PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=342-CP-K33)

Interfaces in PDB 5vf4 crystal.
Space symmetry group: P 32 2 1. Resolution: 2.81 Å

THERMUS AQUATICUS VARIABLE PROTEIN (TAQVP) FROM DIVERSITY-GENERATING RETROELEMENTS (DGR)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`66`	`23`	`13714`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`66`	`22`	`13814`	`623.7`	`-16.9`	`0.001`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`2`		D	`65`	`23`	`14005`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`61`	`20`	`14042`	`591.6`	`-15.4`	`0.003`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`607.7`	`-16.2`	`0.002`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
2	`3`		C	`51`	`17`	`13714`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`18`	`14042`	`398.0`	`3.2`	`0.937`	`9`	`6`	`0`	`0.000`
3	`4`		B	`37`	`17`	`13814`	`◊`	C	-y+1,x-y,z-1/3	`2_654`	`36`	`17`	`13714`	`329.1`	`-5.5`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`36`	`13`	`14005`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`34`	`10`	`13714`	`312.9`	`-2.5`	`0.374`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		D	`32`	`11`	`14005`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`37`	`18`	`13814`	`275.6`	`3.8`	`0.945`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
6	`7`		C	`32`	`15`	`13714`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`31`	`14`	`13714`	`247.9`	`-2.6`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		C	`23`	`4`	`13714`	`◊`	B	y,x,-z+1	`4_556`	`26`	`11`	`13814`	`189.3`	`-2.8`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		C	`24`	`11`	`13714`	`◊`	A	y,x,-z+1	`4_556`	`24`	`10`	`14042`	`158.6`	`-0.7`	`0.626`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[ACT]B:403	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`13814`	`110.0`	`-0.5`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
10	`11`		[ACT]C:405	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`13714`	`107.8`	`-1.5`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
11	`12`		[ACT]A:406	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`14042`	`105.9`	`-1.2`	`0.581`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
12	`13`		[ACT]A:405	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`14042`	`96.9`	`-0.9`	`0.633`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
13	`14`		[ACT]C:404	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`13714`	`94.1`	`-0.9`	`0.643`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
14	`15`		[ACT]C:416	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`13714`	`92.4`	`-0.5`	`0.669`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[ACT]A:407	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`14042`	`89.9`	`-0.6`	`0.687`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
16	`17`		[ACT]C:406	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`13714`	`88.5`	`-0.6`	`0.697`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
17	`18`		[ACT]B:404	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`13814`	`87.6`	`-0.3`	`0.703`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
18	`19`		[ACT]C:408	`4`	`1`	`184`	`f`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`14`	`8`	`13714`	`86.8`	`-1.2`	`0.502`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
19	`20`		[ACT]B:405	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`13814`	`86.6`	`-0.0`	`0.786`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
20	`21`		[ACT]C:414	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`13714`	`85.0`	`-0.6`	`0.661`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
21	`22`		[ACT]C:417	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13714`	`84.2`	`0.2`	`0.778`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
22	`23`		B	`7`	`5`	`13814`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14042`	`83.3`	`-1.1`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[ACT]C:411	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`13714`	`82.5`	`-0.9`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
24	`25`		[ACT]B:409	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`13814`	`79.8`	`-0.1`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		[ACT]C:415	`4`	`1`	`182`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`13714`	`78.7`	`-1.3`	`0.570`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
26	`27`		[ACT]B:408	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`13814`	`77.6`	`-0.7`	`0.486`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
27	`28`		[ACT]A:403	`3`	`1`	`183`	`f`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`13`	`6`	`13714`	`76.5`	`-0.9`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
28	`29`		[ACT]C:410	`4`	`1`	`184`	`f`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`10`	`4`	`13714`	`74.7`	`0.4`	`0.763`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		[ACT]C:412	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`13714`	`74.0`	`-0.9`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
30	`31`		[ACT]C:407	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13714`	`72.0`	`-0.9`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
31	`32`		[ACT]B:411	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`13814`	`71.9`	`-1.5`	`0.447`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
32	`33`		[ACT]B:410	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`13814`	`65.9`	`0.4`	`0.768`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
33	`34`		[ACT]A:404	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`13714`	`65.2`	`-0.2`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		[ACT]C:409	`4`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`13714`	`64.2`	`0.1`	`0.768`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
35	`36`		[ACT]D:402	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`14042`	`63.6`	`-1.1`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
36	`37`		B	`6`	`4`	`13814`	`◊`	A	-y+1,x-y,z-1/3	`2_654`	`10`	`4`	`14042`	`63.3`	`-0.6`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`38`		[ACT]D:402	`4`	`1`	`183`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14005`	`63.0`	`-0.3`	`0.676`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		[ACT]C:413	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`13714`	`62.5`	`0.8`	`0.851`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		[ACT]C:418	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`13714`	`61.3`	`-0.7`	`0.584`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
40	`41`		[ACT]B:406	`4`	`1`	`182`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`9`	`3`	`13714`	`59.5`	`-0.4`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[ACT]C:409	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	y,x,-z+1	`4_556`	`8`	`4`	`13814`	`54.1`	`-0.0`	`0.655`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		[ACT]C:408	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`13714`	`53.7`	`-0.1`	`0.690`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		[ACT]B:407	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`8`	`4`	`13714`	`53.0`	`0.9`	`0.824`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
44	`45`		[ACT]C:413	`4`	`1`	`183`	`f`	B	y,x,-z+1	`4_556`	`6`	`2`	`13814`	`51.5`	`-0.4`	`0.563`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
45	`46`		[ACT]A:403	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`14042`	`50.2`	`0.8`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`47`		[ACT]B:407	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`1`	`13814`	`49.3`	`-1.1`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
47	`48`		[ACT]C:407	`3`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`13814`	`47.2`	`-0.1`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`49`		[ACT]A:404	`3`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`14042`	`46.8`	`-0.6`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
49	`50`		[CA]C:401	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`5`	`13714`	`44.0`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`51`		[CA]A:401	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`14042`	`43.8`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`52`		[CA]B:402	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`13814`	`42.9`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	*Average:*													`43.6`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
50	`53`		[CA]D:401	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`14005`	`43.7`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`54`		[CA]C:402	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`13714`	`43.1`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`55`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`14042`	`42.9`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`56`		[CA]B:401	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`13814`	`42.9`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`43.2`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
51	`57`		[ACT]C:410	`3`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13714`	`43.5`	`-0.4`	`0.681`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`58`		A	`6`	`4`	`14042`	`◊`	A	-x+2,-x+y+1,-z+2/3	`6_765`	`6`	`4`	`14042`	`37.9`	`-0.7`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`59`		[CA]C:403	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`13714`	`37.4`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
54	`60`		[ACT]B:405	`1`	`1`	`183`	`f`	[ACT]B:404	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`35.4`	`-0.4`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
55	`61`		[ACT]B:406	`3`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13814`	`33.4`	`-0.7`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
56	`62`		[ACT]C:412	`3`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13814`	`33.1`	`-0.7`	`0.160`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`63`		[ACT]C:414	`2`	`1`	`184`	`f`	[ACT]C:405	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`183`	`30.2`	`-0.4`	`0.637`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`64`		[ACT]A:407	`1`	`1`	`184`	`f`	[ACT]A:405	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`29.7`	`-0.2`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`65`		[ACT]C:406	`1`	`1`	`184`	`f`	[ACT]C:404	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`29.4`	`-0.2`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`66`		[ACT]C:410	`4`	`1`	`184`	`◊`	[ACT]C:408	y,x,-z+1	`4_556`	`2`	`1`	`184`	`22.8`	`0.0`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`67`		[ACT]C:406	`2`	`1`	`184`	`f`	[CA]C:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`19.7`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
62	`68`		[ACT]C:407	`3`	`1`	`184`	`◊`	[ACT]B:403	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`17.9`	`-0.3`	`0.688`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`69`		[ACT]B:410	`3`	`1`	`183`	`f`	[ACT]B:405	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`183`	`15.9`	`-0.2`	`0.747`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`70`		[ACT]C:404	`1`	`1`	`183`	`f`	[CA]C:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`15.1`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
65	`71`		[ACT]D:402	`3`	`1`	`183`	`f`	[ACT]A:406	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`12.8`	`-0.2`	`0.688`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`72`		[ACT]C:414	`2`	`1`	`184`	`f`	[ACT]C:411	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`183`	`11.3`	`-0.1`	`0.781`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`73`		[ACT]C:413	`1`	`1`	`183`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`4`	`2`	`13714`	`10.8`	`-0.3`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`74`		[ACT]C:413	`1`	`1`	`183`	`◊`	[ACT]C:410	y,x,-z+1	`4_556`	`1`	`1`	`184`	`1.9`	`-0.1`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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