PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=811-HB-6N6)

Interfaces in PDB 5yuz crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.83 Å

DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX 11

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`94`	`10`	`4103`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`106`	`35`	`17739`	`914.8`	`-14.5`	`0.424`	`21`	`0`	`0`	`0.568`
	`2`		G	`98`	`10`	`4089`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`104`	`36`	`17593`	`893.4`	`-14.0`	`0.471`	`18`	`0`	`0`	`0.568`
	*Average:*													`904.1`	`-14.3`	`0.448`	`20`	`0`	`0`	`0.568`
2	`3`		H	`85`	`10`	`3527`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`100`	`34`	`17593`	`703.5`	`-14.1`	`0.458`	`17`	`0`	`0`	`0.482`
3	`4`		F	`73`	`25`	`17593`	`x`	F	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`73`	`24`	`17593`	`678.0`	`-3.4`	`0.519`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`5`		A	`67`	`24`	`17739`	`x`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`69`	`24`	`17739`	`627.3`	`-3.1`	`0.486`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`652.6`	`-3.3`	`0.503`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
4	`6`		C	`87`	`10`	`4256`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`99`	`34`	`17739`	`677.3`	`-12.1`	`0.502`	`19`	`0`	`0`	`0.410`
5	`7`		C	`68`	`16`	`4256`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`66`	`15`	`4103`	`672.8`	`-10.2`	`0.603`	`45`	`0`	`0`	`1.000`
6	`8`		H	`64`	`15`	`3527`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`68`	`15`	`4089`	`666.4`	`-11.1`	`0.582`	`47`	`0`	`0`	`1.000`
7	`9`		C	`56`	`4`	`4256`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`70`	`19`	`17593`	`531.0`	`-1.0`	`0.786`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		F	`28`	`7`	`17593`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`17739`	`223.6`	`-0.3`	`0.570`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
9	`11`		[TTP]C:901	`25`	`1`	`543`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`49`	`19`	`17739`	`203.6`	`-0.7`	`0.581`	`10`	`0`	`0`	`0.109`
10	`12`		H	`27`	`4`	`3527`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`25`	`9`	`17593`	`200.6`	`-5.8`	`0.360`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		F	`19`	`6`	`17593`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`22`	`8`	`17739`	`184.0`	`-0.5`	`0.575`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		C	`22`	`4`	`4256`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`19`	`6`	`17739`	`175.1`	`-4.3`	`0.323`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		G	`15`	`3`	`4089`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`19`	`7`	`17593`	`160.0`	`-4.1`	`0.349`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		C	`19`	`2`	`4256`	`◊`	G	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`25`	`4`	`4089`	`158.0`	`0.8`	`0.740`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		[TTP]C:901	`23`	`1`	`543`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`2`	`4256`	`133.0`	`-0.4`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
16	`18`		B	`15`	`4`	`4103`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`13`	`4`	`17593`	`128.4`	`-1.8`	`0.513`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		[DPO]F:903	`9`	`1`	`265`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`24`	`13`	`17593`	`123.5`	`-0.3`	`0.478`	`6`	`0`	`0`	`0.076`
18	`20`		G	`15`	`4`	`4089`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17739`	`110.6`	`-2.7`	`0.434`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		H	`11`	`3`	`3527`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17739`	`97.6`	`-1.2`	`0.563`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		[DPO]A:903	`9`	`1`	`265`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`13`	`17739`	`93.0`	`0.7`	`0.635`	`6`	`0`	`0`	`0.041`
21	`23`		[TTP]C:901	`14`	`1`	`543`	`f`	[DPO]A:903	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`265`	`77.0`	`-0.7`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
22	`24`		A	`4`	`1`	`17739`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`3`	`17739`	`70.5`	`-2.0`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		F	`3`	`1`	`17593`	`x`	F	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`17593`	`40.5`	`-0.5`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`55.5`	`-1.2`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[DPO]F:903	`5`	`1`	`265`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`3527`	`58.3`	`-0.0`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		F	`9`	`3`	`17593`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`5`	`1`	`4103`	`49.6`	`1.0`	`0.694`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`28`		[TTP]C:901	`6`	`1`	`543`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4103`	`48.2`	`1.1`	`0.701`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`29`		[DPO]A:903	`5`	`1`	`265`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`4256`	`41.0`	`-0.1`	`0.490`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
27	`30`		G	`6`	`1`	`4089`	`x`	G	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`1`	`4089`	`39.5`	`-0.1`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		B	`2`	`1`	`4103`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`1`	`4103`	`11.3`	`-0.9`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.4`	`-0.5`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`32`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`17593`	`29.9`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
	`33`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`17739`	`24.1`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
	*Average:*													`27.0`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
29	`34`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3527`	`28.4`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
30	`35`		[MG]F:901	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`17593`	`27.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.104`
	`36`		[MG]A:901	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`17739`	`19.6`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.104`
	*Average:*													`23.5`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.104`
31	`37`		[DPO]F:903	`4`	`1`	`265`	`f`	[MG]F:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`25.1`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
32	`38`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`4256`	`22.9`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
33	`39`		[MG]F:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3527`	`21.6`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
34	`40`		[TTP]C:901	`5`	`1`	`543`	`f`	[MG]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
35	`41`		[TTP]C:901	`3`	`1`	`543`	`f`	[MG]A:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.0`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
36	`42`		C	`1`	`1`	`4256`	`◊`	H	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`3`	`2`	`3527`	`17.5`	`-1.8`	`0.234`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`43`		[DPO]A:903	`4`	`1`	`265`	`f`	[MG]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`17.2`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
38	`44`		[MG]A:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`4256`	`15.9`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
39	`45`		C	`2`	`1`	`4256`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`17739`	`15.7`	`-0.6`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]F:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
41	`47`		F	`2`	`1`	`17593`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`17739`	`10.7`	`0.5`	`0.840`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`48`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`8.8`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
43	`49`		[DPO]F:903	`3`	`1`	`265`	`f`	[MG]F:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`7.6`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
44	`50`		F	`1`	`1`	`17593`	`x`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`1`	`1`	`17593`	`4.7`	`0.3`	`0.861`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		[DPO]A:903	`3`	`1`	`265`	`f`	[MG]A:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`3.8`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
46	`52`		B	`1`	`1`	`4103`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`17739`	`3.0`	`-0.2`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe