PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=666-5O-1NB)

Interfaces in PDB 6jr1 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.40 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME PHASED WITH 16 SELENIUM ATOMS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`663`	`146`	`32371`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`654`	`146`	`32423`	`6451.5`	`-82.4`	`0.987`	`360`	`0`	`0`	`0.884`
2	`2`		F	`238`	`55`	`7596`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`259`	`58`	`8766`	`2529.8`	`-42.7`	`0.037`	`23`	`5`	`0`	`0.835`
	`3`		B	`225`	`51`	`6574`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`255`	`58`	`8525`	`2445.3`	`-41.8`	`0.053`	`23`	`4`	`0`	`0.835`
	*Average:*													`2487.5`	`-42.3`	`0.045`	`23`	`5`	`0`	`0.835`
3	`4`		H	`251`	`61`	`7633`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`243`	`61`	`8633`	`2454.9`	`-46.1`	`0.027`	`19`	`8`	`0`	`0.830`
	`5`		D	`253`	`60`	`7852`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`246`	`63`	`9072`	`2442.2`	`-45.9`	`0.025`	`19`	`7`	`0`	`0.830`
	*Average:*													`2448.6`	`-46.0`	`0.026`	`19`	`8`	`0`	`0.830`
4	`6`		I	`97`	`19`	`32423`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`82`	`22`	`8766`	`756.3`	`-6.9`	`0.812`	`12`	`0`	`0`	`0.156`
5	`7`		J	`100`	`19`	`32371`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`78`	`23`	`8525`	`755.5`	`-6.6`	`0.818`	`12`	`0`	`0`	`0.186`
6	`8`		J	`94`	`17`	`32371`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`76`	`23`	`8766`	`730.2`	`-14.6`	`0.557`	`14`	`0`	`0`	`0.424`
7	`9`		G	`63`	`18`	`8633`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`60`	`21`	`8525`	`678.5`	`-7.8`	`0.334`	`7`	`0`	`0`	`0.392`
	`10`		C	`64`	`17`	`9072`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`62`	`21`	`8766`	`667.9`	`-8.4`	`0.308`	`7`	`0`	`0`	`0.392`
	*Average:*													`673.2`	`-8.1`	`0.321`	`7`	`0`	`0`	`0.392`
8	`11`		I	`79`	`14`	`32423`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`70`	`22`	`8525`	`661.8`	`-16.1`	`0.427`	`13`	`0`	`0`	`0.519`
9	`12`		E	`58`	`15`	`8766`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`56`	`15`	`8525`	`616.1`	`-9.8`	`0.261`	`3`	`6`	`0`	`0.360`
10	`13`		J	`73`	`15`	`32371`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`54`	`18`	`9072`	`586.1`	`-7.1`	`0.679`	`16`	`0`	`0`	`0.365`
11	`14`		D	`66`	`17`	`7852`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`51`	`11`	`6574`	`548.1`	`0.3`	`0.825`	`6`	`2`	`0`	`0.022`
	`15`		H	`50`	`13`	`7633`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`45`	`10`	`7596`	`485.2`	`0.4`	`0.788`	`5`	`3`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`516.6`	`0.4`	`0.807`	`6`	`3`	`0`	`0.022`
12	`16`		I	`71`	`13`	`32423`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`60`	`17`	`9072`	`532.5`	`-3.8`	`0.782`	`13`	`0`	`0`	`0.231`
13	`17`		I	`59`	`12`	`32423`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`51`	`18`	`8633`	`486.5`	`-7.1`	`0.630`	`8`	`0`	`0`	`0.147`
14	`18`		J	`59`	`14`	`32371`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`45`	`13`	`8633`	`422.3`	`-5.2`	`0.694`	`10`	`0`	`0`	`0.197`
15	`19`		J	`57`	`13`	`32371`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`50`	`15`	`7596`	`404.2`	`-5.6`	`0.641`	`5`	`0`	`0`	`0.091`
16	`20`		I	`43`	`11`	`32423`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`43`	`15`	`7852`	`379.2`	`-9.5`	`0.413`	`12`	`0`	`0`	`0.579`
17	`21`		G	`43`	`15`	`8633`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`46`	`11`	`6574`	`374.0`	`-4.4`	`0.368`	`5`	`0`	`0`	`0.165`
	`22`		C	`42`	`15`	`9072`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`46`	`12`	`7596`	`371.6`	`-4.7`	`0.330`	`5`	`0`	`0`	`0.165`
	*Average:*													`372.8`	`-4.5`	`0.349`	`5`	`0`	`0`	`0.165`
18	`23`		I	`49`	`11`	`32423`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`42`	`15`	`7596`	`368.4`	`-6.2`	`0.578`	`5`	`0`	`0`	`0.203`
19	`24`		J	`38`	`8`	`32371`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`14`	`6574`	`349.2`	`-7.1`	`0.455`	`7`	`0`	`0`	`0.210`
20	`25`		J	`44`	`10`	`32371`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`36`	`12`	`7633`	`340.3`	`-7.0`	`0.543`	`8`	`0`	`0`	`0.086`
21	`26`		J	`38`	`5`	`32371`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`34`	`10`	`7852`	`287.7`	`-4.9`	`0.606`	`3`	`0`	`0`	`0.028`
22	`27`		D	`31`	`9`	`7852`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`29`	`9`	`7596`	`283.8`	`-0.1`	`0.689`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
23	`28`		I	`36`	`5`	`32423`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`32`	`10`	`7633`	`270.2`	`-3.8`	`0.664`	`4`	`0`	`0`	`0.027`
24	`29`		I	`37`	`10`	`32423`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`6574`	`243.8`	`-2.7`	`0.686`	`4`	`0`	`0`	`0.045`
25	`30`		H	`29`	`11`	`7633`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`6574`	`205.6`	`-1.2`	`0.633`	`3`	`1`	`0`	`0.027`
	`31`		D	`28`	`10`	`7852`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`7596`	`196.1`	`-2.4`	`0.464`	`2`	`0`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`200.8`	`-1.8`	`0.549`	`3`	`1`	`0`	`0.027`
26	`32`		J	`26`	`5`	`32371`	`◊`	I	x-1,y,z	`1_455`	`22`	`4`	`32423`	`179.9`	`-5.5`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		C	`23`	`6`	`9072`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`15`	`4`	`7596`	`177.6`	`-1.1`	`0.536`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
28	`34`		D	`16`	`6`	`7852`	`◊`	J	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`18`	`5`	`32371`	`156.2`	`-2.7`	`0.542`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		J	`15`	`3`	`32371`	`x`	J	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`21`	`3`	`32371`	`137.6`	`-4.3`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		I	`17`	`4`	`32423`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`22`	`4`	`32371`	`129.6`	`-4.2`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`37`		J	`18`	`5`	`32371`	`◊`	I	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`20`	`5`	`32423`	`128.8`	`-4.5`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		I	`17`	`3`	`32423`	`◊`	J	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`17`	`3`	`32371`	`118.1`	`0.1`	`0.739`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`39`		G	`16`	`4`	`8633`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`9072`	`116.3`	`-0.1`	`0.675`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`40`		C	`14`	`4`	`9072`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`14`	`5`	`8766`	`113.3`	`0.7`	`0.725`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		I	`17`	`5`	`32423`	`x`	I	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`4`	`32423`	`112.4`	`0.6`	`0.773`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`42`		G	`11`	`4`	`8633`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8766`	`95.8`	`1.9`	`0.861`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		C	`1`	`1`	`9072`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8525`	`1.6`	`0.1`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`48.7`	`1.0`	`0.812`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`44`		A	`8`	`3`	`8525`	`◊`	I	-x+2,y-1/2,-z+3/2	`3_746`	`12`	`3`	`32423`	`86.4`	`-2.8`	`0.445`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
38	`45`		J	`10`	`1`	`32371`	`x`	J	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`13`	`1`	`32371`	`82.7`	`1.0`	`0.737`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`46`		I	`11`	`3`	`32423`	`◊`	H	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`12`	`5`	`7633`	`77.5`	`-1.5`	`0.555`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
40	`47`		D	`7`	`2`	`7852`	`◊`	I	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`9`	`2`	`32423`	`72.8`	`-2.7`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`48`		I	`9`	`3`	`32423`	`x`	I	-x+3/2,-y+1,z-1/2	`2_664`	`10`	`2`	`32423`	`69.2`	`-0.7`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`49`		D	`6`	`2`	`7852`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`8633`	`63.7`	`-0.0`	`0.678`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	`50`		H	`6`	`2`	`7633`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`9072`	`51.5`	`-0.2`	`0.645`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`57.6`	`-0.1`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
43	`51`		I	`9`	`3`	`32423`	`◊`	J	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`12`	`4`	`32371`	`62.3`	`-3.3`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`52`		[CL]A:201	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`8525`	`61.8`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.564`
	`53`		[CL]E:202	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`8766`	`60.7`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.564`
	*Average:*													`61.2`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.564`
45	`54`		[MN]J:302	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`32371`	`57.4`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.128`
46	`55`		D	`6`	`4`	`7852`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`9`	`4`	`8766`	`53.6`	`0.1`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`56`		[MN]J:301	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`32371`	`52.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
48	`57`		[MN]J:303	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`32371`	`51.4`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
49	`58`		[MN]I:203	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`32423`	`51.1`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.149`
50	`59`		[MN]J:304	`1`	`1`	`123`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`32371`	`50.4`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
51	`60`		[MN]I:202	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`32423`	`50.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.132`
52	`61`		[MN]I:201	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`32423`	`49.8`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.140`
53	`62`		I	`7`	`2`	`32423`	`x`	I	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`8`	`2`	`32423`	`48.1`	`-2.6`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`63`		[MN]E:201	`1`	`1`	`123`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`8766`	`47.1`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
55	`64`		[CL]C:201	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`9072`	`44.5`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
	`65`		[CL]G:201	`1`	`1`	`125`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`8633`	`44.2`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
	*Average:*													`44.3`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
56	`66`		[CL]C:201	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7852`	`43.1`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	`67`		[CL]G:201	`1`	`1`	`125`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7633`	`42.9`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	*Average:*													`43.0`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
57	`68`		D	`8`	`4`	`7852`	`◊`	[MN]E:201	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`1`	`1`	`123`	`35.8`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`69`		J	`4`	`3`	`32371`	`◊`	H	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`4`	`2`	`7633`	`33.1`	`-1.8`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`70`		J	`7`	`2`	`32371`	`◊`	I	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`4`	`2`	`32423`	`30.7`	`-1.3`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`71`		[MN]I:203	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`32371`	`24.8`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
61	`72`		J	`2`	`1`	`32371`	`◊`	G	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`2`	`1`	`8633`	`24.5`	`-0.3`	`0.509`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
62	`73`		[MN]J:302	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`32423`	`21.6`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
63	`74`		J	`6`	`2`	`32371`	`x`	J	-x+2,y-1/2,-z+3/2	`3_746`	`4`	`2`	`32371`	`17.9`	`-0.5`	`0.519`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`75`		[CL]G:201	`1`	`1`	`125`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32423`	`16.9`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
65	`76`		C	`3`	`1`	`9072`	`◊`	[MN]E:201	-x+1,y-1/2,-z+3/2	`3_646`	`1`	`1`	`123`	`16.7`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`77`		E	`2`	`1`	`8766`	`◊`	J	x-1/2,-y+3/2,-z+2	`4_467`	`1`	`1`	`32371`	`16.5`	`-1.2`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`78`		[CL]C:201	`1`	`1`	`125`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`32371`	`16.5`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
68	`79`		[MN]J:304	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`32423`	`14.6`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
69	`80`		[MN]E:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`7596`	`12.9`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
70	`81`		[MN]I:202	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`32371`	`12.5`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
71	`82`		[MN]J:302	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`1`	`1`	`32371`	`7.4`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`83`		[MN]J:301	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32423`	`7.3`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`84`		[CL]A:201	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6574`	`6.8`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	`85`		[CL]E:202	`1`	`1`	`125`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7596`	`6.6`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`6.7`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
74	`86`		[MN]I:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32371`	`5.7`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`87`		[MN]J:303	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32423`	`5.1`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
76	`88`		C	`1`	`1`	`9072`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6574`	`2.5`	`0.1`	`0.775`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`89`		[MN]J:303	`1`	`1`	`123`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8766`	`0.7`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`90`		J	`1`	`1`	`32371`	`x`	J	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`32371`	`0.1`	`-0.0`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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