PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=369-63-5D3)

Interfaces in PDB 5vyb crystal.
Space symmetry group: C 2 2 21. Resolution: 2.40 Å

STRUCTURE OF THE CARBOHYDRATE RECOGNITION DOMAIN OF DECTIN-2 COMPLEXED WITH A MAMMALIAN-TYPE HIGH MANNOSE MAN9GLCNAC2 OLIGOSACCHARIDE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`56`	`14`	`7756`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`8_456`	`41`	`14`	`7756`	`427.6`	`-3.0`	`0.461`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`37`	`8`	`7756`	`◊`	A	-x+2,y,-z+3/2	`3_756`	`37`	`8`	`7756`	`364.5`	`-8.7`	`0.047`	`5`	`0`	`0`	`0.016`
3	`3`		[PEG]A:311	`7`	`1`	`261`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`7756`	`141.1`	`4.0`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`14`	`5`	`7756`	`x`	A	-x+3/2,-y+1/2,z-1/2	`6_654`	`15`	`5`	`7756`	`135.0`	`-2.5`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		[MAN]A:307	`11`	`1`	`289`	`f`	[MAN]A:301	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`11`	`1`	`292`	`87.2`	`2.3`	`0.072`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		[MAN]A:305	`10`	`1`	`290`	`f`	[MAN]A:303	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`10`	`1`	`291`	`84.1`	`1.9`	`0.077`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		[MAN]A:307	`9`	`1`	`289`	`◊`	A	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`13`	`8`	`7756`	`82.5`	`1.6`	`0.304`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		[BMA]A:304	`10`	`1`	`298`	`f`	[BMA]A:304	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`10`	`1`	`298`	`76.9`	`2.0`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		[MAN]A:301	`8`	`1`	`292`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`7756`	`76.1`	`1.6`	`0.376`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		[MAN]A:306	`9`	`1`	`292`	`◊`	A	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`13`	`7`	`7756`	`69.4`	`1.0`	`0.260`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[MAN]A:306	`11`	`1`	`292`	`f`	[MAN]A:302	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`11`	`1`	`292`	`69.2`	`2.1`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		[MAN]A:302	`10`	`1`	`292`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`7756`	`68.9`	`0.9`	`0.264`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		A	`9`	`5`	`7756`	`◊`	A	-x+1,y,-z+3/2	`3_656`	`9`	`5`	`7756`	`63.3`	`0.4`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		[NA]A:310	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`7756`	`63.0`	`-10.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
15	`15`		[BMA]A:304	`6`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:305	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`7`	`1`	`290`	`50.4`	`2.1`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		A	`6`	`3`	`7756`	`x`	A	-x+3/2,y-1/2,-z+3/2	`7_646`	`3`	`1`	`7756`	`46.8`	`1.3`	`0.780`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[CA]A:309	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`7756`	`43.4`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
18	`18`		[BMA]A:304	`6`	`1`	`298`	`cf`	[MAN]A:303	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`291`	`39.6`	`1.6`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		[MAN]A:303	`5`	`1`	`291`	`cf`	[MAN]A:302	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`292`	`37.1`	`1.7`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		[MAN]A:306	`6`	`1`	`292`	`cf`	[MAN]A:303	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`4`	`1`	`291`	`35.7`	`1.8`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.4`	`1.7`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[MAN]A:307	`5`	`1`	`289`	`cf`	[MAN]A:302	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`7`	`1`	`292`	`36.9`	`1.8`	`0.242`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[MAN]A:307	`5`	`1`	`289`	`cf`	[MAN]A:306	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`292`	`33.7`	`1.7`	`0.201`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.3`	`1.8`	`0.221`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		[MAN]A:305	`6`	`1`	`290`	`cf`	[MAN]A:302	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`6`	`1`	`292`	`36.2`	`1.3`	`0.184`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		[MAN]A:306	`6`	`1`	`292`	`cf`	[MAN]A:305	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`290`	`34.9`	`1.4`	`0.189`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.6`	`1.3`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[BMA]A:304	`5`	`1`	`298`	`cf`	[MAN]A:305	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`290`	`35.1`	`1.5`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[MAN]A:302	`7`	`1`	`292`	`cf`	[MAN]A:301	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`292`	`33.2`	`1.4`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[MAN]A:306	`5`	`1`	`292`	`cf`	[MAN]A:301	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`7`	`1`	`292`	`30.7`	`1.3`	`0.168`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`28`		[BMA]A:304	`5`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:306	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`4`	`1`	`292`	`25.2`	`0.3`	`0.126`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[BMA]A:304	`5`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:302	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`292`	`23.7`	`0.2`	`0.095`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`24.4`	`0.3`	`0.110`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`30`		[CA]A:308	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`7756`	`23.7`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
27	`31`		[PEG]A:311	`2`	`1`	`261`	`◊`	[PEG]A:311	-x+1,y,-z+3/2	`3_656`	`2`	`1`	`261`	`23.6`	`0.6`	`0.204`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`32`		[BMA]A:304	`2`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:303	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`4`	`1`	`291`	`23.3`	`1.1`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		[MAN]A:307	`3`	`1`	`289`	`f`	[MAN]A:303	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`3`	`1`	`291`	`22.9`	`1.1`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`34`		A	`2`	`1`	`7756`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`5_455`	`1`	`1`	`7756`	`22.0`	`0.1`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`35`		[PEG]A:311	`5`	`1`	`261`	`f`	A	-x+1,y,-z+3/2	`3_656`	`3`	`1`	`7756`	`21.6`	`0.4`	`0.208`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`36`		[MAN]A:303	`4`	`1`	`291`	`f`	[MAN]A:301	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`292`	`21.4`	`0.7`	`0.164`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		[MAN]A:307	`3`	`1`	`289`	`f`	[MAN]A:305	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`290`	`17.8`	`0.6`	`0.209`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`38`		[CA]A:308	`1`	`1`	`85`	`◊`	[MAN]A:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`292`	`16.9`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[CA]A:308	`1`	`1`	`85`	`◊`	[MAN]A:306	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`4`	`1`	`292`	`16.8`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`16.9`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		[NA]A:310	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`8_456`	`3`	`2`	`7756`	`16.7`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`41`		[MAN]A:305	`3`	`1`	`290`	`f`	[MAN]A:301	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`5`	`1`	`292`	`15.8`	`0.2`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		[MAN]A:301	`1`	`1`	`292`	`f`	[MAN]A:301	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`1`	`1`	`292`	`9.4`	`0.2`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`43`		[MAN]A:305	`2`	`1`	`290`	`◊`	A	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`2`	`2`	`7756`	`8.0`	`0.2`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		[MAN]A:303	`3`	`1`	`291`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`7756`	`6.1`	`0.2`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`45`		[BMA]A:304	`2`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:306	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`292`	`5.3`	`0.2`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[BMA]A:304	`2`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:302	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`3`	`1`	`292`	`3.6`	`0.1`	`0.221`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.5`	`0.2`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`47`		[BMA]A:304	`1`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:307	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`1`	`1`	`289`	`1.2`	`0.0`	`0.174`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`48`		[BMA]A:304	`1`	`1`	`298`	`f`	[MAN]A:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`292`	`1.1`	`0.0`	`0.174`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`49`		[MAN]A:303	`1`	`1`	`291`	`f`	[MAN]A:301	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`1`	`1`	`292`	`0.9`	`0.0`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`50`		[MAN]A:305	`1`	`1`	`290`	`f`	[MAN]A:305	x,-y+1,-z+1	`4_566`	`1`	`1`	`290`	`0.3`	`0.0`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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