PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=718-DL-A4B)

Interfaces in PDB 6xf6

CRYO-EM STRUCTURE OF A BIOTINYLATED SARS-COV-2 SPIKE PROBE IN THE PREFUSION STATE (1 RBD UP)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`483`	`149`	`50836`	`◊`	C	`481`	`144`	`50643`	`4577.1`	`-51.9`	`0.137`	`34`	`7`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`445`	`141`	`50836`	`◊`	B	`489`	`147`	`49304`	`4345.9`	`-53.1`	`0.141`	`36`	`11`	`0`	`0.000`
3	`3`		C	`396`	`126`	`50643`	`◊`	B	`400`	`114`	`49304`	`3700.6`	`-46.4`	`0.183`	`31`	`6`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`18`	`8`	`50836`	`c`	[NAG]A:1320	`10`	`1`	`353`	`153.3`	`3.1`	`0.435`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		B	`16`	`6`	`49304`	`c`	[NAG]B:1302	`12`	`1`	`359`	`144.2`	`3.9`	`0.460`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		A	`17`	`6`	`50836`	`c`	[NAG]G:1	`13`	`1`	`364`	`142.7`	`3.1`	`0.348`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		A	`15`	`7`	`50836`	`c`	[NAG]A:1302	`12`	`1`	`363`	`142.3`	`3.4`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`8`		C	`18`	`10`	`50643`	`c`	[NAG]L:1	`13`	`1`	`363`	`142.2`	`2.9`	`0.286`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		A	`15`	`8`	`50836`	`c`	[NAG]E:1	`13`	`1`	`363`	`135.7`	`2.9`	`0.294`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`10`		B	`17`	`8`	`49304`	`c`	[NAG]B:1311	`12`	`1`	`361`	`135.6`	`2.9`	`0.345`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`11`		C	`16`	`5`	`50643`	`c`	[NAG]N:1	`11`	`1`	`360`	`134.2`	`3.4`	`0.462`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		B	`16`	`5`	`49304`	`c`	[NAG]J:1	`12`	`1`	`360`	`133.4`	`3.3`	`0.404`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		C	`13`	`6`	`50643`	`c`	[NAG]C:1302	`12`	`1`	`363`	`130.1`	`3.0`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		A	`22`	`5`	`50836`	`c`	[NAG]A:1301	`12`	`1`	`363`	`129.0`	`3.6`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		A	`12`	`4`	`50836`	`c`	[NAG]A:1315	`12`	`1`	`358`	`128.6`	`3.4`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		C	`12`	`4`	`50643`	`c`	[NAG]C:1315	`11`	`1`	`361`	`126.4`	`3.5`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`127.5`	`3.4`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		B	`12`	`4`	`49304`	`c`	[NAG]B:1314	`11`	`1`	`363`	`124.2`	`3.7`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		C	`18`	`7`	`50643`	`c`	[NAG]M:1	`10`	`1`	`365`	`123.3`	`3.7`	`0.505`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		B	`16`	`7`	`49304`	`c`	[NAG]B:1306	`9`	`1`	`362`	`119.1`	`3.4`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		B	`14`	`6`	`49304`	`c`	[NAG]B:1310	`7`	`1`	`362`	`118.5`	`3.1`	`0.607`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		B	`16`	`6`	`49304`	`c`	[NAG]B:1305	`10`	`1`	`365`	`116.1`	`3.7`	`0.547`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		B	`16`	`6`	`49304`	`c`	[NAG]I:1	`11`	`1`	`363`	`115.9`	`3.3`	`0.411`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		A	`16`	`5`	`50836`	`c`	[NAG]A:1306	`12`	`1`	`359`	`115.7`	`3.9`	`0.412`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		A	`20`	`8`	`50836`	`c`	[NAG]F:1	`10`	`1`	`364`	`115.6`	`3.1`	`0.464`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		A	`12`	`5`	`50836`	`c`	[NAG]A:1310	`8`	`1`	`364`	`114.4`	`2.9`	`0.545`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		B	`12`	`5`	`49304`	`c`	[NAG]B:1319	`9`	`1`	`363`	`110.7`	`3.2`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		C	`13`	`7`	`50643`	`c`	[NAG]C:1306	`12`	`1`	`359`	`105.9`	`1.9`	`0.245`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		C	`12`	`4`	`50643`	`c`	[NAG]C:1310	`8`	`1`	`360`	`105.1`	`2.8`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		C	`14`	`5`	`50643`	`c`	[NAG]C:1305	`10`	`1`	`364`	`104.8`	`3.2`	`0.389`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		A	`13`	`3`	`50836`	`c`	[NAG]A:1309	`7`	`1`	`366`	`104.1`	`4.2`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		B	`10`	`4`	`49304`	`c`	[NAG]B:1308	`8`	`1`	`361`	`102.0`	`2.9`	`0.484`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`32`		B	`12`	`3`	`49304`	`c`	[NAG]B:1309	`7`	`1`	`363`	`102.0`	`4.8`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`33`		C	`13`	`4`	`50643`	`c`	[NAG]C:1301	`9`	`1`	`363`	`98.4`	`2.4`	`0.413`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		B	`12`	`4`	`49304`	`c`	[NAG]B:1303	`11`	`1`	`361`	`98.3`	`1.9`	`0.282`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`35`		B	`11`	`3`	`49304`	`c`	[NAG]B:1304	`7`	`1`	`363`	`96.7`	`3.7`	`0.632`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`36`		B	`13`	`4`	`49304`	`c`	[NAG]B:1301	`10`	`1`	`361`	`96.3`	`2.0`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`37`		A	`11`	`3`	`50836`	`c`	[NAG]D:1	`11`	`1`	`363`	`94.3`	`1.9`	`0.259`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`38`		C	`9`	`3`	`50643`	`c`	[NAG]C:1309	`7`	`1`	`366`	`94.1`	`3.3`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		C	`8`	`3`	`50643`	`c`	[NAG]C:1304	`7`	`1`	`363`	`93.9`	`3.1`	`0.600`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		A	`8`	`3`	`50836`	`c`	[NAG]A:1305	`7`	`1`	`363`	`93.7`	`3.2`	`0.592`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		C	`12`	`4`	`50643`	`c`	[NAG]O:1	`9`	`1`	`363`	`91.3`	`2.8`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		A	`11`	`4`	`50836`	`c`	[NAG]H:1	`7`	`1`	`363`	`90.6`	`3.0`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`91.0`	`2.9`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		A	`12`	`5`	`50836`	`c`	[NAG]A:1308	`9`	`1`	`358`	`90.7`	`2.3`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		C	`10`	`4`	`50643`	`c`	[NAG]C:1303	`7`	`1`	`364`	`88.3`	`3.2`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		B	`11`	`4`	`49304`	`c`	[NAG]K:1	`8`	`1`	`360`	`85.6`	`2.1`	`0.385`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		C	`9`	`2`	`50643`	`c`	[NAG]C:1307	`8`	`1`	`362`	`80.7`	`2.3`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		C	`6`	`3`	`50643`	`c`	[NAG]C:1308	`10`	`1`	`365`	`78.1`	`1.4`	`0.263`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[NAG]F:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]F:2	`9`	`1`	`362`	`77.1`	`1.8`	`0.101`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[NAG]I:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]I:2	`8`	`1`	`364`	`76.1`	`1.9`	`0.121`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[NAG]L:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]L:2	`9`	`1`	`362`	`75.6`	`2.0`	`0.113`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAG]D:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]D:2	`9`	`1`	`362`	`74.9`	`1.9`	`0.097`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[NAG]M:1	`6`	`1`	`365`	`c`	[NAG]M:2	`8`	`1`	`360`	`73.6`	`1.7`	`0.116`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`75.5`	`1.8`	`0.109`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`53`		C	`6`	`2`	`50643`	`c`	[NAG]C:1320	`9`	`1`	`363`	`74.7`	`2.2`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`54`		[NAG]K:1	`7`	`1`	`360`	`c`	[NAG]K:2	`10`	`1`	`361`	`74.6`	`1.7`	`0.080`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]G:1	`6`	`1`	`364`	`c`	[NAG]G:2	`9`	`1`	`360`	`70.9`	`1.1`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`72.7`	`1.4`	`0.082`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`56`		[NAG]H:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]H:2	`8`	`1`	`359`	`73.2`	`2.2`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[NAG]O:1	`6`	`1`	`363`	`c`	[NAG]O:2	`8`	`1`	`358`	`72.8`	`2.1`	`0.138`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`73.0`	`2.2`	`0.152`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`58`		[NAG]J:1	`7`	`1`	`360`	`c`	[NAG]J:2	`10`	`1`	`362`	`73.0`	`1.7`	`0.073`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`59`		A	`13`	`4`	`50836`	`◊`	[NAG]E:2	`5`	`1`	`362`	`67.4`	`1.3`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`60`		B	`7`	`2`	`49304`	`c`	[NAG]B:1307	`9`	`1`	`364`	`67.1`	`1.2`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`61`		[NAG]N:1	`6`	`1`	`360`	`c`	[NAG]N:2	`9`	`1`	`365`	`67.1`	`1.1`	`0.077`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`62`		[NAG]E:1	`5`	`1`	`363`	`c`	[NAG]E:2	`9`	`1`	`362`	`66.3`	`1.3`	`0.093`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`63`		C	`8`	`4`	`50643`	`◊`	[NAG]D:1	`6`	`1`	`363`	`63.1`	`2.6`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`64`		A	`4`	`1`	`50836`	`c`	[NAG]A:1307	`6`	`1`	`361`	`60.7`	`1.8`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`65`		C	`10`	`3`	`50643`	`◊`	[NAG]D:2	`4`	`1`	`362`	`58.0`	`0.4`	`0.375`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`66`		C	`7`	`4`	`50643`	`◊`	[NAG]L:2	`6`	`1`	`362`	`57.3`	`0.6`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`67`		B	`8`	`3`	`49304`	`◊`	[NAG]J:2	`4`	`1`	`362`	`50.5`	`1.3`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`68`		C	`6`	`2`	`50643`	`◊`	[NAG]N:2	`4`	`1`	`365`	`38.8`	`1.0`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`69`		A	`6`	`2`	`50836`	`◊`	[NAG]G:2	`4`	`1`	`360`	`37.2`	`0.9`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`70`		B	`9`	`2`	`49304`	`◊`	[NAG]I:2	`4`	`1`	`364`	`29.4`	`1.1`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`71`		C	`6`	`2`	`50643`	`◊`	[NAG]M:2	`3`	`1`	`360`	`26.8`	`1.1`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`72`		C	`4`	`2`	`50643`	`◊`	[NAG]B:1310	`4`	`1`	`362`	`22.8`	`0.2`	`0.285`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`73`		A	`3`	`2`	`50836`	`◊`	[NAG]C:1310	`4`	`1`	`360`	`20.4`	`-0.0`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`74`		A	`1`	`1`	`50836`	`◊`	[NAG]C:1315	`4`	`1`	`361`	`20.0`	`0.8`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`75`		C	`1`	`1`	`50643`	`◊`	[NAG]B:1314	`3`	`1`	`363`	`19.8`	`0.8`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`19.9`	`0.8`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`76`		B	`1`	`1`	`49304`	`◊`	[NAG]A:1315	`3`	`1`	`358`	`20.0`	`0.8`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`77`		A	`2`	`1`	`50836`	`◊`	[NAG]B:1304	`4`	`1`	`363`	`19.1`	`0.1`	`0.225`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`78`		C	`2`	`1`	`50643`	`◊`	[NAG]A:1305	`3`	`1`	`363`	`15.8`	`-0.0`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.4`	`0.0`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`79`		B	`1`	`1`	`49304`	`◊`	[NAG]A:1310	`3`	`1`	`364`	`9.9`	`-0.3`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`80`		A	`2`	`1`	`50836`	`◊`	[NAG]B:1303	`1`	`1`	`361`	`8.8`	`0.3`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`81`		A	`4`	`1`	`50836`	`◊`	[NAG]F:2	`1`	`1`	`362`	`2.5`	`0.0`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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