PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=811-H3-K39)

Interfaces in PDB 6vzx crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.37 Å

STRUCTURE OF A COVALENTLY CAPTURED COLLAGEN TRIPLE HELIX USING LYSINE- GLUTAMATE PAIRS

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`70`	`24`	`2802`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`81`	`24`	`2758`	`674.5`	`-6.9`	`0.972`	`7`	`1`	`0`	`0.856`
2	`2`		C	`82`	`24`	`2802`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`69`	`22`	`2790`	`660.4`	`-5.5`	`0.981`	`8`	`1`	`0`	`0.840`
3	`3`		B	`67`	`23`	`2758`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`76`	`24`	`2790`	`656.0`	`-6.0`	`0.987`	`7`	`1`	`0`	`0.880`
4	`4`		A	`15`	`7`	`2790`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`16`	`7`	`2758`	`131.0`	`-2.4`	`0.845`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		C	`15`	`6`	`2802`	`x`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`15`	`6`	`2802`	`123.5`	`-2.3`	`0.822`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		B	`13`	`5`	`2758`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`11`	`5`	`2790`	`96.2`	`-2.3`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		B	`9`	`3`	`2758`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`9`	`3`	`2790`	`93.9`	`-1.8`	`0.713`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		A	`14`	`5`	`2790`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`9`	`3`	`2802`	`93.3`	`-2.0`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		C	`11`	`4`	`2802`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`11`	`3`	`2790`	`92.8`	`-2.6`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		A	`12`	`5`	`2790`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`9`	`4`	`2802`	`84.9`	`-2.6`	`0.616`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		C	`6`	`2`	`2802`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`3`	`2758`	`65.8`	`-0.2`	`0.891`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		A	`7`	`2`	`2790`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`10`	`4`	`2758`	`62.4`	`0.0`	`0.922`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
13	`13`		A	`7`	`3`	`2790`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`10`	`3`	`2802`	`60.2`	`-1.3`	`0.774`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		B	`10`	`5`	`2758`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`3`	`2802`	`52.7`	`-1.3`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		B	`6`	`3`	`2758`	`x`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`6`	`2`	`2758`	`50.2`	`-1.3`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		[ACE]A:0	`3`	`1`	`171`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2790`	`47.1`	`-0.6`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.098`
17	`17`		A	`4`	`2`	`2790`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`4`	`1`	`2758`	`46.5`	`-1.1`	`0.554`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		C	`9`	`3`	`2802`	`x`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`7`	`3`	`2802`	`44.5`	`-0.5`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		B	`4`	`2`	`2758`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`3`	`1`	`2790`	`43.0`	`-1.1`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`20`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`171`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`2758`	`39.0`	`-0.5`	`0.811`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
21	`21`		[NH2]B:25	`1`	`1`	`117`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2758`	`37.6`	`0.2`	`0.666`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`22`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`171`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`2790`	`36.1`	`-0.5`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
23	`23`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`171`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2802`	`36.0`	`-0.5`	`0.799`	`1`	`0`	`0`	`0.100`
24	`24`		[NH2]C:25	`1`	`1`	`117`	`c`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`2802`	`35.9`	`0.1`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`25`		B	`3`	`1`	`2758`	`x`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`3`	`1`	`2758`	`34.7`	`-0.7`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`26`		[NH2]B:25	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`5`	`2`	`2758`	`33.6`	`-0.0`	`0.840`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`27`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`171`	`◊`	C	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`5`	`2`	`2802`	`32.2`	`-0.8`	`0.774`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`28`		B	`3`	`1`	`2758`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`6`	`3`	`2790`	`31.8`	`-0.6`	`0.755`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`29`		B	`5`	`1`	`2758`	`◊`	C	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`6`	`2`	`2802`	`31.7`	`-0.6`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`30`		[NH2]A:25	`1`	`1`	`117`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`2790`	`31.6`	`-0.0`	`0.741`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	`31`		[NH2]C:25	`1`	`1`	`117`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2758`	`22.0`	`0.0`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`26.8`	`0.0`	`0.787`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
31	`32`		[ACE]A:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z+1	`3_456`	`5`	`2`	`2758`	`31.5`	`-0.9`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		[NH2]A:25	`1`	`1`	`117`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`2802`	`29.9`	`0.3`	`0.960`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		A	`4`	`1`	`2790`	`◊`	B	x-1/2,y+1/2,z+1	`3_456`	`4`	`2`	`2758`	`27.0`	`-0.6`	`0.666`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		[ACE]B:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`2790`	`26.6`	`-0.3`	`0.902`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
35	`36`		[ACE]B:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	C	-x,y,-z+2	`2_557`	`5`	`2`	`2802`	`25.1`	`-0.5`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		[ACE]C:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`2758`	`24.9`	`-0.3`	`0.912`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
37	`38`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`171`	`◊`	C	-x,y,-z+2	`2_557`	`5`	`2`	`2802`	`24.3`	`-0.6`	`0.752`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		C	`5`	`1`	`2802`	`◊`	C	-x,y,-z+2	`2_557`	`5`	`1`	`2802`	`24.3`	`-0.5`	`0.711`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		A	`3`	`1`	`2790`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z+1	`3_456`	`3`	`2`	`2802`	`23.7`	`-0.7`	`0.566`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		C	`2`	`1`	`2802`	`x`	C	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`2802`	`23.4`	`-0.7`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[ACE]A:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	[NH2]A:25	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`117`	`22.3`	`-0.1`	`0.943`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`43`		C	`5`	`2`	`2802`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`2`	`2790`	`22.2`	`-0.5`	`0.808`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`171`	`◊`	[ACE]C:0	-x,y,-z+2	`2_557`	`3`	`1`	`171`	`21.6`	`-0.4`	`0.852`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`45`		A	`3`	`1`	`2790`	`◊`	[NH2]C:25	x-1/2,y+1/2,z+1	`3_456`	`1`	`1`	`117`	`21.4`	`-0.1`	`0.763`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`46`		[ACE]C:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	[ACE]B:0	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`171`	`21.2`	`-0.5`	`0.801`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
46	`47`		A	`1`	`1`	`2790`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`3`	`1`	`2790`	`21.0`	`-0.1`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`48`		[ACE]A:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	A	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`2`	`1`	`2790`	`19.9`	`-0.4`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`49`		B	`4`	`1`	`2758`	`◊`	[NH2]A:25	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`117`	`17.9`	`-0.1`	`0.846`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`50`		[ACE]A:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2758`	`15.7`	`-0.1`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
50	`51`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`171`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2802`	`15.2`	`-0.1`	`0.671`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
51	`52`		[NH2]C:25	`1`	`1`	`117`	`f`	[NH2]B:25	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`117`	`15.1`	`0.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`53`		[ACE]B:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	[ACE]A:0	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`171`	`15.0`	`-0.3`	`0.801`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
53	`54`		[ACE]A:0	`2`	`1`	`171`	`◊`	C	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`4`	`2`	`2802`	`10.7`	`0.0`	`0.875`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`55`		B	`3`	`2`	`2758`	`◊`	B	-x,y,-z+1	`2_556`	`3`	`2`	`2758`	`10.6`	`-0.3`	`0.726`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`56`		C	`3`	`2`	`2802`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`3`	`2`	`2758`	`10.2`	`-0.2`	`0.765`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`57`		C	`3`	`2`	`2802`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`2`	`2`	`2790`	`8.9`	`-0.3`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`58`		B	`4`	`2`	`2758`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`3`	`3`	`2802`	`8.3`	`-0.2`	`0.790`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`59`		[NH2]B:25	`1`	`1`	`117`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2802`	`7.6`	`-0.0`	`0.686`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
59	`60`		B	`2`	`1`	`2758`	`◊`	[NH2]C:25	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`117`	`7.5`	`-0.0`	`0.824`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		B	`1`	`1`	`2758`	`◊`	[NH2]A:25	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`117`	`0.9`	`-0.0`	`0.789`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.2`	`-0.0`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`62`		A	`2`	`1`	`2790`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`2`	`1`	`2790`	`6.9`	`0.0`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`63`		A	`2`	`1`	`2790`	`◊`	[NH2]A:25	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`117`	`6.8`	`0.1`	`0.899`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`64`		[ACE]B:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	[NH2]A:25	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`117`	`6.3`	`-0.0`	`0.816`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`65`		A	`2`	`1`	`2790`	`◊`	[NH2]B:25	x-1/2,y+1/2,z+1	`3_456`	`1`	`1`	`117`	`4.7`	`-0.0`	`0.848`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`66`		A	`2`	`2`	`2790`	`◊`	A	-x,y,-z+1	`2_556`	`2`	`2`	`2790`	`4.6`	`-0.1`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`67`		[NH2]C:25	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`2790`	`4.1`	`0.1`	`0.890`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`68`		C	`1`	`1`	`2802`	`◊`	B	-x,y,-z+2	`2_557`	`1`	`1`	`2758`	`3.9`	`-0.0`	`0.627`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`69`		B	`2`	`1`	`2758`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`2`	`1`	`2802`	`3.9`	`-0.1`	`0.721`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`70`		[ACE]A:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	C	-x,y,-z+2	`2_557`	`2`	`1`	`2802`	`3.0`	`-0.1`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`71`		[ACE]B:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	A	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`2790`	`2.4`	`-0.1`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`72`		[ACE]C:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	C	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`2802`	`1.8`	`-0.1`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`73`		[ACE]A:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	[NH2]B:25	x-1/2,y+1/2,z+1	`3_456`	`1`	`1`	`117`	`1.5`	`-0.0`	`0.816`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`74`		A	`1`	`1`	`2790`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`2790`	`0.7`	`-0.0`	`0.673`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`75`		A	`1`	`1`	`2790`	`x`	A	x-1/2,y-1/2,z+1	`3_446`	`1`	`1`	`2790`	`0.7`	`-0.0`	`0.687`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`76`		C	`1`	`1`	`2802`	`◊`	[NH2]A:25	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`1`	`1`	`117`	`0.6`	`-0.0`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
75	`77`		[ACE]C:0	`1`	`1`	`171`	`◊`	[ACE]B:0	-x,y,-z+2	`2_557`	`1`	`1`	`171`	`0.3`	`-0.0`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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