PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=145-E1-P33)

Interfaces in PDB 6jjp crystal.
Space symmetry group: P 1 2 1. Resolution: 2.90 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF FAB OF A PD-1 MONOCLONAL ANTIBODY MW11-H317 IN COMPLEX WITH PD-1

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`215`	`58`	`11510`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`194`	`55`	`11506`	`1894.0`	`-29.8`	`0.025`	`18`	`1`	`1`	`1.000`
	`2`		E	`202`	`55`	`11290`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`192`	`56`	`11486`	`1831.5`	`-26.1`	`0.046`	`14`	`2`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1862.7`	`-27.9`	`0.036`	`16`	`2`	`1`	`1.000`
2	`3`		A	`121`	`41`	`11506`	`◊`	A	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`122`	`41`	`11506`	`1111.3`	`-3.7`	`0.793`	`16`	`4`	`0`	`0.100`
3	`4`		D	`103`	`39`	`11486`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`101`	`39`	`11486`	`961.2`	`-2.3`	`0.815`	`20`	`2`	`0`	`0.100`
4	`5`		F	`56`	`19`	`7156`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`70`	`20`	`11486`	`556.0`	`-3.5`	`0.476`	`11`	`1`	`0`	`0.558`
5	`6`		C	`53`	`18`	`7254`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`70`	`20`	`11506`	`545.4`	`-3.6`	`0.447`	`10`	`2`	`0`	`0.374`
6	`7`		D	`64`	`22`	`11486`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`60`	`18`	`11506`	`543.0`	`-5.9`	`0.419`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
7	`8`		F	`42`	`14`	`7156`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`43`	`11`	`11290`	`398.3`	`-3.3`	`0.314`	`2`	`1`	`0`	`0.286`
8	`9`		C	`44`	`14`	`7254`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`41`	`12`	`11510`	`375.6`	`-2.9`	`0.354`	`1`	`0`	`0`	`0.151`
9	`10`		C	`37`	`13`	`7254`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`35`	`13`	`7156`	`329.7`	`-5.5`	`0.141`	`6`	`0`	`0`	`0.299`
10	`11`		E	`30`	`8`	`11290`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`9`	`11510`	`304.5`	`-4.7`	`0.155`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
11	`12`		B	`30`	`10`	`11510`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`11486`	`260.4`	`0.7`	`0.757`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
12	`13`		F	`22`	`10`	`7156`	`◊`	D	-x,y-1,-z	`2_545`	`22`	`6`	`11486`	`190.5`	`-2.2`	`0.372`	`1`	`0`	`0`	`0.344`
13	`14`		[NAG]F:301	`12`	`1`	`341`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`7156`	`161.8`	`4.7`	`0.250`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[NAG]C:301	`12`	`1`	`341`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`7254`	`156.7`	`4.5`	`0.227`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`159.2`	`4.6`	`0.239`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		C	`15`	`5`	`7254`	`◊`	A	-x-1,y-1,-z-1	`2_444`	`16`	`5`	`11506`	`149.6`	`-2.8`	`0.225`	`1`	`0`	`0`	`0.221`
15	`17`		B	`11`	`5`	`11510`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`8`	`11506`	`137.4`	`3.2`	`0.921`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		F	`14`	`4`	`7156`	`◊`	E	-x,y-1,-z	`2_545`	`15`	`5`	`11290`	`131.7`	`0.5`	`0.657`	`2`	`1`	`0`	`0.065`
17	`19`		[NAG]C:306	`12`	`1`	`365`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`7254`	`131.0`	`4.4`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		[NAG]F:306	`12`	`1`	`363`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`7156`	`123.2`	`4.0`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`127.1`	`4.2`	`0.401`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		[FUC]C:303	`10`	`1`	`290`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`7254`	`122.5`	`2.3`	`0.446`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[FUC]F:303	`10`	`1`	`289`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`7156`	`121.8`	`2.2`	`0.427`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		[NAG]C:307	`12`	`1`	`365`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`7254`	`119.6`	`4.0`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		[NAG]F:302	`10`	`1`	`361`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`7156`	`110.6`	`3.0`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[NAG]C:302	`9`	`1`	`360`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`7254`	`106.9`	`2.9`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[NAG]F:307	`12`	`1`	`364`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`7156`	`106.5`	`2.8`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		E	`9`	`5`	`11290`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`16`	`8`	`11486`	`92.6`	`2.6`	`0.866`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
25	`28`		[MAN]F:305	`6`	`1`	`306`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`11486`	`72.5`	`1.9`	`0.559`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`29`		[NAG]C:302	`10`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]C:301	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`341`	`69.9`	`2.9`	`0.020`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[NAG]F:302	`9`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]F:301	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`341`	`69.4`	`3.0`	`0.031`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`69.7`	`2.9`	`0.025`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`31`		[NAG]C:306	`5`	`1`	`365`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`5`	`7156`	`69.3`	`2.0`	`0.498`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		C	`10`	`5`	`7254`	`◊`	[NAG]F:306	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`1`	`363`	`69.1`	`1.9`	`0.382`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`69.2`	`2.0`	`0.440`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`33`		[NAG]F:307	`9`	`1`	`364`	`◊`	E	-x,y-1,-z	`2_545`	`7`	`3`	`11290`	`68.9`	`1.2`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[NAG]C:307	`8`	`1`	`365`	`◊`	B	-x-1,y-1,-z-1	`2_444`	`8`	`4`	`11510`	`65.0`	`1.7`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`67.0`	`1.4`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		[FUC]C:303	`9`	`1`	`290`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`11506`	`64.1`	`0.2`	`0.159`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
30	`36`		[FUC]F:303	`7`	`1`	`289`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`11486`	`63.4`	`0.3`	`0.221`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
31	`37`		[BMA]C:304	`8`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]C:302	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`360`	`63.1`	`2.5`	`0.112`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[BMA]F:304	`7`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]F:302	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`61.1`	`2.6`	`0.150`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.1`	`2.5`	`0.131`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`39`		[NAG]C:307	`6`	`1`	`365`	`◊`	A	-x-1,y-1,-z-1	`2_444`	`7`	`3`	`11506`	`59.2`	`0.4`	`0.273`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
33	`40`		[MAN]F:305	`8`	`1`	`306`	`cf`	[BMA]F:304	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`294`	`59.1`	`2.4`	`0.185`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`41`		[MAN]C:305	`6`	`1`	`303`	`cf`	[BMA]C:304	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`291`	`56.0`	`2.2`	`0.237`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`42`		[MAN]C:305	`7`	`1`	`303`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`11506`	`54.1`	`0.8`	`0.314`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`43`		[FUC]C:303	`7`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]C:301	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`341`	`45.4`	`2.0`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		[FUC]F:303	`7`	`1`	`289`	`cf`	[NAG]F:301	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`341`	`45.2`	`1.9`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`45.3`	`2.0`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`45`		[NAG]C:302	`6`	`1`	`360`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11506`	`45.1`	`1.5`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`46`		[NAG]F:302	`6`	`1`	`361`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11486`	`45.0`	`1.3`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`47`		[FUC]C:303	`5`	`1`	`290`	`f`	[NAG]C:302	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`360`	`44.3`	`2.0`	`0.079`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[FUC]F:303	`5`	`1`	`289`	`f`	[NAG]F:302	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`361`	`43.5`	`1.9`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`43.9`	`2.0`	`0.081`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`49`		B	`8`	`3`	`11510`	`◊`	B	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`7`	`3`	`11510`	`44.0`	`0.2`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		E	`3`	`3`	`11290`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`3`	`11290`	`4.6`	`0.0`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`24.3`	`0.1`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		C	`9`	`3`	`7254`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`3`	`11506`	`43.1`	`0.4`	`0.687`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`52`		[NAG]F:301	`4`	`1`	`341`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11486`	`43.0`	`0.9`	`0.273`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NAG]C:301	`5`	`1`	`341`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11506`	`42.3`	`0.8`	`0.230`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`42.7`	`0.8`	`0.252`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`54`		F	`4`	`2`	`7156`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`4`	`2`	`11290`	`41.6`	`-0.3`	`0.475`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`55`		[BMA]C:304	`4`	`1`	`291`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11506`	`38.7`	`0.8`	`0.370`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`56`		[BMA]F:304	`4`	`1`	`294`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11486`	`37.8`	`0.8`	`0.356`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`57`		F	`2`	`2`	`7156`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`11486`	`13.4`	`-0.1`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`58`		E	`2`	`1`	`11290`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`11506`	`13.0`	`-0.2`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`59`		[MAN]F:305	`2`	`1`	`306`	`f`	[NAG]F:302	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`361`	`10.5`	`0.5`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`60`		E	`1`	`1`	`11290`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`1`	`11486`	`10.2`	`0.1`	`0.688`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`61`		C	`1`	`1`	`7254`	`◊`	B	-x-1,y-1,-z-1	`2_444`	`2`	`2`	`11510`	`9.4`	`0.2`	`0.743`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`62`		[MAN]C:305	`1`	`1`	`303`	`f`	[NAG]C:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`360`	`9.3`	`0.4`	`0.289`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`63`		F	`2`	`1`	`7156`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`11510`	`7.7`	`0.2`	`0.705`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`64`		[BMA]F:304	`1`	`1`	`294`	`f`	[FUC]F:303	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`289`	`4.3`	`0.1`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`65`		[BMA]C:304	`1`	`1`	`291`	`f`	[FUC]C:303	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`290`	`3.4`	`0.1`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`66`		[BMA]C:304	`1`	`1`	`291`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7254`	`2.8`	`0.1`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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