PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=844-G9-348)

Interfaces in PDB 5u52 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.94 Å

2 HELIX MINIMIZED VERSION OF THE B-DOMAIN FROM PROTEIN A (Z34C0 BOUND TO IGG1 FC (MONOCLINIC FORM)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`108`	`30`	`12316`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`110`	`31`	`12069`	`1087.4`	`-13.5`	`0.065`	`8`	`7`	`0`	`0.000`
2	`2`		Z	`78`	`17`	`3177`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`84`	`25`	`12316`	`729.6`	`-7.0`	`0.216`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
	`3`		E	`77`	`18`	`3062`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`25`	`12069`	`695.6`	`-6.4`	`0.235`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`712.6`	`-6.7`	`0.226`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
3	`4`		A	`48`	`15`	`12069`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`44`	`13`	`12316`	`424.0`	`-0.1`	`0.378`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		E	`42`	`16`	`3062`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`56`	`19`	`12316`	`405.0`	`5.1`	`0.900`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`35`	`7`	`12069`	`◊`	Z	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`34`	`11`	`3177`	`272.4`	`0.7`	`0.622`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
6	`7`		A	`20`	`9`	`12069`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`30`	`8`	`12069`	`219.6`	`2.4`	`0.708`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		B	`19`	`7`	`12316`	`x`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`22`	`7`	`12316`	`180.1`	`-1.6`	`0.398`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		A	`16`	`7`	`12069`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`20`	`7`	`12316`	`172.2`	`1.3`	`0.739`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		A	`18`	`5`	`12069`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`23`	`6`	`12316`	`162.3`	`-0.5`	`0.545`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		A	`18`	`5`	`12069`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`13`	`5`	`12316`	`149.7`	`0.6`	`0.646`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
11	`12`		Z	`17`	`7`	`3177`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`12069`	`147.9`	`1.2`	`0.717`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[NAG]B:501	`13`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`12316`	`146.1`	`3.5`	`0.313`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[NAG]A:501	`12`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`12069`	`142.0`	`3.4`	`0.361`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`144.1`	`3.4`	`0.337`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		[GAL]A:507	`11`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`12069`	`145.5`	`3.4`	`0.320`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		[GAL]B:507	`10`	`1`	`292`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`12316`	`134.3`	`3.3`	`0.444`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		[NAG]A:505	`9`	`1`	`363`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`12069`	`123.3`	`2.4`	`0.352`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[NAG]B:505	`9`	`1`	`362`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`12316`	`115.8`	`2.3`	`0.360`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`119.5`	`2.3`	`0.356`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		B	`12`	`4`	`12316`	`x`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`15`	`5`	`12316`	`115.0`	`-1.1`	`0.419`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[NAG]A:502	`11`	`1`	`363`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`12069`	`109.3`	`1.4`	`0.210`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[NAG]B:502	`11`	`1`	`358`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`12316`	`97.3`	`1.0`	`0.188`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		E	`14`	`4`	`3062`	`◊`	[NAG]B:505	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`11`	`1`	`362`	`87.6`	`1.9`	`0.252`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		Z	`8`	`2`	`3177`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`2`	`12316`	`82.2`	`1.3`	`0.769`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		B	`11`	`3`	`12316`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`4`	`3062`	`81.2`	`-1.4`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[NAG]A:502	`9`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`73.5`	`1.9`	`0.119`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[NAG]B:502	`9`	`1`	`358`	`cf`	[NAG]B:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`65.3`	`1.8`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`69.4`	`1.8`	`0.112`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`27`		E	`8`	`5`	`3062`	`◊`	[GAL]B:507	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`7`	`1`	`292`	`72.9`	`2.1`	`0.432`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`28`		[MAN]A:504	`8`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:505	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`363`	`72.2`	`2.6`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[MAN]B:504	`8`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]B:505	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`362`	`70.6`	`2.5`	`0.145`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`71.4`	`2.5`	`0.131`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`30`		[MAN]A:503	`8`	`1`	`290`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`12069`	`67.0`	`0.2`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[MAN]B:503	`9`	`1`	`290`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`12316`	`65.6`	`0.2`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.3`	`0.2`	`0.120`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`32`		[FUC]A:508	`7`	`1`	`278`	`cf`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`66.6`	`2.3`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		[FUC]A:508	`5`	`1`	`278`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`12069`	`62.2`	`0.4`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`34`		[FUC]A:508	`6`	`1`	`278`	`◊`	Z	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`2`	`3177`	`60.2`	`0.9`	`0.256`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		[MAN]A:506	`7`	`1`	`292`	`cf`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`290`	`60.1`	`2.7`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		[MAN]B:506	`7`	`1`	`292`	`cf`	[MAN]B:503	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`290`	`57.7`	`2.5`	`0.242`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`58.9`	`2.6`	`0.252`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`37`		[FUC]B:508	`6`	`1`	`282`	`cf`	[NAG]B:501	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`363`	`59.3`	`2.1`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`38`		[GAL]A:507	`7`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:505	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`59.2`	`0.9`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`39`		[GAL]B:507	`7`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]B:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`57.9`	`1.0`	`0.109`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`40`		[MAN]A:503	`7`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`56.1`	`0.8`	`0.099`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`41`		B	`10`	`5`	`12316`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`12069`	`54.4`	`0.7`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`42`		[MAN]B:503	`7`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`358`	`53.9`	`1.0`	`0.107`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`43`		[MAN]A:504	`6`	`1`	`292`	`cf`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`290`	`52.6`	`2.5`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		[MAN]B:504	`6`	`1`	`291`	`cf`	[MAN]B:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`290`	`49.6`	`2.3`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`51.1`	`2.4`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`45`		[MAN]B:504	`5`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`12316`	`52.0`	`1.3`	`0.410`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[MAN]A:504	`4`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12069`	`47.6`	`1.2`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`49.8`	`1.2`	`0.390`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`47`		[FUC]B:508	`5`	`1`	`282`	`f`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`358`	`49.4`	`2.1`	`0.214`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`48`		[FUC]B:508	`5`	`1`	`282`	`◊`	[MAN]A:506	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`292`	`49.2`	`0.9`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`49`		[MAN]A:504	`6`	`1`	`292`	`f`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`49.0`	`1.8`	`0.156`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`50`		[MAN]B:504	`6`	`1`	`291`	`f`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`358`	`47.0`	`1.5`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`51`		E	`9`	`5`	`3062`	`◊`	[MAN]B:504	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`5`	`1`	`291`	`42.4`	`0.1`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`52`		[MAN]A:506	`3`	`1`	`292`	`◊`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`358`	`37.8`	`0.4`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`53`		[FUC]A:508	`5`	`1`	`278`	`f`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`35.8`	`2.0`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`54`		[MAN]B:506	`5`	`1`	`292`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`12316`	`35.1`	`-0.1`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`55`		[MAN]B:506	`3`	`1`	`292`	`◊`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`33.5`	`0.6`	`0.130`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`56`		[MAN]A:506	`4`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`12069`	`31.3`	`-0.2`	`0.140`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`57`		[FUC]B:508	`3`	`1`	`282`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`12316`	`24.7`	`0.8`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`58`		E	`5`	`2`	`3062`	`◊`	[NAG]B:502	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`1`	`1`	`358`	`23.1`	`0.6`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`59`		[MAN]B:506	`5`	`1`	`292`	`f`	[NAG]B:502	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`358`	`22.7`	`0.6`	`0.166`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`60`		[FUC]B:508	`2`	`1`	`282`	`f`	[MAN]B:504	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`291`	`22.2`	`0.7`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`61`		[FUC]A:508	`4`	`1`	`278`	`◊`	[MAN]B:506	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`292`	`20.4`	`0.0`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`62`		[MAN]A:506	`5`	`1`	`292`	`f`	[NAG]A:502	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`363`	`20.0`	`0.7`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`63`		[MAN]B:503	`3`	`1`	`290`	`◊`	[MAN]A:506	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`292`	`17.9`	`0.3`	`0.169`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`64`		[MAN]B:503	`2`	`1`	`290`	`f`	[NAG]B:505	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`362`	`17.4`	`0.9`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[MAN]A:503	`2`	`1`	`290`	`f`	[NAG]A:505	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`363`	`17.3`	`0.8`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`17.4`	`0.8`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`66`		[GAL]A:507	`2`	`1`	`292`	`◊`	Z	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`3177`	`15.2`	`0.0`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`67`		[NAG]A:501	`2`	`1`	`362`	`◊`	Z	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`2`	`1`	`3177`	`15.0`	`0.5`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`68`		E	`5`	`2`	`3062`	`◊`	Z	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`2`	`2`	`3177`	`12.3`	`0.1`	`0.637`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`69`		[MAN]B:503	`1`	`1`	`290`	`◊`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`290`	`12.0`	`0.3`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`70`		[MAN]B:506	`2`	`1`	`292`	`◊`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`290`	`8.9`	`0.2`	`0.264`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`71`		[FUC]A:508	`2`	`1`	`278`	`f`	[MAN]A:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`292`	`8.7`	`0.0`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`72`		A	`1`	`1`	`12069`	`x`	A	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`2`	`1`	`12069`	`8.6`	`0.3`	`0.751`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`73`		[MAN]B:506	`1`	`1`	`292`	`◊`	[MAN]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`292`	`6.6`	`0.2`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`74`		[MAN]A:506	`3`	`1`	`292`	`◊`	[NAG]B:501	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`363`	`4.3`	`0.1`	`0.167`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		[FUC]B:508	`1`	`1`	`282`	`f`	[MAN]B:503	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`290`	`3.0`	`0.2`	`0.191`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`76`		[MAN]A:504	`1`	`1`	`292`	`◊`	Z	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`2`	`1`	`3177`	`3.0`	`-0.1`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`77`		[MAN]B:506	`1`	`1`	`292`	`◊`	[NAG]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`362`	`1.5`	`-0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`78`		E	`1`	`1`	`3062`	`◊`	[FUC]B:508	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`1`	`1`	`282`	`0.8`	`0.0`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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