PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=731-E2-634)

Interfaces in PDB 6ka7 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 3.00 Å

THE COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN IGG FC AND ITS BINDING REPEBODY

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`106`	`29`	`11822`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`105`	`31`	`11455`	`1056.1`	`-11.4`	`0.166`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
2	`2`		D	`82`	`20`	`11822`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`99`	`31`	`9864`	`850.6`	`-0.2`	`0.707`	`13`	`9`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`79`	`22`	`11455`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`97`	`32`	`10479`	`821.4`	`-0.6`	`0.633`	`8`	`7`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`836.0`	`-0.4`	`0.670`	`11`	`8`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`46`	`13`	`11455`	`x`	C	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`49`	`13`	`11455`	`426.3`	`0.0`	`0.699`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		C	`29`	`11`	`11455`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`26`	`10`	`11822`	`266.7`	`1.8`	`0.793`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		D	`30`	`7`	`11822`	`x`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`31`	`8`	`11822`	`250.4`	`-2.4`	`0.449`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		A	`22`	`8`	`10479`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`18`	`8`	`9864`	`163.9`	`-0.3`	`0.653`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		D	`17`	`7`	`11822`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`22`	`9`	`9864`	`142.6`	`-0.4`	`0.656`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[NAG]D:501	`13`	`1`	`354`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`11822`	`129.4`	`2.1`	`0.262`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[NAG]C:501	`13`	`1`	`354`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`11455`	`125.4`	`2.5`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[NAG]D:507	`10`	`1`	`361`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`11822`	`122.9`	`1.1`	`0.192`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		[NAG]C:507	`8`	`1`	`361`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`11455`	`108.2`	`1.0`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[NAG]C:502	`12`	`1`	`359`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`11455`	`104.5`	`1.6`	`0.199`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[NAG]D:502	`11`	`1`	`364`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`11822`	`96.6`	`0.5`	`0.138`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[MAN]D:506	`8`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]D:507	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`361`	`76.1`	`2.9`	`0.184`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[NAG]C:502	`8`	`1`	`359`	`cf`	[NAG]C:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`354`	`69.0`	`2.0`	`0.132`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		[MAN]D:504	`7`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`355`	`68.8`	`2.7`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		[NAG]D:502	`9`	`1`	`364`	`cf`	[NAG]D:501	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`354`	`68.1`	`1.6`	`0.098`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		[MAN]C:506	`7`	`1`	`293`	`cf`	[NAG]C:507	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`361`	`67.2`	`2.4`	`0.131`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		[MAN]C:504	`9`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]C:505	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`351`	`65.9`	`2.3`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[BMA]D:503	`8`	`1`	`291`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`11822`	`64.6`	`0.7`	`0.163`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[BMA]C:503	`7`	`1`	`289`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`11455`	`61.1`	`0.7`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[MAN]C:506	`4`	`1`	`293`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11455`	`59.0`	`2.0`	`0.631`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[NAG]D:505	`6`	`1`	`355`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11822`	`57.7`	`0.5`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		[FUC]D:508	`7`	`1`	`280`	`cf`	[NAG]D:501	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`354`	`57.5`	`2.4`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		[FUC]C:508	`5`	`1`	`282`	`cf`	[NAG]C:501	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`354`	`57.2`	`2.3`	`0.272`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		[MAN]C:504	`8`	`1`	`294`	`cf`	[BMA]C:503	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`289`	`55.4`	`2.3`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		[MAN]C:506	`7`	`1`	`293`	`f`	[NAG]C:502	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`55.3`	`0.9`	`0.077`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[BMA]D:503	`6`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]D:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`364`	`54.2`	`0.9`	`0.112`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[BMA]C:503	`5`	`1`	`289`	`cf`	[NAG]C:502	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`50.8`	`1.0`	`0.155`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`52.5`	`0.9`	`0.133`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[MAN]D:506	`6`	`1`	`290`	`f`	[NAG]D:502	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`364`	`51.2`	`1.8`	`0.171`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[MAN]D:504	`7`	`1`	`290`	`cf`	[BMA]D:503	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`291`	`50.7`	`2.3`	`0.209`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[MAN]C:506	`7`	`1`	`293`	`cf`	[BMA]C:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`289`	`50.5`	`1.8`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[NAG]D:501	`4`	`1`	`354`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`12`	`3`	`11822`	`48.6`	`1.5`	`0.575`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[MAN]D:506	`6`	`1`	`290`	`cf`	[BMA]D:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`291`	`46.0`	`2.1`	`0.268`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[MAN]D:504	`7`	`1`	`290`	`◊`	[NAG]C:502	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`45.4`	`0.4`	`0.066`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[FUC]C:508	`4`	`1`	`282`	`◊`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`355`	`42.9`	`1.3`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[MAN]C:504	`4`	`1`	`294`	`◊`	[NAG]D:502	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`364`	`41.3`	`0.6`	`0.151`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[FUC]D:508	`5`	`1`	`280`	`f`	[NAG]D:502	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`364`	`39.6`	`1.6`	`0.199`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		[NAG]C:505	`4`	`1`	`351`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`11455`	`37.2`	`0.1`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[FUC]C:508	`4`	`1`	`282`	`f`	[NAG]C:502	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`359`	`37.1`	`1.4`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[MAN]D:506	`4`	`1`	`290`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`11822`	`34.1`	`0.8`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		[MAN]D:504	`5`	`1`	`290`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11822`	`33.0`	`-0.3`	`0.113`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		[FUC]D:508	`7`	`1`	`280`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`11822`	`32.0`	`0.9`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		A	`4`	`1`	`10479`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`6`	`3`	`11822`	`31.1`	`0.0`	`0.662`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		[MAN]D:504	`5`	`1`	`290`	`◊`	[BMA]C:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`289`	`29.3`	`0.2`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		[MAN]C:504	`4`	`1`	`294`	`◊`	[BMA]D:503	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`291`	`28.6`	`-0.2`	`0.126`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		A	`8`	`6`	`10479`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`6`	`4`	`10479`	`28.5`	`0.2`	`0.727`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`49`		[FUC]D:508	`4`	`1`	`280`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`11822`	`28.2`	`0.4`	`0.208`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		A	`3`	`1`	`10479`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`10479`	`26.8`	`-0.6`	`0.177`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		[MAN]C:504	`5`	`1`	`294`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`11455`	`26.3`	`-0.2`	`0.179`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`52`		[MAN]D:504	`3`	`1`	`290`	`◊`	[MAN]C:506	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`293`	`24.7`	`0.6`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`53`		[BMA]C:503	`3`	`1`	`289`	`f`	[NAG]C:505	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`351`	`23.3`	`0.8`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`54`		B	`5`	`2`	`9864`	`x`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`2`	`2`	`9864`	`20.8`	`-0.4`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`55`		[BMA]D:503	`2`	`1`	`291`	`f`	[NAG]D:507	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`361`	`18.9`	`0.9`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`56`		A	`3`	`1`	`10479`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`11455`	`18.2`	`0.3`	`0.751`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`57`		[BMA]D:503	`3`	`1`	`291`	`f`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`355`	`18.0`	`0.7`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`58`		[MAN]C:504	`3`	`1`	`294`	`f`	[NAG]C:502	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`359`	`17.9`	`0.6`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`59`		[MAN]D:504	`3`	`1`	`290`	`f`	[NAG]D:502	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`364`	`17.2`	`0.6`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`60`		[BMA]C:503	`2`	`1`	`289`	`f`	[NAG]C:507	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`361`	`16.9`	`0.7`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`61`		[BMA]D:503	`3`	`1`	`291`	`◊`	[BMA]C:503	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`289`	`13.1`	`0.3`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`62`		[FUC]C:508	`4`	`1`	`282`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`11455`	`12.6`	`0.4`	`0.313`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`63`		[MAN]D:504	`1`	`1`	`290`	`◊`	[MAN]C:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`294`	`10.9`	`0.2`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`64`		[FUC]C:508	`2`	`1`	`282`	`◊`	[MAN]D:504	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`290`	`8.2`	`0.4`	`0.274`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`65`		[FUC]D:508	`2`	`1`	`280`	`◊`	[NAG]C:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`351`	`8.0`	`0.4`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		[MAN]C:506	`2`	`1`	`293`	`◊`	[NAG]D:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`355`	`6.8`	`0.2`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`67`		[NAG]C:505	`1`	`1`	`351`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`11822`	`6.7`	`0.2`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`68`		A	`1`	`1`	`10479`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`11455`	`2.6`	`-0.1`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		B	`1`	`1`	`9864`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`2`	`1`	`11822`	`2.3`	`0.0`	`0.700`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`70`		[FUC]C:508	`1`	`1`	`282`	`f`	[MAN]C:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`293`	`1.7`	`0.0`	`0.191`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`71`		[MAN]D:506	`1`	`1`	`290`	`◊`	[MAN]C:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`294`	`0.8`	`0.0`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`72`		[MAN]D:504	`1`	`1`	`290`	`◊`	[NAG]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`354`	`0.5`	`0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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