PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=173-C2-34E)

Interfaces in PDB 6wxl

CRYO-EM STRUCTURE OF THE VRC315 CLINICAL TRIAL, VACCINE-ELICITED, HUMAN ANTIBODY 1D12 IN COMPLEX WITH AN H7 SH13 HA TRIMER

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`293`	`68`	`16678`	`◊`	B	`334`	`81`	`12995`	`3002.2`	`-31.4`	`0.074`	`43`	`4`	`1`	`0.000`
	`2`		C	`297`	`68`	`16664`	`◊`	D	`336`	`80`	`12997`	`2996.3`	`-31.3`	`0.076`	`43`	`4`	`1`	`0.000`
	`3`		G	`297`	`68`	`16669`	`◊`	I	`334`	`81`	`12984`	`2993.2`	`-31.2`	`0.075`	`43`	`4`	`1`	`0.000`
	*Average:*											`2997.2`	`-31.3`	`0.075`	`43`	`4`	`1`	`0.000`
2	`4`		D	`112`	`32`	`12997`	`◊`	I	`122`	`32`	`12984`	`1176.8`	`-14.1`	`0.161`	`10`	`9`	`0`	`0.000`
	`5`		B	`113`	`32`	`12995`	`◊`	D	`122`	`32`	`12997`	`1176.3`	`-14.2`	`0.161`	`10`	`9`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`120`	`31`	`12995`	`◊`	I	`113`	`32`	`12984`	`1172.2`	`-14.1`	`0.160`	`10`	`9`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1175.1`	`-14.2`	`0.161`	`10`	`9`	`0`	`0.000`
3	`7`		L	`90`	`29`	`6318`	`◊`	H	`110`	`29`	`6947`	`943.9`	`-11.1`	`0.273`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		J	`92`	`29`	`6313`	`◊`	K	`110`	`29`	`6949`	`943.0`	`-11.0`	`0.282`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		E	`92`	`30`	`6320`	`◊`	F	`111`	`29`	`6937`	`942.1`	`-11.0`	`0.284`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`943.0`	`-11.0`	`0.280`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
4	`10`		I	`56`	`14`	`12984`	`◊`	K	`52`	`13`	`6949`	`491.1`	`-6.0`	`0.285`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		D	`56`	`14`	`12997`	`◊`	F	`51`	`13`	`6937`	`490.6`	`-6.0`	`0.280`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`57`	`14`	`12995`	`◊`	H	`51`	`13`	`6947`	`489.9`	`-5.9`	`0.285`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`490.5`	`-6.0`	`0.283`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
5	`13`		C	`54`	`16`	`16664`	`◊`	G	`45`	`13`	`16669`	`416.2`	`-1.8`	`0.478`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		A	`46`	`13`	`16678`	`◊`	G	`53`	`16`	`16669`	`415.9`	`-1.9`	`0.470`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		A	`54`	`16`	`16678`	`◊`	C	`44`	`13`	`16664`	`413.2`	`-1.8`	`0.477`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`415.1`	`-1.9`	`0.475`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
6	`16`		G	`44`	`15`	`16669`	`◊`	J	`36`	`11`	`6313`	`352.3`	`-1.1`	`0.560`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		A	`44`	`15`	`16678`	`◊`	L	`37`	`11`	`6318`	`352.2`	`-0.4`	`0.605`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		C	`44`	`15`	`16664`	`◊`	E	`36`	`11`	`6320`	`351.8`	`-0.4`	`0.607`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`352.1`	`-0.7`	`0.591`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
7	`19`		C	`29`	`10`	`16664`	`◊`	I	`29`	`7`	`12984`	`253.7`	`-0.4`	`0.633`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	`20`		A	`29`	`10`	`16678`	`◊`	D	`29`	`7`	`12997`	`253.5`	`-0.4`	`0.633`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	`21`		G	`28`	`10`	`16669`	`◊`	B	`30`	`7`	`12995`	`253.0`	`-0.4`	`0.638`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`253.4`	`-0.4`	`0.635`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
8	`22`		G	`22`	`6`	`16669`	`◊`	D	`38`	`14`	`12997`	`244.4`	`-1.2`	`0.527`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		C	`22`	`6`	`16664`	`◊`	B	`38`	`14`	`12995`	`243.8`	`-1.2`	`0.530`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		A	`21`	`6`	`16678`	`◊`	I	`38`	`14`	`12984`	`243.0`	`-1.2`	`0.526`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`243.7`	`-1.2`	`0.528`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`25`		B	`25`	`7`	`12995`	`◊`	L	`30`	`8`	`6318`	`243.6`	`-2.4`	`0.298`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		I	`25`	`7`	`12984`	`◊`	J	`31`	`8`	`6313`	`243.6`	`-2.3`	`0.298`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		D	`26`	`7`	`12997`	`◊`	E	`30`	`8`	`6320`	`243.4`	`-2.4`	`0.309`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`243.6`	`-2.4`	`0.302`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
10	`28`		B	`19`	`8`	`12995`	`c`	[NAG]B:301	`12`	`1`	`363`	`148.6`	`4.2`	`0.485`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		I	`19`	`8`	`12984`	`c`	[NAG]I:301	`12`	`1`	`364`	`147.8`	`4.2`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		D	`19`	`8`	`12997`	`c`	[NAG]D:301	`12`	`1`	`363`	`147.5`	`4.2`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`148.0`	`4.2`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`31`		I	`15`	`5`	`12984`	`c`	[NAG]I:302	`11`	`1`	`360`	`125.0`	`3.0`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		B	`14`	`5`	`12995`	`c`	[NAG]B:302	`11`	`1`	`361`	`124.6`	`3.0`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		D	`14`	`5`	`12997`	`c`	[NAG]D:302	`11`	`1`	`360`	`124.5`	`3.0`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`124.7`	`3.0`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`34`		A	`9`	`4`	`16678`	`c`	[NAG]A:401	`7`	`1`	`357`	`92.4`	`3.0`	`0.556`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		G	`9`	`4`	`16669`	`c`	[NAG]G:401	`7`	`1`	`358`	`92.2`	`3.0`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		C	`9`	`4`	`16664`	`c`	[NAG]C:401	`7`	`1`	`357`	`91.9`	`3.0`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`92.1`	`3.0`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`37`		G	`7`	`5`	`16669`	`◊`	F	`10`	`5`	`6937`	`56.8`	`-0.7`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		A	`7`	`5`	`16678`	`◊`	K	`10`	`5`	`6949`	`55.7`	`-0.7`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		C	`6`	`5`	`16664`	`◊`	H	`10`	`5`	`6947`	`55.6`	`-0.7`	`0.469`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`56.0`	`-0.7`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`40`		J	`8`	`3`	`6313`	`◊`	[NAG]G:401	`4`	`1`	`358`	`55.6`	`1.4`	`0.562`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		E	`8`	`3`	`6320`	`◊`	[NAG]C:401	`4`	`1`	`357`	`55.5`	`1.4`	`0.560`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		L	`8`	`3`	`6318`	`◊`	[NAG]A:401	`4`	`1`	`357`	`55.0`	`1.4`	`0.559`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`55.4`	`1.4`	`0.561`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`43`		G	`6`	`2`	`16669`	`◊`	K	`2`	`2`	`6949`	`22.7`	`-0.3`	`0.376`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		C	`6`	`2`	`16664`	`◊`	F	`2`	`2`	`6937`	`22.7`	`-0.3`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		A	`6`	`2`	`16678`	`◊`	H	`2`	`2`	`6947`	`22.4`	`-0.3`	`0.372`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`22.6`	`-0.3`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`46`		C	`4`	`1`	`16664`	`◊`	L	`2`	`1`	`6318`	`21.8`	`-0.4`	`0.353`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		G	`4`	`1`	`16669`	`◊`	E	`2`	`1`	`6320`	`21.7`	`-0.4`	`0.353`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		A	`4`	`1`	`16678`	`◊`	J	`2`	`1`	`6313`	`21.0`	`-0.4`	`0.358`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`21.5`	`-0.4`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`49`		C	`1`	`1`	`16664`	`◊`	[NAG]D:301	`1`	`1`	`363`	`11.6`	`-0.1`	`0.236`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		G	`1`	`1`	`16669`	`◊`	[NAG]I:301	`1`	`1`	`364`	`11.2`	`-0.0`	`0.240`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		A	`1`	`1`	`16678`	`◊`	[NAG]B:301	`1`	`1`	`363`	`11.1`	`-0.0`	`0.241`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`11.3`	`-0.0`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`52`		K	`2`	`1`	`6949`	`◊`	[NAG]I:302	`1`	`1`	`360`	`8.9`	`0.3`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		H	`2`	`1`	`6947`	`◊`	[NAG]B:302	`1`	`1`	`361`	`8.8`	`0.3`	`0.737`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		F	`2`	`1`	`6937`	`◊`	[NAG]D:302	`1`	`1`	`360`	`8.8`	`0.3`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`8.8`	`0.3`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`55`		A	`2`	`1`	`16678`	`◊`	[NAG]D:301	`1`	`1`	`363`	`5.6`	`0.1`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		C	`2`	`1`	`16664`	`◊`	[NAG]I:301	`1`	`1`	`364`	`5.6`	`0.1`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		G	`2`	`1`	`16669`	`◊`	[NAG]B:301	`1`	`1`	`363`	`5.4`	`0.1`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`5.5`	`0.1`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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