PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=317-E2-JG1)

Interfaces in PDB 6vdk

CRYOEM STRUCTURE OF HIV-1 CONSERVED INTASOME CORE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`156`	`39`	`17406`	`◊`	B	`151`	`36`	`16018`	`1361.3`	`-17.8`	`0.244`	`8`	`5`	`0`	`0.000`
	`2`		C	`152`	`37`	`17561`	`◊`	D	`148`	`35`	`15852`	`1321.8`	`-19.5`	`0.157`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1341.6`	`-18.6`	`0.200`	`8`	`6`	`0`	`0.000`
2	`3`		C	`123`	`38`	`17561`	`◊`	I	`142`	`32`	`4522`	`1236.3`	`-14.0`	`0.225`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		A	`125`	`34`	`17406`	`◊`	J	`124`	`30`	`4384`	`1227.1`	`-14.4`	`0.256`	`10`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1231.7`	`-14.2`	`0.240`	`10`	`1`	`0`	`0.000`
3	`5`		A	`113`	`31`	`17406`	`◊`	C	`112`	`30`	`17561`	`1070.3`	`2.1`	`0.942`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
4	`6`		E	`121`	`24`	`6160`	`◊`	F	`108`	`24`	`5608`	`1069.8`	`-14.8`	`0.683`	`65`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		G	`121`	`24`	`6165`	`◊`	H	`117`	`24`	`5634`	`1069.4`	`-16.0`	`0.688`	`65`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1069.6`	`-15.4`	`0.686`	`65`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		A	`80`	`17`	`17406`	`◊`	P	`79`	`21`	`3729`	`692.9`	`-5.4`	`0.476`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`84`	`18`	`17561`	`◊`	M	`73`	`18`	`3935`	`669.3`	`-5.3`	`0.450`	`5`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`681.1`	`-5.4`	`0.463`	`5`	`5`	`0`	`0.000`
6	`10`		A	`89`	`29`	`17406`	`◊`	G	`75`	`7`	`6165`	`674.9`	`-10.1`	`0.571`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		C	`83`	`28`	`17561`	`◊`	E	`77`	`7`	`6160`	`654.0`	`-8.4`	`0.592`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`664.4`	`-9.2`	`0.581`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		D	`39`	`12`	`15852`	`◊`	I	`30`	`7`	`4522`	`328.9`	`-2.8`	`0.402`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		B	`30`	`10`	`16018`	`◊`	J	`24`	`6`	`4384`	`245.2`	`-3.9`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`287.0`	`-3.4`	`0.318`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		M	`42`	`11`	`3935`	`◊`	E	`40`	`4`	`6160`	`326.6`	`-2.6`	`0.342`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		P	`41`	`12`	`3729`	`◊`	G	`41`	`4`	`6165`	`323.7`	`-1.2`	`0.527`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`325.2`	`-1.9`	`0.435`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
9	`16`		C	`21`	`8`	`17561`	`◊`	G	`34`	`5`	`6165`	`277.6`	`-2.7`	`0.598`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		A	`24`	`9`	`17406`	`◊`	E	`35`	`5`	`6160`	`268.5`	`-2.2`	`0.667`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`273.0`	`-2.5`	`0.632`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`18`		A	`27`	`10`	`17406`	`◊`	F	`36`	`5`	`5608`	`258.6`	`-7.1`	`0.294`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		C	`24`	`9`	`17561`	`◊`	H	`38`	`6`	`5634`	`256.1`	`-6.7`	`0.229`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`257.3`	`-6.9`	`0.262`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		C	`34`	`13`	`17561`	`◊`	[DLU]C:303	`27`	`1`	`602`	`245.7`	`-1.7`	`0.725`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		A	`35`	`13`	`17406`	`◊`	[DLU]A:303	`29`	`1`	`603`	`242.9`	`-1.3`	`0.764`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`244.3`	`-1.5`	`0.744`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
12	`22`		C	`25`	`5`	`17561`	`◊`	B	`31`	`7`	`16018`	`244.3`	`-0.3`	`0.652`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`23`		A	`23`	`6`	`17406`	`◊`	D	`31`	`8`	`15852`	`225.6`	`-0.6`	`0.610`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`234.9`	`-0.5`	`0.631`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
13	`24`		A	`33`	`9`	`17406`	`◊`	H	`25`	`4`	`5634`	`240.7`	`-0.7`	`0.694`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		C	`34`	`10`	`17561`	`◊`	F	`23`	`4`	`5608`	`224.5`	`0.0`	`0.745`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`232.6`	`-0.3`	`0.720`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`26`		F	`23`	`2`	`5608`	`◊`	[DLU]C:303	`25`	`1`	`602`	`163.7`	`0.8`	`0.871`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		H	`23`	`2`	`5634`	`◊`	[DLU]A:303	`24`	`1`	`603`	`155.9`	`1.7`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`159.8`	`1.3`	`0.882`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`28`		J	`14`	`5`	`4384`	`◊`	G	`18`	`5`	`6165`	`139.8`	`-3.6`	`0.402`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		I	`12`	`4`	`4522`	`◊`	E	`11`	`4`	`6160`	`113.9`	`-3.1`	`0.294`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`126.9`	`-3.4`	`0.348`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
16	`30`		P	`18`	`5`	`3729`	`◊`	F	`15`	`4`	`5608`	`129.3`	`-1.4`	`0.530`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		M	`15`	`5`	`3935`	`◊`	H	`16`	`4`	`5634`	`128.9`	`-2.1`	`0.489`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`129.1`	`-1.7`	`0.509`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`32`		B	`14`	`5`	`16018`	`◊`	G	`13`	`3`	`6165`	`111.4`	`-2.7`	`0.430`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		D	`11`	`5`	`15852`	`◊`	E	`13`	`3`	`6160`	`94.3`	`-2.1`	`0.470`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`102.9`	`-2.4`	`0.450`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`34`		P	`6`	`3`	`3729`	`◊`	E	`10`	`3`	`6160`	`71.5`	`-1.2`	`0.532`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		M	`7`	`3`	`3935`	`◊`	G	`8`	`3`	`6165`	`61.7`	`-2.2`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`66.6`	`-1.7`	`0.464`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`36`		I	`11`	`4`	`4522`	`◊`	M	`8`	`3`	`3935`	`58.8`	`1.5`	`0.791`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		J	`9`	`4`	`4384`	`◊`	P	`6`	`2`	`3729`	`38.7`	`0.9`	`0.772`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`48.7`	`1.2`	`0.781`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`38`		J	`3`	`1`	`4384`	`◊`	E	`8`	`2`	`6160`	`53.1`	`1.2`	`0.780`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		I	`3`	`1`	`4522`	`◊`	G	`6`	`1`	`6165`	`40.2`	`-0.4`	`0.610`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`46.6`	`0.4`	`0.695`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`40`		G	`10`	`1`	`6165`	`◊`	[DLU]A:303	`6`	`1`	`603`	`44.6`	`0.6`	`0.792`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		E	`8`	`1`	`6160`	`◊`	[DLU]C:303	`6`	`1`	`602`	`43.0`	`0.6`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`43.8`	`0.6`	`0.790`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`42`		M	`2`	`1`	`3935`	`◊`	[DLU]C:303	`5`	`1`	`602`	`38.3`	`0.4`	`0.800`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		P	`2`	`1`	`3729`	`◊`	[DLU]A:303	`5`	`1`	`603`	`37.6`	`0.4`	`0.785`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`38.0`	`0.4`	`0.793`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`44`		C	`11`	`5`	`17561`	`◊`	[MG]C:301	`1`	`1`	`98`	`35.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		A	`6`	`4`	`17406`	`◊`	[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`34.4`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`35.1`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`46`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	[DLU]A:303	`3`	`1`	`603`	`31.2`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[MG]C:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	[DLU]C:303	`4`	`1`	`602`	`30.8`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`◊`	[DLU]A:303	`4`	`1`	`603`	`29.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[MG]C:302	`1`	`1`	`98`	`◊`	[DLU]C:303	`4`	`1`	`602`	`29.2`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`30.1`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`50`		A	`9`	`5`	`17406`	`◊`	[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`29.8`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		C	`10`	`6`	`17561`	`◊`	[MG]C:302	`1`	`1`	`98`	`29.7`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`29.7`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`52`		H	`8`	`2`	`5634`	`◊`	[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`21.2`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		F	`5`	`2`	`5608`	`◊`	[MG]C:302	`1`	`1`	`98`	`17.0`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.1`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`54`		B	`4`	`3`	`16018`	`◊`	H	`3`	`3`	`5634`	`15.4`	`0.1`	`0.584`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`55`		[MG]C:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	[MG]C:302	`1`	`1`	`98`	`13.6`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`56`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	[MG]A:302	`1`	`1`	`98`	`10.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`57`		I	`2`	`1`	`4522`	`◊`	H	`3`	`1`	`5634`	`9.0`	`-0.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		J	`1`	`1`	`4384`	`◊`	F	`1`	`1`	`5608`	`0.4`	`0.0`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`4.7`	`-0.3`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`59`		C	`2`	`1`	`17561`	`◊`	P	`2`	`2`	`3729`	`8.1`	`0.5`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		A	`1`	`1`	`17406`	`◊`	M	`2`	`2`	`3935`	`5.7`	`0.3`	`0.792`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`6.9`	`0.4`	`0.808`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`61`		I	`1`	`1`	`4522`	`◊`	F	`1`	`1`	`5608`	`5.9`	`-0.1`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		J	`1`	`1`	`4384`	`◊`	H	`1`	`1`	`5634`	`2.0`	`-0.0`	`0.456`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`4.0`	`-0.1`	`0.425`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`63`		H	`4`	`1`	`5634`	`◊`	[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`5.4`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`64`		P	`1`	`1`	`3729`	`◊`	H	`1`	`1`	`5634`	`0.2`	`0.0`	`0.585`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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