PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=254-4D-L51)

Interfaces in PDB 6h6d crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.40 Å

CRYSTAL STRUCTURES OF THE MURINE CLASS I MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX H-2DB IN COMPLEX WITH ADENOVIRUS-DERIVED PEPTIDE AD10

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		E	`120`	`30`	`6503`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`125`	`40`	`15774`	`1160.7`	`-7.3`	`0.282`	`20`	`3`	`0`	`0.259`
	`2`		B	`128`	`30`	`6445`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`126`	`41`	`15923`	`1160.0`	`-7.4`	`0.309`	`20`	`4`	`0`	`0.259`
	*Average:*													`1160.3`	`-7.3`	`0.295`	`20`	`4`	`0`	`0.259`
2	`3`		F	`62`	`10`	`1315`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`121`	`35`	`15774`	`807.1`	`-7.8`	`0.473`	`24`	`0`	`0`	`0.500`
	`4`		C	`63`	`10`	`1312`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`121`	`34`	`15923`	`805.6`	`-8.1`	`0.475`	`26`	`1`	`0`	`0.500`
	*Average:*													`806.4`	`-7.9`	`0.474`	`25`	`1`	`0`	`0.500`
3	`5`		D	`83`	`21`	`15774`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`83`	`21`	`15923`	`675.9`	`-1.1`	`0.564`	`10`	`10`	`0`	`0.000`
4	`6`		A	`59`	`13`	`15923`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`61`	`14`	`15774`	`497.4`	`-6.9`	`0.132`	`0`	`3`	`0`	`0.101`
5	`7`		D	`42`	`13`	`15774`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`44`	`10`	`15774`	`388.6`	`-3.6`	`0.270`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		A	`33`	`9`	`15923`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`30`	`10`	`15923`	`254.7`	`-3.0`	`0.233`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		E	`25`	`6`	`6503`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`27`	`12`	`15923`	`249.0`	`-3.9`	`0.195`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		D	`28`	`12`	`15774`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`6`	`6445`	`248.3`	`-3.8`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`248.6`	`-3.9`	`0.197`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		[GOL]B:102	`6`	`1`	`225`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`6445`	`137.2`	`-0.6`	`0.491`	`5`	`0`	`0`	`0.025`
9	`12`		[GOL]E:102	`6`	`1`	`225`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`6503`	`132.8`	`-0.3`	`0.565`	`5`	`0`	`0`	`0.040`
10	`13`		A	`18`	`7`	`15923`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`15`	`5`	`1315`	`131.7`	`-2.2`	`0.358`	`1`	`0`	`0`	`0.049`
	`14`		C	`13`	`4`	`1312`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`17`	`6`	`15774`	`126.6`	`-2.2`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.049`
	*Average:*													`129.2`	`-2.2`	`0.351`	`1`	`0`	`0`	`0.049`
11	`15`		C	`19`	`4`	`1312`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`19`	`4`	`1315`	`118.9`	`-2.2`	`0.666`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
12	`16`		[GOL]A:405	`6`	`1`	`223`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`15923`	`118.0`	`-0.9`	`0.453`	`1`	`0`	`0`	`0.024`
13	`17`		[GOL]B:103	`6`	`1`	`224`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`6445`	`110.9`	`-1.3`	`0.389`	`1`	`0`	`0`	`0.016`
14	`18`		[GOL]E:103	`6`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`15774`	`97.4`	`0.1`	`0.598`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
15	`19`		[GOL]A:404	`6`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`15923`	`90.1`	`-0.1`	`0.566`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`20`		[GOL]E:103	`5`	`1`	`217`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`6503`	`87.0`	`-1.0`	`0.406`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
17	`21`		[GOL]D:401	`6`	`1`	`223`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`15774`	`79.9`	`0.3`	`0.564`	`3`	`0`	`0`	`0.029`
18	`22`		[GOL]A:404	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`6445`	`73.9`	`-1.0`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
19	`23`		[GOL]A:403	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`15923`	`73.1`	`0.4`	`0.610`	`2`	`0`	`0`	`0.010`
20	`24`		[SO4]B:101	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`6445`	`72.1`	`-10.1`	`0.647`	`2`	`0`	`0`	`0.100`
21	`25`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`15923`	`68.9`	`-9.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.248`
	`26`		[CL]D:402	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`15774`	`68.2`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.248`
	*Average:*													`68.5`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.248`
22	`27`		[CL]D:403	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15774`	`68.1`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.235`
	`28`		[CL]A:409	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15923`	`64.1`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.235`
	*Average:*													`66.1`	`-8.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.235`
23	`29`		[CL]B:106	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`6445`	`67.5`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
	`30`		[CL]E:105	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`6503`	`67.1`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
	*Average:*													`67.3`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.133`
24	`31`		[SO4]E:101	`5`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`6503`	`67.3`	`-7.7`	`0.944`	`2`	`0`	`0`	`0.134`
25	`32`		[CL]A:407	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`15923`	`61.4`	`-8.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.155`
26	`33`		[SO4]A:402	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`6445`	`52.8`	`-8.3`	`0.615`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
27	`34`		[SO4]A:401	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15923`	`51.9`	`-5.5`	`0.936`	`3`	`0`	`0`	`0.126`
28	`35`		[GOL]A:405	`3`	`1`	`223`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`6445`	`49.6`	`0.5`	`0.690`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`36`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`15923`	`46.0`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	`37`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`9`	`3`	`15774`	`42.2`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
	*Average:*													`44.1`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
30	`38`		[SO4]A:402	`4`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15923`	`42.6`	`-3.9`	`0.965`	`2`	`0`	`0`	`0.043`
31	`39`		[CL]B:105	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`6445`	`42.2`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`40`		[CL]E:104	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`6503`	`36.7`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	*Average:*													`39.4`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
32	`41`		[CL]B:104	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`6445`	`41.8`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
33	`42`		[GOL]E:102	`4`	`1`	`225`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`15774`	`41.0`	`0.3`	`0.639`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
34	`43`		[GOL]B:102	`2`	`1`	`225`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`15923`	`37.6`	`0.2`	`0.634`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
35	`44`		[GOL]A:404	`3`	`1`	`219`	`f`	[SO4]A:402	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`32.4`	`-4.3`	`0.674`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
36	`45`		[GOL]B:103	`2`	`1`	`224`	`f`	[SO4]A:402	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`31.5`	`-2.9`	`0.865`	`1`	`0`	`0`	`0.031`
37	`46`		A	`3`	`2`	`15923`	`◊`	[SO4]A:401	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`186`	`30.4`	`-2.6`	`0.958`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`47`		D	`6`	`2`	`15774`	`◊`	[GOL]D:401	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`223`	`28.9`	`0.3`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`48`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`1315`	`19.0`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	`49`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`1312`	`8.5`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	*Average:*													`13.8`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
40	`50`		[SO4]E:101	`1`	`1`	`187`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15774`	`16.5`	`-2.0`	`0.731`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
41	`51`		[SO4]B:101	`2`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`15923`	`15.3`	`-2.0`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
42	`52`		D	`1`	`1`	`15774`	`◊`	A	x-1,y+1,z	`1_465`	`3`	`1`	`15923`	`13.1`	`-0.4`	`0.250`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`53`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`15774`	`9.0`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`54`		A	`2`	`1`	`15923`	`◊`	[CL]D:402	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`125`	`3.4`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	*Average:*													`6.2`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
44	`55`		[CL]B:104	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15923`	`7.4`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
45	`56`		[CL]B:104	`1`	`1`	`125`	`f`	[SO4]B:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`187`	`2.3`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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