`0.484`	`11`	`0`	`0`	`0.526`
	`8`		F	`91`	`14`	`4566`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`108`	`31`	`29934`	`876.6`	`-11.9`	`0.420`	`12`	`0`	`0`	`0.526`
	*Average:*													`889.2`	`-11.4`	`0.452`	`12`	`0`	`0`	`0.526`
5	`9`		C	`66`	`16`	`29934`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`69`	`18`	`29808`	`593.5`	`-2.8`	`0.587`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		D	`60`	`14`	`21488`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`65`	`19`	`21387`	`560.1`	`0.2`	`0.730`	`6`	`8`	`0`	`0.000`
7	`11`		C	`45`	`10`	`29934`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1	`2_446`	`44`	`12`	`29808`	`423.9`	`-2.4`	`0.524`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		[DDS]C:601	`28`	`1`	`579`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`50`	`18`	`29934`	`337.1`	`0.9`	`0.530`	`8`	`0`	`0`	`0.082`
	`13`		[DDS]A:603	`28`	`1`	`571`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`18`	`29808`	`331.2`	`0.5`	`0.536`	`6`	`0`	`0`	`0.082`
	*Average:*													`334.1`	`0.7`	`0.533`	`7`	`0`	`0`	`0.082`
9	`14`		[SUC]B:501	`20`	`1`	`463`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`35`	`12`	`21387`	`273.6`	`3.8`	`0.661`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		B	`32`	`9`	`21387`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`29934`	`266.9`	`-2.6`	`0.369`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[SUC]D:501	`19`	`1`	`462`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`37`	`13`	`21488`	`261.0`	`3.2`	`0.631`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[MRG]P:817	`25`	`1`	`569`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`31`	`2`	`4635`	`258.4`	`5.1`	`0.857`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[MRG]F:817	`25`	`1`	`562`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`29`	`2`	`4566`	`258.0`	`5.7`	`0.849`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`258.2`	`5.4`	`0.853`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		D	`28`	`10`	`21488`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`36`	`17`	`29808`	`253.8`	`2.5`	`0.842`	`6`	`3`	`0`	`0.000`
14	`20`		B	`22`	`9`	`21387`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`19`	`8`	`29808`	`151.2`	`0.3`	`0.684`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
15	`21`		[EDO]B:503	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`21387`	`123.5`	`3.6`	`0.506`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
16	`22`		[EDO]D:502	`4`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`21488`	`119.5`	`3.6`	`0.465`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[MRG]F:817	`8`	`1`	`562`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`29934`	`113.0`	`-2.7`	`0.140`	`0`	`0`	`0`	`0.091`
	`24`		[MRG]P:817	`10`	`1`	`569`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`29808`	`112.6`	`-3.0`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.091`
	*Average:*													`112.8`	`-2.9`	`0.148`	`0`	`0`	`0`	`0.091`
18	`25`		[SO4]B:502	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`21387`	`112.0`	`-14.5`	`0.774`	`0`	`0`	`0`	`0.180`
19	`26`		[DDS]C:601	`17`	`1`	`579`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`14`	`1`	`4566`	`98.4`	`2.8`	`0.701`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[DDS]A:603	`17`	`1`	`571`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`4635`	`93.8`	`2.8`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`96.1`	`2.8`	`0.700`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`28`		[MRG]P:817	`8`	`1`	`569`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`5601`	`97.7`	`-0.3`	`0.525`	`4`	`0`	`0`	`0.078`
	`29`		[MRG]F:817	`8`	`1`	`562`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`5589`	`91.4`	`-0.6`	`0.508`	`5`	`0`	`0`	`0.078`
	*Average:*													`94.5`	`-0.4`	`0.517`	`5`	`0`	`0`	`0.078`
21	`30`		[EDO]D:503	`4`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`21488`	`93.1`	`2.7`	`0.478`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		F	`13`	`3`	`4566`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`21488`	`84.5`	`-2.8`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	`32`		P	`12`	`3`	`4635`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`21387`	`84.1`	`-2.9`	`0.396`	`1`	`0`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`84.3`	`-2.8`	`0.414`	`1`	`0`	`0`	`0.022`
23	`33`		E	`11`	`5`	`5589`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`21488`	`80.3`	`-2.3`	`0.368`	`3`	`0`	`0`	`0.028`
	`34`		T	`6`	`4`	`5601`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`21387`	`56.2`	`-1.9`	`0.332`	`1`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`68.2`	`-2.1`	`0.350`	`2`	`0`	`0`	`0.028`
24	`35`		[EDO]D:503	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`29934`	`76.3`	`1.0`	`0.180`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`36`		[EDO]T:801	`4`	`1`	`183`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`5601`	`73.2`	`0.9`	`0.705`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`37`		[DDS]A:603	`8`	`1`	`571`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`11`	`2`	`5601`	`72.5`	`0.4`	`0.560`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
	`38`		[DDS]C:601	`7`	`1`	`579`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`2`	`5589`	`71.0`	`0.2`	`0.560`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`71.7`	`0.3`	`0.560`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
27	`39`		[MG]A:602	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`9`	`29808`	`56.3`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.272`
	`40`		[MG]C:603	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`7`	`29934`	`53.6`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.272`
	*Average:*													`55.0`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.272`
28	`41`		[SO4]B:502	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`29808`	`52.4`	`-7.2`	`0.509`	`1`	`0`	`0`	`0.094`
29	`42`		[EDO]T:801	`3`	`1`	`183`	`f`	P	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`4635`	`42.1`	`0.5`	`0.788`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
30	`43`		F	`6`	`2`	`4566`	`◊`	T	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`1`	`5601`	`41.3`	`-0.1`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`44`		[MG]C:602	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`29934`	`36.2`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.169`
	`45`		[MG]A:601	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`6`	`29808`	`35.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.169`
	*Average:*													`35.8`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.169`
32	`46`		[DDS]A:603	`4`	`1`	`571`	`f`	[MG]A:601	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`33.1`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.148`
	`47`		[DDS]C:601	`4`	`1`	`579`	`f`	[MG]C:602	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.2`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.148`
	*Average:*													`32.6`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.148`
33	`48`		F	`6`	`2`	`4566`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`3`	`29808`	`24.8`	`-0.5`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`49`		D	`5`	`4`	`21488`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`2`	`29808`	`24.0`	`0.4`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`50`		[EDO]B:503	`2`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`29934`	`22.4`	`0.8`	`0.906`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`51`		[SUC]D:501	`1`	`1`	`462`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`4566`	`18.9`	`-1.4`	`0.192`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
37	`52`		[MG]A:602	`1`	`1`	`98`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`5601`	`11.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`53`		[MG]C:603	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`5589`	`3.8`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	*Average:*													`7.6`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
38	`54`		[SUC]B:501	`1`	`1`	`463`	`f`	P	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`4635`	`2.4`	`-0.2`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.006`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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