PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=725-5M-7DL)

Interfaces in PDB 6qx1 crystal.
Space symmetry group: P 61. Resolution: 2.65 Å

2.7A STRUCTURE OF BENZOISOXAZOLE 3 WITH S.AUREUS DNA GYRASE AND DNA.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`164`	`42`	`23780`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`160`	`40`	`24132`	`1615.7`	`-13.0`	`0.084`	`26`	`13`	`0`	`0.616`
2	`2`		C	`142`	`32`	`23780`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`150`	`38`	`9840`	`1412.8`	`-23.3`	`0.004`	`13`	`6`	`0`	`0.705`
	`3`		A	`133`	`29`	`24132`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`139`	`38`	`10087`	`1330.5`	`-22.4`	`0.003`	`11`	`6`	`0`	`0.705`
	*Average:*													`1371.7`	`-22.8`	`0.003`	`12`	`6`	`0`	`0.705`
3	`4`		F	`115`	`19`	`4781`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`109`	`20`	`4793`	`980.0`	`-4.9`	`0.805`	`42`	`0`	`0`	`0.886`
4	`5`		C	`67`	`25`	`23780`	`◊`	A	x-y,x,z+1/6	`6_555`	`70`	`26`	`24132`	`640.2`	`3.6`	`0.794`	`10`	`4`	`0`	`0.000`
5	`6`		E	`71`	`7`	`4793`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`74`	`24`	`24132`	`637.0`	`-7.0`	`0.496`	`14`	`0`	`0`	`0.628`
	`7`		F	`69`	`7`	`4781`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`78`	`24`	`23780`	`598.9`	`-7.7`	`0.428`	`12`	`0`	`0`	`0.628`
	*Average:*													`618.0`	`-7.3`	`0.462`	`13`	`0`	`0`	`0.628`
6	`8`		C	`66`	`22`	`23780`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`72`	`23`	`10087`	`608.9`	`-0.3`	`0.548`	`11`	`4`	`0`	`0.134`
	`9`		A	`64`	`20`	`24132`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`69`	`22`	`9840`	`571.5`	`-0.8`	`0.572`	`10`	`2`	`0`	`0.134`
	*Average:*													`590.2`	`-0.5`	`0.560`	`11`	`3`	`0`	`0.134`
7	`10`		E	`57`	`9`	`4793`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`47`	`18`	`23780`	`457.6`	`-3.6`	`0.547`	`6`	`0`	`0`	`0.113`
	`11`		F	`58`	`9`	`4781`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`18`	`24132`	`433.6`	`-4.3`	`0.499`	`4`	`0`	`0`	`0.113`
	*Average:*													`445.6`	`-4.0`	`0.523`	`5`	`0`	`0`	`0.113`
8	`12`		F	`43`	`6`	`4781`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`46`	`15`	`10087`	`389.1`	`-8.4`	`0.298`	`10`	`0`	`0`	`0.773`
	`13`		E	`47`	`6`	`4793`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`43`	`14`	`9840`	`374.4`	`-7.5`	`0.410`	`9`	`0`	`0`	`0.773`
	*Average:*													`381.7`	`-8.0`	`0.354`	`10`	`0`	`0`	`0.773`
9	`14`		A	`39`	`11`	`24132`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`43`	`15`	`23780`	`364.0`	`0.4`	`0.603`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		E	`39`	`5`	`4793`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`33`	`9`	`10087`	`298.5`	`2.9`	`0.764`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		F	`31`	`5`	`4781`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`9840`	`260.9`	`0.6`	`0.633`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`279.7`	`1.8`	`0.698`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		[JK8]B:702	`21`	`1`	`561`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`10`	`24132`	`252.8`	`-7.8`	`0.117`	`0`	`0`	`0`	`0.301`
	`18`		[JK8]D:702	`22`	`1`	`546`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`30`	`11`	`23780`	`235.1`	`-4.4`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.301`
	*Average:*													`244.0`	`-6.1`	`0.196`	`0`	`0`	`0`	`0.301`
12	`19`		C	`30`	`9`	`23780`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`19`	`4`	`10087`	`226.6`	`1.9`	`0.774`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
13	`20`		[JK8]D:702	`22`	`1`	`546`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`6`	`9840`	`215.0`	`-1.2`	`0.502`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
	`21`		[JK8]B:702	`23`	`1`	`561`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`5`	`10087`	`175.3`	`1.9`	`0.607`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
	*Average:*													`195.2`	`0.4`	`0.555`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
14	`22`		C	`25`	`6`	`23780`	`◊`	E	x-1,y-1,z	`1_445`	`21`	`2`	`4793`	`204.5`	`2.1`	`0.653`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		A	`20`	`8`	`24132`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`19`	`2`	`4793`	`168.2`	`-3.1`	`0.406`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		[GOL]A:502	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`24132`	`138.7`	`0.1`	`0.604`	`4`	`0`	`0`	`0.063`
17	`25`		C	`12`	`6`	`23780`	`◊`	F	x-1,y-1,z	`1_445`	`13`	`2`	`4781`	`125.6`	`2.5`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`26`		[GOL]C:503	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`23780`	`124.0`	`-1.3`	`0.342`	`3`	`0`	`0`	`0.127`
19	`27`		C	`20`	`9`	`23780`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`20`	`9`	`24132`	`116.4`	`1.2`	`0.714`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`28`		C	`16`	`6`	`23780`	`◊`	A	x-1,y-1,z	`1_445`	`20`	`7`	`24132`	`112.2`	`0.8`	`0.671`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`29`		[GOL]E:2101	`5`	`1`	`219`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`4793`	`110.4`	`-0.8`	`0.522`	`3`	`0`	`0`	`0.118`
22	`30`		A	`14`	`5`	`24132`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`15`	`1`	`4781`	`109.6`	`2.5`	`0.773`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`31`		C	`17`	`6`	`23780`	`◊`	[GOL]A:501	x-y,x,z+1/6	`6_555`	`5`	`1`	`220`	`102.3`	`-0.5`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`32`		[GOL]A:501	`5`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`24132`	`69.4`	`0.6`	`0.645`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`33`		[GOL]E:2102	`4`	`1`	`220`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`4793`	`62.6`	`-0.5`	`0.531`	`1`	`0`	`0`	`0.049`
26	`34`		[MN]D:701	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`9840`	`59.4`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.227`
	`35`		[MN]B:701	`1`	`1`	`123`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`10087`	`58.6`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.227`
	*Average:*													`59.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.227`
27	`36`		[CL]C:502	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`23780`	`48.9`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[CL]C:502	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x-y,x,z+1/6	`6_555`	`13`	`5`	`24132`	`47.8`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`48.3`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`38`		[GOL]E:2101	`5`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`24132`	`45.2`	`0.1`	`0.579`	`1`	`0`	`0`	`0.013`
29	`39`		A	`5`	`3`	`24132`	`x`	A	x-y,x-1,z+1/6	`6_545`	`6`	`3`	`24132`	`38.5`	`0.3`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`40`		[GOL]E:2102	`6`	`1`	`220`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`4781`	`36.5`	`-0.5`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
31	`41`		[GOL]C:503	`4`	`1`	`220`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4781`	`32.0`	`-0.2`	`0.540`	`1`	`0`	`0`	`0.032`
32	`42`		[GOL]E:2101	`2`	`1`	`219`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`4781`	`31.4`	`0.6`	`0.634`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`43`		[MN]D:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`4781`	`24.7`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	`44`		[MN]B:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`4793`	`23.6`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	*Average:*													`24.1`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
34	`45`		[CL]C:502	`1`	`1`	`125`	`f`	[GOL]A:501	x-y,x,z+1/6	`6_555`	`1`	`1`	`220`	`14.7`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
35	`46`		A	`1`	`1`	`24132`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`9840`	`10.0`	`0.0`	`0.439`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`47`		A	`1`	`1`	`24132`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`2`	`2`	`10087`	`7.9`	`0.2`	`0.662`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`48`		[GOL]E:2102	`2`	`1`	`220`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`9840`	`3.7`	`-0.1`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
38	`49`		C	`4`	`2`	`23780`	`◊`	[JK8]B:702	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`561`	`3.1`	`0.1`	`0.673`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`50`		[MN]B:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`24132`	`1.7`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`51`		[MN]D:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`23780`	`1.3`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`1.5`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
40	`52`		[MN]B:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`23780`	`1.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`53`		[MN]D:701	`1`	`1`	`123`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`24132`	`1.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`1.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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