PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=153-44-99O)

Interfaces in PDB 5zln crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.30 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF MOUSE TLR9 IN COMPLEX WITH TWO DNAS (CPG DNA AND TCGCCA DNA)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`207`	`59`	`31623`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`207`	`59`	`31820`	`1915.1`	`-14.0`	`0.160`	`22`	`4`	`0`	`1.000`
2	`2`		D	`106`	`10`	`2573`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`120`	`35`	`31623`	`961.1`	`-12.8`	`0.397`	`13`	`0`	`0`	`1.000`
	`3`		C	`104`	`9`	`2562`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`119`	`35`	`31820`	`933.3`	`-12.1`	`0.345`	`13`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`947.2`	`-12.5`	`0.371`	`13`	`0`	`0`	`1.000`
3	`4`		A	`74`	`20`	`31820`	`x`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`69`	`20`	`31820`	`612.3`	`-4.4`	`0.200`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		E	`50`	`4`	`1246`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`70`	`19`	`31820`	`451.2`	`-0.9`	`0.546`	`7`	`0`	`0`	`0.218`
	`6`		F	`47`	`4`	`1250`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`62`	`18`	`31623`	`429.1`	`-1.4`	`0.487`	`7`	`0`	`0`	`0.218`
	*Average:*													`440.1`	`-1.1`	`0.517`	`7`	`0`	`0`	`0.218`
5	`7`		A	`39`	`13`	`31820`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`39`	`14`	`31623`	`395.1`	`-2.6`	`0.249`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
6	`8`		A	`35`	`10`	`31820`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`36`	`13`	`31623`	`326.9`	`2.1`	`0.760`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
7	`9`		F	`26`	`3`	`1250`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`42`	`12`	`31820`	`273.0`	`-2.1`	`0.449`	`5`	`0`	`0`	`0.855`
	`10`		E	`27`	`3`	`1246`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`13`	`31623`	`270.1`	`-2.5`	`0.396`	`5`	`0`	`0`	`0.855`
	*Average:*													`271.6`	`-2.3`	`0.423`	`5`	`0`	`0`	`0.855`
8	`11`		C	`31`	`7`	`2562`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`36`	`11`	`31623`	`269.4`	`-5.3`	`0.444`	`3`	`0`	`0`	`0.187`
	`12`		D	`30`	`7`	`2573`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`11`	`31820`	`267.7`	`-4.8`	`0.467`	`3`	`0`	`0`	`0.187`
	*Average:*													`268.6`	`-5.1`	`0.455`	`3`	`0`	`0`	`0.187`
9	`13`		B	`32`	`9`	`31623`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`30`	`14`	`31820`	`268.1`	`-1.0`	`0.441`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
10	`14`		A	`28`	`7`	`31820`	`◊`	C	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`24`	`3`	`2562`	`235.3`	`0.2`	`0.541`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		[NAG]A:914	`13`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`12`	`31820`	`165.1`	`5.2`	`0.479`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[NAG]B:911	`13`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`12`	`31623`	`162.8`	`4.7`	`0.465`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`163.9`	`5.0`	`0.472`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[NAG]A:901	`14`	`1`	`355`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`31820`	`161.8`	`4.4`	`0.382`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`18`		[NAG]B:901	`11`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`31623`	`160.6`	`4.2`	`0.474`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[NAG]A:908	`11`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`31820`	`154.2`	`5.2`	`0.562`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[NAG]B:905	`11`	`1`	`364`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`31623`	`142.9`	`5.1`	`0.528`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		E	`15`	`2`	`1246`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`16`	`4`	`31623`	`142.8`	`-0.2`	`0.444`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		[NAG]A:905	`10`	`1`	`365`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`31820`	`130.8`	`3.7`	`0.462`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[NAG]B:903	`10`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`31623`	`125.1`	`3.8`	`0.487`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`128.0`	`3.7`	`0.475`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[NAG]A:910	`10`	`1`	`363`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`31820`	`120.8`	`3.0`	`0.407`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]B:907	`10`	`1`	`361`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`31623`	`118.4`	`3.1`	`0.424`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`119.6`	`3.1`	`0.415`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		[NAG]B:902	`10`	`1`	`366`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`31623`	`115.7`	`2.2`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		[NAG]A:904	`10`	`1`	`367`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`31820`	`110.5`	`2.4`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`28`		[NAG]A:912	`10`	`1`	`368`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`31820`	`99.8`	`2.4`	`0.326`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`29`		[NAG]B:909	`10`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`31623`	`95.5`	`2.5`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`30`		[SO4]A:917	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`31820`	`94.9`	`-14.8`	`0.382`	`3`	`0`	`0`	`0.716`
24	`31`		[SO4]A:918	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`31820`	`92.6`	`-12.1`	`0.896`	`5`	`0`	`0`	`0.634`
25	`32`		[SO4]A:916	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`31820`	`90.2`	`-11.9`	`0.732`	`3`	`0`	`0`	`0.589`
26	`33`		[NAG]B:909	`9`	`1`	`362`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`2562`	`85.7`	`2.1`	`0.402`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`34`		[NAG]A:912	`9`	`1`	`368`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`2573`	`82.0`	`2.1`	`0.380`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`35`		[SO4]B:913	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`31623`	`81.6`	`-12.5`	`0.435`	`4`	`0`	`0`	`1.000`
29	`36`		[NAG]B:906	`10`	`1`	`366`	`cf`	[NAG]B:905	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`364`	`77.9`	`1.9`	`0.082`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`37`		[NAG]B:912	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]B:911	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`359`	`72.4`	`1.8`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[NAG]A:915	`9`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]A:914	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`359`	`72.4`	`2.0`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`72.4`	`1.9`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`39`		[NAG]B:910	`8`	`1`	`364`	`cf`	[NAG]B:909	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`362`	`71.9`	`1.8`	`0.118`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[NAG]A:913	`8`	`1`	`367`	`cf`	[NAG]A:912	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`368`	`70.7`	`1.7`	`0.098`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[NAG]B:904	`9`	`1`	`368`	`cf`	[NAG]B:903	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`68.0`	`1.5`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.2`	`1.7`	`0.106`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`42`		[NAG]A:908	`7`	`1`	`361`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`8`	`3`	`31623`	`71.8`	`1.3`	`0.296`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`43`		[NAG]A:909	`4`	`1`	`365`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`9`	`5`	`31623`	`71.1`	`1.3`	`0.352`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`44`		[NAG]B:908	`9`	`1`	`367`	`cf`	[NAG]B:907	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`361`	`70.9`	`2.0`	`0.124`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`45`		[NAG]A:902	`8`	`1`	`364`	`cf`	[NAG]A:901	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`355`	`68.1`	`1.6`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`46`		[NAG]A:906	`8`	`1`	`366`	`cf`	[NAG]A:905	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`365`	`68.1`	`1.2`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`47`		[SO4]A:916	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`11`	`4`	`31623`	`68.0`	`-8.8`	`0.789`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		[NAG]A:909	`8`	`1`	`365`	`cf`	[NAG]A:908	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`361`	`66.0`	`1.6`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`49`		[NAG]A:911	`8`	`1`	`366`	`cf`	[NAG]A:910	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`363`	`63.1`	`1.0`	`0.078`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`50`		[SO4]A:919	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`31820`	`62.1`	`-8.2`	`0.863`	`2`	`0`	`0`	`0.403`
41	`51`		[NAG]A:906	`3`	`1`	`366`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`9`	`4`	`31623`	`59.0`	`1.7`	`0.629`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`52`		[BMA]A:903	`6`	`1`	`295`	`cf`	[NAG]A:902	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`364`	`55.3`	`1.2`	`0.134`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		[BMA]A:907	`5`	`1`	`296`	`cf`	[NAG]A:906	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`366`	`54.5`	`0.8`	`0.139`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`54`		[NAG]A:902	`4`	`1`	`364`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`31820`	`47.6`	`1.0`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`55`		[NAG]A:915	`3`	`1`	`363`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`31820`	`45.6`	`0.8`	`0.401`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`56`		[NAG]B:912	`3`	`1`	`360`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`31623`	`43.1`	`0.7`	`0.411`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`57`		B	`4`	`1`	`31623`	`x`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`3`	`1`	`31623`	`41.4`	`0.1`	`0.490`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`58`		[NAG]A:910	`3`	`1`	`363`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`1250`	`37.6`	`0.8`	`0.514`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`59`		[NAG]B:907	`3`	`1`	`361`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`1246`	`35.6`	`0.8`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`60`		E	`6`	`1`	`1246`	`◊`	D	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`5`	`2`	`2573`	`33.3`	`-0.4`	`0.503`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`61`		[NAG]B:909	`1`	`1`	`362`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31820`	`29.1`	`0.7`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`62`		[NAG]B:908	`3`	`1`	`367`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`31820`	`25.6`	`1.2`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`63`		A	`2`	`1`	`31820`	`◊`	[BMA]A:903	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`3`	`1`	`295`	`23.3`	`0.2`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`64`		[NAG]B:908	`1`	`1`	`367`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`31623`	`20.6`	`0.6`	`0.646`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`65`		[NAG]A:912	`1`	`1`	`368`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31623`	`18.8`	`0.3`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`66`		[NAG]B:910	`4`	`1`	`364`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`2562`	`11.2`	`0.5`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`67`		[NAG]A:913	`2`	`1`	`367`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2573`	`10.4`	`0.3`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`68`		A	`4`	`3`	`31820`	`◊`	[NAG]A:902	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`364`	`10.3`	`0.4`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`69`		[NAG]A:906	`1`	`1`	`366`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31820`	`9.7`	`0.5`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`70`		[NAG]A:911	`1`	`1`	`366`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`31623`	`8.0`	`0.2`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`71`		[NAG]A:909	`1`	`1`	`365`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31820`	`7.0`	`0.3`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`72`		[NAG]B:906	`1`	`1`	`366`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31623`	`4.4`	`0.2`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`73`		A	`1`	`1`	`31820`	`◊`	[NAG]A:901	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`355`	`3.3`	`0.2`	`0.550`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`74`		[NAG]A:911	`1`	`1`	`366`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31820`	`3.0`	`0.0`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		[NAG]B:907	`2`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31820`	`2.7`	`0.2`	`0.410`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		[NAG]A:910	`1`	`1`	`363`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`31623`	`0.6`	`0.0`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1.7`	`0.1`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`77`		[NAG]A:905	`1`	`1`	`365`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`31623`	`2.1`	`-0.0`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`78`		[NAG]A:913	`2`	`1`	`367`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31623`	`2.0`	`0.1`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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