PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=165-EP-908)

Interfaces in PDB 5xau crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.80 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF INTEGRIN BINDING FRAGMENT OF LAMININ-511

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		E	`185`	`42`	`7531`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`172`	`48`	`28227`	`1715.6`	`-34.5`	`0.002`	`9`	`2`	`0`	`1.000`
2	`2`		C	`130`	`38`	`7219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`129`	`36`	`7240`	`1455.4`	`-28.5`	`0.078`	`10`	`4`	`1`	`1.000`
3	`3`		B	`145`	`38`	`7240`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`141`	`43`	`27730`	`1333.9`	`-28.5`	`0.008`	`3`	`4`	`0`	`1.000`
4	`4`		C	`131`	`36`	`7219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`146`	`46`	`27730`	`1306.0`	`-22.9`	`0.079`	`15`	`5`	`1`	`1.000`
5	`5`		F	`102`	`27`	`5327`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`132`	`38`	`28227`	`1155.7`	`-19.8`	`0.087`	`12`	`2`	`1`	`1.000`
6	`6`		F	`98`	`27`	`5327`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`100`	`27`	`7531`	`1108.9`	`-21.7`	`0.111`	`10`	`3`	`1`	`1.000`
7	`7`		D	`60`	`19`	`28227`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`54`	`18`	`27730`	`550.9`	`-0.8`	`0.615`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
8	`8`		D	`58`	`19`	`28227`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`19`	`27730`	`509.9`	`-0.3`	`0.696`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		C	`44`	`11`	`7219`	`◊`	D	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`49`	`15`	`28227`	`413.0`	`-3.2`	`0.564`	`6`	`1`	`0`	`0.043`
10	`10`		B	`41`	`9`	`7240`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`41`	`11`	`27730`	`390.2`	`2.3`	`0.863`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
11	`11`		D	`36`	`13`	`28227`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`48`	`16`	`27730`	`380.4`	`1.0`	`0.787`	`5`	`0`	`0`	`0.009`
12	`12`		D	`35`	`10`	`28227`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`40`	`9`	`7240`	`351.6`	`-3.5`	`0.317`	`2`	`2`	`0`	`0.048`
13	`13`		A	`33`	`12`	`27730`	`◊`	D	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`37`	`13`	`28227`	`323.4`	`-1.0`	`0.593`	`4`	`2`	`0`	`0.022`
14	`14`		F	`28`	`7`	`5327`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`31`	`8`	`27730`	`268.2`	`-1.2`	`0.583`	`4`	`4`	`0`	`0.027`
15	`15`		E	`25`	`7`	`7531`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`23`	`6`	`7240`	`211.6`	`2.7`	`0.891`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
16	`16`		B	`17`	`6`	`7240`	`◊`	B	-x+1,y,-z+2	`2_657`	`17`	`6`	`7240`	`203.3`	`-1.7`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[NAG]A:3404	`13`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`34`	`13`	`27730`	`201.6`	`5.3`	`0.529`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[NAG]D:3404	`13`	`1`	`363`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`32`	`12`	`28227`	`193.3`	`4.3`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`197.4`	`4.8`	`0.488`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		E	`19`	`6`	`7531`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`7240`	`190.7`	`-4.0`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		E	`25`	`6`	`7531`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`17`	`6`	`27730`	`185.3`	`-3.0`	`0.222`	`1`	`0`	`0`	`0.025`
20	`21`		D	`22`	`6`	`28227`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`21`	`8`	`27730`	`181.7`	`-1.5`	`0.410`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		E	`13`	`8`	`7531`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`17`	`7`	`27730`	`179.4`	`-0.5`	`0.371`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
22	`23`		E	`13`	`3`	`7531`	`◊`	D	-x,y,-z-1	`2_554`	`22`	`9`	`28227`	`160.2`	`1.3`	`0.783`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
23	`24`		[NAG]D:3405	`12`	`1`	`364`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`28227`	`153.2`	`4.1`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]A:3405	`11`	`1`	`364`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`27730`	`137.4`	`3.8`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`145.3`	`3.9`	`0.466`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		F	`16`	`4`	`5327`	`◊`	F	-x,y,-z-1	`2_554`	`16`	`4`	`5327`	`139.4`	`-0.5`	`0.712`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		C	`16`	`4`	`7219`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`11`	`3`	`27730`	`125.8`	`-2.8`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[NAG]D:3403	`12`	`1`	`364`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`28227`	`120.1`	`3.5`	`0.377`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[NAG]A:3403	`11`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`27730`	`119.7`	`3.4`	`0.427`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		C	`13`	`4`	`7219`	`◊`	C	-x+1,y,-z+2	`2_657`	`13`	`4`	`7219`	`105.6`	`0.5`	`0.770`	`2`	`2`	`0`	`0.003`
29	`31`		[NAG]D:3402	`11`	`1`	`367`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`28227`	`104.9`	`3.5`	`0.416`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		E	`10`	`4`	`7531`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`27730`	`93.8`	`0.9`	`0.693`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		B	`8`	`4`	`7240`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`28227`	`89.4`	`0.5`	`0.599`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[NAG]A:3402	`8`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`27730`	`77.9`	`1.7`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[NAG]A:3406	`10`	`1`	`365`	`cf`	[NAG]A:3405	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`364`	`68.8`	`1.5`	`0.092`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		D	`9`	`4`	`28227`	`◊`	[NAG]A:3402	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`5`	`1`	`360`	`49.7`	`1.5`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		D	`9`	`4`	`28227`	`x`	D	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`5`	`2`	`28227`	`45.9`	`0.5`	`0.757`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		C	`4`	`2`	`7219`	`◊`	B	-x+1,y,-z+2	`2_657`	`6`	`3`	`7240`	`44.8`	`1.5`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[CA]A:3401	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`27730`	`43.7`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.445`
	`40`		[CA]D:3401	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`28227`	`43.0`	`-12.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.445`
	*Average:*													`43.4`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.445`
38	`41`		F	`3`	`1`	`5327`	`◊`	D	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`28227`	`40.3`	`1.9`	`0.914`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
39	`42`		[NAG]D:3402	`5`	`1`	`367`	`◊`	[NAG]A:3402	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`3`	`1`	`360`	`31.4`	`1.1`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`43`		F	`4`	`3`	`5327`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`27730`	`29.7`	`0.6`	`0.812`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`44`		[NAG]D:3402	`2`	`1`	`367`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`2`	`2`	`7240`	`28.3`	`1.1`	`0.747`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`45`		A	`5`	`3`	`27730`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`6`	`2`	`7240`	`27.6`	`1.2`	`0.848`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`46`		A	`4`	`3`	`27730`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`6`	`2`	`7219`	`24.4`	`0.4`	`0.746`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`47`		C	`4`	`2`	`7219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`28227`	`23.1`	`0.7`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`48`		F	`4`	`2`	`5327`	`◊`	E	-x,y,-z-1	`2_554`	`3`	`2`	`7531`	`22.6`	`0.1`	`0.688`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`49`		[NAG]A:3406	`2`	`1`	`365`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`27730`	`21.5`	`0.3`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`50`		F	`2`	`1`	`5327`	`◊`	[NAG]A:3403	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`362`	`21.3`	`0.1`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`51`		C	`3`	`2`	`7219`	`x`	C	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`1`	`1`	`7219`	`16.8`	`0.2`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`52`		B	`1`	`1`	`7240`	`◊`	D	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`2`	`1`	`28227`	`15.3`	`0.7`	`0.880`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		[NAG]A:3402	`1`	`1`	`360`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7240`	`8.8`	`0.4`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		E	`1`	`1`	`7531`	`◊`	D	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`1`	`1`	`28227`	`6.8`	`0.3`	`0.839`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		D	`2`	`2`	`28227`	`◊`	D	-x,y,-z-1	`2_554`	`2`	`2`	`28227`	`4.8`	`0.2`	`0.762`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`56`		[NAG]D:3402	`1`	`1`	`367`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`7531`	`4.0`	`0.2`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		[NAG]D:3402	`1`	`1`	`367`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`2`	`1`	`27730`	`3.8`	`-0.0`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`58`		E	`1`	`1`	`7531`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7219`	`2.5`	`-0.0`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`59`		A	`1`	`1`	`27730`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`1`	`1`	`27730`	`2.1`	`0.1`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`60`		D	`1`	`1`	`28227`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z-1	`3_454`	`1`	`1`	`27730`	`0.4`	`0.0`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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