PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=824-E6-76O)

Interfaces in PDB 6a85 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 1.45 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF A NOVEL DNA QUADRUPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`144`	`16`	`4479`	`◊`	A	-x+1,-y,z	`2_655`	`120`	`16`	`4268`	`1076.2`	`5.0`	`0.845`	`13`	`0`	`0`	`0.019`
	`2`		B	`97`	`14`	`4479`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`107`	`13`	`4268`	`851.1`	`3.0`	`0.803`	`12`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`963.6`	`4.0`	`0.824`	`13`	`0`	`0`	`0.019`
2	`3`		A	`22`	`3`	`4268`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`21`	`3`	`4479`	`172.1`	`1.5`	`0.738`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		B	`5`	`2`	`4479`	`◊`	A	-x+1,-y,z-1	`2_654`	`2`	`1`	`4268`	`33.9`	`-1.6`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`103.0`	`-0.0`	`0.504`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
3	`5`		A	`14`	`3`	`4268`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`19`	`3`	`4268`	`132.2`	`0.5`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`18`	`3`	`4479`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`16`	`1`	`4479`	`109.1`	`1.8`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`120.7`	`1.2`	`0.683`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		B	`14`	`3`	`4479`	`x`	B	-x+3/2,y-1/2,-z-1	`3_644`	`18`	`2`	`4479`	`127.6`	`-0.9`	`0.520`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		B	`30`	`14`	`4479`	`◊`	B	-x+1,-y,z	`2_655`	`30`	`14`	`4479`	`127.3`	`-7.6`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	`9`		A	`23`	`12`	`4268`	`◊`	A	-x+1,-y,z	`2_655`	`23`	`12`	`4268`	`103.3`	`-7.2`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	*Average:*													`115.3`	`-7.4`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
6	`10`		A	`10`	`2`	`4268`	`◊`	B	-x+3/2,y-1/2,-z-1	`3_644`	`10`	`2`	`4479`	`79.6`	`-1.7`	`0.443`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		[PB]A:112	`1`	`1`	`147`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`4479`	`45.4`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`12`		[PB]A:112	`1`	`1`	`147`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`4268`	`45.2`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`45.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
8	`13`		[LI]A:101	`1`	`1`	`130`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4268`	`40.4`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	`14`		[LI]A:101	`1`	`1`	`130`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4479`	`39.8`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`40.1`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
9	`15`		[NA]A:109	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`4268`	`40.2`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`16`		[NA]A:109	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4479`	`39.7`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	*Average:*													`39.9`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
10	`17`		A	`5`	`3`	`4268`	`◊`	B	-x+1,-y,z-1	`2_654`	`4`	`2`	`4479`	`39.5`	`-1.4`	`0.320`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`18`		[NA]A:106	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4479`	`39.4`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
	`19`		[NA]A:106	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4268`	`39.0`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
	*Average:*													`39.2`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
12	`20`		[NA]A:108	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`4479`	`39.3`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
	`21`		[NA]A:108	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4268`	`39.0`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
	*Average:*													`39.1`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
13	`22`		[NA]A:113	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4479`	`39.2`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	`23`		[NA]B:101	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4479`	`38.1`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	`24`		[NA]A:113	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4268`	`37.6`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	*Average:*													`38.3`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
14	`25`		[NA]A:105	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4268`	`38.8`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
	`26`		[NA]A:105	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4479`	`38.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
	*Average:*													`38.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
15	`27`		[NA]A:107	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4479`	`38.7`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
	`28`		[NA]A:107	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4268`	`38.3`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
	*Average:*													`38.5`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
16	`29`		[NA]A:110	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4268`	`37.9`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
	`30`		[NA]A:110	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4479`	`37.8`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
	*Average:*													`37.9`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
17	`31`		[NA]A:104	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4479`	`37.2`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
	`32`		[NA]A:104	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4268`	`36.9`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
	*Average:*													`37.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
18	`33`		[NA]A:111	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`4479`	`37.1`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
	`34`		[NA]A:111	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4268`	`35.3`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
	*Average:*													`36.2`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
19	`35`		[NA]B:101	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4268`	`36.8`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
20	`36`		[NA]A:103	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4268`	`36.3`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
	`37`		[NA]A:103	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`4479`	`30.4`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
	*Average:*													`33.4`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
21	`38`		A	`3`	`1`	`4268`	`x`	A	-x+1,-y,z-1	`2_654`	`2`	`1`	`4268`	`30.6`	`-1.1`	`0.349`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		B	`1`	`1`	`4479`	`x`	B	-x+1,-y,z-1	`2_654`	`1`	`1`	`4479`	`0.5`	`-0.0`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`15.5`	`-0.6`	`0.340`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`40`		[LI]A:102	`1`	`1`	`130`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`4268`	`30.1`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`41`		[LI]A:102	`1`	`1`	`130`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`4479`	`29.2`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	*Average:*													`29.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
23	`42`		A	`9`	`3`	`4268`	`x`	[NH4]B:102	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`117`	`27.6`	`-0.6`	`0.655`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		B	`3`	`1`	`4479`	`x`	[NH4]B:102	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`117`	`6.9`	`-0.1`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`17.3`	`-0.3`	`0.637`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`44`		[LI]A:102	`1`	`1`	`130`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`4479`	`26.7`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`45`		[NA]A:110	`1`	`1`	`125`	`f`	[LI]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`130`	`26.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
26	`46`		[NA]A:105	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:104	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`25.5`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
27	`47`		[NA]B:101	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:113	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`25.4`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
28	`48`		[PB]A:112	`1`	`1`	`147`	`f`	[LI]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`130`	`25.1`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
29	`49`		[NH4]B:102	`1`	`1`	`117`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`4479`	`25.1`	`0.6`	`0.762`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[NH4]B:102	`1`	`1`	`117`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`4268`	`14.9`	`0.4`	`0.763`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.0`	`0.5`	`0.763`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`51`		[LI]A:102	`1`	`1`	`130`	`◊`	[NH4]B:102	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`117`	`24.1`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`52`		[NA]A:111	`1`	`1`	`125`	`f`	[LI]A:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`130`	`23.2`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
32	`53`		[PB]A:112	`1`	`1`	`147`	`f`	[NA]A:111	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`23.1`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
33	`54`		[NA]A:108	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:107	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`22.5`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
34	`55`		[NA]A:107	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:106	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`22.5`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
35	`56`		A	`4`	`1`	`4268`	`x`	[NA]A:103	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`125`	`21.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`57`		[NA]B:101	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`19.9`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
37	`58`		[NA]A:109	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:108	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`19.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
38	`59`		[NA]A:110	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:109	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`19.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
39	`60`		[NA]A:106	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:105	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`18.7`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
40	`61`		[NA]A:113	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:104	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`18.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
41	`62`		[NH4]B:102	`1`	`1`	`117`	`f`	[NA]A:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`17.8`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
42	`63`		A	`1`	`1`	`4268`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z-1	`4_454`	`1`	`1`	`4268`	`4.3`	`-0.5`	`0.173`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`64`		[NA]A:111	`1`	`1`	`125`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`4479`	`3.5`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`65`		B	`1`	`1`	`4479`	`x`	B	-x+1/2,y-1/2,-z-1	`3_544`	`1`	`1`	`4479`	`2.3`	`-0.2`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`66`		[PB]A:112	`1`	`1`	`147`	`f`	[NA]A:110	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`0.5`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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