PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=282-7A-46H)

Interfaces in PDB 6dk1 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 3.12 Å

HUMAN SIGMA-1 RECEPTOR BOUND TO (+)-PENTAZOCINE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`112`	`28`	`13265`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`111`	`33`	`11969`	`999.7`	`-11.2`	`0.701`	`7`	`4`	`0`	`0.205`
	`2`		C	`117`	`33`	`12394`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`111`	`28`	`11969`	`983.1`	`-13.3`	`0.577`	`3`	`3`	`0`	`0.205`
	`3`		C	`109`	`27`	`12394`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`115`	`31`	`13265`	`980.2`	`-12.4`	`0.700`	`10`	`5`	`0`	`0.205`
	*Average:*													`987.7`	`-12.3`	`0.659`	`7`	`4`	`0`	`0.205`
2	`4`		B	`59`	`11`	`13265`	`◊`	B	-x,-y,z	`2_555`	`59`	`11`	`13265`	`560.0`	`-8.9`	`0.478`	`8`	`0`	`0`	`0.048`
3	`5`		C	`58`	`17`	`12394`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`63`	`22`	`11969`	`557.0`	`-12.3`	`0.178`	`2`	`0`	`0`	`0.062`
4	`6`		B	`49`	`17`	`13265`	`◊`	C	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`42`	`17`	`12394`	`450.0`	`-7.1`	`0.293`	`2`	`0`	`0`	`0.061`
5	`7`		[GM4]C:301	`20`	`1`	`483`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`59`	`23`	`12394`	`371.8`	`-3.7`	`0.627`	`1`	`0`	`0`	`0.065`
	`8`		[GM4]B:301	`20`	`1`	`479`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`56`	`23`	`13265`	`363.2`	`-3.9`	`0.648`	`1`	`0`	`0`	`0.065`
	*Average:*													`367.5`	`-3.8`	`0.637`	`1`	`0`	`0`	`0.065`
6	`9`		B	`41`	`11`	`13265`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`39`	`13`	`11969`	`365.2`	`-8.8`	`0.191`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
7	`10`		[GM4]A:301	`20`	`1`	`482`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`21`	`11969`	`363.2`	`-3.7`	`0.631`	`1`	`0`	`0`	`0.027`
8	`11`		C	`37`	`11`	`12394`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`38`	`9`	`13265`	`347.8`	`-7.8`	`0.239`	`2`	`0`	`0`	`0.067`
9	`12`		C	`36`	`12`	`12394`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z-1	`4_454`	`33`	`9`	`11969`	`310.4`	`-3.3`	`0.667`	`3`	`0`	`0`	`0.031`
10	`13`		C	`30`	`8`	`12394`	`◊`	C	-x-1,-y+1,z	`2_465`	`30`	`8`	`12394`	`235.4`	`-4.0`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
11	`14`		[OLC]A:311	`10`	`1`	`318`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`11969`	`188.0`	`-0.8`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
12	`15`		[OLC]A:310	`9`	`1`	`296`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`7`	`11969`	`180.8`	`-2.3`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
13	`16`		[OLC]C:307	`11`	`1`	`346`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`33`	`9`	`12394`	`179.2`	`0.9`	`0.568`	`3`	`0`	`0`	`0.007`
14	`17`		[OLC]C:312	`12`	`1`	`396`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`28`	`7`	`11969`	`160.8`	`0.8`	`0.421`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[OLC]C:311	`10`	`1`	`316`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`25`	`6`	`12394`	`155.3`	`-0.1`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		[OLC]B:308	`9`	`1`	`320`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`13265`	`151.9`	`-0.1`	`0.463`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
17	`20`		[OLC]C:308	`9`	`1`	`296`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`12394`	`149.4`	`-3.2`	`0.324`	`3`	`0`	`0`	`0.062`
18	`21`		[OLC]C:312	`12`	`1`	`396`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`12394`	`145.7`	`0.0`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[OLC]B:309	`8`	`1`	`292`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`13265`	`140.1`	`0.8`	`0.588`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
20	`23`		[GOL]C:305	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`12394`	`124.5`	`-0.7`	`0.640`	`3`	`0`	`0`	`0.028`
21	`24`		[OLC]C:310	`10`	`1`	`343`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`12394`	`123.8`	`-2.6`	`0.270`	`2`	`0`	`0`	`0.048`
22	`25`		[GOL]B:306	`6`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`13265`	`122.7`	`-0.6`	`0.644`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
23	`26`		[GOL]A:309	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`11969`	`112.1`	`-1.7`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
24	`27`		[OLC]C:309	`8`	`1`	`262`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`12394`	`103.4`	`-1.9`	`0.495`	`2`	`0`	`0`	`0.038`
25	`28`		[SO4]A:303	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`11969`	`87.4`	`-12.0`	`0.877`	`2`	`0`	`0`	`0.086`
26	`29`		[SO4]C:304	`5`	`1`	`185`	`f`	[SO4]C:304	-x,-y+1,z	`2_565`	`5`	`1`	`185`	`85.9`	`-18.2`	`0.993`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
27	`30`		[SO4]B:305	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`13265`	`84.2`	`-13.3`	`0.874`	`2`	`0`	`0`	`0.109`
28	`31`		[OLC]C:309	`6`	`1`	`262`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`12`	`3`	`11969`	`83.6`	`2.1`	`0.739`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`32`		[SO4]A:302	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11969`	`82.8`	`-9.9`	`0.957`	`2`	`0`	`0`	`0.072`
30	`33`		[SO4]A:307	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`11969`	`82.4`	`-12.5`	`0.773`	`1`	`0`	`0`	`0.086`
31	`34`		[SO4]C:302	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`12394`	`79.9`	`-9.7`	`0.981`	`2`	`0`	`0`	`0.146`
32	`35`		[SO4]B:304	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`13265`	`79.1`	`-11.1`	`0.759`	`2`	`0`	`0`	`0.092`
33	`36`		[GOL]C:306	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`12394`	`78.7`	`-0.7`	`0.492`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
34	`37`		[OLC]B:307	`8`	`1`	`315`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13265`	`78.6`	`-2.2`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
35	`38`		[SO4]C:303	`5`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`12394`	`74.7`	`-11.6`	`0.635`	`3`	`0`	`0`	`0.179`
36	`39`		[OLC]B:308	`8`	`1`	`320`	`f`	[OLC]B:307	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`315`	`72.8`	`0.8`	`0.357`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`40`		[OLC]C:310	`7`	`1`	`343`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`13`	`2`	`11969`	`63.9`	`1.6`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`41`		[OLC]C:311	`9`	`1`	`316`	`◊`	[OLC]C:310	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`343`	`62.7`	`3.2`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`42`		[SO4]B:302	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`13265`	`62.6`	`-8.1`	`0.943`	`1`	`0`	`0`	`0.066`
40	`43`		C	`12`	`6`	`12394`	`f`	[SO4]A:305	x-1/2,-y+1/2,-z-1	`4_454`	`4`	`1`	`186`	`61.8`	`-8.8`	`0.766`	`1`	`0`	`0`	`0.127`
41	`44`		[OLC]A:311	`7`	`1`	`318`	`f`	C	-x,-y+1,z	`2_565`	`7`	`2`	`12394`	`59.2`	`-2.5`	`0.281`	`1`	`0`	`0`	`0.040`
42	`45`		[SO4]A:308	`5`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`13265`	`58.9`	`-6.5`	`0.945`	`1`	`0`	`0`	`0.030`
43	`46`		[SO4]A:305	`4`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11969`	`57.3`	`-6.3`	`0.958`	`3`	`0`	`0`	`0.051`
44	`47`		[SO4]A:308	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`11969`	`56.8`	`-6.7`	`0.938`	`2`	`0`	`0`	`0.050`
45	`48`		[SO4]A:308	`5`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`12394`	`56.4`	`-6.4`	`0.941`	`1`	`0`	`0`	`0.029`
46	`49`		[SO4]B:303	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`13265`	`56.1`	`-5.8`	`0.966`	`3`	`0`	`0`	`0.055`
47	`50`		[SO4]A:304	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`11969`	`50.2`	`-5.2`	`0.952`	`2`	`0`	`0`	`0.041`
48	`51`		[SO4]A:306	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`11969`	`50.0`	`-5.3`	`0.966`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
49	`52`		[GOL]C:306	`6`	`1`	`218`	`f`	[GOL]C:305	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`218`	`46.6`	`-0.5`	`0.529`	`1`	`0`	`0`	`0.012`
50	`53`		[OLC]C:310	`8`	`1`	`343`	`f`	[OLC]C:309	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`262`	`44.1`	`0.7`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		[OLC]C:311	`5`	`1`	`316`	`f`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`3`	`1`	`11969`	`39.9`	`-1.3`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
52	`55`		[SO4]C:304	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`12394`	`38.9`	`-3.3`	`0.984`	`1`	`0`	`0`	`0.052`
53	`56`		[SO4]C:304	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	-x,-y+1,z	`2_565`	`5`	`3`	`12394`	`37.9`	`-3.0`	`0.985`	`1`	`0`	`0`	`0.048`
54	`57`		B	`3`	`1`	`13265`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`3`	`1`	`11969`	`25.0`	`-0.0`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`58`		B	`1`	`1`	`13265`	`◊`	[OLC]C:309	-x-1/2,y-1/2,-z	`3_445`	`2`	`1`	`262`	`23.4`	`-0.1`	`0.607`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
56	`59`		[OLC]B:309	`4`	`1`	`292`	`f`	[OLC]B:308	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`320`	`20.8`	`0.1`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`60`		[OLC]C:310	`2`	`1`	`343`	`f`	[OLC]C:308	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`296`	`17.1`	`-0.3`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
58	`61`		[SO4]A:307	`1`	`1`	`185`	`◊`	C	-x,-y+1,z	`2_565`	`1`	`1`	`12394`	`10.3`	`-1.4`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
59	`62`		[SO4]C:302	`1`	`1`	`185`	`◊`	C	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`1`	`12394`	`7.8`	`-1.1`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
60	`63`		[OLC]C:307	`1`	`1`	`346`	`f`	[SO4]C:303	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`2.9`	`-0.5`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
61	`64`		[GOL]C:305	`1`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11969`	`1.6`	`-0.0`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`65`		[GOL]A:309	`1`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13265`	`0.7`	`0.0`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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