PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=637-5M-6J3)

Interfaces in PDB 6qtk crystal.
Space symmetry group: P 61. Resolution: 2.31 Å

2.31A STRUCTURE OF GEPOTIDACIN WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DOUBLY NICKED DNA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`154`	`34`	`24240`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`160`	`46`	`10193`	`1579.7`	`-23.8`	`0.004`	`13`	`6`	`0`	`0.750`
	`2`		C	`147`	`33`	`23895`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`152`	`42`	`9868`	`1435.4`	`-24.4`	`0.003`	`13`	`5`	`0`	`0.750`
	*Average:*													`1507.5`	`-24.1`	`0.004`	`13`	`6`	`0`	`0.750`
2	`3`		C	`163`	`43`	`23895`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`163`	`43`	`24240`	`1578.6`	`-11.1`	`0.127`	`24`	`14`	`0`	`0.518`
3	`4`		F	`94`	`19`	`4768`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`93`	`20`	`4783`	`888.8`	`-7.8`	`0.716`	`47`	`0`	`0`	`0.877`
4	`5`		C	`67`	`25`	`23895`	`◊`	A	x-y,x,z+1/6	`6_555`	`67`	`24`	`24240`	`650.1`	`2.8`	`0.758`	`13`	`4`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`71`	`22`	`24240`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`77`	`24`	`9868`	`631.7`	`-1.9`	`0.461`	`9`	`0`	`0`	`0.172`
	`7`		C	`70`	`22`	`23895`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`74`	`24`	`10193`	`619.9`	`-3.3`	`0.339`	`9`	`0`	`0`	`0.172`
	*Average:*													`625.8`	`-2.6`	`0.400`	`9`	`0`	`0`	`0.172`
6	`8`		E	`66`	`6`	`4783`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`73`	`24`	`24240`	`596.9`	`-5.2`	`0.544`	`11`	`0`	`0`	`0.577`
	`9`		F	`66`	`7`	`4768`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`73`	`24`	`23895`	`589.4`	`-7.4`	`0.431`	`10`	`0`	`0`	`0.577`
	*Average:*													`593.2`	`-6.3`	`0.488`	`11`	`0`	`0`	`0.577`
7	`10`		E	`55`	`9`	`4783`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`48`	`18`	`23895`	`464.2`	`-6.8`	`0.374`	`8`	`0`	`0`	`0.185`
	`11`		F	`51`	`9`	`4768`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`18`	`24240`	`408.8`	`-8.1`	`0.209`	`5`	`0`	`0`	`0.185`
	*Average:*													`436.5`	`-7.5`	`0.291`	`7`	`0`	`0`	`0.185`
8	`12`		F	`46`	`8`	`4768`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`46`	`15`	`10193`	`391.2`	`-7.2`	`0.372`	`8`	`0`	`0`	`0.695`
	`13`		E	`42`	`6`	`4783`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`45`	`15`	`9868`	`383.2`	`-7.9`	`0.353`	`8`	`0`	`0`	`0.695`
	*Average:*													`387.2`	`-7.6`	`0.363`	`8`	`0`	`0`	`0.695`
9	`14`		F	`43`	`5`	`4768`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`41`	`13`	`9868`	`360.0`	`3.0`	`0.851`	`7`	`0`	`0`	`0.002`
	`15`		E	`42`	`5`	`4783`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`13`	`10193`	`355.7`	`3.1`	`0.845`	`7`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`357.9`	`3.0`	`0.848`	`7`	`0`	`0`	`0.002`
10	`16`		A	`34`	`9`	`24240`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`38`	`15`	`23895`	`309.7`	`0.3`	`0.598`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		C	`28`	`8`	`23895`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`19`	`4`	`10193`	`228.0`	`1.6`	`0.768`	`6`	`6`	`0`	`0.000`
12	`18`		C	`25`	`6`	`23895`	`◊`	E	x-1,y-1,z	`1_445`	`20`	`2`	`4783`	`215.2`	`2.4`	`0.725`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		A	`20`	`8`	`24240`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`19`	`2`	`4783`	`167.6`	`-2.4`	`0.495`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		C	`17`	`5`	`23895`	`◊`	F	x-1,y-1,z	`1_445`	`13`	`2`	`4768`	`147.9`	`2.6`	`0.704`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		[JHN]F:2101	`15`	`1`	`674`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`24240`	`143.2`	`-1.1`	`0.106`	`1`	`0`	`0`	`0.035`
16	`22`		C	`21`	`10`	`23895`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`8`	`24240`	`142.1`	`0.6`	`0.597`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
17	`23`		[JHN]F:2101	`16`	`1`	`674`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`2`	`4783`	`141.5`	`4.8`	`0.660`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[JHN]F:2101	`14`	`1`	`674`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`20`	`2`	`4768`	`138.5`	`5.5`	`0.747`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		[GOL]C:501	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`23895`	`137.6`	`0.4`	`0.626`	`4`	`0`	`0`	`0.065`
20	`26`		[JHN]F:2101	`13`	`1`	`674`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`23895`	`133.4`	`-1.4`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
21	`27`		[GOL]A:503	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`11`	`24240`	`126.3`	`-0.9`	`0.438`	`1`	`0`	`0`	`0.028`
22	`28`		A	`14`	`5`	`24240`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`15`	`1`	`4768`	`121.5`	`2.2`	`0.744`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`29`		[GOL]C:502	`6`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`23895`	`101.7`	`-0.6`	`0.456`	`2`	`0`	`0`	`0.072`
24	`30`		[GOL]E:2101	`6`	`1`	`220`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`4783`	`98.5`	`-1.0`	`0.551`	`3`	`0`	`0`	`0.140`
25	`31`		[GOL]C:503	`5`	`1`	`221`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`23895`	`97.8`	`-0.9`	`0.464`	`3`	`0`	`0`	`0.107`
26	`32`		C	`10`	`4`	`23895`	`◊`	A	x-1,y-1,z	`1_445`	`16`	`5`	`24240`	`96.4`	`1.1`	`0.737`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		[GOL]A:501	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`23895`	`88.5`	`-0.7`	`0.457`	`2`	`0`	`0`	`0.075`
28	`34`		[GOL]A:501	`6`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`24240`	`87.5`	`-0.6`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
29	`35`		[GOL]C:502	`6`	`1`	`216`	`◊`	A	x-y,x,z+1/6	`6_555`	`10`	`5`	`24240`	`81.3`	`0.5`	`0.658`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		[GOL]C:504	`5`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`23895`	`77.8`	`0.3`	`0.567`	`3`	`0`	`0`	`0.050`
31	`37`		[GOL]E:2102	`4`	`1`	`223`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`4783`	`64.1`	`-0.7`	`0.418`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
32	`38`		[NA]A:502	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`24240`	`63.2`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.212`
33	`39`		[GOL]E:2101	`5`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`24240`	`52.1`	`-0.2`	`0.550`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
34	`40`		[MN]D:701	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`9868`	`44.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
	`41`		[MN]B:701	`1`	`1`	`123`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`10193`	`43.5`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
	*Average:*													`43.9`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.165`
35	`42`		[GOL]E:2102	`3`	`1`	`223`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4768`	`43.0`	`-0.7`	`0.462`	`1`	`0`	`0`	`0.100`
36	`43`		[GOL]C:504	`4`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10193`	`41.3`	`0.3`	`0.660`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
37	`44`		[GOL]A:503	`4`	`1`	`218`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`4783`	`40.0`	`-0.4`	`0.525`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
38	`45`		[MN]D:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`4768`	`37.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.061`
	`46`		[MN]B:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`4783`	`37.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.061`
	*Average:*													`37.3`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.061`
39	`47`		[GOL]E:2101	`3`	`1`	`220`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`4768`	`32.7`	`0.6`	`0.599`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`48`		[MN]B:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`23895`	`19.5`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	`49`		[MN]D:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`24240`	`19.3`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	*Average:*													`19.4`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
41	`50`		C	`1`	`1`	`23895`	`◊`	[NA]A:502	x-1,y-1,z	`1_445`	`1`	`1`	`125`	`12.6`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`51`		[GOL]E:2102	`2`	`1`	`223`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`9868`	`11.6`	`-0.0`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`52`		A	`3`	`1`	`24240`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`2`	`9868`	`10.3`	`0.2`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`53`		[JHN]F:2101	`1`	`1`	`674`	`◊`	[GOL]E:2101	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`220`	`9.9`	`0.4`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`54`		A	`2`	`2`	`24240`	`x`	A	x-y,x-1,z+1/6	`6_545`	`3`	`2`	`24240`	`8.7`	`0.2`	`0.684`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`55`		A	`1`	`1`	`24240`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`1`	`1`	`10193`	`8.3`	`0.2`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`56`		[JHN]F:2101	`1`	`1`	`674`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`9868`	`3.4`	`0.2`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`57`		A	`1`	`1`	`24240`	`◊`	[GOL]E:2102	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`223`	`2.9`	`0.1`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`58`		[GOL]C:504	`2`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`24240`	`2.8`	`0.0`	`0.655`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`59`		C	`1`	`1`	`23895`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`10193`	`0.6`	`0.0`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`60`		[JHN]F:2101	`1`	`1`	`674`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10193`	`0.5`	`0.0`	`0.564`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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