PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=246-72-N49)

Interfaces in PDB 5y3j crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.81 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HORSE TLR9 IN COMPLEX WITH TWO DNAS (CPG DNA AND TCGCAC DNA)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`224`	`65`	`31804`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`225`	`65`	`31804`	`2161.2`	`-10.1`	`0.357`	`22`	`4`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`221`	`64`	`31695`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`220`	`64`	`31695`	`2148.6`	`-8.9`	`0.413`	`22`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2154.9`	`-9.5`	`0.385`	`22`	`5`	`0`	`0.000`
2	`3`		D	`106`	`9`	`2584`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`118`	`34`	`31695`	`970.3`	`-12.0`	`0.568`	`17`	`0`	`0`	`1.000`
	`4`		C	`105`	`9`	`2580`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`116`	`34`	`31804`	`963.9`	`-11.6`	`0.571`	`18`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`967.1`	`-11.8`	`0.569`	`18`	`0`	`0`	`1.000`
3	`5`		B	`57`	`31`	`31695`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`27`	`31804`	`521.9`	`7.7`	`0.957`	`7`	`5`	`0`	`0.000`
4	`6`		F	`59`	`5`	`1808`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`67`	`19`	`31695`	`489.8`	`-2.0`	`0.474`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		E	`58`	`5`	`1812`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`67`	`19`	`31804`	`485.9`	`-1.9`	`0.470`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`487.9`	`-2.0`	`0.472`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		B	`37`	`10`	`31695`	`x`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`35`	`13`	`31695`	`328.3`	`-2.2`	`0.154`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`9`		A	`35`	`13`	`31804`	`x`	A	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`38`	`10`	`31804`	`322.6`	`-2.4`	`0.150`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`325.5`	`-2.3`	`0.152`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
6	`10`		E	`25`	`3`	`1812`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`40`	`12`	`31804`	`273.5`	`-2.9`	`0.343`	`6`	`0`	`0`	`1.000`
	`11`		F	`25`	`3`	`1808`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`41`	`12`	`31695`	`272.8`	`-3.5`	`0.279`	`6`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`273.2`	`-3.2`	`0.311`	`6`	`0`	`0`	`1.000`
7	`12`		B	`20`	`7`	`31695`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`31`	`15`	`31804`	`239.7`	`3.1`	`0.711`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
8	`13`		C	`27`	`8`	`2580`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`33`	`10`	`31804`	`232.2`	`-5.4`	`0.447`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		D	`28`	`8`	`2584`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`33`	`11`	`31695`	`229.4`	`-5.2`	`0.476`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`230.8`	`-5.3`	`0.461`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`15`		C	`24`	`3`	`2580`	`◊`	E	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`23`	`3`	`1812`	`183.7`	`6.1`	`0.855`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		D	`24`	`3`	`2584`	`◊`	F	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`23`	`3`	`1808`	`182.3`	`6.0`	`0.855`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`183.0`	`6.1`	`0.855`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`17`		[NAG]A:1001	`11`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`11`	`31804`	`150.1`	`4.6`	`0.502`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[NAG]B:1001	`11`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`11`	`31695`	`149.2`	`4.5`	`0.512`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`149.7`	`4.5`	`0.507`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`19`		[NAG]A:1004	`11`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`31804`	`147.9`	`3.6`	`0.408`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		[NAG]B:1004	`11`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`31695`	`147.0`	`3.3`	`0.400`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`147.4`	`3.4`	`0.404`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[NAG]A:1010	`12`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`31804`	`133.8`	`4.0`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		F	`16`	`2`	`1808`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`15`	`7`	`31695`	`126.6`	`0.1`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		A	`14`	`7`	`31804`	`◊`	E	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`16`	`2`	`1812`	`126.3`	`0.2`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`126.5`	`0.1`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`24`		[NAG]B:1006	`11`	`1`	`365`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`31695`	`123.9`	`3.1`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]A:1006	`11`	`1`	`366`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`31804`	`123.8`	`3.1`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`123.9`	`3.1`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`26`		[NAG]B:1005	`8`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`31695`	`117.2`	`3.2`	`0.502`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[NAG]A:1005	`8`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`31804`	`116.5`	`3.1`	`0.518`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`116.8`	`3.1`	`0.510`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`28`		[NAG]B:1009	`10`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`31695`	`110.8`	`2.0`	`0.303`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`29`		[NAG]A:1009	`9`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`31804`	`110.7`	`2.2`	`0.360`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`30`		[NAG]A:1003	`10`	`1`	`364`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`31804`	`110.3`	`2.2`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[NAG]B:1003	`8`	`1`	`365`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`31695`	`109.6`	`2.2`	`0.411`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`109.9`	`2.2`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`32`		[NAG]B:1008	`11`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`31695`	`105.8`	`2.7`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[NAG]A:1008	`10`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`31804`	`100.6`	`2.6`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`103.2`	`2.6`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`34`		[NAG]B:1007	`10`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`31695`	`104.4`	`3.7`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[NAG]A:1007	`10`	`1`	`365`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`31804`	`103.4`	`3.5`	`0.457`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`103.9`	`3.6`	`0.469`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`36`		[NAG]A:1009	`11`	`1`	`359`	`◊`	E	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`16`	`2`	`1812`	`103.8`	`2.4`	`0.237`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		F	`13`	`2`	`1808`	`◊`	[NAG]B:1009	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`10`	`1`	`362`	`99.2`	`3.2`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`101.5`	`2.8`	`0.285`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`38`		[NAG]B:1009	`9`	`1`	`362`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`12`	`3`	`2584`	`91.5`	`2.4`	`0.438`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[NAG]A:1009	`9`	`1`	`359`	`◊`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`12`	`3`	`2580`	`90.6`	`2.3`	`0.442`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`91.1`	`2.4`	`0.440`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`40`		[NAG]A:1010	`8`	`1`	`358`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`31695`	`80.3`	`0.5`	`0.199`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`41`		[NAG]A:1002	`9`	`1`	`365`	`cf`	[NAG]A:1001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`71.3`	`1.6`	`0.071`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[NAG]B:1002	`9`	`1`	`365`	`cf`	[NAG]B:1001	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`361`	`70.9`	`1.6`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`71.1`	`1.6`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`43`		[MG]B:1010	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`31695`	`56.9`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
	`44`		[MG]A:1011	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`31804`	`56.4`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`56.6`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`1.000`
26	`45`		[NAG]A:1006	`6`	`1`	`366`	`◊`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`6`	`2`	`2580`	`54.8`	`1.6`	`0.365`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[NAG]B:1006	`6`	`1`	`365`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`6`	`2`	`2584`	`54.8`	`1.5`	`0.363`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.8`	`1.6`	`0.364`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`47`		A	`5`	`2`	`31804`	`◊`	E	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`8`	`2`	`1812`	`52.0`	`1.2`	`0.692`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		B	`5`	`3`	`31695`	`◊`	F	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`10`	`3`	`1808`	`48.9`	`1.0`	`0.677`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`50.5`	`1.1`	`0.684`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`49`		B	`12`	`8`	`31695`	`◊`	A	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`5`	`3`	`31804`	`51.1`	`1.6`	`0.792`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`50`		C	`8`	`1`	`2580`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`5`	`2`	`31804`	`49.4`	`0.8`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		D	`7`	`1`	`2584`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`5`	`2`	`31695`	`48.5`	`0.7`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`49.0`	`0.7`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`52`		[NAG]B:1003	`3`	`1`	`365`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`31804`	`37.1`	`0.2`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`53`		[NAG]B:1009	`4`	`1`	`362`	`f`	[NAG]B:1006	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`365`	`36.6`	`1.9`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NAG]A:1009	`4`	`1`	`359`	`f`	[NAG]A:1006	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`366`	`36.0`	`1.9`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.3`	`1.9`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`55`		[NAG]B:1002	`4`	`1`	`365`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`31695`	`35.6`	`0.7`	`0.335`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[NAG]A:1002	`5`	`1`	`365`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`31804`	`34.8`	`0.7`	`0.279`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.2`	`0.7`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`57`		[NAG]A:1008	`3`	`1`	`358`	`◊`	E	-x,y,-z+1	`2_556`	`6`	`1`	`1812`	`30.3`	`1.2`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[NAG]B:1008	`3`	`1`	`360`	`◊`	F	-x,y,-z	`2_555`	`6`	`1`	`1808`	`29.6`	`1.1`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`30.0`	`1.2`	`0.536`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`59`		[NAG]A:1007	`3`	`1`	`365`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`5`	`1`	`31804`	`26.1`	`-0.1`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		B	`5`	`1`	`31695`	`◊`	[NAG]B:1007	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`3`	`1`	`364`	`25.7`	`-0.0`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.9`	`-0.1`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`61`		[NAG]A:1008	`4`	`1`	`358`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`1`	`1`	`31804`	`19.4`	`1.1`	`0.431`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NAG]B:1008	`4`	`1`	`360`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`1`	`1`	`31695`	`18.0`	`1.0`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.7`	`1.1`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`63`		[NAG]A:1003	`3`	`1`	`364`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`31695`	`18.3`	`0.1`	`0.216`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`64`		[NAG]B:1006	`3`	`1`	`365`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`2`	`31695`	`15.2`	`0.0`	`0.274`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[NAG]A:1006	`2`	`1`	`366`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`3`	`2`	`31804`	`13.9`	`-0.0`	`0.265`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`14.5`	`-0.0`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`66`		[NAG]B:1009	`2`	`1`	`362`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`2`	`31695`	`11.1`	`0.2`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		[NAG]A:1009	`2`	`1`	`359`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`3`	`2`	`31804`	`9.4`	`0.2`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`10.2`	`0.2`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`68`		B	`4`	`2`	`31695`	`x`	B	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`1`	`1`	`31695`	`10.0`	`-0.3`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`69`		A	`1`	`1`	`31804`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`4`	`2`	`31804`	`9.1`	`-0.3`	`0.303`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`9.6`	`-0.3`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`70`		[MG]A:1011	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`2`	`1`	`31804`	`8.4`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[MG]B:1010	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`1`	`31695`	`8.2`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`8.3`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`72`		[NAG]A:1006	`1`	`1`	`366`	`◊`	E	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`1`	`1`	`1812`	`1.1`	`0.1`	`0.251`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		F	`1`	`1`	`1808`	`◊`	[NAG]B:1006	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`1`	`1`	`365`	`0.3`	`0.0`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`0.7`	`0.0`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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