PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=652-5B-20H)

Interfaces in PDB 6a4b crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.70 Å

STRUCTURE OF TREX2 IN COMPLEX WITH A DUPLEX DNA WITH 2 NUCLEOTIDE 3'- OVERHANG

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`154`	`41`	`11247`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`157`	`43`	`11366`	`1517.6`	`-6.1`	`0.505`	`33`	`13`	`0`	`0.562`
	`2`		B	`157`	`43`	`10877`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`156`	`42`	`10739`	`1511.8`	`-7.0`	`0.466`	`34`	`15`	`0`	`0.562`
	`3`		D	`152`	`42`	`11133`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`153`	`43`	`11266`	`1487.8`	`-6.5`	`0.493`	`34`	`12`	`0`	`0.562`
	*Average:*													`1505.8`	`-6.5`	`0.488`	`34`	`13`	`0`	`0.562`
2	`4`		K	`87`	`11`	`3100`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`99`	`28`	`11366`	`768.4`	`-9.3`	`0.557`	`15`	`0`	`0`	`0.298`
	`5`		L	`76`	`10`	`3476`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`83`	`29`	`11247`	`719.2`	`-6.5`	`0.660`	`11`	`0`	`0`	`0.298`
	`6`		G	`70`	`9`	`3305`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`83`	`29`	`10877`	`656.2`	`-8.1`	`0.473`	`11`	`0`	`0`	`0.298`
	*Average:*													`714.6`	`-8.0`	`0.563`	`12`	`0`	`0`	`0.298`
3	`7`		J	`75`	`10`	`3734`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`90`	`30`	`11133`	`703.3`	`-10.2`	`0.523`	`8`	`0`	`0`	`0.171`
4	`8`		I	`79`	`9`	`3351`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`86`	`30`	`11266`	`699.1`	`-6.8`	`0.589`	`12`	`0`	`0`	`0.195`
5	`9`		H	`72`	`10`	`3519`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`81`	`31`	`10739`	`660.1`	`-9.8`	`0.454`	`14`	`0`	`0`	`0.169`
6	`10`		E	`61`	`15`	`11366`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`65`	`21`	`10877`	`552.0`	`1.6`	`0.783`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
7	`11`		D	`49`	`15`	`11133`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`56`	`17`	`10739`	`506.6`	`-1.4`	`0.536`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
8	`12`		F	`42`	`13`	`11247`	`x`	F	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`44`	`12`	`11247`	`393.6`	`0.2`	`0.634`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		I	`33`	`4`	`3351`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`35`	`11`	`10739`	`321.6`	`-0.8`	`0.432`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		J	`44`	`7`	`3734`	`◊`	K	x,y-1,z	`1_545`	`46`	`9`	`3100`	`319.7`	`3.1`	`0.894`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		C	`34`	`11`	`11266`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`32`	`3`	`3519`	`319.2`	`0.8`	`0.677`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		L	`45`	`9`	`3476`	`◊`	G	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`46`	`10`	`3305`	`318.4`	`2.4`	`0.872`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		I	`40`	`7`	`3351`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`41`	`7`	`3519`	`307.5`	`3.7`	`0.883`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		L	`27`	`2`	`3476`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`29`	`8`	`10877`	`240.0`	`-0.9`	`0.505`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		F	`24`	`7`	`11247`	`◊`	G	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`20`	`2`	`3305`	`198.5`	`-0.2`	`0.511`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`219.2`	`-0.6`	`0.508`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		J	`26`	`4`	`3734`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`27`	`8`	`11366`	`225.9`	`-2.4`	`0.397`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		D	`23`	`7`	`11133`	`◊`	K	x,y-1,z	`1_545`	`23`	`3`	`3100`	`204.0`	`-1.1`	`0.560`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		A	`20`	`6`	`10739`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`22`	`4`	`10739`	`171.6`	`-2.8`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`23`		E	`23`	`6`	`11366`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`10739`	`167.1`	`-0.8`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`24`		C	`19`	`6`	`11266`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`26`	`9`	`11266`	`166.7`	`1.1`	`0.736`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
20	`25`		J	`14`	`3`	`3734`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`6`	`10877`	`124.0`	`2.4`	`0.752`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`26`		F	`8`	`4`	`11247`	`x`	F	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`4`	`11247`	`98.8`	`1.7`	`0.827`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
22	`27`		F	`9`	`2`	`11247`	`◊`	E	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`13`	`3`	`11366`	`87.6`	`-1.4`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		D	`5`	`1`	`11133`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10877`	`61.7`	`-0.1`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`74.6`	`-0.8`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`29`		E	`9`	`3`	`11366`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10877`	`81.9`	`-0.4`	`0.535`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
24	`30`		B	`5`	`3`	`10877`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`5`	`10877`	`51.8`	`0.7`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`31`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`10739`	`44.2`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.255`
	`32`		[MG]D:301	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`11133`	`44.0`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.255`
	`33`		[MG]I:101	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`11266`	`43.3`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.255`
	`34`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`10877`	`40.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.255`
	`35`		[MG]L:101	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`11247`	`38.2`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.255`
	`36`		[MG]E:301	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`11366`	`37.7`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.255`
	*Average:*													`41.3`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.255`
26	`37`		[MG]F:301	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11247`	`39.8`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.251`
	`38`		[MG]E:302	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11366`	`39.6`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.251`
	`39`		[MG]B:301	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`10877`	`39.5`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.251`
	`40`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`10739`	`39.0`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.251`
	`41`		[MG]C:301	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`5`	`11266`	`38.7`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.251`
	*Average:*													`39.3`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.251`
27	`42`		F	`4`	`1`	`11247`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`2`	`11366`	`38.3`	`0.2`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`43`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3305`	`33.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
	`44`		[MG]L:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`3476`	`33.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
	`45`		[MG]E:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`3100`	`32.5`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
	`46`		[MG]I:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3351`	`31.6`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
	`47`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`3519`	`30.6`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
	*Average:*													`32.3`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
29	`48`		[MG]D:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3734`	`32.8`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
30	`49`		[MG]F:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`3476`	`29.5`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
	`50`		[MG]C:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`3351`	`28.4`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
	`51`		[MG]E:302	`1`	`1`	`98`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`3100`	`28.3`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
	`52`		[MG]B:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3305`	`23.4`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
	*Average:*													`27.4`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
31	`53`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`3519`	`28.8`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
32	`54`		D	`1`	`1`	`11133`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`10739`	`15.7`	`0.1`	`0.664`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`55`		[MG]L:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]F:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.5`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
34	`56`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
35	`57`		[MG]E:302	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]E:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.5`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
36	`58`		[MG]I:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]C:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`8.2`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
37	`59`		F	`2`	`2`	`11247`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`10877`	`7.3`	`-0.2`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`60`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`7.3`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
39	`61`		C	`1`	`1`	`11266`	`◊`	H	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`3519`	`3.3`	`0.1`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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