PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=518-7H-62H)

Interfaces in PDB 6dbv

CRYO-EM STRUCTURE OF RAG IN COMPLEX WITH 12-RSS AND 23-RSS SUBSTRATE DNAS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`312`	`79`	`33321`	`◊`	C	`322`	`82`	`33899`	`3264.3`	`-54.1`	`0.000`	`15`	`11`	`0`	`0.000`
2	`2`		G	`296`	`61`	`13946`	`◊`	H	`288`	`61`	`13617`	`2793.4`	`-30.4`	`0.921`	`146`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		E	`254`	`50`	`11327`	`◊`	F	`235`	`50`	`11216`	`2181.9`	`-28.8`	`0.856`	`106`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`176`	`49`	`33321`	`◊`	B	`190`	`52`	`17416`	`1770.2`	`-9.7`	`0.454`	`23`	`13`	`0`	`0.000`
5	`5`		D	`199`	`52`	`17036`	`◊`	C	`179`	`53`	`33899`	`1759.3`	`-11.9`	`0.287`	`21`	`8`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`125`	`40`	`33321`	`◊`	E	`116`	`14`	`11327`	`1053.8`	`-13.4`	`0.513`	`15`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		A	`102`	`27`	`33321`	`◊`	H	`112`	`16`	`13617`	`959.0`	`-14.3`	`0.463`	`15`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		C	`104`	`30`	`33899`	`◊`	F	`109`	`17`	`11216`	`930.5`	`-17.1`	`0.506`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		A	`76`	`24`	`33321`	`◊`	G	`97`	`21`	`13946`	`800.1`	`1.2`	`0.895`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		C	`80`	`25`	`33899`	`◊`	E	`101`	`21`	`11327`	`776.3`	`-3.1`	`0.809`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		C	`56`	`18`	`33899`	`◊`	G	`63`	`13`	`13946`	`536.1`	`-5.0`	`0.682`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		C	`61`	`22`	`33899`	`◊`	H	`68`	`14`	`13617`	`492.9`	`-4.6`	`0.697`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		A	`46`	`14`	`33321`	`◊`	F	`55`	`10`	`11216`	`397.5`	`-0.5`	`0.723`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		B	`32`	`10`	`17416`	`◊`	F	`41`	`9`	`11216`	`287.1`	`-3.0`	`0.662`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		B	`23`	`9`	`17416`	`◊`	E	`30`	`5`	`11327`	`230.6`	`-3.2`	`0.570`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		D	`14`	`8`	`17036`	`◊`	G	`19`	`7`	`13946`	`112.6`	`-3.7`	`0.437`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		D	`11`	`6`	`17036`	`◊`	H	`14`	`3`	`13617`	`83.8`	`-1.8`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		C	`9`	`5`	`33899`	`◊`	[CA]C:1103	`1`	`1`	`85`	`38.5`	`-7.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		C	`8`	`4`	`33899`	`◊`	[CA]C:1102	`1`	`1`	`85`	`38.2`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`38.3`	`-7.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		A	`6`	`4`	`33321`	`◊`	[CA]A:1103	`1`	`1`	`85`	`32.5`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		A	`7`	`4`	`33321`	`◊`	[CA]A:1102	`1`	`1`	`85`	`31.7`	`-6.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`32.1`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		E	`8`	`2`	`11327`	`◊`	[CA]A:1103	`1`	`1`	`85`	`29.7`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		E	`3`	`1`	`11327`	`◊`	[CA]A:1102	`1`	`1`	`85`	`23.1`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`26.4`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		[CA]C:1102	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]C:1103	`1`	`1`	`85`	`22.5`	`-6.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[CA]A:1102	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]A:1103	`1`	`1`	`85`	`15.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		H	`3`	`2`	`13617`	`◊`	[CA]C:1102	`1`	`1`	`85`	`14.9`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		H	`1`	`1`	`13617`	`◊`	[CA]C:1103	`1`	`1`	`85`	`11.5`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`13.2`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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