PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=262-EA-F55)

Interfaces in PDB 6vfu crystal.
Space symmetry group: P 32 2 1. Resolution: 3.50 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN PROTOCADHERIN 19 EC1-EC4

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`203`	`66`	`24302`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`211`	`69`	`24432`	`1995.9`	`-24.1`	`0.053`	`6`	`7`	`0`	`0.257`
	`2`		B	`157`	`54`	`23053`	`◊`	B	y-1,x+1,-z	`4_465`	`158`	`54`	`23053`	`1554.5`	`-23.4`	`0.023`	`0`	`2`	`0`	`0.257`
	*Average:*													`1775.2`	`-23.8`	`0.038`	`3`	`5`	`0`	`0.257`
2	`3`		A	`128`	`39`	`24432`	`◊`	C	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`139`	`41`	`24302`	`1187.0`	`-7.4`	`0.410`	`3`	`4`	`0`	`0.074`
3	`4`		B	`90`	`30`	`23053`	`◊`	B	-x,-x+y,-z-1/3	`6_554`	`88`	`30`	`23053`	`973.2`	`-5.1`	`0.452`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
4	`5`		C	`97`	`32`	`24302`	`◊`	A	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`105`	`33`	`24432`	`931.0`	`-3.9`	`0.547`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`78`	`24`	`24432`	`◊`	B	y-1,x,-z	`4_455`	`73`	`20`	`23053`	`729.4`	`3.5`	`0.880`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		C	`47`	`17`	`24302`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`51`	`13`	`23053`	`450.6`	`-2.4`	`0.499`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
7	`8`		A	`31`	`7`	`24432`	`x`	A	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`33`	`12`	`24432`	`306.2`	`-1.0`	`0.580`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`29`	`12`	`24302`	`x`	C	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`29`	`6`	`24302`	`273.3`	`-2.2`	`0.402`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`289.8`	`-1.6`	`0.491`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		B	`30`	`10`	`23053`	`x`	B	-y+1,x-y+2,z-1/3	`2_674`	`35`	`7`	`23053`	`268.6`	`-1.1`	`0.564`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		C	`26`	`9`	`24302`	`◊`	A	x-y,-y+1,-z+1/3	`5_565`	`30`	`13`	`24432`	`207.0`	`1.9`	`0.798`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		[NAG]C:510	`10`	`1`	`359`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`24302`	`105.8`	`2.6`	`0.353`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		[NAG]A:510	`9`	`1`	`355`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`24432`	`96.6`	`2.5`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`101.2`	`2.5`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		[NAG]C:514	`7`	`1`	`362`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`24302`	`105.1`	`3.9`	`0.618`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		[NAG]B:510	`9`	`1`	`355`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`23053`	`104.9`	`4.0`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[NAG]B:511	`9`	`1`	`346`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`23053`	`99.8`	`2.5`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[NAG]A:512	`7`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`24432`	`94.4`	`3.9`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		[NAG]B:512	`10`	`1`	`356`	`cf`	[NAG]B:511	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`346`	`71.8`	`2.0`	`0.092`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		[NAG]C:511	`10`	`1`	`355`	`cf`	[NAG]C:510	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`70.1`	`1.4`	`0.094`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		[CL]A:515	`1`	`1`	`125`	`f`	C	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`16`	`8`	`24302`	`69.8`	`-9.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
18	`21`		[BMA]C:512	`7`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]C:511	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`355`	`64.8`	`1.4`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		[FUC]A:511	`4`	`1`	`277`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`24432`	`61.7`	`0.5`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		[CL]C:517	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`24302`	`60.5`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
21	`24`		[FUC]C:513	`5`	`1`	`277`	`cf`	[NAG]C:510	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`54.4`	`2.1`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		[FUC]A:511	`6`	`1`	`277`	`cf`	[NAG]A:510	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`355`	`50.4`	`2.2`	`0.202`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		[CL]C:516	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`24302`	`49.1`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
24	`27`		[NI]C:515	`1`	`1`	`115`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`24302`	`47.9`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
	`28`		[NI]A:513	`1`	`1`	`115`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`24432`	`45.8`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
	*Average:*													`46.8`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
25	`29`		[CA]B:505	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`23053`	`43.3`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.245`
	`30`		[CA]A:505	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`24432`	`42.7`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.245`
	`31`		[CA]C:504	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`24302`	`42.6`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.245`
	*Average:*													`42.9`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.245`
26	`32`		[FUC]C:513	`5`	`1`	`277`	`f`	[NAG]C:511	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`355`	`42.7`	`2.1`	`0.177`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		[CA]C:508	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`24302`	`41.5`	`-11.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.233`
	`34`		[CA]A:508	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`24432`	`39.6`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.233`
	`35`		[CA]B:507	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`23053`	`37.4`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.233`
	*Average:*													`39.5`	`-10.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.233`
28	`36`		[CA]C:501	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`24302`	`36.9`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.222`
	`37`		[CA]A:501	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`24432`	`36.3`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.222`
	`38`		[CA]B:501	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`23053`	`35.2`	`-10.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.222`
	*Average:*													`36.1`	`-10.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.222`
29	`39`		A	`5`	`2`	`24432`	`◊`	[NI]C:515	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`1`	`1`	`115`	`36.7`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	`40`		[NI]A:513	`1`	`1`	`115`	`◊`	C	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`4`	`2`	`24302`	`34.9`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	*Average:*													`35.8`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
30	`41`		[CL]A:515	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`24432`	`36.5`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
31	`42`		[CL]A:514	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`24432`	`32.7`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
32	`43`		B	`6`	`2`	`23053`	`◊`	B	x-y+1,-y+2,-z+1/3	`5_675`	`6`	`2`	`23053`	`29.9`	`0.2`	`0.672`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`44`		[NAG]C:511	`3`	`1`	`355`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`24302`	`23.7`	`0.6`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`45`		[CA]B:508	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`13.9`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
35	`46`		[CA]A:508	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`13.3`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
36	`47`		[FUC]C:513	`2`	`1`	`277`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`24302`	`12.0`	`0.2`	`0.365`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`48`		[CA]C:502	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.3`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
38	`49`		[CA]A:503	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.1`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
39	`50`		[CA]A:505	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.0`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
40	`51`		[CA]B:502	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.7`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
41	`52`		[CA]C:505	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]C:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.6`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
42	`53`		[CA]B:505	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.5`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
43	`54`		[CA]C:508	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]C:507	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.1`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
44	`55`		[CA]B:501	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	-x,-x+y,-z-1/3	`6_554`	`2`	`1`	`23053`	`7.2`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`56`		C	`1`	`1`	`24302`	`◊`	[CA]A:501	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`1`	`1`	`85`	`3.6`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[CA]C:501	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`1`	`1`	`24432`	`1.3`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.5`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`58`		[NAG]B:512	`1`	`1`	`356`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`23053`	`2.1`	`-0.0`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`59`		A	`1`	`1`	`24432`	`◊`	[NAG]C:510	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`1`	`1`	`359`	`1.0`	`0.0`	`0.271`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`60`		[NAG]A:510	`1`	`1`	`355`	`◊`	C	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`1`	`1`	`24302`	`1.0`	`0.0`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`61`		[FUC]C:513	`1`	`1`	`277`	`◊`	A	x-y,-y+1,-z+1/3	`5_565`	`1`	`1`	`24432`	`0.2`	`0.0`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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