PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=557-43-I5D)

Interfaces in PDB 6ht8 crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.50 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF SCHISTOSOMA MANSONI HDAC8 COMPLEXED WITH A BENZOHYDROXAMATE INHIBITOR 3

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`91`	`27`	`16853`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`107`	`37`	`17781`	`928.1`	`-7.0`	`0.265`	`13`	`3`	`0`	`0.000`
	`2`		C	`106`	`34`	`17623`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`97`	`29`	`16935`	`922.2`	`-7.5`	`0.246`	`9`	`3`	`0`	`0.000`
	`3`		D	`106`	`34`	`16935`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`95`	`30`	`17623`	`907.6`	`-6.8`	`0.234`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	`4`		B	`86`	`26`	`17781`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`94`	`32`	`16853`	`821.4`	`-7.5`	`0.185`	`9`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`894.8`	`-7.2`	`0.232`	`10`	`3`	`0`	`0.000`
2	`5`		C	`62`	`17`	`17623`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`44`	`11`	`17781`	`555.3`	`-3.6`	`0.411`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`45`	`12`	`17623`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`63`	`17`	`17781`	`521.2`	`-2.6`	`0.480`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`538.3`	`-3.1`	`0.445`	`12`	`0`	`0`	`0.000`
3	`7`		D	`55`	`18`	`16935`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`49`	`17`	`17781`	`457.6`	`-1.5`	`0.558`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		D	`30`	`7`	`16935`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`13`	`17781`	`319.0`	`-2.3`	`0.411`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`30`	`10`	`17623`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`16853`	`266.0`	`-3.6`	`0.212`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`292.5`	`-3.0`	`0.311`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
5	`10`		[GQE]C:504	`20`	`1`	`493`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`47`	`14`	`17623`	`285.9`	`-1.1`	`0.537`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	`11`		[GQE]A:504	`20`	`1`	`492`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`14`	`16853`	`285.9`	`-2.1`	`0.420`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	`12`		[GQE]D:504	`20`	`1`	`494`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`14`	`16935`	`280.8`	`-1.9`	`0.435`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	`13`		[GQE]B:504	`21`	`1`	`496`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`44`	`14`	`17781`	`278.7`	`-2.2`	`0.428`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`282.8`	`-1.8`	`0.455`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
6	`14`		C	`31`	`12`	`17623`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`10`	`16853`	`278.5`	`-0.5`	`0.604`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`15`		D	`21`	`9`	`16935`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`23`	`7`	`16853`	`166.8`	`-0.5`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`16`		D	`19`	`8`	`16935`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`7`	`17781`	`165.9`	`0.1`	`0.663`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`17`		C	`22`	`8`	`17623`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`22`	`9`	`16853`	`154.7`	`0.5`	`0.702`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`160.3`	`0.3`	`0.683`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
9	`18`		[GOL]B:505	`6`	`1`	`222`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`17781`	`144.6`	`0.1`	`0.615`	`6`	`0`	`0`	`0.002`
10	`19`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`17623`	`144.4`	`3.3`	`0.501`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		[GOL]A:506	`6`	`1`	`222`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`16853`	`141.3`	`1.1`	`0.703`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[GOL]A:507	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`16853`	`141.1`	`-0.0`	`0.608`	`9`	`0`	`0`	`0.003`
13	`22`		[DMF]C:507	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`17623`	`139.9`	`3.9`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`23`		[GOL]C:505	`6`	`1`	`225`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`17623`	`137.4`	`1.3`	`0.688`	`8`	`0`	`0`	`0.002`
15	`24`		[GOL]B:506	`6`	`1`	`221`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`17781`	`133.0`	`2.4`	`0.680`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
16	`25`		[DMF]B:510	`5`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`28`	`9`	`17781`	`130.4`	`3.3`	`0.509`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[DMF]B:509	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`17781`	`129.6`	`2.2`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[GOL]B:508	`6`	`1`	`221`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`17781`	`126.1`	`1.7`	`0.645`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[GOL]A:505	`6`	`1`	`222`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`16853`	`125.9`	`-0.2`	`0.591`	`6`	`0`	`0`	`0.002`
20	`29`		[GOL]B:507	`5`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`17781`	`121.9`	`0.6`	`0.688`	`5`	`0`	`0`	`0.001`
21	`30`		[DMF]A:508	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`16853`	`116.1`	`3.5`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		[DMF]D:506	`5`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`16935`	`115.4`	`1.9`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		[K]D:503	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`16935`	`114.1`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
	`33`		[K]B:503	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17781`	`113.9`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
	`34`		[K]A:503	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`16853`	`113.3`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
	`35`		[K]C:503	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17623`	`113.1`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
	*Average:*													`113.6`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
24	`36`		[DMF]D:505	`5`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`16935`	`106.8`	`2.4`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`37`		[DMF]A:509	`5`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`16853`	`81.3`	`2.2`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`38`		[GQE]A:504	`8`	`1`	`492`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`3`	`17781`	`64.4`	`-0.1`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		C	`10`	`3`	`17623`	`◊`	[GQE]D:504	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`1`	`494`	`55.1`	`-0.6`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[GQE]B:504	`6`	`1`	`496`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`16853`	`51.0`	`-0.5`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[GQE]C:504	`7`	`1`	`493`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`16935`	`49.9`	`-0.4`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`55.1`	`-0.4`	`0.532`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`42`		[DMF]A:509	`5`	`1`	`217`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`3`	`17781`	`57.0`	`1.0`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`43`		[DMF]D:506	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`17623`	`49.2`	`1.0`	`0.216`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`44`		[DMF]B:510	`2`	`1`	`217`	`cf`	[GOL]B:507	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`218`	`36.5`	`0.7`	`0.490`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`45`		[ZN]C:501	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17623`	`36.4`	`-25.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`46`		[ZN]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`16853`	`36.4`	`-24.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`47`		[ZN]D:501	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`16935`	`36.0`	`-24.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`48`		[ZN]B:501	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17781`	`36.0`	`-25.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`36.2`	`-25.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
31	`49`		C	`4`	`2`	`17623`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`5`	`2`	`17781`	`34.0`	`0.4`	`0.746`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`50`		[GQE]A:504	`5`	`1`	`492`	`f`	[ZN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.2`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`51`		[GQE]D:504	`5`	`1`	`494`	`f`	[ZN]D:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.7`	`-13.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`52`		[GQE]B:504	`5`	`1`	`496`	`f`	[ZN]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.4`	`-13.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`53`		[GQE]C:504	`5`	`1`	`493`	`f`	[ZN]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.1`	`-13.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`30.6`	`-13.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
33	`54`		[DMF]D:505	`2`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`16853`	`26.0`	`1.2`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`55`		D	`3`	`1`	`16935`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`16935`	`21.9`	`1.0`	`0.870`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
35	`56`		C	`3`	`1`	`17623`	`f`	[DMF]B:509	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`216`	`7.8`	`0.0`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`57`		[DMF]A:509	`1`	`1`	`217`	`f`	[DMF]B:509	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`216`	`4.6`	`0.3`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`58`		[GOL]A:505	`1`	`1`	`222`	`f`	[K]A:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`3.6`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
38	`59`		[GOL]A:505	`1`	`1`	`222`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`17781`	`1.7`	`-0.0`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`60`		C	`1`	`1`	`17623`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`16935`	`0.2`	`-0.0`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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