PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=913-C5-8K4)

Interfaces in PDB 6nkw crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.98 Å

TERNARY COMPLEX CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA WITH "HOT- SPOT SEQUENCE" WITH BETA-GAMMA-METHYLENE DGTP

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		T	`82`	`8`	`3792`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`81`	`27`	`17205`	`706.3`	`-3.0`	`0.533`	`14`	`0`	`0`	`0.093`
`2`		P	`38`	`9`	`2143`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`38`	`10`	`3792`	`407.2`	`-5.5`	`0.504`	`23`	`0`	`0`	`0.945`
`3`		D	`38`	`4`	`1359`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`18`	`17205`	`372.8`	`-7.3`	`0.445`	`9`	`0`	`0`	`0.111`
`4`		[GGH]A:407	`30`	`1`	`600`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`17`	`17205`	`301.7`	`0.8`	`0.548`	`6`	`0`	`0`	`0.020`
`5`		P	`25`	`3`	`2143`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`16`	`17205`	`248.9`	`-6.3`	`0.269`	`5`	`0`	`0`	`0.090`
`6`		A	`30`	`7`	`17205`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`7`	`17205`	`243.7`	`2.4`	`0.799`	`8`	`1`	`0`	`0.000`
`7`		A	`24`	`10`	`17205`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`28`	`10`	`17205`	`234.6`	`-1.8`	`0.293`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
`8`		D	`24`	`5`	`1359`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`24`	`5`	`3792`	`228.1`	`-3.1`	`0.580`	`13`	`0`	`0`	`0.634`
`9`		A	`31`	`10`	`17205`	`◊`	P	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`25`	`3`	`2143`	`222.2`	`2.3`	`0.649`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`10`		A	`20`	`9`	`17205`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`29`	`9`	`17205`	`194.1`	`4.2`	`0.899`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
`11`		A	`23`	`10`	`17205`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`22`	`7`	`17205`	`192.6`	`3.4`	`0.850`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
`12`		A	`18`	`9`	`17205`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`19`	`2`	`3792`	`172.7`	`0.0`	`0.605`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`13`		[2DT]P:10	`11`	`1`	`427`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`17205`	`134.8`	`1.6`	`0.560`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`14`		A	`14`	`5`	`17205`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`11`	`3`	`17205`	`125.1`	`-2.0`	`0.192`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		T	`17`	`2`	`3792`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`14`	`3`	`17205`	`116.8`	`-1.9`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		D	`15`	`1`	`1359`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`11`	`3`	`17205`	`113.5`	`2.3`	`0.862`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		[2DT]P:10	`14`	`1`	`427`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`2143`	`97.2`	`1.1`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		[GGH]A:407	`17`	`1`	`600`	`◊`	[2DT]P:10	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`427`	`94.6`	`2.3`	`0.552`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`19`		[CL]A:405	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`17205`	`74.8`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.119`
`20`		[CL]A:403	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`17205`	`73.3`	`-12.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
`21`		[GGH]A:407	`8`	`1`	`600`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`3792`	`73.2`	`1.1`	`0.618`	`4`	`0`	`0`	`0.007`
`22`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`17205`	`68.1`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.102`
`23`		[CL]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17205`	`64.3`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.105`
`24`		A	`6`	`2`	`17205`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`10`	`2`	`3792`	`64.0`	`-2.1`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`25`		[2DT]P:10	`5`	`1`	`427`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3792`	`60.7`	`1.3`	`0.570`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`26`		[NA]D:101	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17205`	`57.9`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
`27`		[NA]P:101	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17205`	`56.8`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
`28`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`17205`	`39.1`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
`29`		A	`8`	`3`	`17205`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`2`	`17205`	`35.0`	`-0.2`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`30`		[NA]P:101	`1`	`1`	`125`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2143`	`34.3`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
`31`		[NA]D:101	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1359`	`32.9`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
`32`		[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`17205`	`32.6`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
`33`		[MG]T:101	`1`	`1`	`98`	`f`	T	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3792`	`31.1`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.204`
`34`		[GGH]A:407	`5`	`1`	`600`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.6`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
`35`		D	`4`	`1`	`1359`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`3`	`1`	`3792`	`29.3`	`0.1`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`36`		[GGH]A:407	`6`	`1`	`600`	`f`	[NA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`28.4`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
`37`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`◊`	[2DT]P:10	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`427`	`26.3`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
`38`		A	`4`	`2`	`17205`	`◊`	T	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`3792`	`20.3`	`-1.1`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`39`		[MG]T:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1359`	`19.8`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.162`
`40`		[CL]A:404	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1359`	`19.5`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
`41`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.1`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
`42`		[MG]T:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17205`	`9.7`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
`43`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3792`	`7.2`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
`44`		A	`1`	`1`	`17205`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2143`	`4.0`	`-0.2`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`45`		[CL]A:404	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3792`	`3.0`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
`46`		A	`1`	`1`	`17205`	`x`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`17205`	`2.2`	`-0.1`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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