PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=273-HP-D1B)

Interfaces in PDB 6dk9 crystal.
Space symmetry group: P 3 2 1. Resolution: 2.60 Å

YEAST DDI2 CYANAMIDE HYDRATASE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		I	`158`	`37`	`10744`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`156`	`38`	`10266`	`1420.3`	`-12.9`	`0.376`	`7`	`4`	`0`	`0.172`
	`2`		E	`151`	`35`	`10481`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`150`	`36`	`10436`	`1365.7`	`-15.5`	`0.194`	`9`	`5`	`0`	`0.172`
	`3`		C	`147`	`35`	`10270`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`150`	`36`	`10164`	`1355.9`	`-18.8`	`0.130`	`6`	`5`	`0`	`0.172`
	`4`		G	`148`	`36`	`10230`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`151`	`36`	`10457`	`1351.6`	`-16.4`	`0.235`	`6`	`5`	`0`	`0.172`
	`5`		A	`146`	`35`	`10236`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`146`	`35`	`10236`	`1341.5`	`-17.1`	`0.190`	`4`	`6`	`0`	`0.172`
	*Average:*													`1367.0`	`-16.1`	`0.225`	`6`	`5`	`0`	`0.172`
2	`6`		B	`75`	`17`	`10164`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`69`	`21`	`10236`	`649.2`	`-8.7`	`0.175`	`2`	`3`	`0`	`0.075`
	`7`		E	`72`	`22`	`10481`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`76`	`18`	`10270`	`648.4`	`-8.8`	`0.142`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	`8`		H	`72`	`16`	`10266`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`72`	`23`	`10457`	`647.5`	`-7.7`	`0.294`	`0`	`1`	`0`	`0.075`
	`9`		F	`73`	`16`	`10457`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`72`	`23`	`10436`	`641.0`	`-8.1`	`0.187`	`2`	`2`	`0`	`0.075`
	`10`		C	`69`	`22`	`10270`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`75`	`17`	`10236`	`640.6`	`-9.0`	`0.151`	`1`	`0`	`0`	`0.075`
	`11`		G	`71`	`22`	`10230`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`69`	`17`	`10481`	`632.3`	`-8.0`	`0.211`	`0`	`1`	`0`	`0.075`
	`12`		D	`77`	`18`	`10436`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`71`	`22`	`10164`	`630.5`	`-9.1`	`0.177`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
	`13`		I	`64`	`18`	`10744`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`78`	`17`	`10230`	`626.8`	`-7.5`	`0.169`	`1`	`1`	`0`	`0.075`
	*Average:*													`639.6`	`-8.4`	`0.188`	`1`	`1`	`0`	`0.075`
3	`14`		F	`55`	`19`	`10457`	`◊`	D	-y+1,x-y+1,z	`2_665`	`53`	`17`	`10436`	`571.4`	`-3.3`	`0.519`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
4	`15`		H	`60`	`15`	`10266`	`◊`	A	-y+1,x-y+1,z-1	`2_664`	`51`	`19`	`10236`	`520.2`	`-5.0`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`16`		F	`45`	`15`	`10457`	`◊`	E	-y+1,x-y+1,z	`2_665`	`60`	`18`	`10481`	`501.0`	`-6.6`	`0.236`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`17`		E	`23`	`8`	`10481`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`25`	`10`	`10270`	`217.7`	`2.5`	`0.824`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
7	`18`		H	`17`	`7`	`10266`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`10230`	`139.9`	`-1.2`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`19`		F	`13`	`5`	`10457`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`10481`	`110.7`	`-1.4`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`20`		D	`14`	`5`	`10436`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`10270`	`110.5`	`-1.3`	`0.404`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`21`		B	`12`	`5`	`10164`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`13`	`5`	`10236`	`104.5`	`-1.6`	`0.357`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`116.4`	`-1.4`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
8	`22`		[SO4]E:305	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`18`	`11`	`10481`	`115.9`	`-18.7`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
9	`23`		[SO4]D:305	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`10436`	`102.3`	`-15.0`	`0.801`	`2`	`0`	`0`	`0.056`
10	`24`		C	`12`	`5`	`10270`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`12`	`5`	`10270`	`100.9`	`-0.7`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`25`		[SO4]A:303	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10236`	`96.6`	`-12.9`	`0.961`	`3`	`0`	`0`	`0.143`
12	`26`		[SO4]E:303	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10481`	`96.3`	`-14.2`	`0.922`	`3`	`0`	`0`	`0.055`
13	`27`		[SO4]B:304	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`10164`	`95.4`	`-13.7`	`0.929`	`3`	`0`	`0`	`0.068`
14	`28`		[SO4]D:304	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10436`	`93.9`	`-13.4`	`0.919`	`3`	`0`	`0`	`0.052`
15	`29`		[SO4]F:304	`5`	`1`	`185`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10457`	`93.5`	`-12.5`	`0.960`	`2`	`0`	`0`	`0.078`
16	`30`		[SO4]C:302	`5`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`10270`	`92.5`	`-13.2`	`0.942`	`2`	`0`	`0`	`0.063`
17	`31`		[SO4]C:305	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`10270`	`91.3`	`-12.1`	`0.851`	`1`	`0`	`0`	`0.056`
18	`32`		[SO4]E:306	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10481`	`88.6`	`-11.5`	`0.877`	`3`	`0`	`0`	`0.046`
19	`33`		[SO4]D:308	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`10436`	`87.3`	`-11.5`	`0.874`	`1`	`0`	`0`	`0.042`
20	`34`		[SO4]E:302	`5`	`1`	`185`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`10481`	`85.9`	`-11.9`	`0.787`	`5`	`0`	`0`	`0.050`
21	`35`		[SO4]A:302	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`10236`	`84.2`	`-12.1`	`0.801`	`2`	`0`	`0`	`0.130`
22	`36`		[SO4]C:303	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10270`	`83.8`	`-11.9`	`0.703`	`1`	`0`	`0`	`0.055`
23	`37`		[SO4]B:303	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`10164`	`83.8`	`-12.4`	`0.669`	`1`	`0`	`0`	`0.058`
24	`38`		[SO4]D:303	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10436`	`83.4`	`-11.6`	`0.795`	`3`	`0`	`0`	`0.046`
25	`39`		[SO4]G:302	`5`	`1`	`184`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10230`	`82.6`	`-11.4`	`0.841`	`1`	`0`	`0`	`0.069`
26	`40`		[SO4]F:303	`5`	`1`	`183`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`10457`	`82.3`	`-12.0`	`0.708`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
27	`41`		[SO4]D:307	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10436`	`81.5`	`-11.8`	`0.836`	`2`	`0`	`0`	`0.045`
28	`42`		[SO4]E:304	`5`	`1`	`185`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10230`	`81.1`	`-11.1`	`0.707`	`1`	`0`	`0`	`0.067`
29	`43`		[SO4]C:306	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10270`	`80.7`	`-11.0`	`0.875`	`2`	`0`	`0`	`0.053`
30	`44`		[SO4]F:305	`5`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`10266`	`75.5`	`-10.4`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
31	`45`		[SO4]F:305	`5`	`1`	`185`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`10457`	`75.2`	`-11.4`	`0.528`	`1`	`0`	`0`	`0.069`
32	`46`		[SO4]D:301	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10164`	`74.2`	`-10.3`	`0.708`	`1`	`0`	`0`	`0.104`
	`47`		[SO4]B:301	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10236`	`71.5`	`-9.9`	`0.709`	`1`	`0`	`0`	`0.104`
	*Average:*													`72.9`	`-10.1`	`0.708`	`1`	`0`	`0`	`0.104`
33	`48`		[SO4]C:304	`5`	`1`	`186`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10481`	`73.4`	`-10.0`	`0.712`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
34	`49`		[SO4]F:301	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`10436`	`73.1`	`-9.9`	`0.703`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
35	`50`		[SO4]A:304	`4`	`1`	`185`	`f`	C	y,x,-z+2	`4_557`	`11`	`4`	`10270`	`72.8`	`-10.1`	`0.637`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
36	`51`		[SO4]A:304	`5`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10236`	`71.1`	`-9.0`	`0.926`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
37	`52`		[SO4]D:301	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10436`	`69.3`	`-8.4`	`0.946`	`2`	`0`	`0`	`0.020`
	`53`		[SO4]B:301	`5`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10164`	`68.5`	`-8.5`	`0.937`	`2`	`0`	`0`	`0.020`
	*Average:*													`68.9`	`-8.4`	`0.941`	`2`	`0`	`0`	`0.020`
38	`54`		[SO4]C:304	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10270`	`68.8`	`-8.4`	`0.937`	`2`	`0`	`0`	`0.010`
39	`55`		[SO4]F:301	`4`	`1`	`185`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10457`	`68.5`	`-8.3`	`0.950`	`2`	`0`	`0`	`0.010`
40	`56`		[SO4]E:304	`5`	`1`	`185`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10481`	`66.5`	`-7.9`	`0.933`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
41	`57`		[SO4]D:306	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`10436`	`58.7`	`-8.1`	`0.721`	`1`	`0`	`0`	`0.030`
42	`58`		[ZN]H:500	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`10266`	`53.3`	`-40.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`59`		[ZN]I:500	`1`	`1`	`98`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`13`	`8`	`10744`	`53.0`	`-39.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`60`		[ZN]E:301	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`10481`	`52.9`	`-40.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`61`		[ZN]C:301	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`10270`	`52.7`	`-39.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`62`		[ZN]F:302	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`10457`	`52.5`	`-40.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`63`		[ZN]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`10236`	`52.5`	`-40.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`64`		[ZN]D:302	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`10436`	`52.4`	`-40.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`65`		[ZN]G:301	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`10230`	`52.1`	`-39.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	`66`		[ZN]B:302	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`10164`	`52.0`	`-39.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
	*Average:*													`52.6`	`-40.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.828`
43	`67`		[SO4]E:306	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	y,x,-z+1	`4_556`	`9`	`4`	`10270`	`49.4`	`-5.5`	`0.844`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`68`		[SO4]B:303	`5`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`10236`	`48.6`	`-5.4`	`0.831`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
45	`69`		[SO4]F:303	`5`	`1`	`183`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10436`	`45.6`	`-4.9`	`0.814`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
46	`70`		[SO4]A:302	`5`	`1`	`184`	`◊`	C	y,x,-z+2	`4_557`	`5`	`2`	`10270`	`42.9`	`-4.8`	`0.830`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
47	`71`		[SO4]D:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`10164`	`42.4`	`-5.2`	`0.832`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
48	`72`		I	`8`	`4`	`10744`	`◊`	A	-y+1,x-y+1,z-1	`2_664`	`4`	`2`	`10236`	`41.2`	`0.3`	`0.757`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`73`		[SO4]C:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`10481`	`41.0`	`-5.1`	`0.792`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
50	`74`		[SO4]C:303	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]C:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`184`	`40.9`	`-9.2`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
51	`75`		[SO4]D:304	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]D:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`40.7`	`-9.2`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
52	`76`		[SO4]E:303	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]E:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`40.3`	`-9.1`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
53	`77`		[SO4]A:303	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]A:302	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`184`	`39.7`	`-8.9`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
54	`78`		[SO4]E:302	`4`	`1`	`185`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10230`	`39.1`	`-4.9`	`0.826`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
55	`79`		[SO4]F:304	`4`	`1`	`185`	`f`	[SO4]F:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`183`	`38.1`	`-8.5`	`0.998`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
56	`80`		[SO4]B:304	`5`	`1`	`185`	`f`	[SO4]B:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`185`	`35.0`	`-7.9`	`0.999`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
57	`81`		[SO4]E:306	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10270`	`31.6`	`-3.6`	`0.529`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
58	`82`		I	`3`	`2`	`10744`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`10457`	`27.4`	`0.7`	`0.884`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		E	`2`	`1`	`10481`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10164`	`21.6`	`0.5`	`0.872`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`84`		C	`1`	`1`	`10270`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10236`	`21.5`	`0.5`	`0.888`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`85`		G	`1`	`1`	`10230`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10436`	`18.9`	`0.4`	`0.899`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`22.3`	`0.5`	`0.885`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`86`		[SO4]B:301	`1`	`1`	`186`	`◊`	A	y,x,-z+2	`4_557`	`2`	`1`	`10236`	`17.0`	`-2.3`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
60	`87`		[SO4]C:304	`1`	`1`	`186`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10436`	`14.5`	`-1.9`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
61	`88`		[SO4]D:301	`1`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10270`	`14.1`	`-1.9`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
62	`89`		[SO4]E:304	`1`	`1`	`185`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10457`	`13.6`	`-1.9`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
63	`90`		[SO4]A:304	`1`	`1`	`185`	`◊`	B	y,x,-z+2	`4_557`	`1`	`1`	`10164`	`13.2`	`-1.8`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
64	`91`		[SO4]F:301	`1`	`1`	`185`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10481`	`13.0`	`-1.8`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
65	`92`		[SO4]C:306	`1`	`1`	`185`	`f`	[SO4]C:305	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`4.4`	`-1.0`	`0.996`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
66	`93`		[SO4]D:305	`1`	`1`	`186`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10481`	`0.2`	`-0.0`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe