PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=673-E9-4OG)

Interfaces in PDB 6dow crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.50 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF BACILLUS HALODURANS RIBONUCLEASE H1 IN COMPLEX WITH AN RNA/DNA HYBRID: REACTION IN 5 MM MG2+ AND 200 MM RB+ FOR 160 S AT 21 C

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`45`	`13`	`7666`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`45`	`13`	`7666`	`427.5`	`-0.2`	`0.574`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		C	`42`	`5`	`1554`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`13`	`7666`	`386.3`	`-3.0`	`0.579`	`6`	`0`	`0`	`0.055`
3	`3`		A	`40`	`12`	`7666`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`37`	`10`	`7666`	`323.9`	`2.4`	`0.709`	`2`	`6`	`0`	`0.000`
4	`4`		b	`29`	`2`	`694`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`15`	`7666`	`238.8`	`-5.6`	`0.274`	`6`	`0`	`0`	`0.086`
5	`5`		B	`22`	`3`	`1032`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`11`	`7666`	`226.8`	`-5.3`	`0.299`	`4`	`0`	`0`	`0.083`
6	`6`		B	`19`	`4`	`1032`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`5`	`1554`	`177.4`	`-2.5`	`0.531`	`8`	`0`	`0`	`0.467`
7	`7`		A	`17`	`4`	`7666`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`16`	`5`	`7666`	`143.8`	`-0.7`	`0.467`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
8	`8`		b	`16`	`2`	`694`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`3`	`1554`	`122.2`	`0.5`	`0.722`	`6`	`0`	`0`	`0.017`
9	`9`		[GOL]A:210	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`7666`	`106.6`	`-0.5`	`0.487`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
10	`10`		[EDO]A:213	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`7666`	`102.6`	`3.0`	`0.421`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		[GOL]A:211	`6`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`7666`	`97.7`	`0.6`	`0.716`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		[RB]A:205	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`7666`	`97.6`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.065`
13	`13`		C	`13`	`1`	`1554`	`x`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`12`	`1`	`1554`	`92.1`	`1.8`	`0.738`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		[EDO]A:212	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`7666`	`90.9`	`3.0`	`0.467`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		b	`13`	`1`	`694`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`14`	`1`	`1032`	`86.1`	`2.9`	`0.858`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		[EDO]C:102	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`1554`	`85.4`	`2.5`	`0.286`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`7666`	`77.9`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	`18`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`7666`	`76.9`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	*Average:*													`77.4`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
18	`19`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`7666`	`75.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
19	`20`		[RB]C:101	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`1554`	`74.1`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.492`
20	`21`		b	`15`	`1`	`694`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`1032`	`69.2`	`-0.2`	`0.662`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
21	`22`		[CL]A:206	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`7666`	`66.9`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.111`
22	`23`		[GOL]A:209	`5`	`1`	`220`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`1554`	`66.0`	`1.5`	`0.711`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[GOL]A:209	`4`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7666`	`63.4`	`-0.2`	`0.503`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
24	`25`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`7666`	`61.6`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.107`
25	`26`		[CL]A:207	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`7666`	`61.4`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
26	`27`		[RB]C:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`1032`	`58.7`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.157`
27	`28`		[GOL]A:210	`5`	`1`	`217`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`9`	`3`	`7666`	`57.9`	`0.6`	`0.694`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`1032`	`50.3`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
29	`30`		C	`7`	`1`	`1554`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`7`	`1`	`1032`	`46.8`	`0.6`	`0.640`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`694`	`43.6`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
	`32`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`694`	`33.3`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
	*Average:*													`38.4`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
31	`33`		[EDO]C:102	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`7666`	`43.5`	`1.1`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[GOL]A:211	`5`	`1`	`215`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`5`	`2`	`7666`	`43.0`	`0.3`	`0.635`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:203	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`40.9`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
34	`36`		[EDO]C:103	`4`	`1`	`185`	`f`	[RB]C:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`40.8`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
35	`37`		[EDO]C:103	`3`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`1554`	`40.7`	`-0.5`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
36	`38`		[EDO]A:213	`3`	`1`	`184`	`f`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`4`	`2`	`7666`	`36.2`	`0.8`	`0.899`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		b	`6`	`2`	`694`	`◊`	[EDO]C:103	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`185`	`32.7`	`0.0`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		A	`4`	`1`	`7666`	`◊`	[RB]C:101	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`216`	`29.6`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`694`	`29.1`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
40	`42`		[EDO]C:103	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`1032`	`28.7`	`1.3`	`0.848`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		[GOL]A:209	`2`	`1`	`220`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`694`	`28.2`	`0.4`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		[GOL]A:211	`3`	`1`	`215`	`f`	[GOL]A:210	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`217`	`27.9`	`0.5`	`0.748`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
43	`45`		[GOL]A:211	`3`	`1`	`215`	`f`	[CL]A:206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`26.8`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
44	`46`		[MG]A:201	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`7666`	`25.8`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
45	`47`		A	`5`	`1`	`7666`	`◊`	[EDO]C:103	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`185`	`25.7`	`0.4`	`0.773`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`7666`	`25.5`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
47	`49`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`3`	`1`	`7666`	`24.6`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:204	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`24.4`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
49	`51`		[MG]A:201	`1`	`1`	`98`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`694`	`19.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
50	`52`		C	`1`	`1`	`1554`	`◊`	[EDO]C:103	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`185`	`18.3`	`0.8`	`0.895`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`53`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`◊`	b	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`694`	`16.8`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
52	`54`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1032`	`16.8`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
53	`55`		b	`3`	`1`	`694`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`1554`	`15.5`	`-0.9`	`0.411`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`56`		[RB]A:204	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
55	`57`		[RB]A:203	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
56	`58`		A	`4`	`2`	`7666`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`1032`	`12.9`	`0.4`	`0.682`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:202	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.7`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
58	`60`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.1`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
59	`61`		C	`1`	`1`	`1554`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`7666`	`7.8`	`0.1`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`62`		[MG]A:202	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`7.1`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
61	`63`		[RB]B:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[RB]A:203	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`7.0`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
62	`64`		b	`2`	`1`	`694`	`◊`	[RB]C:101	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`216`	`3.2`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`65`		[GOL]A:209	`1`	`1`	`220`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`1032`	`3.0`	`-0.0`	`0.389`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		[EDO]C:103	`1`	`1`	`185`	`f`	[EDO]C:102	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`1.3`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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