PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=912-EG-H4E)

Interfaces in PDB 5zlv crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.35 Å

DNA POLYMERASE IV - DNA TERNARY COMPLEX WITH 50MM MGCL2

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		G	`95`	`10`	`3878`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`104`	`34`	`17595`	`874.0`	`-14.1`	`0.443`	`18`	`0`	`0`	`0.599`
	`2`		B	`87`	`10`	`4094`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`113`	`36`	`17695`	`872.1`	`-15.4`	`0.362`	`22`	`0`	`0`	`0.599`
	*Average:*													`873.0`	`-14.8`	`0.402`	`20`	`0`	`0`	`0.599`
2	`3`		C	`86`	`10`	`4023`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`98`	`33`	`17695`	`712.7`	`-12.6`	`0.550`	`19`	`0`	`0`	`0.471`
3	`4`		H	`86`	`10`	`3295`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`100`	`34`	`17595`	`707.6`	`-13.3`	`0.530`	`18`	`0`	`0`	`0.288`
4	`5`		C	`65`	`16`	`4023`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`68`	`15`	`4094`	`676.4`	`-10.5`	`0.636`	`46`	`0`	`0`	`1.000`
5	`6`		F	`68`	`23`	`17595`	`x`	F	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`76`	`26`	`17595`	`667.4`	`-3.6`	`0.499`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	`7`		A	`69`	`24`	`17695`	`x`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`70`	`23`	`17695`	`605.8`	`-2.2`	`0.572`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`636.6`	`-2.9`	`0.535`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
6	`8`		H	`62`	`14`	`3295`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`62`	`14`	`3878`	`615.1`	`-9.4`	`0.637`	`41`	`0`	`0`	`0.843`
7	`9`		C	`44`	`3`	`4023`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`46`	`13`	`17595`	`402.1`	`-1.3`	`0.784`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		F	`26`	`7`	`17595`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`9`	`17695`	`227.3`	`0.4`	`0.680`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
9	`11`		F	`20`	`6`	`17595`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`21`	`8`	`17695`	`184.4`	`0.2`	`0.667`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		C	`20`	`4`	`4023`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`21`	`6`	`17695`	`171.6`	`-4.8`	`0.295`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		H	`17`	`3`	`3295`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`22`	`8`	`17595`	`162.4`	`-5.5`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		G	`18`	`3`	`3878`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`20`	`7`	`17595`	`153.6`	`-3.9`	`0.405`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		B	`20`	`4`	`4094`	`◊`	F	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`14`	`4`	`17595`	`152.2`	`-2.1`	`0.552`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		[DPO]A:903	`9`	`1`	`263`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`13`	`17695`	`127.2`	`-0.2`	`0.476`	`6`	`0`	`0`	`0.069`
15	`17`		G	`15`	`4`	`3878`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17695`	`113.3`	`-2.9`	`0.426`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		C	`15`	`1`	`4023`	`◊`	G	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`16`	`3`	`3878`	`99.6`	`-0.3`	`0.661`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		H	`11`	`3`	`3295`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`17695`	`97.2`	`-1.4`	`0.562`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		[PO4]F:904	`5`	`1`	`188`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`17595`	`83.7`	`-5.0`	`0.697`	`3`	`0`	`0`	`0.122`
19	`21`		A	`6`	`2`	`17695`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`3`	`17695`	`80.5`	`-2.4`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		F	`3`	`1`	`17595`	`x`	F	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`17595`	`36.8`	`-0.6`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`58.6`	`-1.5`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		[DPO]A:903	`5`	`1`	`263`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`4023`	`60.3`	`-0.2`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
21	`24`		[PO4]F:903	`5`	`1`	`189`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`10`	`17595`	`60.0`	`-3.7`	`0.811`	`3`	`0`	`0`	`0.096`
22	`25`		F	`8`	`3`	`17595`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`6`	`1`	`4094`	`57.0`	`1.8`	`0.815`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[PO4]F:903	`4`	`1`	`189`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`3295`	`43.2`	`-2.7`	`0.745`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
24	`27`		[MG]H:901	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`3295`	`34.0`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.157`
25	`28`		[PO4]F:904	`4`	`1`	`188`	`f`	[PO4]F:903	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`189`	`33.8`	`-3.1`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
26	`29`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`17595`	`30.9`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.113`
	`30`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`17695`	`30.4`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.113`
	*Average:*													`30.6`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.113`
27	`31`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3295`	`29.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
28	`32`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`4023`	`28.2`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.078`
29	`33`		[MG]A:901	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`17695`	`27.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
	`34`		[MG]F:901	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17595`	`25.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
	*Average:*													`26.4`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
30	`35`		[DPO]A:903	`4`	`1`	`263`	`f`	[MG]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.3`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
31	`36`		[MG]A:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`4023`	`22.9`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
32	`37`		[MG]F:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`3295`	`20.2`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
33	`38`		[PO4]F:903	`1`	`1`	`189`	`◊`	[MG]H:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.4`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
34	`39`		C	`1`	`1`	`4023`	`◊`	H	-x-1,y-1/2,-z-1	`2_444`	`3`	`2`	`3295`	`18.2`	`-1.8`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		[PO4]F:904	`3`	`1`	`188`	`f`	[MG]F:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.7`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
36	`41`		[PO4]F:903	`3`	`1`	`189`	`f`	[MG]F:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.1`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
37	`42`		[PO4]F:904	`3`	`1`	`188`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3295`	`16.1`	`-1.4`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
38	`43`		F	`2`	`1`	`17595`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`17695`	`14.9`	`-0.0`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		[PO4]F:904	`3`	`1`	`188`	`◊`	[MG]H:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.0`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
40	`45`		[MG]A:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.9`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
41	`46`		G	`1`	`1`	`3878`	`x`	G	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`3878`	`11.2`	`0.1`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`47`		[MG]F:902	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]F:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
43	`48`		[MG]H:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`17595`	`10.0`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
44	`49`		[DPO]A:903	`3`	`1`	`263`	`f`	[MG]A:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`6.4`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
45	`50`		[MG]H:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	[MG]F:901	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`2.3`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
46	`51`		[PO4]F:903	`2`	`1`	`189`	`f`	[MG]F:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.8`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
47	`52`		[PO4]F:904	`1`	`1`	`188`	`f`	[MG]F:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`1.5`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
48	`53`		[MG]H:901	`1`	`1`	`98`	`◊`	[MG]F:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`0.7`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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