PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=277-4H-4O2)

Interfaces in PDB 5yut crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.15 Å

DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 3

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`101`	`11`	`4312`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`118`	`36`	`17656`	`966.5`	`-17.2`	`0.396`	`20`	`0`	`0`	`0.542`
	`2`		G	`103`	`11`	`4240`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`113`	`36`	`17537`	`944.3`	`-18.9`	`0.384`	`19`	`0`	`0`	`0.542`
	*Average:*													`955.4`	`-18.0`	`0.390`	`20`	`0`	`0`	`0.542`
2	`3`		F	`69`	`23`	`17537`	`x`	F	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`74`	`25`	`17537`	`654.8`	`-5.0`	`0.421`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		A	`69`	`24`	`17656`	`x`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`72`	`23`	`17656`	`644.0`	`-2.6`	`0.554`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`649.4`	`-3.8`	`0.487`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
3	`5`		C	`61`	`15`	`4083`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`67`	`15`	`4312`	`653.2`	`-10.1`	`0.601`	`47`	`0`	`0`	`1.000`
4	`6`		H	`62`	`16`	`3767`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`65`	`15`	`4240`	`646.3`	`-10.0`	`0.654`	`44`	`0`	`0`	`1.000`
5	`7`		C	`67`	`9`	`4083`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`69`	`24`	`17656`	`558.7`	`-13.5`	`0.342`	`16`	`0`	`0`	`0.445`
6	`8`		H	`65`	`9`	`3767`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`65`	`25`	`17537`	`550.0`	`-13.3`	`0.398`	`15`	`0`	`0`	`0.438`
7	`9`		C	`57`	`4`	`4083`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`63`	`19`	`17537`	`545.2`	`2.8`	`0.894`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		[TTP]A:900	`27`	`1`	`547`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`18`	`17656`	`276.6`	`-1.3`	`0.602`	`9`	`0`	`0`	`0.115`
	`11`		[TTP]F:900	`27`	`1`	`545`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`49`	`19`	`17537`	`270.9`	`-0.8`	`0.640`	`10`	`0`	`0`	`0.115`
	*Average:*													`273.8`	`-1.0`	`0.621`	`10`	`0`	`0`	`0.115`
9	`12`		F	`33`	`8`	`17537`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`10`	`17656`	`225.8`	`0.8`	`0.740`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
10	`13`		H	`23`	`2`	`3767`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`18`	`6`	`17656`	`200.3`	`-1.1`	`0.553`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		F	`19`	`7`	`17537`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`21`	`8`	`17656`	`185.2`	`-0.2`	`0.627`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		C	`21`	`4`	`4083`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`23`	`7`	`17656`	`173.3`	`-4.8`	`0.312`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		H	`26`	`5`	`3767`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`16`	`5`	`17537`	`170.6`	`-4.2`	`0.216`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		B	`23`	`5`	`4312`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`18`	`7`	`17537`	`162.7`	`-2.1`	`0.589`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		G	`16`	`3`	`4240`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`18`	`7`	`17537`	`155.8`	`-3.9`	`0.392`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		G	`12`	`4`	`4240`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`17656`	`122.5`	`-4.0`	`0.216`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		C	`14`	`2`	`4083`	`◊`	G	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`16`	`3`	`4240`	`105.9`	`-0.4`	`0.630`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[TTP]F:900	`16`	`1`	`545`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`14`	`1`	`3767`	`104.5`	`0.6`	`0.680`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[TTP]A:900	`16`	`1`	`547`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`4083`	`103.1`	`0.7`	`0.684`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		H	`10`	`3`	`3767`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`17656`	`92.1`	`-1.7`	`0.512`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		A	`7`	`2`	`17656`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`3`	`17656`	`62.6`	`-1.2`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		F	`3`	`1`	`17537`	`x`	F	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`17537`	`37.1`	`-0.4`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`49.8`	`-0.8`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		B	`7`	`1`	`4312`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`11`	`2`	`4312`	`61.5`	`-1.8`	`0.431`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		G	`8`	`2`	`4240`	`x`	G	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`2`	`4240`	`57.1`	`-0.9`	`0.504`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`59.3`	`-1.3`	`0.468`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`28`		[TTP]A:900	`6`	`1`	`547`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4312`	`60.6`	`1.3`	`0.737`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[TTP]F:900	`6`	`1`	`545`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4240`	`60.2`	`1.3`	`0.727`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`60.4`	`1.3`	`0.732`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		F	`8`	`3`	`17537`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`5`	`1`	`4312`	`55.4`	`1.2`	`0.760`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`31`		[MG]A:901	`1`	`1`	`98`	`f`	[TTP]A:900	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`547`	`30.7`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`32`		[MG]F:901	`1`	`1`	`98`	`f`	[TTP]F:900	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`545`	`30.4`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`30.6`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
26	`33`		[MG]F:901	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17537`	`30.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	`34`		[MG]A:901	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17656`	`29.5`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	*Average:*													`29.9`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
27	`35`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`17537`	`28.8`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	`36`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`17656`	`28.5`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
	*Average:*													`28.7`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
28	`37`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[TTP]A:900	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`547`	`24.1`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
	`38`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[TTP]F:900	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`545`	`23.6`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
	*Average:*													`23.9`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
29	`39`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`3767`	`22.9`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
30	`40`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`4083`	`20.5`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
31	`41`		F	`2`	`1`	`17537`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`17656`	`12.7`	`0.6`	`0.851`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`42`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
33	`43`		C	`1`	`1`	`4083`	`◊`	[TTP]F:900	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`3`	`1`	`545`	`11.4`	`-0.5`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`44`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]F:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.0`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
35	`45`		C	`1`	`1`	`4083`	`◊`	H	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`1`	`1`	`3767`	`9.2`	`-1.0`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`46`		F	`1`	`1`	`17537`	`x`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`2`	`1`	`17537`	`6.8`	`0.4`	`0.836`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`47`		[MG]F:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3767`	`3.8`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
38	`48`		[MG]A:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`4083`	`1.6`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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