PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=117-EB-8I2)

Interfaces in PDB 5u17 crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.15 Å

STRUCTURE OF HUMAN MR1-DA-6-FP IN COMPLEX WITH HUMAN MAIT A-F7 TCR

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		G	`208`	`57`	`12534`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`215`	`57`	`11473`	`1929.0`	`-26.8`	`0.091`	`26`	`6`	`1`	`0.815`
	`2`		E	`211`	`59`	`12865`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`209`	`58`	`11616`	`1918.5`	`-27.2`	`0.056`	`23`	`6`	`1`	`0.815`
	*Average:*													`1923.7`	`-27.0`	`0.074`	`25`	`6`	`1`	`0.815`
2	`3`		H	`127`	`31`	`6423`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`130`	`39`	`14711`	`1144.2`	`-8.0`	`0.288`	`13`	`3`	`0`	`0.747`
	`4`		F	`120`	`28`	`6169`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`128`	`39`	`14545`	`1135.2`	`-7.4`	`0.397`	`14`	`4`	`0`	`0.747`
	*Average:*													`1139.7`	`-7.7`	`0.342`	`14`	`4`	`0`	`0.747`
3	`5`		E	`87`	`30`	`12865`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`81`	`29`	`14711`	`722.2`	`-7.0`	`0.309`	`5`	`2`	`0`	`0.099`
4	`6`		B	`60`	`16`	`11473`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`69`	`17`	`14711`	`595.1`	`-1.5`	`0.660`	`10`	`2`	`0`	`0.082`
	`7`		D	`61`	`15`	`11616`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`70`	`18`	`14545`	`587.6`	`-2.2`	`0.609`	`11`	`2`	`0`	`0.082`
	*Average:*													`591.3`	`-1.9`	`0.635`	`11`	`2`	`0`	`0.082`
5	`8`		G	`63`	`18`	`12534`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`68`	`18`	`14711`	`565.5`	`-5.2`	`0.385`	`5`	`0`	`0`	`0.088`
	`9`		E	`60`	`17`	`12865`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`66`	`15`	`14545`	`556.4`	`-4.0`	`0.420`	`9`	`0`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`561.0`	`-4.6`	`0.403`	`7`	`0`	`0`	`0.088`
6	`10`		A	`54`	`15`	`14711`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`63`	`14`	`14545`	`542.5`	`-2.7`	`0.221`	`3`	`2`	`0`	`0.039`
7	`11`		B	`59`	`17`	`11473`	`◊`	C	-x,y,-z+3	`2_558`	`45`	`12`	`14545`	`469.5`	`-5.9`	`0.129`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		D	`59`	`16`	`11616`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`42`	`12`	`14711`	`464.7`	`-6.4`	`0.116`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`467.1`	`-6.2`	`0.122`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
8	`13`		H	`33`	`13`	`6423`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`36`	`12`	`14545`	`284.7`	`-0.5`	`0.537`	`3`	`0`	`0`	`0.017`
9	`14`		E	`32`	`10`	`12865`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`11473`	`253.4`	`-1.7`	`0.494`	`2`	`0`	`0`	`0.023`
10	`15`		D	`25`	`8`	`11616`	`x`	D	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`34`	`10`	`11616`	`244.2`	`1.2`	`0.824`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[7WP]C:301	`13`	`1`	`332`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`40`	`14`	`14545`	`236.9`	`1.6`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		[7WP]A:301	`13`	`1`	`331`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`14`	`14711`	`233.6`	`2.0`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`235.3`	`1.8`	`0.536`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		D	`21`	`5`	`11616`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`14711`	`178.0`	`-1.2`	`0.374`	`1`	`2`	`0`	`0.020`
13	`19`		C	`18`	`5`	`14545`	`◊`	G	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`16`	`6`	`12534`	`135.1`	`0.3`	`0.706`	`5`	`0`	`0`	`0.018`
14	`20`		[GOL]C:305	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`14545`	`113.7`	`-0.6`	`0.543`	`4`	`0`	`0`	`0.123`
15	`21`		[GOL]A:302	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`4`	`14711`	`113.4`	`-0.9`	`0.458`	`1`	`0`	`0`	`0.072`
16	`22`		[GOL]C:303	`6`	`1`	`221`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`4`	`14545`	`107.9`	`-0.9`	`0.469`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
17	`23`		[GOL]E:301	`6`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`14711`	`105.7`	`-0.8`	`0.496`	`4`	`0`	`0`	`0.134`
18	`24`		D	`12`	`5`	`11616`	`◊`	E	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`12`	`4`	`12865`	`103.5`	`-0.8`	`0.497`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
19	`25`		[GOL]H:102	`6`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`14711`	`100.9`	`-0.3`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
20	`26`		[GOL]H:101	`5`	`1`	`223`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`6423`	`95.5`	`-0.2`	`0.525`	`5`	`0`	`0`	`0.086`
21	`27`		[GOL]B:301	`6`	`1`	`219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`11473`	`92.7`	`0.3`	`0.681`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
22	`28`		H	`15`	`7`	`6423`	`◊`	[GOL]C:302	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`6`	`1`	`218`	`85.4`	`0.4`	`0.625`	`3`	`0`	`0`	`0.008`
23	`29`		[GOL]C:302	`5`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`14545`	`82.0`	`0.1`	`0.577`	`3`	`0`	`0`	`0.064`
24	`30`		[ACT]D:301	`4`	`1`	`182`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`11616`	`79.6`	`-1.4`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
25	`31`		[ACT]F:101	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`14545`	`76.7`	`-0.7`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
26	`32`		[GOL]B:301	`5`	`1`	`219`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`12865`	`75.8`	`-0.1`	`0.554`	`3`	`0`	`0`	`0.026`
27	`33`		[ACT]F:101	`3`	`1`	`183`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`6169`	`74.1`	`-0.8`	`0.577`	`1`	`0`	`0`	`0.100`
28	`34`		[GOL]H:102	`4`	`1`	`220`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`6423`	`69.8`	`0.5`	`0.654`	`2`	`0`	`0`	`0.014`
29	`35`		[GOL]E:301	`5`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`12865`	`69.6`	`0.3`	`0.669`	`2`	`0`	`0`	`0.006`
30	`36`		E	`9`	`4`	`12865`	`◊`	C	-x,y,-z+3	`2_558`	`9`	`3`	`14545`	`69.0`	`-1.4`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
31	`37`		[GOL]C:304	`6`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14545`	`67.8`	`1.2`	`0.736`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
32	`38`		[NA]E:302	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`12865`	`66.1`	`-10.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
	`39`		[NA]G:301	`1`	`1`	`125`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`12534`	`65.5`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
	*Average:*													`65.8`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
33	`40`		[NA]H:103	`1`	`1`	`125`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`6423`	`64.3`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.328`
34	`41`		[GOL]H:101	`4`	`1`	`223`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`7`	`3`	`14545`	`58.2`	`0.0`	`0.621`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
35	`42`		[GOL]C:304	`5`	`1`	`218`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`12865`	`54.1`	`0.8`	`0.767`	`4`	`0`	`0`	`0.017`
36	`43`		[GOL]A:302	`5`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11473`	`52.4`	`-0.1`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`44`		[GOL]C:303	`5`	`1`	`221`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11616`	`47.5`	`0.1`	`0.578`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
38	`45`		E	`7`	`2`	`12865`	`x`	E	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`4`	`1`	`12865`	`47.4`	`-0.4`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`46`		F	`8`	`2`	`6169`	`◊`	B	-x,y,-z+3	`2_558`	`4`	`2`	`11473`	`44.2`	`1.3`	`0.867`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`47`		[ACT]D:301	`4`	`1`	`182`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14545`	`43.5`	`0.6`	`0.803`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`48`		D	`5`	`2`	`11616`	`◊`	H	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`8`	`3`	`6423`	`41.2`	`-0.1`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`49`		H	`6`	`2`	`6423`	`◊`	F	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`2`	`1`	`6169`	`31.0`	`-0.4`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
43	`50`		[GOL]B:301	`4`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14711`	`26.1`	`-0.5`	`0.210`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
44	`51`		H	`1`	`1`	`6423`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12865`	`23.0`	`0.9`	`0.762`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`52`		[ACT]D:301	`3`	`1`	`182`	`◊`	[GOL]C:303	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`221`	`21.6`	`-0.1`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`53`		[7WP]A:301	`5`	`1`	`331`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11473`	`19.0`	`0.3`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[7WP]C:301	`4`	`1`	`332`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11616`	`17.1`	`0.2`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.1`	`0.2`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`55`		H	`4`	`3`	`6423`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11616`	`18.4`	`0.8`	`0.815`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`56`		[GOL]H:101	`2`	`1`	`223`	`◊`	[GOL]C:302	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`1`	`1`	`218`	`17.2`	`-0.0`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`57`		H	`3`	`1`	`6423`	`◊`	[GOL]C:305	-x+1/2,y-1/2,-z+3	`4_548`	`2`	`1`	`218`	`11.8`	`-0.0`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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