PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=726-5N-A5E)

Interfaces in PDB 6hu2 crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 1.99 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF SCHISTOSOMA MANSONI HDAC8 COMPLEXED WITH A BENZOHYDROXAMATE INHIBITOR 11

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`91`	`28`	`18139`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`114`	`38`	`17455`	`986.4`	`-10.4`	`0.113`	`8`	`5`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`85`	`29`	`17455`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`105`	`33`	`18139`	`881.3`	`-7.1`	`0.229`	`11`	`4`	`0`	`0.000`
	`3`		D	`105`	`37`	`17947`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`86`	`28`	`18133`	`879.9`	`-6.9`	`0.214`	`8`	`5`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`98`	`32`	`18133`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`85`	`26`	`17947`	`846.9`	`-8.9`	`0.178`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`898.6`	`-8.3`	`0.184`	`9`	`4`	`0`	`0.000`
2	`5`		C	`65`	`18`	`18133`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`43`	`12`	`18139`	`543.5`	`-2.6`	`0.497`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`46`	`13`	`18133`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`61`	`18`	`18139`	`534.7`	`-2.9`	`0.467`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`539.1`	`-2.8`	`0.482`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
3	`7`		C	`54`	`17`	`18133`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`58`	`18`	`17455`	`478.3`	`0.3`	`0.697`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		D	`30`	`7`	`17947`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`38`	`13`	`18139`	`335.4`	`-2.2`	`0.333`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`38`	`13`	`18133`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`8`	`17455`	`314.2`	`-2.4`	`0.354`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`324.8`	`-2.3`	`0.344`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
5	`10`		D	`39`	`11`	`17947`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`29`	`9`	`18139`	`312.7`	`0.4`	`0.700`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
6	`11`		[T34]B:504	`19`	`1`	`465`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`14`	`18139`	`249.9`	`0.0`	`0.438`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		[T34]C:504	`17`	`1`	`466`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`43`	`14`	`18133`	`247.5`	`2.3`	`0.644`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[T34]A:504	`17`	`1`	`469`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`40`	`14`	`17455`	`247.3`	`-0.0`	`0.421`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[T34]D:504	`17`	`1`	`463`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`40`	`14`	`17947`	`243.9`	`2.2`	`0.619`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`247.1`	`1.1`	`0.530`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
7	`15`		D	`23`	`8`	`17947`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`27`	`9`	`18139`	`211.6`	`0.5`	`0.705`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`16`		C	`21`	`7`	`18133`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`22`	`8`	`17455`	`179.6`	`-0.3`	`0.611`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`195.6`	`0.1`	`0.658`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
8	`17`		[DMF]C:511	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`18133`	`147.8`	`3.4`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[DMF]B:508	`5`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`18139`	`142.7`	`2.8`	`0.408`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`145.2`	`3.1`	`0.435`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`19`		[DMF]B:505	`5`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`18139`	`146.9`	`2.2`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`20`		D	`25`	`7`	`17947`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`26`	`8`	`17455`	`146.7`	`0.1`	`0.656`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
11	`21`		[DMF]A:506	`5`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`17455`	`146.0`	`2.8`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`22`		[DMF]D:505	`5`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`28`	`9`	`17947`	`143.8`	`3.1`	`0.423`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`23`		[DMF]C:510	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`25`	`8`	`18133`	`143.6`	`2.4`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`24`		[DMF]B:509	`5`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`8`	`18139`	`143.0`	`3.4`	`0.490`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`25`		[GOL]C:512	`6`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`18133`	`142.5`	`-0.1`	`0.605`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
16	`26`		[GOL]D:507	`6`	`1`	`220`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`17947`	`141.6`	`-0.3`	`0.574`	`6`	`0`	`0`	`0.002`
	`27`		[GOL]B:511	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`18139`	`141.5`	`-0.3`	`0.589`	`5`	`0`	`0`	`0.002`
	`28`		[GOL]A:509	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`17455`	`140.6`	`-0.4`	`0.563`	`6`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`141.3`	`-0.3`	`0.575`	`6`	`0`	`0`	`0.002`
17	`29`		[DMF]A:508	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`17455`	`141.6`	`3.3`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`30`		[DMF]C:508	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`18133`	`141.4`	`3.6`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`31`		[DMF]D:506	`5`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`17947`	`131.8`	`3.3`	`0.450`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`32`		[GOL]B:512	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`18139`	`128.7`	`-0.6`	`0.580`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
21	`33`		C	`21`	`8`	`18133`	`◊`	[DMF]A:505	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`1`	`216`	`126.5`	`3.4`	`0.483`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`34`		[DMF]C:505	`5`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`18133`	`123.1`	`3.5`	`0.455`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`35`		[DMF]C:507	`5`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`18133`	`122.7`	`3.1`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`36`		[DMF]B:507	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`18139`	`121.4`	`2.8`	`0.425`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`37`		[DMF]C:509	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`18133`	`119.3`	`3.9`	`0.515`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`38`		[DMF]A:507	`5`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17455`	`115.5`	`3.0`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`39`		[K]B:503	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`18139`	`114.6`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	`40`		[K]A:503	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17455`	`114.3`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	`41`		[K]C:503	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`18133`	`114.3`	`-108.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	`42`		[K]D:503	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17947`	`114.2`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	*Average:*													`114.4`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
28	`43`		[DMF]B:506	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`18139`	`114.1`	`3.2`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`44`		[DMF]B:510	`5`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`18139`	`80.9`	`1.0`	`0.234`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`45`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`215`	`f`	D	x,y-1,z	`1_545`	`13`	`5`	`17947`	`80.3`	`1.2`	`0.238`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`46`		[DMF]C:506	`5`	`1`	`215`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`18133`	`68.7`	`1.8`	`0.318`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`47`		C	`4`	`1`	`18133`	`◊`	[T34]D:504	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`1`	`463`	`47.9`	`-0.1`	`0.504`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[T34]C:504	`7`	`1`	`466`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`17947`	`47.7`	`-0.1`	`0.487`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[T34]B:504	`7`	`1`	`465`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`17455`	`45.5`	`0.7`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[T34]A:504	`6`	`1`	`469`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`18139`	`45.0`	`0.6`	`0.643`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`46.5`	`0.3`	`0.571`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`51`		A	`10`	`4`	`17455`	`◊`	[GOL]B:512	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`217`	`47.2`	`-0.3`	`0.562`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`52`		[DMF]A:505	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`17455`	`42.5`	`0.3`	`0.175`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`53`		A	`4`	`1`	`17455`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`2`	`18139`	`38.7`	`0.8`	`0.816`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`54`		[ZN]C:501	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`18133`	`37.9`	`-26.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`55`		[ZN]A:501	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17455`	`37.4`	`-26.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`56`		[ZN]D:501	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17947`	`37.3`	`-26.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`57`		[ZN]B:501	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`18139`	`37.0`	`-26.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	*Average:*													`37.4`	`-26.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
37	`58`		C	`4`	`2`	`18133`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`5`	`2`	`18139`	`35.4`	`0.5`	`0.777`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`59`		[T34]D:504	`4`	`1`	`463`	`f`	[ZN]D:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.9`	`-13.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`60`		[T34]A:504	`4`	`1`	`469`	`f`	[ZN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.9`	`-13.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`61`		[T34]B:504	`4`	`1`	`465`	`f`	[ZN]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.4`	`-13.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`62`		[T34]C:504	`4`	`1`	`466`	`f`	[ZN]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.9`	`-12.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`30.5`	`-13.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
39	`63`		[DMF]B:510	`4`	`1`	`217`	`f`	[DMF]B:506	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`216`	`30.5`	`2.0`	`0.220`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`64`		D	`3`	`1`	`17947`	`f`	[DMF]A:507	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`217`	`18.0`	`0.6`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`65`		C	`1`	`1`	`18133`	`f`	[DMF]B:507	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`216`	`17.4`	`-0.1`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`66`		[DMF]C:505	`2`	`1`	`217`	`f`	B	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`18139`	`16.4`	`0.2`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`67`		[DMF]C:507	`3`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`17455`	`11.6`	`-0.1`	`0.154`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`68`		C	`3`	`2`	`18133`	`f`	[DMF]B:510	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`217`	`11.4`	`0.2`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`69`		[GOL]A:509	`1`	`1`	`219`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`18139`	`2.8`	`0.1`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		C	`1`	`1`	`18133`	`◊`	[GOL]D:507	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`220`	`0.6`	`0.0`	`0.588`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`1.7`	`0.0`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe