Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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wwPDB

EMDataBank

PISA Interface List.

Session Map (id=179-E2-ICA)

Interfaces in PDB 5uz1

SOLUTION STRUCTURE OF A DNA DODECAMER WITH 5-METHYLCYTOSINE AT THE 3RD POSITION AND 8-OXOGUANINE AT THE 10TH POSITION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`46`	`10`	`2924`	`◊`	B	`46`	`10`	`2908`	`483.6`	`-7.9`	`0.415`	`16`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`31`	`2`	`2924`	`c`	[5CM]A:3	`19`	`1`	`476`	`247.4`	`4.9`	`0.666`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`3`		B	`32`	`2`	`2908`	`c`	[5CM]B:15	`18`	`1`	`476`	`247.1`	`4.9`	`0.653`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`247.3`	`4.9`	`0.659`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		B	`26`	`2`	`2908`	`c`	[8OG]B:22	`23`	`1`	`503`	`246.0`	`4.3`	`0.655`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		A	`26`	`2`	`2924`	`c`	[8OG]A:10	`23`	`1`	`500`	`243.8`	`4.1`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`244.9`	`4.2`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		A	`18`	`3`	`2924`	`◊`	[8OG]B:22	`9`	`1`	`503`	`112.7`	`1.4`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		B	`18`	`3`	`2908`	`◊`	[8OG]A:10	`9`	`1`	`500`	`112.6`	`1.5`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`112.6`	`1.4`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		[5CM]A:3	`4`	`1`	`476`	`◊`	[8OG]B:22	`4`	`1`	`503`	`55.3`	`0.9`	`0.446`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[5CM]B:15	`4`	`1`	`476`	`◊`	[8OG]A:10	`4`	`1`	`500`	`55.1`	`0.9`	`0.444`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`55.2`	`0.9`	`0.445`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		B	`6`	`3`	`2908`	`◊`	[5CM]A:3	`4`	`1`	`476`	`30.8`	`0.0`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		A	`5`	`3`	`2924`	`◊`	[5CM]B:15	`4`	`1`	`476`	`29.9`	`0.0`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`30.3`	`0.0`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]